氨基酸蛋白质与核酸.ppt
《氨基酸蛋白质与核酸.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《氨基酸蛋白质与核酸.ppt(167页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、关于氨基酸蛋白质和核酸第一张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月蛋白质在生物体内占有特殊的地位,它是生命现象的最基本的物质基础。生命是物质运动的高级形式,这种运动形式是通过蛋白质来实现的。生物体内存在的多数物质,除水之外,都含有一种或多种蛋白质。蛋白质参与有机体的结构组成,催化细胞中化学反应并执行着无数的各式各样的主要功能。第二张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月所有蛋白质均含C、H、N、O,大多数蛋白质还含少量的S,除此之外,有些还含磷、铁、镍、铜、碘等。所有蛋白质的含氮量都很接近,平均为16,这个数值可作为蛋白质的定量测定(1克氮相当于6.25克蛋白质)。蛋白质彻底水解得
2、氨基酸的混合物,氨基酸是蛋白质的基本组成单位。第三张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月1.天然氨基酸氨基酸是形成蛋白质的基本单元组成蛋白质的天然氨基酸主要有20种,均为L型a-氨基酸第一节氨基酸第四张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基酸常用的名称多来自于来源或性质。如:微具甜味的甘氨酸,从天门冬植物中得到的天门冬氨酸,蚕丝中的丝氨酸等等。1975年,IUPAC对20多种蛋白氨基酸中的每个氨基酸都作了一个正式命名及标准的一个字母或三个字母组成的通用的缩写符号,并规定了它们的碳架结构。缩写符号由其英文名称的前三个字母组成,这种符号在表示蛋白质和肽链结构时是被广泛采用的。第五
3、张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月2.天然氨基酸的结构和名称非极性(疏水性)中性氨基酸:8种第六张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月极性(不带电荷)中性氨基酸:7种第七张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月酸性氨基酸:2种碱性氨基酸:3种第八张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月3.氨基酸的性质水溶液中为两性离解氨基酸在固态时主要以内盐形式存在高熔点或分解点不溶于有机溶剂3.氨基酸的性质3.1两性解离和等电点第九张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基酸的等电点IP(等电点,isoelectricpoint):氨基酸处于电中性时的pH值等电点时氨
4、基酸以两性离子形式存在,处于电中性状态,在电场中不移动。等电点时氨基酸溶解度最小,易结晶析出。中性氨基酸pI7(7.510.8)第十张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月3.2氨基酸氨基端的反应Sanger试剂第十一张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基酸中氨基能与亚硝酸反应生成-羟基酸并快速放出氮气,这是一个定量反应,1摩尔氨基酸放出1摩尔氮气,通过定氮测定氨基酸的含量,可判断蛋白质的水解程度。随着蛋白质的水解,氨基氮的量逐渐上升,但总氮量不变。通常将氨基氮/总氮量表示蛋白水解的程度,比值越大,水解程度越高。RCHCOOH+HNO2NH2RCHCOOHOH+N2+OH2第
5、十二张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基与甲醛作用后转化为亚胺或醇胺,碱性消失,这样可以用碱来滴定羧基的量,这个方法称为甲醛滴定法:NH3NH2H+NHCH2OHN(CH2OH)2RCHCOO-+RCHCOO-+NaOH滴定中和HCHORCHCOO-HCHORCHCOO-羟甲基氨基酸第十三张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基酸分子在溶液中主要是以两性离子形式存在,不能直接用酸、碱滴定。加入甲醛就可以使平衡向右移动,从而游离出质子,这样就能用酸碱滴定法来滴定。通过氨基酸的甲醛滴定法,可以求得氨基酸的含量。但这种方法的误差常在10左右,只可大体判断蛋白质水解的程度或合成
6、的速度。第十四张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基上的氮原子具有亲核性,因此能与烃化试剂反应,如与2,4-二硝基氟苯的反应:该反应发生在弱碱性溶液中,它首先被英国的Sanger用来鉴定多肽或蛋白质的末端氨基,曾经广泛应用于测定氨基酸在多肽或蛋白质中的排列顺序。FNO2O2N+NH2CHCOOHRNO2O2NCHCOOHRNH+HFDNP-氨基酸第十五张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基酸中的羧基表现出的主要反应与通常的羧基相似,如可以酯化、酰胺化、还原等:3.3氨基酸羧基端的反应NH2NH2NH2NH2R-CH-COOHR-CH-COOCH3CH3OHHClRNH2
