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1、附件1:科技报告格式模板科技报告编号科技报告编号公开范围延迟期限科技报告报告名称:支持渠道:编制单位:编制时间:承诺书本人完全了解国家科技报告的有关规定，同意国家按照规定收藏使用科技报 告，并承诺本科技报告中所有的研究内容和数据信息真实可靠。如有失实，本人 承当相关责任。课题负责人：报告编制人：年 月 日10科技报告案例报告编号：717815901-2009ZX10004206-01科技报告报告名称：呼吸道病毒件传染病病原谱流行规律及变异研究支持渠道：国家科技重大专项编制单位：中国医学院病原生物学研究所编制时间：2010年12月11科技报告基本信息表L报告名称呼吸道病毒性传染病病原谱流行规律及

2、变异研究2 .报告作者及单位XXX,中国医学科学院病原生物学研究所3 .公开范围4 .编制时间公开2010125.报告编号717815901-2009ZX10004206-016洛注无7.摘要本研究通过对呼吸道样本病毒谱的分析，首次系统揭示了以北京、ft东地区为代表的华 北地区急性呼吸道感染中常见呼吸道病毒的流行地域、季节和年龄分布特征；系统揭示 包括流感病毒、偏肺病毒、腺病毒、肠道病毒和冠状病毒等的基因变异及规律；首次发 现一批国外已报道、但国内流行情况不明的病毒包括C组鼻病毒，Wu、KI多瘤病毒和博 卡病毒3型和一些新的肠道病毒基因型等。这些基线数据为呼吸道突发疫情排查、鉴定， 开展病原监

3、测及未来诊断提供依据和基础，并为呼吸道传染病的异常流行的预警提供依 据。创新性的将国际前沿病原组合检测鉴定技术引入监测技术体系，实现从致病病 原的检测到条件致病病原的发现和泛病原体检测的跨越，为我国呼吸道病毒监测技术体 系的升级、换代并与国际先进水平接轨打下基础。应用已建立技术平台承当并圆满完成 国家应急检测任务，并打造了一支熟悉国情、技术过硬同时又具有国际视野的队伍。8.关键词：呼吸道病毒，病毒谱，病原学，变异，进化9.支持渠道工程（课题）名称呼吸道病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究主管部门卫生部计划名称国家科技重大专项工程（课题）编号2009ZX10004206科技领域生物医药承相单位中

4、国医学科学院病原牛物学研究所合作单位（不超过5家）北京市疾病预防控制中心；中国医学科学院北京协和医 院；首都医科大学附属北京儿童医院；首都医科大学附属 北京朝阳医院：北乐大学人民医院总经费X X万元国拨经费X X万元负责人XXX起止日期2009-1 至 2010-1210.联系人姓名XXX由话 XXXE-MailXXX单位中国医学科学院病原生物学研究所12引言11 .呼吸道病毒感染病原谱的研究（华北地区）3研究背景31.1 技术方案3技术路线流程图31.1.1 病例定义4样本的采集和前处理41.1.2 检测内容及方法4研究结果82 .常见重要呼吸道病毒在我国流行特征的系统研究9冠状病毒102.

5、1 腺病毒12副流感病毒152.2 偏肺病毒16呼吸道合胞病毒193 .新发现呼吸道病毒在我国流行情况的研究20C组鼻病毒203.1 新型多瘤病毒24博卡病毒263.2 肠道病毒EV68和CA21型284 .重要呼吸道病毒的变异变迁特征的初步揭示31偏月市病毒314.1 博卡病毒34流感病毒355 .呼吸道病毒抗体人群血清流行率的研究376,泛病原体监测技术在呼吸道传染病监测中的建立和应用387 .样本资源库的建设398.结论和建议4113插图清单图1.冠状病毒流行季节性分布12图2.腺病毒基因进化分析14图3,腺病毒流行季节性分布14图4.副流感病毒的季节性分布16图5. 偏肺病毒的季节性分

6、布18图6,呼吸道合胞病毒各基因型的季节流行特点19图7.HRV-C抗原基因进化分析21图8.C种鼻病毒（BCH019）抗原蛋白VP1空间模拟图22图9.鼻病毒在成人（a）和儿童（b）急性呼吸道感染病例中的季节性分布特点.24图10.博卡病毒抗原基因VP1/2的进化分析28图11.成人急性呼吸道感染呼吸道样本中EV的血清型分布29图12. EV68和CA21的季节分布30图13 .偏肺病毒各亚型流行情况33图14 .偏肺病毒分子进化分析33图15.偏肺病毒群体动力学分析34图16 .偏肺病毒地理传播模式分析34图17. 3型博卡病毒的基因变异重组分析35图18.流感病毒各亚型的季节性流行情况3

