微生物基因表达调控.ppt
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1、关于微生物基因表达的调控第一张,PPT共六十页,创作于2022年6月概述(Introduction)基因表达基因表达(gene expression)-基因转录及基因转录及翻译的过程。翻译的过程。生物基因组中结构基因所携带的遗传信息,经过转生物基因组中结构基因所携带的遗传信息,经过转录、翻译等一系列过程,合成具有特定的生物学功能录、翻译等一系列过程,合成具有特定的生物学功能和生物学效应的蛋白质的全过程和生物学效应的蛋白质的全过程中心法则中心法则(the central dogma):第二张,PPT共六十页,创作于2022年6月基因表达是受调控的基因表达是受调控的 不是所有的基因表达都产生蛋白质
2、,不是所有的基因表达都产生蛋白质,rRNA或或tRNA的基因经转录和转录后加工产生成熟的的基因经转录和转录后加工产生成熟的rRNA或或tRNA,也是也是rRNA或或tRNA的基因表达,因的基因表达,因为为rRNA或或tRNA就具有在蛋白质翻译方面的功能。就具有在蛋白质翻译方面的功能。但是但是基因表达转录翻译基因表达转录翻译第三张,PPT共六十页,创作于2022年6月 大肠杆菌基因组(约大肠杆菌基因组(约4000个基因个基因),一般情况下只有,一般情况下只有510%在高水平转录状态,其它基因有的处于较低水平的表达,在高水平转录状态,其它基因有的处于较低水平的表达,或者暂时不表达。或者暂时不表达。
3、人的基因组约含有人的基因组约含有10万个基因,但在一个组织细胞中万个基因,但在一个组织细胞中通常只有一部分基因表达,多数基因处在沉静状态,典型通常只有一部分基因表达,多数基因处在沉静状态,典型的哺乳类细胞中开放转录的基因约在的哺乳类细胞中开放转录的基因约在1万个上下,即使蛋白万个上下,即使蛋白质合成量比较多、基因开放比例较高的肝细胞,一般也只有不质合成量比较多、基因开放比例较高的肝细胞,一般也只有不超过超过20%的基因处于表达状态。的基因处于表达状态。生物基因组的遗传信息生物基因组的遗传信息并不是同时全部都表达出来的并不是同时全部都表达出来的第四张,PPT共六十页,创作于2022年6月基因表达
4、的时间性及空间性(temporal and spatial specificity)l l时间特异性(temporal specificity)l l某一基因的表达严格按特定的时间顺序发生l l Hb(hemoglobin)l l 珠蛋白基因簇:珠蛋白基因簇:(胚胎型)(胚胎型)、l l 珠蛋白基因簇:珠蛋白基因簇:(胚胎型)、(胚胎型)、(胎儿型)、(胎儿型)、l l 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2第五张,PPT共六十页,创作于2022年6月空间特异性(spatial specificity)l l在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组织空间顺序出现l l同形异位现象(
5、homeosis):l l果蝇头部长触角部位长出脚来果蝇头部长触角部位长出脚来l l同形异位盒基因同形异位盒基因(homeobox):(homeobox):高度保守的一段核苷酸高度保守的一段核苷酸序列(序列(180bp180bp),控制胚胎发育的基因控制胚胎发育的基因第六张,PPT共六十页,创作于2022年6月第七张,PPT共六十页,创作于2022年6月基因表达的方式-1l l组成性基因表达(constitutive gene expression):指不大受环境变动而变化的一类基因表达。指不大受环境变动而变化的一类基因表达。管家管家基因与奢侈基因基因与奢侈基因l l产物是细胞或生物体整个生命
6、过程中都持续需要而必不可少产物是细胞或生物体整个生命过程中都持续需要而必不可少的,这类基因也称为的,这类基因也称为看家基因看家基因看家基因看家基因(house-keeping gene)(house-keeping gene);l l管家基因管家基因-在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因。达的基因。l l奢侈基因(奢侈基因(luxury geneluxury gene)只在特定的细胞类型中表只在特定的细胞类型中表达的基因达的基因第八张,PPT共六十页,创作于2022年6月基因表达的方式-2l l适应性表达适应性表达(adaptive expressi
