(精品)第十三章基因表达的调节基因表达调节的基本概念及原理原核.ppt
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1、第十三章第十三章基因表达的调节基因表达的调节基因表达调节的基本概念及原理基因表达调节的基本概念及原理原核生物基因转录调节原核生物基因转录调节真核生物基因转录调节真核生物基因转录调节第第 一一 节节基本概念与原理基本概念与原理一、一、基本基本概念概念基因(基因(gene)一段编码蛋白质多肽链和功能一段编码蛋白质多肽链和功能RNA的的DNA片段。片段。基因组基因组(genome)一个细胞或病毒所携带的全部遗传一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。信息或整套基因。典型的基因表达是储典型的基因表达是储存遗传信息的基因,在一存遗传信息的基因,在一定调节机制控制下,经过定调节机制控制下,经过转录、
2、翻译,产生有生物转录、翻译,产生有生物活性的蛋白质或活性的蛋白质或成熟的成熟的rRNA和和tRNA的过程。的过程。基因表达基因表达基因表达转录翻译基因表达转录翻译 大肠杆菌基因组(约大肠杆菌基因组(约40004000个基因个基因),一般情况下只有,一般情况下只有5 510%10%在高水平转录状态,其它基因有的处于较低水平的在高水平转录状态,其它基因有的处于较低水平的表达,或者暂时不表达。表达,或者暂时不表达。人的基因组约含有人的基因组约含有1010万个基因,但在一个组织细胞中通万个基因,但在一个组织细胞中通常只有一部分基因表达,多数基因处在沉静状态,典型常只有一部分基因表达,多数基因处在沉静状
3、态,典型的哺乳类细胞中开放转录的基因约在的哺乳类细胞中开放转录的基因约在1 1万个上下,即使蛋万个上下,即使蛋白质合成量比较多、基因开放比例较高的肝细胞,一般白质合成量比较多、基因开放比例较高的肝细胞,一般也只有不超过也只有不超过20%20%的基因处于表达状态。的基因处于表达状态。生物基因组的遗传信息生物基因组的遗传信息并不是同时全部都表达出来的并不是同时全部都表达出来的二、基因表达的规律二、基因表达的规律 -时间性及空间性时间性及空间性(1 1)时间特异性)时间特异性按功能需要,某一特定基因的表达严格按按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生,称之为基因表达的特定的时间顺序发生
4、,称之为基因表达的时间时间特异性特异性。多细胞生物基因表达的时间特异性又称多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶阶段特异性段特异性。(2 2)空间特异性)空间特异性基基因因表表达达伴伴随随时时间间顺顺序序所所表表现现出出的的这这种种分分布布差差异异,实实际际上上是是由由细细胞胞在在器器官官的的分分布布决决定定的的,所以空间特异性又称所以空间特异性又称细胞或组织特异性细胞或组织特异性。在在个个体体生生长长全全过过程程,某某种种基基因因产产物物在在个个体体按按不不同同组组织织空空间间顺顺序序出出现现,称称之之为为基基因因表表达达的的空间特异性空间特异性。三、基因表达的方式三、基因表达的方式按对按对刺
5、激的反应性,基因表达的方式分为:刺激的反应性,基因表达的方式分为:(1 1)组成性表达)组成性表达某某些些基基因因在在一一个个个个体体的的几几乎乎所所有有细细胞胞中中持持续表达,通常被称为续表达,通常被称为管家基因管家基因。管家基因管家基因无无论论表表达达水水平平高高低低,管管家家基基因因较较少少受受环环境境因因素素影影响响,而而是是在在个个体体各各个个生生长长阶阶段段的的大大多多数数或或几几乎乎全全部部组组织织中中持持续续表表达达,或或变变化化很很小小。区区别别于于其其他基因,这类基因表达被视为他基因,这类基因表达被视为组成性基因表达组成性基因表达。组组成成性性基基因因表表达达只只受受到到启
