氨基酸 (4)精选PPT.ppt
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1、关于氨基酸关于氨基酸(4)第1页,讲稿共103张,创作于星期二n n 氨基酸是蛋白质的构件分子。氨基酸是蛋白质的构件分子。第2页,讲稿共103张,创作于星期二一一一一 氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子二二二二 氨基酸的分类氨基酸的分类氨基酸的分类氨基酸的分类三三 氨基酸的酸碱化学氨基酸的酸碱化学四四 氨基酸的化学反应氨基酸的化学反应五五 氨基酸的光学活性和光谱性质氨基酸的光学活性和光谱性质六六 氨基酸的分析分离氨基酸的分析分离第3页,讲稿共103张,创作于星期二(1 1)酸水解:)酸水解:常用H2S04或HCl进行水解。一般用6molL HCl,4molL H2S04;
2、回流煮沸20h左右可使蛋白质完全水解。优点:不引起消旋作用,得到的是L氨基酸。缺点:色氨酸完全被沸酸所破坏,羟基氨基酸(丝氨酸及苏氨酸)有一小部分被分解,同时天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解下来。蛋白质可以在酸、碱和蛋白酶的作用下发生水解,但水解的结果有所不同(一一)蛋白质的水解蛋白质的水解123页页一、一、氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子(2 2)碱水解)碱水解(3 3)酶水解)酶水解1.蛋白质的酸水解一般用6mol/L HCI,110水解20小时左右,可使蛋白质完全水解。酸水解的优点是(),缺点是使()被完全破坏。(厦大2007)第4页,讲稿共103张,创作于星期二(2 2)碱
3、水解:)碱水解:一般与一般与5molL NaOH共煮共煮1020h,即可使蛋白质完,即可使蛋白质完全水解。全水解。缺点缺点:(1)多数氨基酸遭到不同程度的破坏,如)多数氨基酸遭到不同程度的破坏,如精氨酸精氨酸 脱氨脱氨,生成鸟,生成鸟氨酸和尿素。氨酸和尿素。(2)产生消旋现象产生消旋现象,所得产物是,所得产物是D和和L氨基酸的混合物,氨基酸的混合物,称消旋物。称消旋物。优点:优点:在碱性条件下色氨酸是稳定的。在碱性条件下色氨酸是稳定的。蛋白质水解产物即为氨基酸的混合物,不同水解方法各有其优缺点蛋白质水解产物即为氨基酸的混合物,不同水解方法各有其优缺点。(一一)蛋白质的水解蛋白质的水解123页页
4、(3)酶水解:)酶水解:(1)酸水解:)酸水解:一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子第5页,讲稿共103张,创作于星期二(3 3)酶水解)酶水解:常用的蛋白酶有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶以及胃蛋白酶等,该方法常用的蛋白酶有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶以及胃蛋白酶等,该方法主要用于蛋白质一级结构分析以获得蛋白质的部分水解产物。主要用于蛋白质一级结构分析以获得蛋白质的部分水解产物。优点:优点:不产生消旋作用,也不破坏氨基酸。不产生消旋作用,也不破坏氨基酸。缺点:缺点:a a使用一种酶往往水解不彻底,需要几种酶使用一种酶往往水解不彻底,需要几
5、种酶 协同作用才能使蛋白质完全水解。协同作用才能使蛋白质完全水解。b.b.酶水解所需时间较长。酶水解所需时间较长。蛋白质水解产物即为氨基酸的混合物,不同水解方法各有其优缺点蛋白质水解产物即为氨基酸的混合物,不同水解方法各有其优缺点。(一一)蛋白质的水解蛋白质的水解123页页(1)酸水解)酸水解(2)碱水解)碱水解一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子第6页,讲稿共103张,创作于星期二氨基酸的通式氨基酸的通式n n组成蛋白质的组成蛋白质的组成蛋白质的组成蛋白质的常见氨基酸常见氨基酸常见氨基酸常见氨基酸有有有有2020种,除脯氨酸
6、(亚氨基酸)外种,除脯氨酸(亚氨基酸)外种,除脯氨酸(亚氨基酸)外种,除脯氨酸(亚氨基酸)外,均为均为均为均为-氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸n n共同特点是在同一个碳原子上共同特点是在同一个碳原子上共同特点是在同一个碳原子上共同特点是在同一个碳原子上有羧基、氨基和氢有羧基、氨基和氢有羧基、氨基和氢有羧基、氨基和氢n n不同特点是不同特点是不同特点是不同特点是R R不同。不同。不同。不同。(二)-氨基酸氨基酸 的一般结构结构 一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子第7页,讲稿共103张,创作于星期二按氨基酸按分子中所含按氨基酸按分子中