7、on):指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。l l诱导和阻遏表达l l诱导诱导(inductioninduction)-可诱导基因可诱导基因在特定环境信号刺在特定环境信号刺激下表达增强的过程。激下表达增强的过程。l lDNADNA损伤损伤 修复酶基因激活修复酶基因激活l l乳糖乳糖 利用乳糖的三种酶表达利用乳糖的三种酶表达l l阻遏阻遏(repressionrepression)-可阻遏基因可阻遏基因表达产物水平降表达产物水平降低的过程低的过程l l色氨酸色氨酸 色氨酸合成酶系色氨酸合成酶系第九张,PPT共六十页,创作于2022年6月基因表达的方式-3协调表达协调表达 协调表达协调
8、表达 在在一一定定机机制制控控制制下下,功功能能上上相相关关的的一一组组基基因因,无无论论其其为为何何种种表表达达方方式式,均均需需协协调调一一致致、共共同同表表达达,即为即为协调表达协调表达(coordinate expression)第十张,PPT共六十页,创作于2022年6月l l基因表达的调控方式基因表达的调控方式:阻遏阻遏l l负调控负调控:调控蛋白调控蛋白+DNA+DNA序列序列 基因的表达基因的表达 (相应蛋白质相应蛋白质降低降低)促进促进l l正调控正调控:调控蛋白调控蛋白+DNA+DNA序列序列 基因的表达基因的表达 (相应蛋白质相应蛋白质增加增加)第十一张,PPT共六十页,
9、创作于2022年6月五、基因表达调控的基本原理五、基因表达调控的基本原理基因表达的多级调控基因表达的多级调控转录水平转录水平的调控的调控transcriptional level:transcriptional level:转录激活、转录起始转录激活、转录起始;转录后水平转录后水平的调控的调控post-transcriptional levelpost-transcriptional level:转录后加工、运输、转录后加工、运输、mRNAmRNA降解降解;翻译水平翻译水平的调控的调控translation leveltranslation level:翻译的起始翻译的起始;翻译后水平翻译后水
10、平的调控的调控post-translation levelpost-translation level 翻译后的加工、转运、多肽链的分解翻译后的加工、转运、多肽链的分解.l l基因表达调控的生物学意义l l适应环境、维持生长和增殖适应环境、维持生长和增殖l l维持个体发育与分化维持个体发育与分化第十二张,PPT共六十页,创作于2022年6月第十三张,PPT共六十页,创作于2022年6月l l原原原原核核核核生生生生物物物物中中中中,营营营营养养养养状状状状况况况况(nutritional nutritional statusstatus)和和和和环环环环境境境境因因因因素素素素(environ
11、mental environmental factorfactor)对对对对基基基基因因因因表表表表达达达达起起起起着着着着举举举举足足足足轻轻轻轻重的影响。重的影响。重的影响。重的影响。l l真真真真 核核核核 生生生生 物物物物尤尤尤尤 其其其其 是是是是 高高高高 等等等等 真真真真 核核核核 生生生生 物物物物 中中中中,激激激激 素素素素 水水水水 平平平平(hormone hormone levellevel)和和和和发发发发育育育育阶阶阶阶段段段段(developmental developmental stagestage)是是是是基基基基因因因因表表表表达达达达调调调调控控控
12、控的的的的最最最最主主主主要要要要手手手手段段段段,营营营营养养养养和和和和环环环环境境境境因因因因素的影响力大为下降。素的影响力大为下降。素的影响力大为下降。素的影响力大为下降。l l在在在在转转转转录录录录水水水水平平平平上上上上对对对对基基基基因因因因表表表表达达达达的的的的调调调调控控控控决决决决定定定定于于于于DNADNA的的的的结结结结构构构构、RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶的的的的功功功功能能能能、蛋蛋蛋蛋白白白白因因因因子子子子及及及及其其其其他他他他小小小小分分分分子子子子配配配配基基基基的的的的相互作用。相互作用。相互作用。相互作用。原核生物基因表达调控原核生物基因表
13、达调控主要在转录水平,其次是翻译水主要在转录水平,其次是翻译水平平。第十四张,PPT共六十页,创作于2022年6月l l 因为细菌因为细菌因为细菌因为细菌mRNAmRNA在形成过程中在形成过程中在形成过程中在形成过程中与核糖体混合在一起,所以,细菌与核糖体混合在一起,所以,细菌与核糖体混合在一起,所以,细菌与核糖体混合在一起,所以,细菌的转录与翻译过程几乎发生在同一的转录与翻译过程几乎发生在同一的转录与翻译过程几乎发生在同一的转录与翻译过程几乎发生在同一时间间隔内,转录与翻译相耦联时间间隔内,转录与翻译相耦联时间间隔内,转录与翻译相耦联时间间隔内,转录与翻译相耦联(coupled transc
