核酸化学 (6)精选PPT.ppt
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1、关于核酸化学关于核酸化学(6)第1页,讲稿共84张,创作于星期二5.1 核酸概述核酸概述 核酸是生物大分子之一,在生命活动中起着核酸是生物大分子之一,在生命活动中起着重要的决定性作用。糖、脂是由酶(蛋白质)重要的决定性作用。糖、脂是由酶(蛋白质)催化合成的,它们与蛋白质组合成复合体增加催化合成的,它们与蛋白质组合成复合体增加了蛋白质的功能多样性。蛋白质是生命体功能了蛋白质的功能多样性。蛋白质是生命体功能的体现着。而蛋白质的合成取决于核酸,核酸的体现着。而蛋白质的合成取决于核酸,核酸是决定生命体差异的根源。是决定生命体差异的根源。第2页,讲稿共84张,创作于星期二5.1.1 核酸的发现与研究简史
2、核酸的发现与研究简史 1868年瑞士青年科学家年瑞士青年科学家F.Miescher从外科从外科手术绷带上的脓细胞中分离出一种富含手术绷带上的脓细胞中分离出一种富含P的酸的酸性化合物,称它为核素(性化合物,称它为核素(nuclein),实际上就),实际上就是我们现在所指的核蛋白。米歇尔因此被认为是我们现在所指的核蛋白。米歇尔因此被认为是细胞核化学的创始人和是细胞核化学的创始人和DNA的发现者。的发现者。第3页,讲稿共84张,创作于星期二研究简史:研究简史:1868年年1950年,研究核酸是什么年,研究核酸是什么1953年年4月月25日,日,J.D.Watson和和F.Crick提出提出DNA双螺
3、旋结构双螺旋结构 模型。模型。1958年年Crick提出了提出了“中心法则中心法则”,即遗传信息从,即遗传信息从DNA传到传到 RNA,再传到蛋白质,一旦传给蛋白质就不再转移。,再传到蛋白质,一旦传给蛋白质就不再转移。1970年代,诞生年代,诞生DNA重组技术(重组、克隆、测序)重组技术(重组、克隆、测序)1981年年T.Cech证明证明RNA也具有催化功能(发现核酶)也具有催化功能(发现核酶)1997年,第一次举行国际年,第一次举行国际“蛋白质组学蛋白质组学”会议会议2003年年4月月14日,美、英、法、日、德、中完成人类基因组计划。日,美、英、法、日、德、中完成人类基因组计划。第4页,讲稿
4、共84张,创作于星期二5.1.2 核酸的种类和分布核酸的种类和分布P149核酸分为两大类:核酸分为两大类:脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 (DNA)核糖核酸核糖核酸 (RNA)第5页,讲稿共84张,创作于星期二 9898核中(染色体中)核中(染色体中)真核真核 线粒体(线粒体(mtDNAmtDNA)核外核外 叶绿体(叶绿体(ctDNActDNA)DNA DNA 拟核拟核 原核原核 核外:质粒(核外:质粒(plasmidplasmid)病毒:病毒:DNADNA病毒病毒 DNA主要存在于细胞核中染色体上。主要存在于细胞核中染色体上。环状双链环状双链DNA线型双链线型双链DNA第6页,讲稿共84张,创作于
5、星期二RNARNA主要存在于细胞质中主要存在于细胞质中 参与蛋白质合成的参与蛋白质合成的RNA tRNA(转移(转移RNA)rRNA(核糖体(核糖体RNA)mRNA(信使(信使RNA)其他:小其他:小RNA(小于(小于300个核苷酸)个核苷酸)核内小核内小RNA(snRNA)、核仁小)、核仁小RNA(snoRNA)核内不均一核内不均一RNA(hnRNA)等。)等。病毒病毒RNA第7页,讲稿共84张,创作于星期二5.1.3 核酸的生物核酸的生物功能功能DNA是遗传信息的载体是遗传信息的载体 证明实验:肺炎球菌转化作用证明实验:肺炎球菌转化作用RNA除除主要参与蛋白质的生物合成主要参与蛋白质的生物
6、合成外,还有基外,还有基因表达的调节功能。因表达的调节功能。证明实验:生长旺盛的细胞中(蛋白质合成旺盛),证明实验:生长旺盛的细胞中(蛋白质合成旺盛),RNA含量含量特别丰富。特别丰富。第8页,讲稿共84张,创作于星期二5.2 核酸的结构核酸的结构 核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖(核糖或脱氧核糖)和磷酸的混合物。核酸部分糖(核糖或脱氧核糖)和磷酸的混合物。核酸部分水解则产生核苷和核苷酸。每个核苷分子含一分子水解则产生核苷和核苷酸。每个核苷分子含一分子碱基和一分子戊糖,一分子核苷酸部分水解后除产碱基和一分子戊糖,一分子核苷酸部分水解后除产生核苷
