m第十四章基因工程nai.pptx
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1、目目 录录临床医学院生物化学教研室佘集凯 基因重组和基因工程基因重组和基因工程 第第 十十 四四 章章目目 录录目目 录录第第 一一 节节DNA的重组的重组 DNA Recombination目目 录录DNA重组重组细菌的基因转移与重组细菌的基因转移与重组接合作用、转化作用、转导作用接合作用、转化作用、转导作用转转 座重组座重组同源重组同源重组特异位点的重组特异位点的重组目目 录录发发生生在在同同源源序序列列间间的的重重组组称称为为同同源源重重组组,又又称称基基本本重重组组。是是最最基基本本的的DNA重重组组方方式式,通通过过链链的的断断裂裂和和再再连连接接,在在两两个个DNA分分子子同同源序
2、列间进行单链或双链片段的交换。源序列间进行单链或双链片段的交换。以以E.coli的的同同源源重重组组为为例例,了了解解同同源源重重组组机制的机制的Holliday模型。模型。一、同源重组一、同源重组目目 录录Holliday模型中,同源重组主要模型中,同源重组主要4个关键步骤个关键步骤 两个同源染色体两个同源染色体DNA排列整齐排列整齐一个一个DNA的一条链断裂、并与另一个的一条链断裂、并与另一个DNA对应的链连接,形成对应的链连接,形成Holliday中间体中间体通过分支移动产生异源双链通过分支移动产生异源双链DNAHolliday中间体切开并修复,形成两个双链中间体切开并修复,形成两个双链
3、重组体重组体DNA,分别为:,分别为:片段重组体片段重组体拼接重组体拼接重组体 内切酶内切酶(recBCD)DNA侵扰侵扰(recA)分支迁移分支迁移 (recA)内切酶内切酶(recBCD)DNA 连接酶连接酶535353535353535353535353535333535335535353Holiday中间体中间体53535353目目 录录目目 录录片段重组体片段重组体:切开的链与原来断裂的是同一条链,重组切开的链与原来断裂的是同一条链,重组体含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本体含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本DNA。拼接重组体拼接重组体:切开的链并非原来断裂的链,重组体异源切
4、开的链并非原来断裂的链,重组体异源双链区的两侧来自不同亲本双链区的两侧来自不同亲本DNA。Holiday中间体中间体535353535355533355553333555533335555333355553333内切酶内切酶(ruvC)内切酶内切酶(ruvC)DNA连接酶连接酶 DNA连接酶连接酶片段重组体片段重组体拼接重组体拼接重组体目目 录录目目 录录二、细菌的基因转移与重组二、细菌的基因转移与重组接合作用接合作用转化作用转化作用转导作用转导作用细胞融合细胞融合目目 录录(一)接合作用(一)接合作用当当细细胞胞或或细细菌菌通通过过菌菌毛毛相相互互接接触触时时,质质粒粒DNA从从一一个个细细
5、胞胞(细细菌菌)转转移移至至另另一一细细胞胞(细菌),这种(细菌),这种DNA转移称为转移称为接合作用接合作用。质粒质粒 细菌染色体外的小型环状双链细菌染色体外的小型环状双链DNA分子分子目目 录录可接合质粒如可接合质粒如 F 因子因子(F factor)目目 录录(二)转化作用(二)转化作用通通过过自自动动获获取取或或人人为为地地供供给给外外源源DNA,使使细细胞胞或或培培养养的的受受体体细细胞胞获获得得新新的的遗遗传传表表型型,称为称为转化作用转化作用。目目 录录例:例:溶菌时,裂解的溶菌时,裂解的DNA片段被另一细菌摄取。片段被另一细菌摄取。目目 录录目目 录录(三)转导作用(三)转导作
6、用当当病病毒毒从从被被感感染染的的细细胞胞(供供体体)释释放放出出来来、再再次次感感染染另另一一细细胞胞(受受体体)时时,发发生生在在供供体体细细胞胞与与受受体体细细胞胞之之间间的的DNA转转移移及及基基因因重组即为重组即为转导作用转导作用。噬菌体的生活史噬菌体的生活史溶菌生长途径溶菌生长途径溶源菌生长途径溶源菌生长途径例例目目 录录目目 录录目目 录录三、位点特异重组三、位点特异重组位位点点特特异异重重组组是是由由整整合合酶酶催催化化,在在两两个个DNA序列的特异位点间发生的整合。序列的特异位点间发生的整合。目目 录录例例(二)细菌的特异位点重组(二)细菌的特异位点重组鼠伤寒沙门杆菌鼠伤寒沙
