生物技术制药第三章基因工程制药.ppt
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1、生物技术制药第三章基因工程制药现在学习的是第1页,共71页第三讲 基因工程制药基因工程与药物概述基因工程药物上游技术基因工程药物下游技术基因工程药物的质量控制基因工程药物制造实例现在学习的是第2页,共71页第一节 概述生物技术的核心就是基因工程,基因工程技术最成功的应用就是用于生物治疗的新型生物药物的研制。传统生物药物由于来源及制备上的困难、价格等因素的影响,此外在制备过程可能受到的病毒、衣原体、支原体等的感染等问题,促使人们寻求安全、实用、疗效可靠的新方法来制备生物药物。现在学习的是第3页,共71页基因工程正在逐渐显示其在生物技术药物制备上的优势。应用基因工程技术可十分方便且有效地解决上述提
2、到的问题,从量、质上都可以得到改进,且可以创造全新物质。如今,癌症、病毒性疾病、心血管疾病以及内分泌等方面的预防、治疗和诊断已可通过基因工程技术获得。现在学习的是第4页,共71页利用基因工程技术生产药品的优点:(1)可以大量生产过去难以获得的生理活性蛋白和多肽(如胰岛素、干扰素、细胞因子等),为临床使用提供有效的保障;(2)可以提供足够数量的生理活性物质,以便对其生理、生化和结构进行深入的研究,从而扩大这些物质的应用范围;(3)利用基因工程技术可以发现、挖掘更多的内源性生理活性物质;现在学习的是第5页,共71页利用基因工程技术生产药品的优点:(4)内源性生理活性物质在作为药物使用时存在的不足之
3、处,可通过基因工程和蛋白质工程进行改造和去除。如IL-2的第125位半胱氨酸是游离的,有可能引起-S-S-键的错配而导致活性下降,如将此半胱氨酸改为丝氨酸或丙氨酸,IL-2的活性以及热稳定性均有提高;(5)利用基因工程技术可获得新型化合物,扩大药物筛选来源。基因工程技术可将不同种类和用途的基因,在原核细胞中表达的特性使其不仅在医药,而且在很多行业中都会有重要的应用。现在学习的是第6页,共71页第二节 基因工程药物生产的基本过程基因工程技术就是将重组对象的目的基因插入载体,拼接后转入新的宿主细胞,构建工程菌(或细胞),实现遗传物质的重新组合,并使目的基因在工程菌内进行复制和表达的技术。基因工程药
4、物制造的主要程序是:目的基因的克隆,构建DNA重组体,将DNA重组体转入宿主菌构建工程菌,工程菌的发酵,外源基因表达产物的分离纯化,产品的检验等。以上程序中的每个阶段都包含若干细致的步骤,这些程序和步骤将会随研究和生产条件的不同而改变。现在学习的是第7页,共71页获得目的基因获得目的基因组建重组质粒组建重组质粒培养工程菌培养工程菌构建基因工程构建基因工程菌或细胞菌或细胞产物分离纯化产物分离纯化除菌过滤除菌过滤半成品检定半成品检定包装包装成品检定成品检定基因工程药物制备的一般过程基因工程药物制备的一般过程现在学习的是第8页,共71页基因工程药物生产的上游和下游上游:主要指的是目的基因分离、工程菌
5、(或细胞)构建。上游阶段的工作主要在实验室内完成;下游:主要指的是从工程菌(或细胞)的大规模培养一直到产品的分离纯化、质量控制等。现在学习的是第9页,共71页工程菌(或细胞)构建中重要的工具该过程中重要的工具便是酶:限制性内切酶和连接酶是将所需目的基因插入适当的载体质粒或噬菌体中并转入大肠杆菌或其他宿主菌(细胞)大量复制目的基因过程中的重要工具。同时为保证目的基因的正确性,对目的基因要进行限制性内切酶和核苷酸序列分析。基因表达系统就是上述的工程菌或细胞,有原核生物和真核生物两类表达系统;选择基因表达的系统主要考虑的是保证表达蛋白质的功能,其次要考虑的是表达量的多少和分离纯化的难易。现在学习的是