7、外,还有一分子磷酸。核酸的各种水解产物生核苷外,还有一分子磷酸。核酸的各种水解产物可用层析或电泳等方法分离鉴定。可用层析或电泳等方法分离鉴定。5.2.1 核酸的元素组成核酸的元素组成元素组成:元素组成:C H O N C H O N P P 第9页,讲稿共84张,创作于星期二核酸核酸核苷酸核苷酸核苷核苷磷酸磷酸碱基碱基戊糖戊糖核蛋白核蛋白蛋白质蛋白质基本结构单元:基本结构单元:核苷酸核苷酸(磷酸(磷酸+戊糖戊糖+碱基)碱基)第10页,讲稿共84张,创作于星期二5.2.2 核苷酸核苷酸P1505.2.2.1 戊糖戊糖 组成核酸的戊糖有两种。组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为所含的糖为-D-2
8、-脱脱氧核糖;氧核糖;RNA所含的糖则为所含的糖则为-D-核糖。核糖。RiboseDeoxyribose1324513245第11页,讲稿共84张,创作于星期二1.1.嘌呤(嘌呤(PurinePurine)碱)碱1 12 23 34 45 56 69 97 78 8l腺嘌呤腺嘌呤adeninel鸟嘌呤鸟嘌呤guanine AGOH6265.2.2.2 碱基碱基第12页,讲稿共84张,创作于星期二2.2.嘧啶(嘧啶(PyrimidinePyrimidine)碱)碱1 12 23 34 45 56 6尿嘧啶尿嘧啶uracilU42胞嘧啶胞嘧啶cytosineC24胸腺嘧啶胸腺嘧啶thymineT4
9、25第13页,讲稿共84张,创作于星期二 核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多,大部分是上述五种很多,大部分是上述五种常见碱基常见碱基的甲基化产物的甲基化产物。第14页,讲稿共84张,创作于星期二l黄嘌呤黄嘌呤xanthineXO26l次黄嘌呤次黄嘌呤hypoxanthineI6第15页,讲稿共84张,创作于星期二POHHOOHO5.2.2.3 磷酸(磷酸(H3PO4)第16页,讲稿共84张,创作于星期二两大核酸的比较两大核酸的比较DNARNA存在细胞核内细胞质中功能遗传信息载体指导合成蛋白质组成磷酸脱氧核糖A、G、C、T磷酸核糖
10、A、G、C、U第17页,讲稿共84张,创作于星期二核苷:戊糖核苷:戊糖 +碱基碱基 糖与碱基之间的糖与碱基之间的C-NC-N键,称为键,称为C-NC-N糖苷键糖苷键1122334455(OH)1122334455(OH)5.2.2.4 核苷核苷P152第18页,讲稿共84张,创作于星期二Adenosine Guanosine Cytidine UridineHHH脱氧脱氧脱氧脱氧脱氧脱氧第19页,讲稿共84张,创作于星期二修饰核苷(稀有核苷)修饰核苷(稀有核苷)次黄苷(肌苷)次黄苷(肌苷)I 黄嘌呤核苷黄嘌呤核苷 X5 5OH假尿苷(假尿苷()5,6二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶核苷(核苷(D )56第
11、20页,讲稿共84张,创作于星期二 核苷酸:核苷核苷酸:核苷+磷酸磷酸 戊糖戊糖+碱基碱基+磷酸磷酸自然界存在的自由核苷酸主要是自然界存在的自由核苷酸主要是5磷酸酯磷酸酯555.2.2.5 核苷酸核苷酸P154第21页,讲稿共84张,创作于星期二多聚核苷酸是通过一个核苷酸的多聚核苷酸是通过一个核苷酸的C C3 3-OH-OH与另一分子核与另一分子核苷酸的苷酸的5-5-磷酸基磷酸基形成形成3,5-3,5-磷酸二酯键磷酸二酯键相连而成相连而成的链状聚合物。的链状聚合物。55335.2.3 核酸(多聚核苷酸)核酸(多聚核苷酸)第22页,讲稿共84张,创作于星期二第23页,讲稿共84张,创作于星期二l