14、ription and coupled transcription and translationtranslation)。)。)。)。l l真核生物中,转录产物(真核生物中,转录产物(真核生物中,转录产物(真核生物中,转录产物(primary primary transcripttranscript)只有从核内运转到)只有从核内运转到)只有从核内运转到)只有从核内运转到核外,才能被核糖体翻译成蛋核外,才能被核糖体翻译成蛋核外,才能被核糖体翻译成蛋核外,才能被核糖体翻译成蛋白质。白质。白质。白质。第十五张,PPT共六十页,创作于2022年6月 原核生物的共有序列原核生物的共有序列 原核生物的启
15、动序列,在距离转录起始点原核生物的启动序列,在距离转录起始点10区和区和35区往往含有区往往含有一些重要的一些重要的保守序列(共有序列)保守序列(共有序列)。10区区:含:含TATAAT序列,又称序列,又称Pribnow盒盒。35区区:含:含TTGACA序列。序列。RNARNA聚合酶结合部位聚合酶结合部位 决定转录起始点决定转录起始点第十六张,PPT共六十页,创作于2022年6月共共有有序序列列(consensus sequence)决决定定启启动动序序列的转录活性大小。列的转录活性大小。某某些些特特异异因因子子(蛋蛋白白质质)决决定定RNA聚聚合合酶酶对对一个或一套启动序列的特异性识别和结合
16、能力。一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。第十七张,PPT共六十页,创作于2022年6月阻遏蛋白阻遏蛋白(repressor)(repressor)的结合位点的结合位点当当操操纵纵序序列列结结合合有有阻阻遏遏蛋蛋白白时时,会会阻阻碍碍RNARNA聚聚合合酶酶与与启启动动序序列列的的结结合合,或或是是RNARNA聚聚合合酶酶不不能能沿沿DNADNA向前移动向前移动 ,阻碍转录。,阻碍转录。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol阻遏蛋白阻遏蛋白操纵序列操纵序列 第十八张,PPT共六十页,创作于2022年6月可可结结合合启启动动序序列列邻邻近近的的DNA序序列列,促促进进
17、RNA聚聚合合酶酶与与启启动动序序列列的的结结合合,增增强强RNA聚聚合合酶酶活活性。性。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol激活蛋白激活蛋白激活蛋白激活蛋白(activator)第十九张,PPT共六十页,创作于2022年6月有有些些基基因因在在没没有有激激活活蛋蛋白白存存在在时时,RNA聚聚合合酶很少或完全不能结合启动序列。酶很少或完全不能结合启动序列。启动序列启动序列编码序列编码序列操纵序列操纵序列polpol激活蛋白激活蛋白第二十张,PPT共六十页,创作于2022年6月操纵子模型的提出 莫洛(Monod)和雅各布(Jacob)(Jacob)获1965年诺贝尔生理学
18、和医学奖第一节 转录水平的调控(control of transcription)第二十一张,PPT共六十页,创作于2022年6月l l操纵子(操纵子(operonoperon):l l原核生物原核生物中几个功能相关的结构基因成簇串联中几个功能相关的结构基因成簇串联排列组成的一个基因表达的协同单位(排列组成的一个基因表达的协同单位(DNADNA序序列)列).l l一个操纵子一个操纵子 =编码序列(编码序列(2-62-6)+启动序列启动序列+操纵序列操纵序列+(+(其他调节序列其他调节序列)第二十二张,PPT共六十页,创作于2022年6月Discovery of Operonl l1940年,M
19、onod发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基上生长时,细菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳糖;在糖源转变期,细菌的生长会出现停顿。即产生“二次生长曲线”。l l文献:细胞中存在两种酶,即组成酶与适应酶(诱导酶)。l l1947年,报告:“酶的适应现象及其在细胞分化中的意义”。第二十三张,PPT共六十页,创作于2022年6月l l1951年,Monod与Jacob合作。l l发现两对基因:l lZ Z基因:与合成基因:与合成-半乳糖苷酶有关;半乳糖苷酶有关;l lI I基因:决定细胞对诱导物的反应。基因:决定细胞对诱导物的反应。l lSzilard:I基因决定阻遏物的合成,当阻遏物存在时,酶无
