蛋白质的生物合成修饰和分泌精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质的生物合成修饰和分泌第1页,讲稿共135张,创作于星期三本节课内容本节课内容蛋白质的合成蛋白质的合成蛋白质翻译后修饰蛋白质翻译后修饰蛋白质的折叠蛋白质的折叠蛋白质的靶向转运蛋白质的靶向转运第2页,讲稿共135张,创作于星期三DNA RNA ProteinNuclearmembraneTranscriptionTranscriptionRNA ProcessingRNA ProcessingTranslationTranslationDNAPre-mRNAmRNARibosomeProtein真核生物细真核生物细胞胞一、蛋白质的合成(翻译)一、蛋白质的合成(翻译)第3页,讲稿共135张
2、,创作于星期三 TranscriptionTranscriptionTranslationTranslationDNAmRNARibosomeProtein原核生物细胞原核生物细胞DNA RNA Protein第4页,讲稿共135张,创作于星期三蛋白质生物合成的概念蛋白质生物合成的概念 利用某一特定核苷酸序列的利用某一特定核苷酸序列的mRNAmRNA作为模板,合作为模板,合成相应氨基酸序列的多肽链的过程。成相应氨基酸序列的多肽链的过程。因为该过程将遗传信息从因为该过程将遗传信息从mRNAmRNA传递给了新合成传递给了新合成的蛋白质,的蛋白质,mRNAmRNA的核苷酸序列被转换成了蛋白质的核苷酸
3、序列被转换成了蛋白质中的氨基酸序列,所以该过程也被形象的称为中的氨基酸序列,所以该过程也被形象的称为翻译翻译。第5页,讲稿共135张,创作于星期三中心法则中心法则central dogma氨基端氨基端羧基端羧基端第6页,讲稿共135张,创作于星期三nDNA是遗传物质的携带者是遗传物质的携带者,并通过并通过RNA控制蛋白质的合成。控制蛋白质的合成。4种核苷酸种核苷酸VS20种氨基酸种氨基酸?物理学家物理学家Gamov通过数学推算,认为通过数学推算,认为3个核苷酸决定一个氨基酸,首次提出个核苷酸决定一个氨基酸,首次提出“密码密码”概念。概念。n大量实验证明大量实验证明mRNA上相邻三个碱基编码一种
4、氨基酸上相邻三个碱基编码一种氨基酸(AA),因,因而被称为而被称为碱基三联体碱基三联体或或密码子密码子。四种核苷酸,能有。四种核苷酸,能有43=64组密码组密码子。子。n1966年已经完全查清了年已经完全查清了20种基本氨基酸所对应的种基本氨基酸所对应的61个密码子,个密码子,其中有一个密码子也作为肽链合成的其中有一个密码子也作为肽链合成的起始密码子起始密码子,另外还有三另外还有三个个终止密码子终止密码子。n在遗传密码的破译中在遗传密码的破译中,美国科学家美国科学家M.W.NirenbergM.W.Nirenberg等人做出了等人做出了重要贡献重要贡献,于于19681968年获得了诺贝尔生理医
5、学奖年获得了诺贝尔生理医学奖.(一)遗传密码(一)遗传密码(genetic codegenetic code)第7页,讲稿共135张,创作于星期三第8页,讲稿共135张,创作于星期三(1)密码子的方向性()密码子的方向性(directivity)密码子的阅读方向及它们在密码子的阅读方向及它们在mRNA由起始信号到终止信由起始信号到终止信号的排列方向均为号的排列方向均为5-3,与,与mRNA链合成时的延伸方链合成时的延伸方向相同。向相同。(2)密码子的简并性()密码子的简并性(degeneracy)64-3=61个代表个代表20种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有一个
6、密码子。一个氨基酸可以有几个不同的密码子,编一个密码子。一个氨基酸可以有几个不同的密码子,编码同一个氨基酸的一组密码子称为码同一个氨基酸的一组密码子称为同义密码子。同义密码子。这种现这种现象称为象称为密码子的简并性,意义?密码子的简并性,意义?遗传密码的特点遗传密码的特点第9页,讲稿共135张,创作于星期三第10页,讲稿共135张,创作于星期三(3)密码子的连续性()密码子的连续性(commaless)从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存在间从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存在间隔(无标点),也无重叠。在隔(无标点),也无重叠。在mRNA分子上插入或删去一
