医学专题一土壤中分解尿素的细菌的分离和计数-上课用.ppt
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1、第一页,共三十八页。一、课题一、课题(kt)(kt)(kt)(kt)背景背景1 1、尿素、尿素(nio s)(nio s)(nio s)(nio s)的利的利用用 尿素尿素是一种重要的是一种重要的农业氮肥农业氮肥(dnfi)(dnfi)。尿素尿素不能直接不能直接被农作物被农作物吸收。吸收。土壤中的细菌将尿素土壤中的细菌将尿素分解成氨分解成氨之后之后才能被植物利用。才能被植物利用。2 2、细菌利用尿素的原因、细菌利用尿素的原因土壤中的细菌分解尿素是因为它们能合成土壤中的细菌分解尿素是因为它们能合成脲酶脲酶CO(NHCO(NH2 2)2 2脲酶脲酶+CO+CO2 2NHNH3 3+H2O第二页,共
2、三十八页。3 3、常见、常见(chn jin)(chn jin)(chn jin)(chn jin)的分解尿素的微生物的分解尿素的微生物 芽孢杆菌芽孢杆菌(gnjn)(gnjn)、小球菌、假单胞杆菌、小球菌、假单胞杆菌(gnjn)(gnjn)、克、克氏杆菌氏杆菌(gnjn)(gnjn)、棒状杆菌、棒状杆菌(gnjn)(gnjn)、梭状芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌(gnjn)(gnjn),某些真菌和放线菌也能分解尿素。,某些真菌和放线菌也能分解尿素。4 4、课题、课题(kt)(kt)(kt)(kt)目的目的从土壤中分离出能够分解尿素的细菌从土壤中分离出能够分解尿素的细菌统计每克土壤样品中究竟含有多少这
3、样的细菌统计每克土壤样品中究竟含有多少这样的细菌一一.研究思路研究思路.筛选菌株筛选菌株.统计菌落数目统计菌落数目.设置对照设置对照第三页,共三十八页。1 1、实例、实例(shl)(shl)(shl)(shl):启示:寻找目的菌种时要根据它对生存环境的启示:寻找目的菌种时要根据它对生存环境的要求,到相应要求,到相应(xingyng)(xingyng)的环境中去寻找。的环境中去寻找。问:问:如果如果(rgu)(rgu)请你寻找这种耐高温的酶,你会去哪请你寻找这种耐高温的酶,你会去哪里寻找?里寻找?DNADNA多聚酶链式反应多聚酶链式反应(PCRPCR)是一种在体外将是一种在体外将少少量量DNAD
4、NA大量复制大量复制的技术,此项技术要求使用的技术,此项技术要求使用耐高温耐高温的的DNADNA聚合酶聚合酶(93930 0C C)。.筛选菌株筛选菌株第四页,共三十八页。问:问:为什么为什么TaqTaq细菌细菌(xjn)(xjn)能从热泉中被筛选出来?能从热泉中被筛选出来?水生耐热细菌水生耐热细菌TaqTaq:美国科学家布鲁克于美国科学家布鲁克于19661966年在年在美国黄石国家美国黄石国家(guji)(guji)公园的一个热泉中发现,并分离公园的一个热泉中发现,并分离出耐高温的出耐高温的TaqDNATaqDNA聚合酶。聚合酶。第五页,共三十八页。原因:原因:因为热泉温度因为热泉温度707
5、080800 0C C,高温高温(gown)(gown)淘汰淘汰了绝大多数微生物(了绝大多数微生物(不耐热不耐热),只有),只有TaqTaq细菌被细菌被筛选出来。筛选出来。【研究【研究(ynji)(ynji)(ynji)(ynji)思路】思路】(一)筛选(一)筛选(shixun)(shixun)菌菌株株原理:原理:人为提供有人为提供有利于目的菌株利于目的菌株生长的条件生长的条件(包括营养、温度、(包括营养、温度、PHPH等),同时等),同时抑抑制或阻止制或阻止其他微生物生长。其他微生物生长。有选择作用第六页,共三十八页。要分离一种微生物,必须根据该微生物的特点,要分离一种微生物,必须根据该微生
6、物的特点,包括营养、生理、生长条件等;配置合适的培养基包括营养、生理、生长条件等;配置合适的培养基方法:方法:抑制抑制(yzh)(yzh)大多数微生物生长大多数微生物生长 造成有利于该菌生长的环境,造成有利于该菌生长的环境,结果:结果:培养一定时间后,该菌数量上升,再通过稀释涂培养一定时间后,该菌数量上升,再通过稀释涂布平板法等方法对它进行纯化培养分离。布平板法等方法对它进行纯化培养分离。2、实验室中微生物的筛选、实验室中微生物的筛选(shixun)(shixun)原理:原理:第七页,共三十八页。15.0g15.0g琼脂琼脂1.0g1.0g尿素尿素10.0g10.0g葡萄糖葡萄糖0.2g0.2
