蛋白质的结构和功能PPT (2)精选PPT.ppt
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1、关于蛋白质的结构和功能关于蛋白质的结构和功能PPT(2)第1页,讲稿共103张,创作于星期三第一章第一章 蛋白质的结构和功能蛋白质的结构和功能Structure and function of protein第2页,讲稿共103张,创作于星期三教学大纲教学大纲l l掌握掌握蛋白质的元素组成及特点、组成人体蛋蛋白质的元素组成及特点、组成人体蛋白质的基本单位白质的基本单位-氨基酸的种类及通式。氨基酸的种类及通式。l l掌握掌握蛋白质一、二、三、四级结构的概念及蛋白质一、二、三、四级结构的概念及其稳定因素、掌握蛋白质二级结构的基本形其稳定因素、掌握蛋白质二级结构的基本形式式,了解肽、肽键、肽单位、结
2、构域的概念了解肽、肽键、肽单位、结构域的概念.l l掌握掌握蛋白质(氨基酸)的等电点和两性电蛋白质(氨基酸)的等电点和两性电离、蛋白质变性及沉淀、盐析的概念。离、蛋白质变性及沉淀、盐析的概念。第3页,讲稿共103张,创作于星期三 第一节第一节 概述概述 蛋白质(蛋白质(Protein)是生命是生命的物质基础,是生物体的基本的物质基础,是生物体的基本组成成分之一,普遍存在于一组成成分之一,普遍存在于一切生物体中,占人体干重的切生物体中,占人体干重的45%,含量丰富、分布广泛、,含量丰富、分布广泛、种类繁多。种类繁多。第4页,讲稿共103张,创作于星期三蛋白质(protein)的功能n n生物体的
3、基本组成成分(占干重生物体的基本组成成分(占干重45%)n n参与物质代谢(酶的催化作用)参与物质代谢(酶的催化作用)n n参与机体防御(免疫球蛋白)参与机体防御(免疫球蛋白)n n参与调节与控制(激素、生长因子)参与调节与控制(激素、生长因子)n n参与凝血(凝血因子、纤维蛋白原)参与凝血(凝血因子、纤维蛋白原)n n参与转运和贮存(铁蛋白、运铁蛋白)参与转运和贮存(铁蛋白、运铁蛋白)n n参与肌肉收缩(肌动球蛋白)参与肌肉收缩(肌动球蛋白)n n参与信号传导(受体)参与信号传导(受体)n n第5页,讲稿共103张,创作于星期三 第二节第二节 蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成第6页,讲稿共1
4、03张,创作于星期三1.组成元素:组成元素:C(50-55%)H(6-7%)O(19-24%)N(13-19%)S(0-4%)P Fe Cu Zn Mn Co Mo I 2.特征性元素:特征性元素:氮:氮:16%每克样品含氮克数每克样品含氮克数6.25100=100克样品中蛋白质含量克样品中蛋白质含量(g)一、蛋白质的元素组成一、蛋白质的元素组成第7页,讲稿共103张,创作于星期三二、蛋白质的组成单位二、蛋白质的组成单位 -氨基酸氨基酸(amino acid,AA)2.1 结构结构 2.2 分类分类 2.3 理化性质理化性质第8页,讲稿共103张,创作于星期三H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通
5、式R2.1 氨基酸的结构氨基酸的结构第9页,讲稿共103张,创作于星期三 R|H2N-C-COOH|H 氨基酸结构通式氨基酸结构通式第10页,讲稿共103张,创作于星期三一些特殊结构的氨基酸n n-碳为非手性碳的氨基酸:碳为非手性碳的氨基酸:Glyn n芳香氨基酸:芳香氨基酸:PheTyrTrpn n含含-SH的氨基酸:的氨基酸:Cysn n含含-OH的氨基酸:的氨基酸:SerThrTyrn n含活性含活性-CH3的氨基酸:的氨基酸:Metn n含咪唑基的氨基酸:含咪唑基的氨基酸:Hisn n亚氨基酸:亚氨基酸:Pro第11页,讲稿共103张,创作于星期三 2.2 2.2 氨基酸的分类氨基酸的
6、分类 根据带电性质分:根据带电性质分:按酸碱性质,按酸碱性质,AAAA可分为:可分为:A.A.极性中性氨基酸极性中性氨基酸 B.B.酸性氨基酸酸性氨基酸 C.C.碱性氨基酸碱性氨基酸第12页,讲稿共103张,创作于星期三甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe P 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301、非
7、极性疏水性氨基酸、非极性疏水性氨基酸第13页,讲稿共103张,创作于星期三色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.60 2、极性中性氨基酸、极性中性氨基酸第14页,讲稿共103张,创作于星期三天冬