7、个碱基,分子上插入或删去一个碱基,会使该点以后的读码发生错误,称为会使该点以后的读码发生错误,称为移码移码,由这种情况引起的突变由这种情况引起的突变称为称为移码突变。移码突变。(4)密码子的通用性()密码子的通用性(universal)各种低等和高等生物,包括病毒、细菌及真核生物,基本上共用各种低等和高等生物,包括病毒、细菌及真核生物,基本上共用同一套遗传密码。有例外:真核生物同一套遗传密码。有例外:真核生物线粒体线粒体DNA的编码方式与通常的编码方式与通常遗传密码有所不同。遗传密码有所不同。3 3 起始密起始密码子码子5 5 第11页,讲稿共135张,创作于星期三(5)密码子的摆动性()密码
8、子的摆动性(wobble )n如丙氨酸的密码子是如丙氨酸的密码子是GCU、GCC、GCA和和GCG,前两位碱基相前两位碱基相同,只第三位不同同,只第三位不同,显然密码子的专一性基本取决于,显然密码子的专一性基本取决于前两位碱基前两位碱基,第第三位碱基三位碱基有较大灵活性。有较大灵活性。ntRNA上的反密码子与上的反密码子与mRNA上的密码子配对时,密码子的第一位、上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的为密码的摆动性摆动性(wobble)。)。n在在tRNA反密码子中除反密
9、码子中除A、U、G、C四种碱基外,还经常在第一位出四种碱基外,还经常在第一位出现稀有碱基现稀有碱基次黄嘌呤(次黄嘌呤(I),次黄嘌呤可以和),次黄嘌呤可以和A、U、C配对,也配对,也是常见的摆动现象。是常见的摆动现象。第12页,讲稿共135张,创作于星期三密码子前两位碱基中单个碱基的变化通常产生不同的氨基酸,但是具有相同密码子前两位碱基中单个碱基的变化通常产生不同的氨基酸,但是具有相同密码子前两位碱基中单个碱基的变化通常产生不同的氨基酸,但是具有相同密码子前两位碱基中单个碱基的变化通常产生不同的氨基酸,但是具有相同的物理化学性质,如第二位碱基往往决定了氨基酸是极性还是非极性的,这的物理化学性质
10、,如第二位碱基往往决定了氨基酸是极性还是非极性的,这的物理化学性质,如第二位碱基往往决定了氨基酸是极性还是非极性的,这的物理化学性质,如第二位碱基往往决定了氨基酸是极性还是非极性的,这种一个氨基酸被另一个具有相似化学性质的氨基酸所替代的现象,称为种一个氨基酸被另一个具有相似化学性质的氨基酸所替代的现象,称为种一个氨基酸被另一个具有相似化学性质的氨基酸所替代的现象,称为种一个氨基酸被另一个具有相似化学性质的氨基酸所替代的现象,称为保守性保守性保守性保守性替换替换替换替换。AspAsp和和GluGlu相互替换,酸性氨基酸相互替换,酸性氨基酸第13页,讲稿共135张,创作于星期三(6)密码子的偏爱性
11、)密码子的偏爱性n同一个氨基酸有多个密码子,但对原核、酵母及哺同一个氨基酸有多个密码子,但对原核、酵母及哺乳动物细胞来说,其中有一两个是被优先选用的。乳动物细胞来说,其中有一两个是被优先选用的。n基因工程中,人工合成靶基因时尤其要注意在不基因工程中,人工合成靶基因时尤其要注意在不同同表达系统表达系统中选择不同的密码子。中选择不同的密码子。第14页,讲稿共135张,创作于星期三(7)起始密码子和终止密码子)起始密码子和终止密码子在在64种密码子中,种密码子中,AUG为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的起始密码子起始密码子,UAA、UAG、UGA为为终止密码子终止密
12、码子,不编码任何氨,不编码任何氨基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码子)。基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码子)。AUG 肽链内部肽链内部Met的密码子的密码子原核生物编码甲酰甲硫氨酸原核生物编码甲酰甲硫氨酸起始密码起始密码真核生物编码甲硫氨酸真核生物编码甲硫氨酸UAA,UGA,UAG:终止密码子:终止密码子第15页,讲稿共135张,创作于星期三(8)第二套密码系统)第二套密码系统tRNA氨基酸臂有一辅密码区,可被氨基酰氨基酸臂有一辅密码区,可被氨基酰-tRNA合成酶识别合成酶识别并决定并决定tRNA的特异性。的特异性。取代取代tRNALeu中反密码子以外的中反密码子以外的12个碱基