6、启动动序序列列或或者者启启动动子子与与RNA聚合酶相互作用的影响。聚合酶相互作用的影响。组成性基因表达也是相对的,而不是一成不组成性基因表达也是相对的,而不是一成不变的,其表达强弱也是受一定机制调控的。变的,其表达强弱也是受一定机制调控的。(2 2)诱导和阻遏表达)诱导和阻遏表达适适应应性性表表达达指指环环境境的的变变化化容容易易使使其其表表达达水水平变动的一类基因表达平变动的一类基因表达。改变基因表达的情况以适应环境,例如与适改变基因表达的情况以适应环境,例如与适宜温度下生活相比较,在冷或热环境下适应生活宜温度下生活相比较,在冷或热环境下适应生活的动物,其肝脏合成的蛋白质图谱就有明显的不的动
7、物,其肝脏合成的蛋白质图谱就有明显的不同;长期摄取不同的食物,体内合成代谢酶类的同;长期摄取不同的食物,体内合成代谢酶类的情况也会有所不同。所以,基因表达调控是生物情况也会有所不同。所以,基因表达调控是生物适应环境生存的必需。适应环境生存的必需。是指在特定环境因素刺激下,可诱导基因被是指在特定环境因素刺激下,可诱导基因被激活,从而使基因的表达产物增加。激活,从而使基因的表达产物增加。如如:DNA发生损伤时,修复酶的基因被诱导激活。发生损伤时,修复酶的基因被诱导激活。诱导表达诱导表达 在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活,在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活,基因表达产物增加,这种基因称为基
8、因表达产物增加,这种基因称为可诱导基因可诱导基因。如如果果基基因因对对环环境境信信号号应应答答是是被被抑抑制制,这这种种基因是基因是可阻遏基因可阻遏基因。可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为阻遏阻遏。阻遏阻遏如:周围有充足的葡萄糖,细菌就可以利用葡萄如:周围有充足的葡萄糖,细菌就可以利用葡萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖类糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖类的酶类,如乳糖操纵子被阻遏、关闭。的酶类,如乳糖操纵子被阻遏、关闭。在在一一定定机机制制控控制制下下,功功能能上上相相关关的的一一组组基基因因,无无论论其其为为何何种种表表达达方方式式,均
9、均需需协协调调一一致致、共共同同表表达达,即即为为协协调调表表达达(coordinateexpression),这这种种调调节节称称为为协协调调节调调节(coordinateregulation)。1 1、基因表达的多级调控基因表达的多级调控四、基因表达调控的基本原理四、基因表达调控的基本原理基因基因激活激活转录起始转录起始转录后加工转录后加工mRNA降解降解蛋白质降解等蛋白质降解等蛋白质翻译蛋白质翻译翻译后加工修饰翻译后加工修饰转录水平的基因表达调控最重要转录水平的基因表达调控最重要 2 2、特异特异DNA序列对基因转录激活的调节序列对基因转录激活的调节基因转录激活调节基本要素基因转录激活调
10、节基本要素基基因因表表达达的的调调节节与与基基因因的的结结构构、性性质质,生生物物个个体体或或细细胞胞所所处处的的内内、外外环环境境,以以及及细细胞内所存在的转录胞内所存在的转录调节蛋白调节蛋白有关。有关。原核生物原核生物 操纵子操纵子(operon)(operon)机制机制 编码序列编码序列 启动序列启动序列 操纵序列操纵序列 其他调节序列其他调节序列共有序列共有序列决定启动序列的转录活性大小决定启动序列的转录活性大小。RNA聚合酶结合并启动转录的聚合酶结合并启动转录的特异特异DNA序列。序列。启动序列启动序列RNA转录起始转录起始-35区区-10区区TTGACATTAACTTTTACATA