8、氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593、酸性氨基酸、酸性氨基酸4、碱性氨基酸碱性氨基酸第15页,讲稿共103张,创作于星期三 2.3 AA的理化性质的理化性质 2.3.1 两性解离及等电点两性解离及等电点 2.3.2 紫外吸收性质紫外吸收性质 2.3.3 茚三酮反应茚三酮反应第16页,讲稿共103张,创作于星期三 2.3.1 两性解离两性解离 氨基酸既可
9、解离成阳离子也可解氨基酸既可解离成阳离子也可解 离成阴离子的性质。离成阴离子的性质。两性解离的结构基础为所有两性解离的结构基础为所有AA 都含有碱性(都含有碱性(a-氨基)和酸性(氨基)和酸性(a-羧基)基团。羧基)基团。第17页,讲稿共103张,创作于星期三 等电点等电点(Isoelectric point,pI)在某一在某一pHpH时,氨基酸所带正负电荷相等,即时,氨基酸所带正负电荷相等,即正负电荷为零,此时的正负电荷为零,此时的pHpH称为该氨基酸的等电点称为该氨基酸的等电点或等离子点。用或等离子点。用pIpI表示表示氨基酸在等电点时氨基酸在等电点时 偶极离子存在偶极离子存在特点:静电荷
10、为零,电场中不移动;溶解度最小特点:静电荷为零,电场中不移动;溶解度最小第18页,讲稿共103张,创作于星期三n n*如何判断氨基酸在如何判断氨基酸在pHpH一定一定的溶液中所带的电荷?的溶液中所带的电荷?如何计算氨基酸的等电点?如何计算氨基酸的等电点?pI=pI=(pK1+pK2pK1+pK2)第19页,讲稿共103张,创作于星期三n n吸收峰:吸收峰:n n =280nmn n原因:原因:n n TrpTyrn n用途:用途:n n 测定蛋白质含量测定蛋白质含量 2.3.2 紫外吸收性质紫外吸收性质第20页,讲稿共103张,创作于星期三n n原理:原理:氨基酸与茚三酮水合物共热,生成兰氨基
11、酸与茚三酮水合物共热,生成兰紫色化合物,吸收峰在紫色化合物,吸收峰在570nm。n n用途:用途:2.3.3 茚三酮反应茚三酮反应 作为氨基酸定量分析的方法。作为氨基酸定量分析的方法。第21页,讲稿共103张,创作于星期三 2.1 组成成分:组成成分:单纯蛋白质单纯蛋白质 结合蛋白质:辅基(共价结合)结合蛋白质:辅基(共价结合)细胞色素、寡糖、脂类、磷酸、金属离子、核酸细胞色素、寡糖、脂类、磷酸、金属离子、核酸 2.2 分子形状:分子形状:纤维状蛋白质:胶原蛋白纤维状蛋白质:胶原蛋白 球状蛋白质:酶、免疫球蛋白、激素等球状蛋白质:酶、免疫球蛋白、激素等二、蛋白质的分类二、蛋白质的分类第22页,
12、讲稿共103张,创作于星期三 蛋白质的分子结构包括:蛋白质的分子结构包括:一级结构一级结构-基本结构(平面结构)基本结构(平面结构)二级结构二级结构 三级结构三级结构 高级结构或空间构象高级结构或空间构象 四级结构四级结构 (Conformation)第三节第三节 蛋白质的结构蛋白质的结构第23页,讲稿共103张,创作于星期三n n一、蛋白质的一级结构 又称为共价结构、化学结构。指蛋白质中氨基酸的排列顺序。化学键:肽键和二硫键n n特点:特点:n n 1 1)多样性)多样性n n 2 2)是空间结构和生物学功能的)是空间结构和生物学功能的基础,基础,但并不是决定空间构象的但并不是决定空间构象的
13、唯一因素唯一因素第24页,讲稿共103张,创作于星期三 1.1 肽键肽键(Peptide bond)1.2 肽肽(Peptide)1.3 多肽链多肽链(Polypeptide chain)1.4 生物活性肽生物活性肽 第25页,讲稿共103张,创作于星期三 1.1 肽键肽键(Peptide bond)一种氨基酸的一种氨基酸的-氨基与另一种氨基酸氨基与另一种氨基酸的的-羧基脱水缩合形成的酰胺键。羧基脱水缩合形成的酰胺键。第26页,讲稿共103张,创作于星期三+-HOHNH2-CH-C-N-CH-COOHHHHONH2-CH-CHOOH甘氨酸 NH-CH-CHOOHH甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键第27页
14、,讲稿共103张,创作于星期三 肽键肽键(peptide bond):):由一个氨由一个氨基酸的基酸的羧基羧基与另一个氨基酸的与另一个氨基酸的氨基氨基脱水缩合形成的化学键。脱水缩合形成的化学键。第28页,讲稿共103张,创作于星期三 特点:特点:A.由由C H O N 四个原子构成四个原子构成 B.共价键共价键 C.蛋白质分子的主键蛋白质分子的主键第29页,讲稿共103张,创作于星期三 肽键的键长为肽键的键长为0.132nm,0.132nm,介于介于单单键键(键长(键长 0.149nm0.149nm)与)与双键双键(键(键长长0.127 nm0.127 nm)之间。)之间。具双键的性质,即不能