20、法合成,只有有诱导物存在,才能去掉该阻遏物。l l Jacob:结构基因旁有开关基因(即操纵基因),阻遏物通过与开关基因的结合,控制结构基因的表达。第二十四张,PPT共六十页,创作于2022年6月l l乳糖操纵子的发现:乳糖操纵子的发现:l l细菌以细菌以葡萄糖葡萄糖为能量来源为能量来源l l葡萄糖充分时:葡萄糖充分时:与与葡萄糖代谢葡萄糖代谢有关的酶基因有关的酶基因-表达表达 与与其他糖代谢其他糖代谢有关的酶基因有关的酶基因-关闭关闭l l葡萄糖耗尽时,乳糖存在(培养基):葡萄糖耗尽时,乳糖存在(培养基):与与乳糖代谢乳糖代谢有关的酶基因有关的酶基因 -表达表达 与与葡萄糖代谢葡萄糖代谢有关
21、的酶基因有关的酶基因-关闭关闭第二十五张,PPT共六十页,创作于2022年6月IPOZYa调控基因调控基因调控基因调控基因 控制位点控制位点控制位点控制位点 结构基因结构基因结构基因结构基因DNADNA阻阻阻阻遏遏遏遏蛋蛋蛋蛋白白白白启启启启动动动动序序序序列列列列cAMP-CAPcAMP-CAP结合位点结合位点结合位点结合位点操操操操纵纵纵纵序序序序列列列列 半半半半乳乳乳乳糖糖糖糖苷苷苷苷酶酶酶酶通通通通透透透透酶酶酶酶乙乙乙乙酰酰酰酰基基基基转转转转移移移移酶酶酶酶乳糖操纵子(乳糖操纵子(lactose opron)结构)结构RNARNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶结合位点结合位点结合位点结
22、合位点第二十六张,PPT共六十页,创作于2022年6月mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白IDNAZYAOPpol没有乳糖存在时没有乳糖存在时阻遏蛋白的负性调节阻遏蛋白的负性调节阻遏基因阻遏基因第二十七张,PPT共六十页,创作于2022年6月mRNA阻遏蛋白阻遏蛋白有乳糖存在时有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录启动转录mRNA乳糖乳糖半乳糖半乳糖-半乳糖苷酶半乳糖苷酶第二十八张,PPT共六十页,创作于2022年6月+转录转录无葡萄糖,无葡萄糖,cAMP浓度高时浓度高时有葡萄糖,有葡萄糖,cAMP浓度低时浓度低时CAP的正性调节的正性调节ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAPCAP:
23、CAP:分解物基因激活物蛋白分解物基因激活物蛋白分解物基因激活物蛋白分解物基因激活物蛋白可促进乳糖利用,但须与可促进乳糖利用,但须与可促进乳糖利用,但须与可促进乳糖利用,但须与cAMPcAMP结合才有活结合才有活结合才有活结合才有活性性性性第二十九张,PPT共六十页,创作于2022年6月 阻遏基因转录翻译阻遏蛋白阻遏基因转录翻译阻遏蛋白R,R与操纵基因结合,与操纵基因结合,阻止结合在启动子上的阻止结合在启动子上的DDRP前移,结构基因前移,结构基因不被转不被转录录 1 1)无乳糖也无葡萄糖存在时:)无乳糖也无葡萄糖存在时:OO2 2)当无乳糖,有葡萄糖时:)当无乳糖,有葡萄糖时:由于葡萄糖不能
24、使阻遏蛋白失活,乳糖操纵子关由于葡萄糖不能使阻遏蛋白失活,乳糖操纵子关闭,另外,由于有葡萄糖,闭,另外,由于有葡萄糖,cAMP含量低,含量低,CAP的的正性调节不起作用正性调节不起作用 总结:总结:所以:无乳糖时,无论有无葡萄糖,操纵子关闭所以:无乳糖时,无论有无葡萄糖,操纵子关闭第三十张,PPT共六十页,创作于2022年6月 由于有葡萄糖,由于有葡萄糖,cAMP含量低,含量低,CAP的正性调节不的正性调节不起作用,抑制乳糖操纵子的转录,使细菌只能利用起作用,抑制乳糖操纵子的转录,使细菌只能利用葡萄糖葡萄糖。3 3)既有乳糖,又有葡萄糖时:)既有乳糖,又有葡萄糖时:O 乳糖与阻遏蛋白结合,乳糖
25、与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与操使阻遏蛋白变构,失去与操纵基因结合的能力而脱落纵基因结合的能力而脱落第三十一张,PPT共六十页,创作于2022年6月 由于不含葡萄糖,细胞由于不含葡萄糖,细胞内内cAMP含量高,含量高,cAMP与与CAP结合成复合物,与结合成复合物,与DNA结结合,并推动合,并推动DDRP向前移动,向前移动,促进转录。促进转录。4 4)有乳糖,无葡萄糖时:)有乳糖,无葡萄糖时:mRNARNA-polO 乳糖与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与操纵乳糖与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与操纵基因结合的能力而脱落,结合在启动子上的基因结合的能力而脱落,结合在启动子上的D
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- 微生物 基因 表达 调控
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