7、所含NHNH2 2和和COOHCOOH的相对位置,可将其分为:的相对位置,可将其分为:-氨基酸氨基酸(amino acid)(amino acid):是羧酸分子中是羧酸分子中-碳原子上的一个氢原子被碳原子上的一个氢原子被氨基替代而成的化合物,故称氨基替代而成的化合物,故称-氨基酸。氨基酸。它是构成蛋白质的基本它是构成蛋白质的基本单元。单元。第8页,讲稿共103张,创作于星期二氨基酸的通式氨基酸的通式氨基酸的通式氨基酸的通式n n组成蛋白质的组成蛋白质的组成蛋白质的组成蛋白质的常见氨基酸常见氨基酸常见氨基酸常见氨基酸有有有有2020种,除脯氨酸(亚氨基种,除脯氨酸(亚氨基种,除脯氨酸(亚氨基种,
8、除脯氨酸(亚氨基酸)外酸)外酸)外酸)外,均为均为均为均为-氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸n n共同特点共同特点共同特点共同特点是在同一个碳原子上是在同一个碳原子上是在同一个碳原子上是在同一个碳原子上有羧基、氨基和氢有羧基、氨基和氢有羧基、氨基和氢有羧基、氨基和氢n n不同特点不同特点不同特点不同特点是是是是R R不同。不同。不同。不同。(二)-氨基酸氨基酸 的一般结构结构 一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子第9页,讲稿共103张,创作于星期二1.1.1.1.形成肽键形成肽键 因为氨基酸同时含有氨基和羧基,所以它们能以因为氨基酸同
9、时含有氨基和羧基,所以它们能以因为氨基酸同时含有氨基和羧基,所以它们能以因为氨基酸同时含有氨基和羧基,所以它们能以首尾相连的方式进行聚合反应,除去一分子水形首尾相连的方式进行聚合反应,除去一分子水形首尾相连的方式进行聚合反应,除去一分子水形首尾相连的方式进行聚合反应,除去一分子水形成一个共价酰胺键或称肽键成一个共价酰胺键或称肽键成一个共价酰胺键或称肽键成一个共价酰胺键或称肽键.2 2 2 2兼性离子兼性离子兼性离子兼性离子 多数氨基酸在中性多数氨基酸在中性多数氨基酸在中性多数氨基酸在中性pHpHpHpH时,羧基以时,羧基以时,羧基以时,羧基以-COO-COO-COO-COO-,氨基以,氨基以,
10、氨基以,氨基以-NH-NH-NH-NH3 3 3 3+形式存在,形式存在,形式存在,形式存在,R R R R基不解离。这样的氨基酸分基不解离。这样的氨基酸分基不解离。这样的氨基酸分基不解离。这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷,成为兼性子含有一个正电荷和一个负电荷,成为兼性子含有一个正电荷和一个负电荷,成为兼性子含有一个正电荷和一个负电荷,成为兼性离子离子离子离子(同时带有正电荷和负电荷的离子,且正负电荷相(同时带有正电荷和负电荷的离子,且正负电荷相(同时带有正电荷和负电荷的离子,且正负电荷相(同时带有正电荷和负电荷的离子,且正负电荷相等、净电荷为零)等、净电荷为零)等、净电荷为零)等、
11、净电荷为零)。3 3 3 3旋光性旋光性旋光性旋光性 -氨基酸除氨基酸除氨基酸除氨基酸除甘氨酸甘氨酸甘氨酸甘氨酸外,其它的外,其它的外,其它的外,其它的-碳原子是一个碳原子是一个碳原子是一个碳原子是一个手性碳原子,因此都具有旋光性。手性碳原子,因此都具有旋光性。手性碳原子,因此都具有旋光性。手性碳原子,因此都具有旋光性。(三)氨基酸的性质氨基酸的性质P145P145一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子第10页,讲稿共103张,创作于星期二构型:根据甘油醛构型确定构型:根据甘油醛构型确定D D型和型和L L型型1.根据甘油醛原则
12、确定构型,由-碳原子上氨基的位置来确定碳原子上氨基的位置来确定2.组成蛋白质的氨基酸除甘氨酸外都有旋光性。LAA3.自然界的氨基酸有两种构型,构型和旋光方向没有必然联系。一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子(厦大2009)第11页,讲稿共103张,创作于星期二1.1.形成肽键形成肽键 因为氨基酸同时含有氨基和羧基,所以它们能以首尾相连的方式进行聚合反应,除去一分子因为氨基酸同时含有氨基和羧基,所以它们能以首尾相连的方式进行聚合反应,除去一分子水形成一个共价酰胺键或称肽键水形成一个共价酰胺键或称肽键.2 2兼性离子兼性离子 氨基
13、酸在中性氨基酸在中性pHpH时,羧基以时,羧基以-COO-COO-,氨基以,氨基以-NH3+-NH3+形式存在。这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一形式存在。这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷,称为兼性离子。个负电荷,称为兼性离子。3 3旋光性旋光性 -氨基酸除氨基酸除甘氨酸甘氨酸外,其它的外,其它的-碳原子是一个手性碳原子,因此都具有旋光性。碳原子是一个手性碳原子,因此都具有旋光性。4结晶 -氨基酸都是白色晶体,熔点很高,一般都能溶于水。每种氨基酸都有特殊的结晶形状。利用结晶形状可以鉴别各种氨基酸。氨基酸的性质氨基酸的性质P145P145一、一、一、一、氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的