15、自由旋转具双键的性质,即不能自由旋转。第30页,讲稿共103张,创作于星期三 1.2 肽肽(Peptide)氨基酸通过肽键相连而成的化合物。氨基酸通过肽键相连而成的化合物。分别称为二肽、三肽、四肽分别称为二肽、三肽、四肽,依此类推。,依此类推。寡肽寡肽(oligopeotide):10个氨基酸个氨基酸 多肽多肽(polypeptide):10个氨基酸个氨基酸 氨基酸残基氨基酸残基(AA residue):肽链中氨基酸肽链中氨基酸分子因脱水缩合而基团不全。分子因脱水缩合而基团不全。第31页,讲稿共103张,创作于星期三 1.3 多肽链多肽链(polypeptide chain)由由10个或个或1
16、0个以上氨基酸通过肽键连接而成个以上氨基酸通过肽键连接而成的链状化合物。的链状化合物。特点:特点:A.无分支无分支 B.两个末端:氨基末端(两个末端:氨基末端(N-端)端)羧基末端(羧基末端(C-端)端)书写时,书写时,N-端在左侧,端在左侧,C-端在右侧端在右侧 C.主链和侧链主链和侧链 D.是蛋白质的结构基础是蛋白质的结构基础 E.蛋白质和多肽的区别蛋白质和多肽的区别第32页,讲稿共103张,创作于星期三 R1O R2 OO R3 OO Rn H2N-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C-COO-H H H H H H H H H H H H H H 肽肽 链链第33页,讲稿共103张,
17、创作于星期三 1 1.4 生物活性肽(生物活性肽(生物体内有调节功能的肽)生物体内有调节功能的肽)生物体内有调节功能的肽)生物体内有调节功能的肽)A.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)由由谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸组成谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸组成的的三肽,功能基团为巯基。三肽,功能基团为巯基。生理功能生理功能 还原剂还原剂 保护机体免遭毒物损害保护机体免遭毒物损害第34页,讲稿共103张,创作于星期三二二.蛋白质的高级结构蛋白质的高级结构n n构型(构型(configurationconfiguration)是指在一个不对是指在一个不对称性的化合物中不对称中心上的几个原称性的化合
18、物中不对称中心上的几个原子或基团的空间排布方式。这种排列方子或基团的空间排布方式。这种排列方式的改变会牵涉到共价键的形成或破坏,式的改变会牵涉到共价键的形成或破坏,而与氢键无关,是一种两维的变化。例而与氢键无关,是一种两维的变化。例如单糖的如单糖的-、-型,氨基酸的型,氨基酸的L-L-、D-D-型型都是构型。都是构型。第35页,讲稿共103张,创作于星期三n构象(构象(conformationconformation)是表示一是表示一个分子结构中一切原子沿共价键个分子结构中一切原子沿共价键(单键)转动时而产生的不同空间(单键)转动时而产生的不同空间排列,它通常与分子的不对称性无排列,它通常与分
19、子的不对称性无关。这种排列的变化会涉及到氢键关。这种排列的变化会涉及到氢键等次级键的形成和破坏,而不改变等次级键的形成和破坏,而不改变共价键,这是三维空间的变化,如共价键,这是三维空间的变化,如多肽及蛋白质的高级结构即属于构多肽及蛋白质的高级结构即属于构象。象。第36页,讲稿共103张,创作于星期三共价键共价键次级键次级键化学键化学键 肽键肽键一级结构一级结构氢键氢键二硫键二硫键二、三、四级结构二、三、四级结构疏水键疏水键盐键盐键范德华力范德华力三、四级结构三、四级结构 维持蛋白质空间构象的化学键维持蛋白质空间构象的化学键二硫键二硫键第37页,讲稿共103张,创作于星期三 (一)蛋白质的二级结
20、构一)蛋白质的二级结构 Secondary structure 1.1 概念概念 1.2 肽单元肽单元(peptide unit)1.4 主要化学键主要化学键 1.3 主要形式主要形式氢键氢键第38页,讲稿共103张,创作于星期三 1.1 蛋白质二级结构的概念蛋白质二级结构的概念 指蛋白质分子内某一段肽链中的局指蛋白质分子内某一段肽链中的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,不含氨基酸残基侧链的相对空间位置,不含氨基酸残基侧链的构象。的构象。第39页,讲稿共103张,创作于星期三 1.2 肽单位肽单位 肽键中肽键中C-N的键长较短的键长较短(0.