7、门杆菌H片段倒位决定鞭毛相转变片段倒位决定鞭毛相转变 目目 录录hix为为反反向向重重复复序序列列,它它们们之之间间的的H片片段段可可在在Hin控控制制下下进进行行特特异异位位点点重重组组(倒倒位位)。H片片段段上上有有两两个个启启动动子子P,其其一一驱驱动动hin基基因因表表达达,另另一一正正向向时时驱驱动动H2和和rH1基基因因表表达达,反反向向(倒倒位位)时时H2和和rH1不不表表达达。rH1为为H1的的阻阻遏蛋白基因。遏蛋白基因。目目 录录 H2鞭毛素鞭毛素 阻遏蛋白阻遏蛋白Hin重组酶重组酶转位片段转位片段 H1鞭毛素鞭毛素沙门氏菌沙门氏菌H H片段倒位决定鞭毛相转变片段倒位决定鞭毛
8、相转变hinH2IDNA启动序列启动序列H1启动序列启动序列hinH2IH1目目 录录四、转座重组四、转座重组由由插插入入序序列列和和转转座座子子介介导导的的基基因因移移位位或或重排称为重排称为转座转座(transposition)。目目 录录典型的插入序列典型的插入序列(IS)组成:组成:二个分离的反向重复二个分离的反向重复(IR)序列序列一个转座酶(一个转座酶(transposase)编码基因编码基因特有的正向重复序列特有的正向重复序列 IRTransposase GeneIR发生形式:发生形式:保守性转座保守性转座复制性转座复制性转座(一)插入序列转座(一)插入序列转座插入序列的复制性转
9、座插入序列的复制性转座目目 录录目目 录录转座子转座子(transposons)可从一个染色体位点可从一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列。转移到另一位点的分散重复序列。转座子组成:转座子组成:反向重复序列反向重复序列转座酶编码基因转座酶编码基因抗生素抗性等有用的基因抗生素抗性等有用的基因IRIRTransposase Gene有用基因有用基因(二)转座子转座(二)转座子转座目目 录录由转座子介导的转座由转座子介导的转座目目 录录目目 录录第第 二二 节节 重组重组DNA技术技术DNA Recombination Technique 目目 录录重组重组DNA技术的发展史技术的发展史186
10、5年年 G.J.Mendel的豌豆杂交试验的豌豆杂交试验18661944年年 O.T.Avery的肺炎球菌转化实验的肺炎球菌转化实验1973年年 美国斯坦福大学的科学家构建美国斯坦福大学的科学家构建第一个第一个重组重组DNA分子分子1977年年 美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家第一家遗传工遗传工程公司,专门应用重组程公司,专门应用重组DNA技术制造医学上重要的药物。技术制造医学上重要的药物。1980年年 开始建造开始建造第一家第一家应用重组应用重组DNA技术生产胰岛素的工厂技术生产胰岛素的工厂1997年年 英国罗林研究所成功的克隆了英国罗林研究所成
11、功的克隆了多莉多莉目目 录录一、重组一、重组DNA技术相关概念技术相关概念 克隆克隆(clone)来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。获取同一拷贝的过程称为获取同一拷贝的过程称为克隆化克隆化(cloning),即即无性繁殖无性繁殖。(一)(一)DNA克隆克隆目目 录录技术水平:技术水平:分子克隆分子克隆 即即DNA 克隆克隆 细胞克隆细胞克隆个体克隆(动物或植物)个体克隆(动物或植物)目目 录录DNA克隆克隆应应用用酶酶学学的的方方法法,在在体体外外将将各各种种来来源源的的遗遗传传物物质质(同同源源的的或或异异源源的的、原原核核的的或或真真核核的的、天天然然
12、的的或或人人工工的的DNA)与与载载体体DNA接接合合成成一一具具有有自自我我复复制制能能力力的的DNA分分子子复复制制子子,继继而而通通过过转转化化或或转转染染宿宿主主细细胞胞,筛筛选选出出含含有有目目的的基基因因的的转转化化子子细细胞胞,再再进进行行扩扩增增提提取取获获得得大大量量同同一一DNA分分子子。也称也称基因克隆或重组基因克隆或重组DNA。目目 录录生物技术工程生物技术工程:基因工程、蛋白质工程、基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程等酶工程、细胞工程等目的目的 分离获得某一感兴趣的基因或分离获得某一感兴趣的基因或DNA 获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质)获得感兴趣基因的表达产物(