13、,能够使个碱基,能够使tRNALeu转转变为变为tRNASer。第16页,讲稿共135张,创作于星期三蛋白质合成概述蛋白质合成概述1.原料:氨基酸原料:氨基酸2.模板:模板:mRNA3.运载工具:运载工具:tRNA4.装配场所:核糖体装配场所:核糖体5.能量:能量:GTP,ATP6.酶:氨基酰酶:氨基酰tRNA合成酶;转肽酶合成酶;转肽酶7.蛋白因子:蛋白因子:起始、延长、终止各阶段均有蛋白因子参与,如果是真起始、延长、终止各阶段均有蛋白因子参与,如果是真核生物,则在这些因子前加核生物,则在这些因子前加“e”(eukaryotic),如:,如:eIF、eRF等。等。(二)蛋白质合成的分子基础(
14、二)蛋白质合成的分子基础总共需要大约总共需要大约200种生物大分子的参与种生物大分子的参与第17页,讲稿共135张,创作于星期三nmRNA(messenger RNA)的概念首先是由的概念首先是由Jacob和和Monod 1961年提出来的。年提出来的。nmRNA的半衰期很短,极不稳定,一旦完成其使命后很快就被水解掉。的半衰期很短,极不稳定,一旦完成其使命后很快就被水解掉。n原核生物和真核生物原核生物和真核生物mRNA的结构差异较大,尤其是在的结构差异较大,尤其是在5端。端。1.mRNA是蛋白质合成的模板是蛋白质合成的模板第18页,讲稿共135张,创作于星期三(1)5端端SD序序列列起起始始密
15、密码码子子AUG上上游游9-13个个核核苷苷酸酸处处,有有一一段段可可与与核核糖糖体体16SrRNA配配对对结结合合的的、富富含含嘌嘌呤呤的的3-9个个核核苷苷酸酸的的共共同同序序列列,一一般般为为AGGA,此此序序列列称称SD序序列列。它它与与核核糖糖体体小小亚亚基基内内16SrRNA的的3端端一一段段富富含含嘧嘧啶啶的的序序列列(称称反反SD序序列列)互互补补,形形成成氢氢键键,因因此此SD序序列列也也称称为为核核蛋蛋白白体体结结合合位位点点,SD序序列列使使得得结结合合于于30S亚亚基基上的起始上的起始tRNA能正确地定位于能正确地定位于mRNA的起始密码子的起始密码子AUG。(2)原原
16、核核mRNA分分子子,许许多多是是多多顺顺反反子子。原原核核生生物物一一条条连连续续的的mRNA链链往往往往为为功功能能相相关关的的几几种种蛋蛋白白质质(例例如如一一个个酶酶系系统统)编编码码。如如E.coli中一个中一个7000bp的的mRNA编码编码5种与色氨酸合成有关的酶。种与色氨酸合成有关的酶。原核生物原核生物mRNA的结构的结构第19页,讲稿共135张,创作于星期三(1)真真核核生生物物mRNA5端端有有m7GpppN帽帽子子结结构构,无无SD序序列列,3端端有有polyA尾巴。尾巴。帽帽子子结结构构具具有有增增强强翻翻译译效效率率的的作作用用。若若起起始始AUG与与帽帽子子结结构构
17、间间的的距距离离太太近近(小小于于12个个核核苷苷酸酸),就就不不能能有有效效利利用用这这个个AUG,而而从从下下游游适适当当的的AUG起起始始翻翻译译;当当距距离离在在17-80个个核核苷苷酸酸之之间间时时,离离体体翻翻译译效效率与距离成正比。率与距离成正比。真核生物真核生物mRNA的结构的结构(2)真核生物)真核生物mRNA通常是单顺反子。通常是单顺反子。真真核核mRNA具具有有“第第一一AUG规规律律”,即即当当5端端具具有有数数个个AUG时时,其其中中只只有有一一个个AUG作作为为开开放放阅阅读读框框架架的的翻翻译译起起点点,起起始始AUG具具有有两个特点:两个特点:nAUG上游的上游
18、的-3经常是嘌呤,尤其是经常是嘌呤,尤其是A;n紧跟紧跟AUG的的+4常常是常常是G。第20页,讲稿共135张,创作于星期三mRNAmRNA是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者n遗遗传传学学上上将将编编码码一一种种蛋蛋白白质质或或多多肽肽的的遗遗传传单单位位称称为为顺反子顺反子(cistron)(cistron)。n原原核核细细胞胞中中数数个个结结构构基基因因常常串串联联为为一一个个转转录录单单位位,转转录录生生成成的的mRNAmRNA可可编编码码几几种种功功能能相相关关的的蛋蛋白白质质,为多顺反子为多顺反子(polycistron)(polycistron)。n真真核核mRNAmRNA只只编
19、编码码一一种种蛋蛋白白质质,为为单单顺顺反反子子(single cistron)(single cistron)。第21页,讲稿共135张,创作于星期三原核生物的多顺反子原核生物的多顺反子真核生物的单顺反子真核生物的单顺反子非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPPPPP5 5 3 3 蛋白质蛋白质PPPPPPmG-5 5 3 3 蛋白质蛋白质第22页,讲稿共135张,创作于星期三开放读码框架开放读码框架(open reading frame,ORF)mRNA链上,从链上,从5至至3,以,以AUG为起点,每三个碱基作为起点