6、第10页,共71页下游阶段在产业化中是极其重要的下游阶段是将实验室成果产业化、商品化,主要包括工程菌大规模发酵最佳参数的确立,新型生物反应器的研制,高效分离介质及装置的开发,分离纯化的优化控制,高纯度产品的制备技术,生物传感器等一系列仪器仪表的设计和制造,电子计算机的优化控制等。工程菌的发酵工艺不同于传统的抗生素和氨基酸发酵,需要对影响目的基因表达的因素进行分析,对各种影响因素进行优化,建立适于目的基因高效表达的发酵工艺,同时建立一系列相应的分离纯化、质量控制、产品保存等技术。现在学习的是第11页,共71页第三节 目的基因的获得对于目的基因的获得需要根据目的基因的来源采取适当的方法。对于真核细
7、胞来源的目的基因,是不能直接进行分离的。真核细胞中单拷贝基因仅是染色体DNA中的很小一部分,即使多拷贝基因也是极少的,因此从染色体中分离纯化目的基因是很困难的。另外,原核表达系统是有局限性的,主要是由于真核基因的内含子及基因的后翻译过程,所以真核系统得到了相应发展。现在学习的是第12页,共71页第三节 目的基因的获得目前克隆真核基因常用的方法有逆转录法和化学合成法 一、逆转录法逆转录法就是先分离纯化目的基因的mRNA,再反转录成cDNA,然后进行cDNA的克隆表达。为了克隆编码某种特异蛋白质多肽的DNA序列,可从产生该蛋白质的真核细胞中提取mRNA,以其为模板,在逆转录酶的作用下,反转录合成该
8、蛋白质mRNA的互补DNA(cDNA第一链),再以cDNA第一链为模板,在逆转录酶或DNA聚合酶I(或者Klenow大片段)作用下,最终合成编码该多肽的双链DNA序列。cDNA与模板mRNA序列严格互补,而不含内含子。现在学习的是第13页,共71页第三节 目的基因的获得一、逆转录法1、mRNA的纯化2、cDNA第一链的合成3、cDNA第二链的合成4、cDNA克隆5、将重组体导入宿主细胞6、cDNA文库的鉴定7、目的cDNA克隆的分离和鉴定现在学习的是第14页,共71页cDNA克隆示意图mRNA逆转录酶ss-DNADNA多聚酶IKlenow片段逆转录酶ds-cDNAds-cDNA现在学习的是第1
9、5页,共71页1、mRNA的纯化分离纯化目的基因的mRNA是极其困难的,细胞内含有3种以上的RNA,mRNA占细胞内总RNA总量的2%5%,相对分子质量大小很不一致,由几百到几千个核苷酸组成。在真核细胞中mRNA的3末端常常含有一多聚腺苷酸polyA组成的末端,长达20250个腺苷酸,可采用Oligo dT-纤维素,以亲和层析法将mRNA从细胞总RNA中分离出来。洗脱方法是高浓度盐溶液使mRNA特异结合于寡聚dT,再以低盐溶液和蒸馏水将其洗脱,经过两次寡聚dT,可得到较纯的mRNA。现在学习的是第16页,共71页2、cDNA第一链的合成一般mRNA都带有3-polyA,所以可用寡聚dT作为引物
10、,在逆转录酶的催化下,开始cDNA链的合成。在合成反应体系中加入一种放射性标记的dNTP,在反应中以及反应后可通过测定放射性标记的dNTP掺入量,计算出cDNA的合成效率;在凝胶电泳后,进行放射自显影分析产物的分子大小,探索最佳反应条件。一次好的逆转录反应可使寡聚dT选出的mRNA有5%30%被拷贝。现在学习的是第17页,共71页3、cDNA第二链的合成先用碱解或RNaseH酶解的方法除去cDNA-mRNA杂交链中的mRNA链,然后以cDNA第一链为模板合成第二链。由于第一链cDNA链3末端往往形成一个发夹形结构,所以,可以从这一点开始合成cDNA第二链。此反应是在DNA聚合酶I催化下完成的。