11、TGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTACTGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AAAAAtrptRNATyrlacrecAAra BADTTGACATATAAT共有序列共有序列真核生物真核生物 顺式作用元件顺式作用元件可影响自身基因表达活性的可影响自身基因表达活性的DNA序列序列 顺式作用元件并非都位于转录起始点的上游顺式作用元件并非都位于转录起始点的上游(5(5端端)启动子启动子 增强子增强子 沉默子沉默子转录起始点转录起始点增强子增强子DNA编码序列编码序列启动子启动子顺式作用元件通常是基因的非编码序列。顺式作用元件通常是基因的非编码序列
12、。不不同同真真核核生生物物的的顺顺式式作作用用元元件件中中也也会会发发现现一一些些共共有有序序列列,如如TATA盒盒、CAAT盒盒等等,这这些些共共有有序序列列是是RNA聚聚合合酶酶或或特特异异转转录录因因子子的结合位点。的结合位点。3 3、调节蛋白对转录起始的调节、调节蛋白对转录起始的调节原核生物基因的调节蛋白原核生物基因的调节蛋白-DNA结合蛋白结合蛋白特异因子、阻遏蛋白、激活蛋白特异因子、阻遏蛋白、激活蛋白真核生物基因的调节蛋白真核生物基因的调节蛋白-反式作用因子反式作用因子与与DNA结合的调节蛋白结合的调节蛋白与蛋白质结合的调节蛋白与蛋白质结合的调节蛋白热休克反应热休克反应细菌的细菌的
13、RNA聚合酶聚合酶 70(启动常规基因表达)(启动常规基因表达)被被 32取代,从而启动另一套基因的表达。取代,从而启动另一套基因的表达。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol阻遏阻遏蛋白蛋白阻遏蛋白阻遏蛋白是由调节基因编码产生的调节是由调节基因编码产生的调节蛋白。专一与操纵基因(操纵序列)结合。蛋白。专一与操纵基因(操纵序列)结合。当当操操纵纵序序列列结结合合有有阻阻遏遏蛋蛋白白时时,会会阻阻碍碍RNA聚聚合合酶酶与与启启动动序序列列的的结结合合,或或是是RNA聚聚合合酶不能沿酶不能沿DNA向前移动向前移动,阻碍转录。,阻碍转录。操纵序列操纵序列 阻遏蛋白的结合位点阻遏
14、蛋白的结合位点 因因阻遏阻遏蛋白结合蛋白结合DNA产生的阻断转录调节产生的阻断转录调节作用称作用称负调节负调节。激激活活蛋蛋白白可可结结合合启启动动序序列列邻邻近近的的DNA序序列列,促促进进RNA聚聚合合酶酶与与启启动动序序列列的的结结合合,增增强强RNA聚合酶活性。聚合酶活性。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol激活蛋白激活蛋白激活蛋白激活蛋白是由调节基因编码产生的调节蛋白。是由调节基因编码产生的调节蛋白。因激活蛋白结合因激活蛋白结合DNADNA产生的增强转录调节产生的增强转录调节作用称作用称正调节正调节。有有些些基基因因在在没没有有激激活活蛋蛋白白存存在在时时,R
15、NA聚合酶很少或完全不能结合启动序列。聚合酶很少或完全不能结合启动序列。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol激活蛋白激活蛋白真核基因的调节蛋白真核基因的调节蛋白-反式作用因子(转录因子)反式作用因子(转录因子)由由某某一一基基因因表表达达产产生生的的蛋蛋白白质质因因子子,通通过过与与另另一一基基因因的的特特异异的的顺顺式式作作用用元元件件相相互互作作用用,调节其表达。这种调节作用称为调节其表达。这种调节作用称为反式作用反式作用。反式调节反式调节BAaDNAmRNA蛋白质蛋白质AA转录调节因子结构转录调节因子结构DNA结合域结合域转录激活域转录激活域蛋白质蛋白质结合域蛋白