7、6图19,2009甲型H1N1流感病毒流行期间各亚型的季节性流行情况36图20.流感病毒各亚型和其他呼吸道病毒的季节性流行情况37图21.偏肺病毒和呼吸道合胞病毒抗体血清流行病学分析38图22.呼吸道样本宏基因组分析39图23.入组病例临床信息表及存量记录表4014附表清单表1,呼吸道病毒核酸检测引物信息及扩增条件6表2.冠状病毒阳性病例的各年检出情况10表3.冠状病毒阳性病例在不同年龄人群中的检出情况11表4.冠状病毒阳性者临床表现和特点11表5.腺病毒验证引物序列13表6.副流感病毒感染的临床表现特点15表7,副流感病毒的共检出16表8.偏肺病毒在呼吸道感染病例中的临床特点18表9.鼻病毒

8、感染临床表现23表10.急性呼吸道感染病例WU/KI多瘤病毒阳性病例临床表现25表11.博卡病毒在急性胃肠炎病例粪便样本中的检出情况27表12 .博卡病毒在呼吸道感染病例中的临床特点28表13.成人急性呼吸道感染样本中肠道病毒CA21与EV68的检出情况30表14.CA21与EV68阳性病例的临床表现30表15.2007-2009年甲型H1N1流感病毒回顾性筛查结果4215呼吸道病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究引言传染病一直是人类健康的重大威胁，病毒是人类传染病的重要病原体，而呼 吸道传染病相关病毒因其传播快、流行广等特点对社会生活的危害尤其巨大，如历 史上流感病毒曾引起三次全球流感大流行

9、，2003年SARS冠状病毒突发流行，高 致病性禽流感病毒的肆虐以及肠道病毒EV71的影响等。每一次新发、突发传染 病的出现都对人们的健康、生活秩序和经济开展造成不同程度的影响。特别是当短 时间内不能明确病原时，常引起社会的不安和恐慌，甚至危及国家平安。随着我国 参与全球性活动的日益频繁，对传染病的防控能力提出了更高的要求。因此，如何 在传染病发生的早期，在最短的时间内确定病原体的种类，对传染病的预防控制至 关重要，更是国家公共卫生水平和综合科技能力的表达。我国目前在呼吸道病毒的监测方面已经有了一定的积累，但是尚缺乏系统、 全面的人群呼吸道病毒本底情况的检测数据，缺少对新发现病毒流行情况的本底

10、 调查，不利于及时发现传染病的新流行态势。因此，开展全人群的常见呼吸道病毒 的筛查，充分了解常见呼吸道病毒的流行特点和变异规律，通过对呼吸道病毒的变 异监测，说明相关病原的流行优势型别、病原基因变异和重要位点的变异及其意义, 结合流行病学和临床分析病原变迁有助于及时发现传染病新的流行态势。我国目前 在应对突发和不明原因传染病的技术体系已经建立，但尚不系统。因此，开展突发 和不明原因传染病监测研究，说明新发突发传染病的相关病原，并对其流行进 行预测和预警，以探索建立有效的突发和不明原因传染病的监测、防控和研究策 略，锻炼和提升突发传染病事件中病因快速鉴定和应急反响的能力。本研究作为传染病防治重大

11、专项“传染病监测技术平台”的一局部，根据总 体部署重点加强呼吸道病毒检测技术能力的建设。通过集成现有的先进技术，对 患呼吸道感染的广泛人群（成人和儿童）开展常见呼吸道病原谱的筛查，建立和 完善呼吸道病毒检测体系；通过对呼吸道感染样本中常见呼吸道病毒的检测，明 确各种呼吸道病原的季节流行情况，提供本底数据和了解常见呼吸道病原的疾病 负担，为我国呼吸道病毒感染的预防控制提供基础数据，为呼吸道传染病的监测 预警提供依据；通过大规模重点基因和全长基因组序列测定，对重要呼吸道病毒 基因的生物信息学分析，明确研究期间病毒基因的变异情况；通过对重要呼吸道（以下局部略去）16A呼吸道症候群监测数据统计分析报告

12、17参考文献11J. Coiras MT, Perez-Brena P, Garcia ML, Casas I. Simultaneous detection of influenza A,B, and C viruses, respiratory syncytial virus, and adenoviruses in clinical samples by multiplex reverse transcription nested- PCR assay. J Med Virol. 2003, 69: 132-144.2 . Coiras MT, Aguilar JC, Garci a M

13、L, Casas I, Pe rez-Brena P. Simultaneous detection of fourteen respiratory viruses in clinical specimens by two multiplex reverse transcription nested- PCR assays. J Med Virol. 2004, 72: 484-495.3J. Woo PC, Lau SK, Chu CM, et al. Characterization and complete genome sequence of a novel coronavirus,

14、coronavirus HKU1, from patients with pneumonia. J Virol. 2005, 79: 884- 895.4 . Allard AK, Girones R, Juto P, Wadell G. Polymerase chain reaction for detection of adenoviruses in stools. J Clin Microbiol. 1990, 28: 2659-2667.5 . Human Bocaviruses Are Highly Diverse, Dispersed Recombination Prone, an