11、核酸酶S1专一性切除单链DNA,因此用它可以切除发夹结构。发夹结构结构切除后,双链cDNA分子的大小常用变性琼脂糖凝胶电泳进行测定。现在学习的是第18页,共71页4、cDNA克隆用于cDNA克隆的载体有两类:质粒DNA(如pUC、pBR322等)和噬菌体DNA(如gt10、gt11等)。根据重组后插入的cDNA是否能够表达、能否经转录和翻译合成蛋白质,又将载体分为表达型和非表达型载体。pUC及gt11为表达型载体,在cDNA插入位置的上游具有启动基因顺序;而pBR322及gt10为非表达型载体。在cDNA克隆操作中应该根据不同的需要选择适当的载体。cDNA插入片段小于10kb,可选质粒载体,如
12、大于10kb则应选用噬菌体DNA为载体。选用表达型载体可以增加目的基因的筛选方法,有利于目的基因的筛选。现在学习的是第19页,共71页cDNA文库R.Young和R.Davis设计的gt10和gt11是噬菌体克隆载体,可用于构建cDNA文库。一方面它们具有较高的克隆效率,1ng cDNA可产生5000个克隆,另一方面又可容纳较大分子量的外源DNA片段。因为筛选噬菌斑在技术操作上较筛选细菌菌落更方便,因此gt10和gt11类载体在构建文库时优于质粒载体pBR322。现在学习的是第20页,共71页gt10载体在合适的宿主中,gt10载体对于未携带cDNA的噬菌体的裂解生长有很强的生物学选择作用。c
13、DNA插入到gt10中可使噬菌体阻碍物基因(cI)失活。当用大肠杆菌c600的突变型hflA(高频溶原性)作为宿主时,只有携带cDNA插入片段的噬菌体可形成噬菌斑,而在非突变型大肠杆菌c600宿主菌中,带与不带cDNA插入片段的噬菌体都可形成噬菌斑。现在学习的是第21页,共71页gt11载体gt11则没有类似gt10载体的选择作用,但它是蛋白质表达的cDNA克隆载体。gt11的宿主菌是大肠杆菌Y1090。gt11中cDNA插入片段是克隆在-半乳糖苷酶基因编码区(lacZ)的羧基端,在含IPTG(isopropylthio-D-galactoside,异丙基硫代-D-半乳糖苷)和X-gal(5-
14、bromo-4-chloro-3-indolyl-D-galactoside,5-溴-4氯-3-吲哚-D-半乳糖苷)的平板上,带cDNA插入片段的gt11可形成清晰的无色噬菌斑,未带cDNA插入片段的gt11则形成蓝色噬菌斑。cDNA插入片段的翻转产物可表达成半乳糖苷酶-cDNA融合蛋白。现在学习的是第22页,共71页cDNA片段与载体的连接方法一:加同聚尾连接,用3末端脱氧核苷酸转移酶催化,使载体与cDNA的3末端带上互补的同型多聚体序列,如载体加上polyC(或A)的尾巴,则cDNA加上polyG(或T)的尾巴,这两种粘性末端只能使载体与cDNA连接而不能自我环化,借助同型多聚体的退火作用
15、形成重组分子,最后用T4DNA连接酶封口。方法二:加人工接头连接,用T4DNA连接酶在平末端接上人工接头可以使DNA发生连接。所谓人工接头是指人工合成的、连接在目的基因两端的含有某些限制酶切位点的寡核苷酸片段。cDNA连上人工接头后,用该种限制酶酶切就可得到粘性末端,从而能够与载体连接;cDNA中也可能也带有同样的限制酶切点,为了保护cDNA不受限制酶破坏,可在加接头前用甲基化酶修饰这些限制酶切位点。现在学习的是第23页,共71页5、将重组体导入宿主细胞体外包装的噬菌体,感染感受态大肠杆菌形成噬菌斑;或转化感受态大肠杆菌使质粒进入细胞内。现在学习的是第24页,共71页6、cDNA文库的鉴定根据