7、gMgSOMgSO447H7H2 2OO2.1g2.1gNaHNaH2 2POPO4 41.4g1.4gKHKH2 2POPO4 43 3、土壤中分解土壤中分解土壤中分解土壤中分解(fnji)(fnji)(fnji)(fnji)尿素的细菌的分离与计数所需培养基:尿素的细菌的分离与计数所需培养基:尿素的细菌的分离与计数所需培养基:尿素的细菌的分离与计数所需培养基:从物理性质从物理性质(wl xngzh)(wl xngzh)看此培养基属于哪类?从功看此培养基属于哪类?从功能上能上属于哪类培养基?属于哪类培养基?固体固体(gt)(gt)培养基培养基在此培养基中哪些作为碳源、氮源?在此培养基中哪些作为
8、碳源、氮源?碳源:碳源:葡萄糖、尿素葡萄糖、尿素 氮源:氮源:尿素尿素选择培养基选择培养基第八页,共三十八页。培养基的培养基的氮源为尿素氮源为尿素,只有能只有能合成脲酶合成脲酶的微生物才的微生物才能利用尿素作为氮源而生存能利用尿素作为氮源而生存。缺乏缺乏脲酶的微生物由于不能分解尿素,缺乏氮源脲酶的微生物由于不能分解尿素,缺乏氮源而不能生长发育繁殖,而受到抑制,所以而不能生长发育繁殖,而受到抑制,所以(suy)(suy)用此用此培养基就能够选择出分解尿素的微生物。培养基就能够选择出分解尿素的微生物。4 4、该培养基如何将分解尿素、该培养基如何将分解尿素(nio s)(nio s)(nio s)(
9、nio s)的细菌选择出来?的细菌选择出来?选择培养基:选择培养基:在微生物学中,将允许特定种类在微生物学中,将允许特定种类(zhngli)(zhngli)的微生物生长,同时抑制或阻止其他种类的微生物生长,同时抑制或阻止其他种类(zhngli)(zhngli)微生物生长的培养基。微生物生长的培养基。第九页,共三十八页。组别组别培养基类型培养基类型是否涂是否涂布接种布接种目目 的的实验组实验组以尿素为唯一氮源以尿素为唯一氮源的选择性培养基的选择性培养基是是对照组对照组牛肉膏蛋白胨牛肉膏蛋白胨培养基培养基是是分离尿素分离尿素(nio s)细菌细菌用以判断用以判断(pndun)选择性选择性培养基是否
10、具有选择性培养基是否具有选择性对设计实验对设计实验(shyn)的训练的训练第十页,共三十八页。对照组对照组牛肉牛肉(ni ru)(ni ru)膏蛋白胨培养基膏蛋白胨培养基 实验组实验组以尿素以尿素(nio s)(nio s)为氮源的培养为氮源的培养基基第十一页,共三十八页。【统计【统计(tngj)(tngj)(tngj)(tngj)菌落数目】菌落数目】常用方法:常用方法:稀释涂布平板法稀释涂布平板法、显微镜直接、显微镜直接计数法,计数法,还可以还可以(ky(ky)用过滤膜法用过滤膜法1 1、稀释、稀释(xsh)(xsh)(xsh)(xsh)涂布平板法涂布平板法(也叫活菌计数(也叫活菌计数法)法
11、)(1 1)原理原理:当样品的稀释度足够高时,培:当样品的稀释度足够高时,培养基表面生长的一个菌落,来源于样品稀释养基表面生长的一个菌落,来源于样品稀释液中的一个活菌,通过统计平板上的菌落数,液中的一个活菌,通过统计平板上的菌落数,就能推测出样品中大约含有多少活菌。就能推测出样品中大约含有多少活菌。1 1个菌落个菌落=1=1个活菌个活菌 第十二页,共三十八页。稀释稀释(xsh)(xsh)(xsh)(xsh)涂布平板法。涂布平板法。(2 2)操作方法:稀释涂布平板)操作方法:稀释涂布平板 统计统计(tngj)(tngj)菌落数。菌落数。(3 3)统计原则)统计原则 、选、选 30 30300 3
12、00 个菌落的平板统计。个菌落的平板统计。、每个稀释度取、每个稀释度取3 3个平板取其平均值个平板取其平均值。(4 4)统计结果:统计的菌落数往往比活菌的实际数目统计结果:统计的菌落数往往比活菌的实际数目低低,因此因此(ync)(ync)统计结果一般用统计结果一般用菌落数菌落数来来表示。表示。第十三页,共三十八页。同学同学平板平板1 1平板平板2 2平板平板3 3平均数平均数评价评价甲甲230230230230乙乙2121212212256256163163结论结论启示启示没有设置重复组,因此结果没有设置重复组,因此结果(ji gu)不具说服力。不具说服力。1 1个平板的计数结果与另个平板的计
13、数结果与另2 2个个相差相差(xin ch)(xin ch)太远,说明在操太远,说明在操作过程作过程中可能出现了错误。中可能出现了错误。不能简单地将不能简单地将3 3个平板的计数值个平板的计数值(shz)(shz)用来求平均值。用来求平均值。在设计实验时,一定要涂布至少在设计实验时,一定要涂布至少3 3个平板,作为重复组,才能个平板,作为重复组,才能增强实验的说服力与准确性增强实验的说服力与准确性。在分析实验结果时,一定要考虑。在分析实验结果时,一定要考虑所设置的重复组的结果是否一致,结果不一致,意味着操作有误,需要重新实验。所设置的重复组的结果是否一致,结果不一致,意味着操作有误,需要重新实