12、5-5-磷酸端(常用磷酸端(常用5 5-P-P表示);表示);3-3-羟基端(常用羟基端(常用3 3-OH-OH表示)。表示)。多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须注明它多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须注明它的方向是的方向是5353或是或是3535。多聚核苷酸的表示方式(线条式、文字式)多聚核苷酸的表示方式(线条式、文字式)DNA RNA5PdAPdCPdGPdTOH 3 5PAPCPGPUOH 或5ACGTGCGT 3 5ACGUAUGU 3 ACGTGCGT ACGUAUGUT53OH U53OH OH OH OH OH 第24页,讲稿共84张,创作
13、于星期二5.2.4 核酸的结构核酸的结构第25页,讲稿共84张,创作于星期二一、一、DNADNA的的的的一级结构一级结构P159P1595.2.4.1 核酸的共价结构核酸的共价结构第26页,讲稿共84张,创作于星期二 由由四种脱氧核苷酸四种脱氧核苷酸dAMP,dGMP,dCMP,dTMP 通过通过通过通过3333,5555-磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键连接起来的多聚核苷酸链。连接起来的多聚核苷酸链。连接起来的多聚核苷酸链。连接起来的多聚核苷酸链。l l 脱氧核糖核酸的排列顺序脱氧核糖核酸的排列顺序脱氧核糖核酸的排列顺序脱氧核糖核酸的排列顺序可以用碱基排列顺序表示可以用碱基排列顺序表
14、示可以用碱基排列顺序表示可以用碱基排列顺序表示 ATCCGTGCCAATCCGTGCCAATCCGTGCCAATCCGTGCCA第27页,讲稿共84张,创作于星期二 连接键:连接键:连接键:连接键:3333,5-5-5-5-磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架碱基形成侧链碱基形成侧链碱基形成侧链碱基形成侧链 多核苷酸链均有多核苷酸链均有多核苷酸链均有多核苷酸链均有5-5-5-5-末端和末端和末端和末端和3 3 3 3-末端末端末端末端 DNADNA的碱基顺序本身就是遗传信
15、息存的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于寓于DNADNA分子中四种核苷酸千变万化的分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。不同排列组合之中。第28页,讲稿共84张,创作于星期二1961年,年,F.Jacob和和J.Monod提出了操纵子学提出了操纵子学说。阐明了原核生物基因表达调控的机制。说。阐明了原核生物基因表达调控的机制。原核生物原核生物原核生物原核生物第29页,讲稿共84张,创作于星期二基因(基因(genegene):一段有功能的:一段有功能的DNADNA片段,生物细胞中片段,生物细胞中DNADNA分子分子的最小功能单位
16、(交换单位)。的最小功能单位(交换单位)。外显子(外显子(exonexon):真核细胞的基真核细胞的基因在表达过程中能编码蛋白质因在表达过程中能编码蛋白质的核苷酸序列。的核苷酸序列。内含子(内含子(intronintron):在转录后的在转录后的加工中,从最初的转录产物除去加工中,从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。的内部的核苷酸序列。真核生物真核生物真核生物真核生物第30页,讲稿共84张,创作于星期二1.碱基组成碱基组成 A、G、C、U(AU/GC)稀有碱基较多,稀有碱基较多,稳定性较差,易水解稳定性较差,易水解2.多为单链结构,少数局部形成螺旋多为单链结构,少数局部形成螺旋3.分子较小
17、分子较小4.分类分类lmRNAltRNA lrRNAl其他其他RNA(hnRNA 核不均一核不均一RNA)()(snRNA核内小核内小RNA)二、二、RNARNARNARNA的的的的一级结构一级结构P173P173第31页,讲稿共84张,创作于星期二5.2.4.2 核酸的高级结构(三维结构)核酸的高级结构(三维结构)第32页,讲稿共84张,创作于星期二DNA的二级结构的二级结构P164 一,核酸化学结构和核苷酸键长与键角数据;一,核酸化学结构和核苷酸键长与键角数据;二,二,Chargaff提出的碱基配对原则;提出的碱基配对原则;三,三,DNA纤维的纤维的X射线衍射分析结果。射线衍射分析结果。一