20、,每三个碱基作为一个密码子连续阅读,直至出现终止密码子,若编码的多为一个密码子连续阅读,直至出现终止密码子,若编码的多肽链有功能活性,则该段密码子就称为肽链有功能活性,则该段密码子就称为ORF。ORF之外的之外的序列并不组成密码子,称为非编码区,或者非翻译区序列并不组成密码子,称为非编码区,或者非翻译区(untranslatedregion,UTR).但但UTR并不是无功能的,往并不是无功能的,往往在翻译调控中具有重要的意义。往在翻译调控中具有重要的意义。第23页,讲稿共135张,创作于星期三tRNA(transferRNA)在蛋白质合成中,起着运载氨基酸的作用,在蛋白质合成中,起着运载氨基酸
21、的作用,按照按照mRNA链上的密码子所决定的氨基酸顺序将氨基酸转运到核糖体的特链上的密码子所决定的氨基酸顺序将氨基酸转运到核糖体的特定部位。定部位。同功受体同功受体tRNA:一种氨基酸可以有一种以上一种氨基酸可以有一种以上tRNA作为运载工具。把作为运载工具。把携带相同氨基酸而反密码子不同的一组携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA称为称为同功受体同功受体tRNA。反密码子反密码子(anticodon):tRNA分子上三个特定的碱基分子上三个特定的碱基组成一个反密码子,位于反密码子环上。组成一个反密码子,位于反密码子环上。2.tRNA转运活化的氨基酸至转运活化的氨基酸至mRNA模板上模板上
22、第24页,讲稿共135张,创作于星期三tRNA有两个关键部位:有两个关键部位:3端端CCA:接受氨基酸,接受氨基酸,形成氨酰形成氨酰-tRNA,需,需ATP提供活化氨基酸提供活化氨基酸所需的能量。所需的能量。与与mRNA结合部位结合部位-反密码子部位反密码子部位:tRNA的接头作用的接头作用35ICCA-OH53CCA-OHGGCCCG密码子与反密码子的密码子与反密码子的阅读方向均为阅读方向均为5 5 3 3,两者反向平行配对。两者反向平行配对。tRNA凭借自身的反密码子识别凭借自身的反密码子识别mRNA链上的密码子,把所链上的密码子,把所带氨基酸放到肽链的一定位置。带氨基酸放到肽链的一定位置
23、。第25页,讲稿共135张,创作于星期三tRNA 是密码子和氨基酸之间的中介是密码子和氨基酸之间的中介第26页,讲稿共135张,创作于星期三3.核糖体是蛋白质合成的工厂核糖体是蛋白质合成的工厂核糖体又称核蛋白体,它是核糖体又称核蛋白体,它是蛋白质合成的场所。蛋白质合成的场所。存在方式:存在方式:真核生物:游离核糖体或与内质网结合真核生物:游离核糖体或与内质网结合原核生物:游离核糖体或与原核生物:游离核糖体或与mRNA结合成串状的结合成串状的多核糖体(提高翻译多核糖体(提高翻译效率)。效率)。不论原核细胞还是真核细胞,一条不论原核细胞还是真核细胞,一条mRNA可以被同时几个核糖体阅可以被同时几个
24、核糖体阅读,把同时结合并翻译同一条读,把同时结合并翻译同一条mRNA的多个核糖体称为的多个核糖体称为多核糖体多核糖体。第27页,讲稿共135张,创作于星期三 多核糖体多核糖体n n一条一条一条一条mRNAmRNAmRNAmRNA链上链上链上链上同时具有同时具有许多个核糖体许多个核糖体许多个核糖体许多个核糖体(每隔(每隔(每隔(每隔80808080核苷酸有一个核糖体)核苷酸有一个核糖体)核苷酸有一个核糖体)核苷酸有一个核糖体)n n一条一条一条一条mRNAmRNA可同时合成可同时合成可同时合成可同时合成多条多肽链多条多肽链多条多肽链多条多肽链第28页,讲稿共135张,创作于星期三不同来源核糖体的
25、大小和不同来源核糖体的大小和RNA组成组成核糖体是由核糖体是由核糖核酸核糖核酸(称为核糖体核酸(称为核糖体核酸,rRNA)和几十种和几十种蛋白质分蛋白质分子子(核糖体蛋白)组成的一个巨大的复合体。不同类型生物中核糖体的结(核糖体蛋白)组成的一个巨大的复合体。不同类型生物中核糖体的结构高度保守,尽管其构高度保守,尽管其rRNA和核糖体蛋白的一级结构有所不同,但其和核糖体蛋白的一级结构有所不同,但其三级三级结构却惊人的相似结构却惊人的相似。第29页,讲稿共135张,创作于星期三小亚基小亚基大亚基大亚基核糖体核糖体头头颈颈体体脊脊鼻鼻柄柄mRNA结合位点,负责对模板结合位点,负责对模板mRNA序列特
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