14、构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子第12页,讲稿共103张,创作于星期二一一一一 氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子(一一)蛋白质的水解蛋白质的水解(水解蛋白质的方法有哪几种(水解蛋白质的方法有哪几种?有什么优缺点?)有什么优缺点?)(二)-氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸的一般结构结构结构结构 (三)氨基酸的性质(兼性离子;旋光性)氨基酸的性质(兼性离子;旋光性)第13页,讲稿共103张,创作于星期二一一 氨基酸氨基酸蛋白质的构件分子蛋白质的构件分子二二二二 氨基酸的分类氨基酸的分类氨基酸的分类氨基酸的分类三三三三 氨基酸的酸碱化学氨基酸的酸碱化学氨基酸的
15、酸碱化学氨基酸的酸碱化学四四 氨基酸的化学反应氨基酸的化学反应五五 氨基酸的光学活性和光谱性质氨基酸的光学活性和光谱性质六六六六 氨基酸的分析分离氨基酸的分析分离氨基酸的分析分离氨基酸的分析分离第14页,讲稿共103张,创作于星期二常常见见的的蛋蛋白白质质氨氨基基酸酸(基本氨基酸):蛋蛋白白质质中中常常见见的的20种种氨氨基基酸酸不不常常见见的的蛋蛋白白质质氨氨基基酸酸(稀有氨基酸):蛋蛋白白质质组组成成中中,除除上上述述20种种常常见见氨氨基基酸酸外外,从从少少数数蛋蛋白白质质中中还还分分离离出出一一些些稀稀有有氨氨基基酸酸,它它们们都都是相应常见氨基酸的衍生物。如是相应常见氨基酸的衍生物。
16、如4-羟脯氨酸、羟脯氨酸、5-羟赖氨酸等。羟赖氨酸等。非蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸:生物体内呈游离或结合态的氨基酸,生物体内呈游离或结合态的氨基酸,150150多种多种多种多种.二二 氨基酸的分类氨基酸的分类 P124P124P124P124蛋白质蛋白质中的氨中的氨基酸基酸目前从各种生物体中发现的氨基酸已有目前从各种生物体中发现的氨基酸已有180180多种多种第15页,讲稿共103张,创作于星期二 20种氨基酸的名称及缩写代号P124P124(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸20种种第16页,讲稿共103张,创作于星期二n n1 1
17、)按)按R R R R基的基的化学结构化学结构分类分类 脂肪族脂肪族脂肪族脂肪族氨基酸:氨基酸:氨基酸:氨基酸:15151515种种种种 芳香族芳香族芳香族芳香族氨基酸(含有苯环):氨基酸(含有苯环):氨基酸(含有苯环):氨基酸(含有苯环):3 3 3 3种种种种 杂环族杂环族杂环族杂环族氨基酸(含咪唑基或吡咯环):氨基酸(含咪唑基或吡咯环):氨基酸(含咪唑基或吡咯环):氨基酸(含咪唑基或吡咯环):2 2 2 2种种种种(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P1241 1 常见氨基酸常见氨基酸 P124-127P124-127第17页
18、,讲稿共103张,创作于星期二根据性质分为根据性质分为根据性质分为根据性质分为中性中性、含含羟基羟基或或硫硫、酸性酸性氨基酸及氨基酸及酰胺酰胺及及碱性碱性碱性碱性脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸。中性脂肪族氨基酸中性脂肪族氨基酸 P125P125(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P124脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸干干Gan了了le的的叶叶ye子子 一个夹心一个夹心饼饼干(把干(把A想成一片饼干,想成一片饼干,两面都是两面都是A,中间加,中间加点东西)点东西)山谷(山谷(Valley)的坡面是)的坡面是斜(斜(缬缬)的
19、)的 亮的读音亮的读音碳原子数目碳原子数目侧链是氢原子或烷烃侧链。R基对分子酸碱性影响很小,几乎有相同的等电点(6.00.03)。第18页,讲稿共103张,创作于星期二含羟基或硫脂肪族氨基酸含羟基或硫脂肪族氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P124脂肪族脂肪族脂肪族脂肪族氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸加一个儿化音,加一个儿化音,丝丝儿(儿(Si er)科学理论(科学理论(Theory)的出现,)的出现,标志着人类开始标志着人类开始苏苏醒醒 西红柿炒鸡西红柿炒鸡蛋蛋,每个人的做法,每个人的做法(method)是不同)是不同 的的第1