21、132nm),具,具有部分双键性质,不能旋转,从而使参与肽键有部分双键性质,不能旋转,从而使参与肽键构成的构成的6个原子位于同一平面内,称为肽单位。个原子位于同一平面内,称为肽单位。第40页,讲稿共103张,创作于星期三肽平面肽平面第41页,讲稿共103张,创作于星期三第42页,讲稿共103张,创作于星期三 1.3 蛋白质二级结构的蛋白质二级结构的主要形式主要形式 1.3.1 -螺旋螺旋(-helix)1.3.2 -折叠折叠(-pleated sheet)1.3.3 -转角转角(-turn)1.3.4 无规卷曲无规卷曲(random coil)注:二级结构的形成是以一级结构为基础的注:二级结构
22、的形成是以一级结构为基础的 第43页,讲稿共103张,创作于星期三 1.3.1 -螺旋螺旋(-helix)A、右手螺旋、右手螺旋 B、侧链伸向螺旋外侧、侧链伸向螺旋外侧 C、螺距、螺距0.54nm,每,每3.6个氨基酸残基上升个氨基酸残基上升 一圈,每个氨基酸残基绕轴旋转一圈,每个氨基酸残基绕轴旋转100 D、每个肽键的亚氨基氢(、每个肽键的亚氨基氢(N-H)与前面第)与前面第 四个肽键的羰基氧(四个肽键的羰基氧(C=O)之间形成链)之间形成链 内内氢键氢键,氢键与螺旋长轴基本平行。,氢键与螺旋长轴基本平行。第44页,讲稿共103张,创作于星期三helix示意图示意图第45页,讲稿共103张,
23、创作于星期三-螺旋(螺旋(-helix)-helix)模型图模型图0.54nm3.6残基残基第46页,讲稿共103张,创作于星期三第47页,讲稿共103张,创作于星期三 1.3.2 -折叠折叠(-pleated sheet)A、锯齿状、充分伸展、锯齿状、充分伸展 B、侧链位于锯齿结构的上下方、侧链位于锯齿结构的上下方 C、多条、多条(段段)肽链平行排列,走向可相同也可肽链平行排列,走向可相同也可 相反相反 D、不同的肽链间(同一肽链的不同肽段间)的不同的肽链间(同一肽链的不同肽段间)的 N-H与与C=O形成形成氢键氢键。这些肽链的长轴互。这些肽链的长轴互 相平行,而氢键与长轴近似垂直。相平行,
24、而氢键与长轴近似垂直。第48页,讲稿共103张,创作于星期三氢键-pleated sheet第49页,讲稿共103张,创作于星期三1.3.3 -转角转角 (-turn)A、180o转角转角B、4个个AA残基残基C、氢键、氢键D、第二个残基、第二个残基 常为常为Pro第50页,讲稿共103张,创作于星期三1.3.3 无规则卷曲无规则卷曲 第51页,讲稿共103张,创作于星期三(二)(二)超二级结构和结构域超二级结构和结构域超二级结构超二级结构是指若干相邻的二级结指若干相邻的二级结构中的构象单元彼此相互作用,构中的构象单元彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认形成有规则的,在空间上能辨认的二级
25、结构组合体。是蛋白质二的二级结构组合体。是蛋白质二级结构至三级结构层次的一种级结构至三级结构层次的一种过过渡态构象层次渡态构象层次。第52页,讲稿共103张,创作于星期三n超二级结构常分为超二级结构常分为组合组合(组合由一个环连接两个连组合由一个环连接两个连续的反平行续的反平行-螺旋缠绕构成)螺旋缠绕构成)(二段平行的(二段平行的-折叠链和折叠链和-螺旋右手交连)、螺旋右手交连)、组合组合(三条反平行(三条反平行-折叠片构成)、折叠片构成)、-桶状桶状(持续的(持续的-折叠片构成)折叠片构成)等几种类型。等几种类型。第53页,讲稿共103张,创作于星期三第54页,讲稿共103张,创作于星期三结
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