16、重组体的表型进行筛选,主要有抗性基因失活法和菌落或噬菌斑颜色改变法。然后采用凝胶电泳、分子杂交、DNA序列分析测定等方法进行进一步筛选和鉴定。现在学习的是第25页,共71页7、目的cDNA克隆的分离和鉴定从cDNA文库中分离特异的cDNA克隆,主要采用:(1)核酸探针杂交法。用层析和高分辨电泳等技术纯化微克量的目的蛋白质,根据目的蛋白质纯品的氨基酸序列分析结果,人工合成相应的单链寡核苷酸作为探针,从cDNA文库中分离特异cDNA克隆。(2)免疫反应鉴定法。在既无可供选择的基因表型特征,又无合适探针的情况下,本法是重要途径。用表达型载体构建的cDNA文库,可用免疫学方法分组逐一鉴定各cDNA的表
17、达产物,即以某种蛋白质的抗体寻找相应的特异cDNA克隆。现在学习的是第26页,共71页分离得到含有目的基因的阳性克隆后,必须对其作进一步的验证和鉴定,主要是进行限制酶图谱的绘制、杂交分析、基因定位、基因测序以及确定基因的转录方向、转录起始点等。1985,PCR发明以后,RT-PCR得到了广泛的应用。现在学习的是第27页,共71页二、化学合成法人工化学合成的限制:一不能合成太长的基因,5060bp;二是人工合成时,遗传密码的简并性可导致中性突变;三是费用较高。现在学习的是第28页,共71页第四节 基因表达进行基因研究,我们主要关心的是目的基因的表达产量、表达产物的稳定性、产物的生物学活性和表达产
18、物的分离纯化。因此在进行基因表达设计时,需综合考虑各种影响因素以建立最佳基因表达体系。现在学习的是第29页,共71页一、宿主细胞的选择对于宿主细胞其应该:容易获得较高浓度的细胞;能利用易得廉价原料;不致病、不产生内毒素;发热量低,需氧低,适当的发酵温度和细胞形态;容易进行代谢调控;容易进行DNA重组技术操作;产物的产量、产率高,产物容易提取纯化。基因表达有两类宿主细胞:一类是原核细胞,目前常用的有大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、链霉菌等;另一类是真核细胞,常用的有酵母、丝状真菌、哺乳动物细胞等。现在学习的是第30页,共71页1、原核细胞-1(1)大肠杆菌大肠杆菌表达基因工程产物的形式:细胞不溶性表达(
19、包含体)、细胞内可溶性表达、细胞周质表达等,极少数情况下还可分泌到细胞外表达。不同的表达形式具有不同的表达水平,且杂质的含量和种类也会变化。大肠杆菌中的表达的特点:不存在信号肽,产品多为胞内产物;分泌能力不足,真核蛋白质常形成不溶性的包含体,产物须在下游处理过程中经过变性和复性处理才能恢复其生物活性;不存在翻译后修饰作用;翻译通常从甲硫氨酸的AUG密码子开始,故目的蛋白质的N端常多余一个甲硫氨酸残基,容易引起免疫反应;产生的内毒素难以除去;产生的蛋白质酶会破坏蛋白质。现在学习的是第31页,共71页1、原核细胞-2(2)枯草芽孢杆菌分泌能力强,可以将蛋白质产物直接分泌到培养液中,不形成包含体。该
20、菌也不能使蛋白质产物糖基化,另外由于它有很强的胞外蛋白酶,会对产物进行不同程度的降解,因此在外源基因克隆表达的应用中受到影响。现在学习的是第32页,共71页1、原核细胞-3(3)链霉菌其是重要的工业微生物,近年来作为外源基因表达体系正日益受到人们的重视。其主要特点是:不致病、使用安全,分泌能力强,可将表达产物直接分泌到培养液中,具有糖基化能力,变铅青链霉菌限制修饰能力弱,可以作为理想的受体菌。现已构建了一系列有效的载体,下游培养工艺也已经成熟。现在学习的是第33页,共71页2、真核细胞-1(1)酵母 特点:真核生物细胞,故有后翻译过程;基因组小,仅为大肠杆菌的4倍;世代时间短,有单倍体和双倍体
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- 生物技术 制药 第三 基因工程
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