16、质蛋白质结合域(二聚化结构域)(二聚化结构域)酸性激活域酸性激活域谷氨酰胺富含域谷氨酰胺富含域脯氨酸富含域脯氨酸富含域(1)调节蛋白与)调节蛋白与DNA的结合的结合大部分调节蛋白与大部分调节蛋白与DNA的结合为的结合为特异结合特异结合。调节蛋白中与调节蛋白中与DNA特异结合的结构域中有特征特异结合的结构域中有特征性的亚结构性的亚结构-即即结构模序结构模序。如:。如:螺旋螺旋-转角转角-螺旋螺旋(HTH)、)、锌指(锌指(zincfinger)、)、同质异形结构域同质异形结构域等。等。调节蛋白中的一些极性带电荷的氨基酸残基调节蛋白中的一些极性带电荷的氨基酸残基Asn、Gln、Glu、Arg、Ly
17、s与与DNA碱基形成碱基形成氢键氢键。螺旋螺旋-转角转角-螺旋(螺旋(HTH)由两个由两个7-9个氨基个氨基酸残基组成的酸残基组成的 螺旋。螺旋。一个用于识别一个用于识别DNA,结合在结合在DNA分子分子的大沟中。的大沟中。锌指(锌指(zincfinger)见于于TFA和和类固醇激素受体中,由一段富含半固醇激素受体中,由一段富含半胱氨酸的多胱氨酸的多肽链构成。每四个半胱氨酸残基或构成。每四个半胱氨酸残基或His残残基螯合一分子基螯合一分子Zn2+,其余其余约12-13个残基个残基则呈指呈指样突突出,出,刚好能嵌入好能嵌入DNA双螺旋的大沟中而与之相双螺旋的大沟中而与之相结合。合。每个蛋白每个蛋
18、白质分子中可含分子中可含2-9个个锌指指结构。构。常常结合结合DNA的的GC盒,也盒,也有与有与mRNA结合的功能。结合的功能。同质同质异形结构域异形结构域由由6060个氨基酸残基组成,结构与个氨基酸残基组成,结构与HTHHTH相相似似。在真核生物发育,如身体形成期间在真核生物发育,如身体形成期间起作用。起作用。编码这种结构域的编码这种结构域的DNADNA序列,叫做序列,叫做同同质异形盒质异形盒。(2 2)调节蛋白中)调节蛋白中 蛋白质蛋白质-蛋白质相互作用结构域蛋白质相互作用结构域绝绝大大多多数数调调节节蛋蛋白白质质结结合合DNA前前,需需通通过过蛋蛋白白质质-蛋蛋白白质质相相互互作作用用,
19、形形成成二二聚聚体体或或多多聚聚体体。(同质或异质)同质或异质)也也有有的的是是在在结结合合DNA前前,需需要要蛋蛋白白质质与与蛋蛋白质之间的解聚过程白质之间的解聚过程二聚体二聚体亮亮氨氨酸酸之之间间相相互互作作用用形形成成二聚体,形成二聚体,形成“拉链拉链”。肽肽链链氨氨基基端端2030个个富富含含碱碱性性氨氨基基酸酸结结构构域域与与DNA结结合。合。亮氨酸拉链亮氨酸拉链(zip)(zip)亮氨酸拉链亮氨酸拉链碱性螺旋碱性螺旋-环环-螺旋螺旋(HLH)可形成二聚体可形成二聚体由由50个氨基酸残基的个氨基酸残基的保守区组成保守区组成肽环长度可变肽环长度可变碱性螺旋与碱性螺旋与DNA结合结合4、
20、RNA聚合酶聚合酶DNA顺式作用元件、调节蛋白对转录顺式作用元件、调节蛋白对转录激活的调节最终是由激活的调节最终是由RNA聚活酶的活性聚活酶的活性体现的。体现的。启动子的结构、调节蛋白的性质对启动子的结构、调节蛋白的性质对RNA聚活酶活性影响最大。聚活酶活性影响最大。启动序列与启动序列与RNA聚合酶活性聚合酶活性 启动子有强弱只分,原核、真核启动子启动子有强弱只分,原核、真核启动子碱基碱基序列序列影响影响RNA聚合酶与其亲和力,进而影响转聚合酶与其亲和力,进而影响转录启动频率。录启动频率。启动子序列的差别,使细胞中不同的管家启动子序列的差别,使细胞中不同的管家基因在不同的水平表达。基因在不同的