13、蛋白质)基因工程基因工程(genetic engineering)实现基实现基因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,又称又称重组重组DNA工艺学工艺学。目目 录录(二)工具酶(二)工具酶n 限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶n DNA聚合酶聚合酶n 逆转录酶逆转录酶n T4DNA连接酶连接酶n 碱性磷酸酶碱性磷酸酶n 末端转移酶末端转移酶n Taq DNA聚合酶聚合酶目目 录录重组重组DNA技术中常用的工具酶技术中常用的工具酶工工 具具 酶酶功功 能能限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶识别特异序列,切割识别特异序列,切割DNADNA连接酶连接酶催化催化DN
14、A中相邻的中相邻的5磷酸基和磷酸基和3羟基末端之间形成磷酸二羟基末端之间形成磷酸二酯键,使酯键,使DNA切口封合或使两个切口封合或使两个DNA分子或片段连接分子或片段连接DNA聚合酶聚合酶合成双链合成双链cDNA分子或片段连接分子或片段连接缺口平移制作高比活探针缺口平移制作高比活探针DNA序列分析序列分析填补填补3末端末端Klenow片段片段又名又名DNA聚合酶聚合酶I大片段,具有完整大片段,具有完整DNA聚合酶聚合酶I的的53 聚合、聚合、35 外切活性,而无外切活性,而无53 外切活外切活性。常用于性。常用于cDNA第二链合成,双链第二链合成,双链DNA 3 末端标记等末端标记等反转录酶反
15、转录酶合成合成cDNA替代替代DNA聚合酶聚合酶I进行填补,标记或进行填补,标记或DNA序列分析序列分析多聚核苷酸激酶多聚核苷酸激酶催化多聚核苷酸催化多聚核苷酸5羟基末端磷酸化,或标记探针羟基末端磷酸化,或标记探针末端转移酶末端转移酶在在3羟基末端进行同质多聚物加尾羟基末端进行同质多聚物加尾碱性磷酸酶碱性磷酸酶切除末端磷酸基切除末端磷酸基目目 录录限制性核酸内切酶限制性核酸内切酶定义定义限限制制性性核核酸酸内内切切酶酶(RE)是是识识别别DNA的的特特异异序序列列,并并在在识识别别位位点点或或其其周周围围切切割割双双链链DNA的的一一类类内内切酶。切酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGA
16、TCC G+Bam H目目 录录作用作用与与甲甲基基化化酶酶共共同同构构成成细细菌菌的的限限制制-修修饰饰系统,限制外源系统,限制外源DNA,保护自身保护自身DNA。分类分类、(基因工程技术中常用(基因工程技术中常用型)型)目目 录录第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。用罗马数字表示发现的先后次序。命名命名Hin d 属属 系系 株株 序序Haemophilus influenzae d株株流感嗜血杆菌
17、流感嗜血杆菌d株的第三种酶株的第三种酶目目 录录类酶识别序列特点类酶识别序列特点 回文结构回文结构(palindrome)切口切口 :平端切口平端切口、粘端切口粘端切口GGGGA AT TCCCCCCCCT TA AGGGG目目 录录Bam HGTCCAGGCCTAGGATCC G+GGATCCCCTAGGHindGTCGACCAGCTGGACCTG+平端切口平端切口粘端切口粘端切口目目 录录同功异源酶同功异源酶来来源源不不同同的的限限制制酶酶,但但能能识识别别和和切切割割同一位点,这些酶称同一位点,这些酶称同功异源酶同功异源酶。GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCC G+Bam HG
18、GATCCCCTAGGGCCTAGGATCC G+Bst目目 录录同尾酶同尾酶有有些些限限制制性性内内切切酶酶虽虽然然识识别别序序列列不不完完全全相相同同,但但切切割割DNA后后,产产生生相相同同的的粘粘性性末末端端,称称为为同同尾尾酶酶。这这两两个个相相同同的的粘粘性性末末端端称称为为配配伍未端伍未端。Bam Bam HHBg Bg l l GGATCC CCTAGG AGATCT TCTAGAGCCTAG GATCC G+ATCTAG GATCT A目目 录录(三)目的基因(三)目的基因n cDNAn基因组基因组DNA目的基因目的基因 分离获得某一感兴趣的基因或分离获得某一感兴趣的基因或D
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- 第十四 基因工程 nai
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