14、验。统计菌落数目统计菌落数目 P22第十四页,共三十八页。注意事项注意事项为了保证结果准确,一般选择菌落数在为了保证结果准确,一般选择菌落数在3030300300的平板上进行计数。的平板上进行计数。为使结果接近真实值可将为使结果接近真实值可将同一稀释度加到三个同一稀释度加到三个或三个以上的平皿中或三个以上的平皿中,经涂布,培养计算出菌落,经涂布,培养计算出菌落平均数。平均数。统计的菌落往往统计的菌落往往(wngwng)(wngwng)(wngwng)(wngwng)比活菌的实际数目低。比活菌的实际数目低。涂布平板法所选择的稀释度很重要,一般以三个涂布平板法所选择的稀释度很重要,一般以三个稀释度
15、中的第二个稀释度所出现的平均菌落数在稀释度中的第二个稀释度所出现的平均菌落数在5050个左右为最好。个左右为最好。第十五页,共三十八页。(三)设置(三)设置(shzh)(shzh)对照对照 在做本课题的实验时,在做本课题的实验时,A A 同学从对应同学从对应10106 6倍稀释的培养基中筛选出大约倍稀释的培养基中筛选出大约150150个菌落。但是,其他同学在同样的稀释度下只选择出大约个菌落。但是,其他同学在同样的稀释度下只选择出大约5050个菌落。个菌落。其他同学认为其他同学认为A A同学的结果有问题。他们分析可能是同学的结果有问题。他们分析可能是A A同学的培养基被杂同学的培养基被杂菌污染菌
16、污染(wrn)(wrn)了,或者培养基中混入了其他含氮物质,因而导致不能分解了,或者培养基中混入了其他含氮物质,因而导致不能分解尿素的细菌也能在该培养基上生长。尿素的细菌也能在该培养基上生长。但是,但是,A A同学确信自己的实验操作准确无误,与其他同学的结果之所以不相同学确信自己的实验操作准确无误,与其他同学的结果之所以不相同,是因为自己所选用的土壤样品不同。但是,同,是因为自己所选用的土壤样品不同。但是,A A同学在设计实验的时候并没有设同学在设计实验的时候并没有设置对照,因而此时也拿了不出令人信服的证据。置对照,因而此时也拿了不出令人信服的证据。你能通过设置对照,帮助你能通过设置对照,帮助
17、A A同学学排除上述两个可能影响实验结果的同学学排除上述两个可能影响实验结果的因素吗?因素吗?第十六页,共三十八页。设置对照的主要目的设置对照的主要目的是排除实验组中非测试因素是排除实验组中非测试因素对实验结果的影响对实验结果的影响(yngxing)(yngxing),提高实验结果的可信度。,提高实验结果的可信度。.设置设置(shzh)(shzh)对照:对照:设置对照设置对照(duzho)的方法:的方法:空白对照:不给对照组任何处理因素。空白对照:不给对照组任何处理因素。条件对照:给对照组施以部分实验因素,但不是所要研究的条件对照:给对照组施以部分实验因素,但不是所要研究的 处处理因素。理因素
18、。自身对照:对照组和实验组都在同一研究对象上进行。自身对照:对照组和实验组都在同一研究对象上进行。相互对照:不单设对照组,而是几个实验组相互对照。相互对照:不单设对照组,而是几个实验组相互对照。A A同学的结果与其他同学不同,可能的解释有两种。同学的结果与其他同学不同,可能的解释有两种。一是由于土样不同一是由于土样不同;二是由于培养基污染或操作失误二是由于培养基污染或操作失误。第十七页,共三十八页。小结:通过小结:通过(tnggu)这个事例可以看出,实验结果要这个事例可以看出,实验结果要有说服力,对照的设置是必不可少的。有说服力,对照的设置是必不可少的。方案方案(fng n)一:一:由其他同学
19、用与由其他同学用与A同学相同土样进行实验同学相同土样进行实验 方案二:方案二:将将A同学配制的培养基在不加土样的情况同学配制的培养基在不加土样的情况下进行培养,作为下进行培养,作为(zuwi)空白对照,以证明培养基是空白对照,以证明培养基是否受到污染。否受到污染。结果预测:结果预测:如果结果与如果结果与A同学一致,则证明同学一致,则证明A无误;如无误;如果结果不同,则证明果结果不同,则证明A同学存在操作失误或培养基的配同学存在操作失误或培养基的配制有问题。制有问题。第十八页,共三十八页。二二.实验的具体操作实验的具体操作 .土壤取样土壤取样 从肥沃、湿润的土壤中取样。先铲去表层土从肥沃、湿润的
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