15、d Prevalent in Enteric Infections. J Infect Dis. 2010, 201: 1633-1643. Ren L, Gonzalez R, Xu J, Xiao Y, Li Y, Zhou H, Li J, Yang Q, Zhang J, Chen L, Wang W, Vernet G, Paranhos-BaccalaG, Wang Z, Wang J. Prevalence of human coronaviruses in adults with acute respiratory tract infections in Beijing, Ch

16、ina. J Med Virol. 2011, 83: 291-297.6 . Metzgar D, Osuna M, Kajon AE, Hawksworth AW, Irvine M, Russell KL. Abrupt emergence of diverse species B adenoviruses at US military recruit training centers. J Infect Dis. 2007, 196:1465-1473.7 . Ren L, Gonzalez R, Xie Z, Xiong Z, Liu C, Xiang Z, Xiao Y,Li Y,

17、Zhou H, Li J, Yang Q, Zhang J, Chen L, Wang W, Vernet G, Paranhos-Baccala G, Shen K, Wang J. Human parainfluenza virus type 4 infection in Chinese children with lower respiratory tract infections: A comparison study. J Clin Virol. 2011, 51: 209-212.8 . Li J, Wang Z, Gonzalez R, Xiao Y, Zhou H, Zhang

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19、, Wang Z, Wang J. Prevalence and clinical characteristics of human respiratory syncytial virus in Chinese adults with acute respiratory tract infection. J Med ViroL 2013, 85:348-353.10 . McErlean P, Shackelton LA, Lambert SB, Nissen MD, Sloots TP, Mackay IM. Characterization of a newly identified hu

20、man rhinovirus, HRV-QPM, discovered in infants with bronchiolitis. J Clin Virol. 2007, 39: 67-75.11 . Kistler A, Avila PC, Rouskin S, Wang D, Ward T, Yagi S, et al. Panviral screening of respiratory tract infections in adults with and without asthma reveals unexpected human coronavirus and human rhi

21、novirus diversity. J Infect Dis. 2007, 196: 817-825.12 . Lau SKP, Yip CC, TsoiHW, Lee RA, So LY, Lau YL, et aL Clinical features and complete genome characterization of a distinct human rhinovirus (HRV) genetic cluster, probably representing a previously undetected HRV species, HRV-C, associated wit

22、h acute respiratory illness in children. J ClinMicrobiol. 2007, 45: 3655-3664.13 . Huang T, Wang W, Bessaud M, Ren P, Sheng J, Yan H, et al. Evidence of recombination and genetic diversity in human rhinoviruses in children with acute respiratory infection. PLoS ONE. 2009,4:e6355.18承诺书本人完全了解国家科技报告的有关

23、规定，同意国家按照规定收藏使用科技报 告，并承诺本科技报告中所有的研究内容和数据信息真实可靠。如有失实，本人 承当相关责任。课题负责人：XXX报告编制人：XXXX义年X月X日19编写说明课题负责人负责组织研究人员编写科技报告，并按相关计划管理 的要求审核和提交。科技报告一般包括封面、基本信息表、目录、插图清单、附表清单、 正文、附录和参考文献等局部。三、报告内容应客观真实、准确完整、层次清晰。本领域的专业读者依据这 些描述能重复调查研究过程、评议研究结果。科技报告基本信息表1.报告名称中文（不招过40字）：英文：2.报告作者及单位中文：英文：3.使用范围（公开和延期公开，延期公开需明确延期时间

24、）4,编制时间（YYYY-MM-DD）5.报告编号（单位机构代码+课题编号+/顺序号，XXXXXXXXX - NNNNUUNNNNNN/NN ）6.备注（须注明的特殊事项，如延期公开报告的查询权限、免责声明、报告与其它工作或成果的联系等）7.摘要中文（1000字左右）:英文（不超过2500个字符）：8.关键词中文（3.8个，以分号隔开）：英文（3-8个，以分号隔开）：9支持渠道工程名称（编号）组织单位课题名称（编号）课题承当单位合作单位（不超过5家）计划名称科技领域主管部门总经费国拨经费负责人起始日期结束日期10.联系人姓名 E-Mail.0目录.0目录此处插入目录插图清单此处插入插图清单附表清单此处插入附表图清单摘要报告仅附摘要即可，其他报告可根据需要，按引言、主体和结论三局部 分章节撰写。引言局部：描述研究背景和意义、前期研究基础、研究范围和目标、研究思 路和总体方案等。主体局部：逐一论述各项研究内容的研究方案、研究方法、研究过程、研究 结果等信息，提供必要的图、表、实验及观察数据等信息，并对使用到的关键装 置、仪表仪器、材料原料等进行描述和说明。结论局部：阐述主要研究发现，可包括研究成果的作用、影响、应用前景， 和研究中的问题、经验和建议等。假设有附录，插在此处参考文献参考文献插在此处