18、、一、DNA的空间结构的空间结构第33页,讲稿共84张,创作于星期二 19531953年年,J.J.WatsonWatson和和F.F.CrickCrick 在在前前人人研研究究工工作作的的基基础础上上,提提出出了了著著名名的的DNADNA双双螺螺旋旋结结构构模模型型,并并对对模模型型的的生生物物学学意意义义作作出出了了科科学学的解释和预测。的解释和预测。DNA的双螺旋模型的双螺旋模型第34页,讲稿共84张,创作于星期二DNA双螺旋模型要点双螺旋模型要点2.0 nm小小沟沟大大沟沟1、DNA分子由两条分子由两条反向平行互补反向平行互补的多的多核苷酸链构成双螺旋结构。两条链围核苷酸链构成双螺旋结
19、构。两条链围绕同一个中心轴形成绕同一个中心轴形成右手螺旋右手螺旋,螺旋,螺旋表面有一条表面有一条大沟大沟和一条和一条小沟小沟。2、嘌呤碱和嘧啶碱层叠于螺旋内侧嘌呤碱和嘧啶碱层叠于螺旋内侧,碱基平面与纵轴垂直,碱基间的堆集距离碱基平面与纵轴垂直,碱基间的堆集距离为为0.34nm。磷酸和脱氧戊糖在外侧磷酸和脱氧戊糖在外侧,靠,靠酯键连接,形成酯键连接,形成DNA骨架,糖环平面骨架,糖环平面与中轴平行。与中轴平行。第35页,讲稿共84张,创作于星期二3 3、双螺旋直径为、双螺旋直径为2nm2nm,顺轴方向每隔顺轴方向每隔0.34nm0.34nm有有一个核苷酸,螺距为一个核苷酸,螺距为3.4nm3.4
20、nm。两个核苷酸之间。两个核苷酸之间的夹角为的夹角为3636,因此,沿,因此,沿中心轴中心轴每旋转一周有每旋转一周有1010个核苷酸个核苷酸。2.0 nm小小沟沟大大沟沟第36页,讲稿共84张,创作于星期二4 4、两条链间的碱、两条链间的碱基以嘌呤碱对嘧基以嘌呤碱对嘧啶碱,形成碱基啶碱,形成碱基对。配对原则是对。配对原则是A=TA=T,之间两个,之间两个氢键,氢键,CGCG,之,之间三个氢键。因间三个氢键。因此两条链形成反此两条链形成反向互补。向互补。在在DNADNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。第37页,讲稿共84张,创作于星期二碱碱
21、基基对对间间的的氢氢键键第38页,讲稿共84张,创作于星期二维持维持DNA双螺旋结构稳定的作用力:双螺旋结构稳定的作用力:1)氢键氢键 2)碱基堆积力碱基堆积力(疏水相互作用及范德华力)(疏水相互作用及范德华力)3)离子键离子键等等 DNA变性剂(脲变性剂(脲/酰胺、有机溶剂)、热、酰胺、有机溶剂)、热、pH、第39页,讲稿共84张,创作于星期二B型结构型结构 W and C 提出的模型提出的模型 在溶液中在溶液中A型结构型结构 碱基平面倾斜碱基平面倾斜20,螺旋变粗变短,螺旋变粗变短,螺距螺距23nm。脱水时、脱水时、DNA和和RNA杂交时杂交时Z型结构型结构 左手螺旋,锯齿状,细长而伸左手
22、螺旋,锯齿状,细长而伸展,只有小沟展,只有小沟DNADNA双螺旋构象的多态性双螺旋构象的多态性第40页,讲稿共84张,创作于星期二双螺旋双螺旋DNADNA的结构参数的结构参数类型旋转方向螺旋直径(nm)螺距(nm)每转碱基对数目碱基对间垂直距离(nm)碱基对与水平面倾角ADNABDNAZDNA右右左2.32.01.82.83.44.51110120.2550.340.372007第41页,讲稿共84张,创作于星期二噬菌体噬菌体T2DNA长约长约50m E-coli DNA 长约长约1mm 人类生殖细胞人类生殖细胞DNA长约长约1m 双链环状双链环状DNA(double stranded cyc
23、lic DNA,dscDNA)双链环状双链环状DNADNA在自然界也是广泛存在的,如一些病毒在自然界也是广泛存在的,如一些病毒DNADNA、一些噬菌体一些噬菌体DNADNA、细菌质粒、细菌质粒DNADNA、线粒体和叶绿体、线粒体和叶绿体DNADNA等。等。DNADNA的三级结构的三级结构P169P169大多数大多数DNA都是都是双链线状双链线状形式存在。形式存在。例如:例如:第42页,讲稿共84张,创作于星期二1 1共价闭合环状共价闭合环状DNADNA(covalently closed circular DNA,cccDNAcovalently closed circular DNA,ccc
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