21、水平表达。调节蛋白与调节蛋白与RNA聚合酶活性聚合酶活性启启动动序序列列决决定定基基础础转转录录频频率率,一一些些特特异异调调节节蛋蛋白白在在适适当当环环境境信信号号(如如诱诱导导剂剂和和阻阻遏遏剂剂等等)刺刺激激下下在在细细胞胞内内表表达达,然然后后通通过过DNA-蛋蛋白白质质、蛋蛋白白质质-蛋蛋白白质质相相互互作作用用影影响响RNA聚聚合合酶酶活活性性,使使基础转录频率发生变化,从而引起表达的变化。基础转录频率发生变化,从而引起表达的变化。第第 二二 节节 原核生物基因转录调节原核生物基因转录调节调节的主要环节在转录起始调节的主要环节在转录起始一、原核一、原核生物生物基因转录调节特点基因转
22、录调节特点(1 1)因子决定因子决定RNA聚合酶识别特异性聚合酶识别特异性只有一种只有一种RNA-pol,但是有很多种但是有很多种因子因子(2 2)操纵子模型的普遍性操纵子模型的普遍性 功能相关基因成簇串联通过单个启动子协调表达功能相关基因成簇串联通过单个启动子协调表达(3 3)阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性)阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性 原核生物主要以这种负调节方式为主原核生物主要以这种负调节方式为主二、乳糖操纵子调节机制二、乳糖操纵子调节机制(1 1)乳糖操纵子乳糖操纵子(laclac operonoperon)的结构的结构 结构基因结构基因Z Z:-半乳糖苷酶半乳糖苷酶Y Y:透酶透酶A A:
23、乙酰基转移酶乙酰基转移酶 调控区调控区CAPCAP结合位点结合位点启动序列启动序列操纵序列操纵序列Z ZY YA AO OP PDNADNAmRNA阻遏蛋白阻遏蛋白IDNAZYAOPpol没有乳糖存在时没有乳糖存在时(2 2)阻遏蛋白的负性调节阻遏蛋白的负性调节调节基因调节基因mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白有乳糖存在时有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录启动转录mRNA乳糖乳糖半乳糖半乳糖-半乳糖苷酶半乳糖苷酶CAP降解物基因活化蛋白降解物基因活化蛋白CAP-cAMP复合物复合物CAP+转录转录无葡萄糖,无葡萄糖,cAMP浓度高时浓度高时有葡萄糖,有葡萄糖,cAMP浓度低时浓度低时(3)CA
24、P的的正性调节正性调节ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP 调节基因转录翻译阻遏蛋白调节基因转录翻译阻遏蛋白R,R与操纵基与操纵基因结合,阻止结合在启动子上的因结合,阻止结合在启动子上的RNA-pol前移,前移,结构基因结构基因不被转录不被转录。1 1)无乳糖也无葡萄糖存在时:)无乳糖也无葡萄糖存在时:2 2)当无乳糖,有葡萄糖时:)当无乳糖,有葡萄糖时:由于葡萄糖不能使阻遏蛋白失活,乳糖操由于葡萄糖不能使阻遏蛋白失活,乳糖操纵子关闭,另外,由于有葡萄糖,纵子关闭,另外,由于有葡萄糖,cAMP含量含量低,低,CAP的正性调节不起作用。的正性调节不起作用。总结:总结:所以:无乳糖
25、时,无论有无葡萄糖,操纵子关闭所以:无乳糖时,无论有无葡萄糖,操纵子关闭OPOP 由于葡萄糖降解物能降低由于葡萄糖降解物能降低cAMP含量,不含量,不与与CAP形成复合物,形成复合物,CAP不能结合到启动子附不能结合到启动子附近,近,RNA聚合酶不能有效转录,使细菌只能利聚合酶不能有效转录,使细菌只能利用葡萄糖。用葡萄糖。3 3)既有乳糖,又有葡萄糖时:)既有乳糖,又有葡萄糖时:O 乳糖与阻遏蛋白结合,乳糖与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与操使阻遏蛋白变构,失去与操纵基因结合的能力而脱落。纵基因结合的能力而脱落。细胞内细胞内cAMP含量高,含量高,cAMP与与CAP结合成复合结合成复合物,
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