20、9页,讲稿共103张,创作于星期二酸性氨基酸及酰胺酸性氨基酸及酰胺 P125 P125(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P124脂肪族脂肪族脂肪族脂肪族氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸冬天冬天非常寒冷,我们渴非常寒冷,我们渴望(望(Aspire)温暖)温暖碳原子数目碳原子数目“谷谷”的拼音的拼音在生理条件下仅有的带负电荷的两个氨基酸酰胺基中氨基易发生氨基转移反应,转氨基反应在生物合成和代谢中有重要意义第20页,讲稿共103张,创作于星期二(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P1
21、24脂肪族脂肪族脂肪族脂肪族氨基酸氨基酸氨基酸氨基酸碱性碱性碱性碱性脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸 P126P126胍基胍基胍基胍基侧链上的胍基是已知碱性最强的有机碱Arg是碱性最强的氨基酸,侧链有4个C的直链,柔性较大,使侧链的氨基反应活性增大。工作要精益求精,有些事需经过激烈的争辩(argument)第21页,讲稿共103张,创作于星期二芳香族氨基酸芳香族氨基酸 P126吲哚基吲哚基吲哚基吲哚基把把trytry后两个字后两个字母颠倒过来母颠倒过来 都含苯环,都有紫外吸收(280nm)。所以可通过测量蛋白质的紫外吸收来测定蛋白质的含量。第22页,讲稿共103张,创作于星期二杂环氨基酸杂环氨基酸 P
22、126-127 P126-127(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P124咪唑基咪唑基咪唑基咪唑基俗话说,男(俗话说,男(His)女女组组合,干活不累合,干活不累 胸胸脯脯(p)肉肉(ro)碱性较弱的氨基酸,在生理条件下是否带电与周围内环境有关。它在活性中心常起传递电荷的作用。-螺旋的破坏者第23页,讲稿共103张,创作于星期二5、写出、写出Ser、Thr、Pro、Tyr的分子结构式,并简述其的分子结构式,并简述其R基特征。基特征。2006年暨南大学年暨南大学7、常见的杂环族氨基酸有(21)和(22)。(华南理工2011)(中山大
23、学2011)(厦大2009)5、常见的芳香族氨基酸有(14)、(15)和苯丙氨酸。(华南理工2010)(厦大2009)(暨南大学暨南大学2010)第24页,讲稿共103张,创作于星期二n n1 1)按)按R R基的基的化学结构化学结构分类分类 脂肪族脂肪族氨基酸:氨基酸:1515种种种种 芳香族芳香族氨基酸:氨基酸:3 3种种 杂环族杂环族氨基酸:氨基酸:2 2种种种种(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸(一)常见的蛋白质氨基酸 P124第25页,讲稿共103张,创作于星期二非极性、疏水氨基酸非极性、疏水氨基酸(非极性非极性R R基氨基酸基氨基酸):AlaA
24、la Val,Leu,Ile Val,Leu,Ile(脂肪烃支链);(脂肪烃支链);MetMet(含硫);(含硫);PhePhe,TrpTrp(芳香族);(芳香族);ProPro(亚氨基)(亚氨基);不带电荷的极性不带电荷的极性R R基氨基酸:基氨基酸:Ser,ThrSer,Thr(含羟基);(含羟基);Tyr Tyr(芳香族);(芳香族);CysCys(含硫);(含硫);Gln,AsnGln,Asn(含(含酰氨)酰氨)GlyGly(无旋光异构);(无旋光异构);带正电荷的带正电荷的R R基氨基酸基氨基酸 ArgArg(胍基)、(胍基)、HisHis(咪唑基)、(咪唑基)、LysLys(氨基)
25、,氨基),侧链基团在中性(侧链基团在中性(pH=7.0)溶液中解离后带正电荷的氨基酸溶液中解离后带正电荷的氨基酸带负电荷的带负电荷的R R基氨基酸基氨基酸 GluGlu(含(含羧基)、羧基)、AspAsp(含(含羧基),羧基),侧链基团在中性溶液(侧链基团在中性溶液(pH=7.0)中解离)中解离后带负电荷的氨基酸后带负电荷的氨基酸(2)(2)按侧链按侧链R R基的极性基的极性22氨基酸根据氨基酸根据R基的极性性质可分为基的极性性质可分为4类,即类,即(43)、不带电荷的极性、不带电荷的极性R基氨基酸、基氨基酸、(44)和带负电荷的和带负电荷的R基氨基酸基氨基酸。(华南理工。(华南理工2009第
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