7、DCCR-CH-CONHRLiAlH4R-CH-CH2OH第十六张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月3.4 氨基酸与水合茚三酮的反应氨基酸与水合茚三酮的反应水合茚三酮应用氨基酸的显色定量分析OOOHOH+NH2COOHR+H2O+CO2OOOON+RCHO蓝紫色,罗曼紫第十七张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月OOOOOOHOHNH2ROON-CHRCO2HCH COOH茚三酮水合茚三酮-H2OOON-CRCO2HOON=CRCO2HOH-H2OH2ORCOCO2HRCHO+CO2第十八张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月OONH2HOOOOOOONHOHOOON
8、第十九张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月许多氨基酸可以通过某些易得到的蛋白质水解而产生。如味精谷氨酸钠就是面粉中的蛋白质(面筋)的水解产物,胱氨酸是动物毛发水解的产物。3氨基酸的制备第二十张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月通过有机合成制备的氨基酸常常是外消旋的混合物。如可以从醛酮为主要原料得到氨基酸:NH2NH2RCHONH3RCH=NH+H2OHCNRCHCNH3ORCHCO2H+第二十一张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月-卤代酸的氨解也是制备氨基酸的好方法。由于生成的氨基酸上的氨基碱性较弱,故多取代的产物并不多:BrNH2RCHCO2HNH3RCHCO2
9、H第二十二张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月要得到纯的伯胺取代的氨基酸,可以用盖布尔(Gabriel)法:N-KOOXN-CHRCO2ROOH+NH2CO2HCO2HRCHCO2RRCHCO2H+第二十三张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月工业上脯氨酸由明胶水解制得,L-氨基酸用吲哚、丙酮酸和氨在色氨酸酶作用下生产,光活性的L-赖、缬、亮、异亮、苏、精、苯丙氨、酪、组、脯等L-氨基酸主要由微生物发酵法生产,甘、丙和蛋氨酸主要仍用合成法来制取。生物体系中氨基酸的合成在酶的催化下进行,多由-酮酸经还原氨基化产生,NANH为还原剂,其化学原理和实验室里的合成完全一样。第二十四张
10、,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月氨基酸是人工合成肽和蛋白质的原材料。在医药卫生上,用适当比例配制的氨基酸混合物可以直接注射到人体血液以补充营养,部分地代替人的血浆。对创伤、烧伤手术后的病人有增进抗病力,促进康复的作用。某些氨基酸对特殊疾病还有治疗功效。如:半胱氨酸有抗辐射和治疗心脏机能衰弱的效果。有些“必需氨基酸”在人体和动物营养上有维持正常发育的保健功用。在食品烹调上,可利用氨基酸增加鲜味,促进食欲。最常用的“味精”就是谷氨酸钠盐,其它象天冬氨酸、甘氨酸、丙氨酸、组氨酸、赖氨酸等也都有鲜味,可用作增鲜剂。第二十五张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月肽是由两个或两个以上的
11、氨基酸通过肽键联结所形成的化合物。肽键是一个氨基酸的羧基和另一氨基酸的氨基缩合去1分子水而形成的键。肽键二肽肽键是氨基酸在蛋白质分子中的主要连接方式第二节肽NH2CH COOHR1+CH COOHR2NHHOH2NH2CH CONHR1CH COOHR2第二十六张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月肽:氨基酸偶联产物,分子量小于10000蛋白质:分子量大于10000一个三肽二肽第二十七张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月二肽仍有自由氨基和羧基,故能继续形成三肽或四肽等等。多肽链中有自由氨基的一端称为氨基末端(或N一端);有自由羧基的一端称羧基末端(或C一端)。在书写多肽或蛋白
12、质肽链结构时,习惯上总是将N一端写在左边,C一端写在右边。第二十八张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月多个氨基酸由多个肽键结合起来形成的肽称为多肽(polypeptide),分子量大于10000的肽一般就称之为蛋白质了。形成肽键的氨基酸可以是相同的,也可以是不相同的。两个不相同的氨基酸成肽时,会有两种可能的结合方式,一个氨基酸给出羧基上的一个羟基成肽后留下游离的胺基,而另一个氨基酸给出一个氨基上的氢成肽后留下的羧基。第二十九张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月上述三肽被命名为缬氨酰半胱氨酰甘氨酸。但这样的命名显然有点繁琐,故可以将其简称为缬-半胱-甘肽或缬半胱甘肽或缬半胱甘
13、肽。用英文缩写符号来表示,这个三肽可命名为Val-Cys-Gly或ValCysGly。肽的书写和命名都由左到右排列,即从N-端开始书写到C-端为止,称为某酰某酰某酸。如CH(CH3)2OCH2SHOH2NCHC-NHCHC-NHCH2CO2H第三十张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月因为n种不同的氨基酸形成多肽时可以有n!种不同的排列方式,要研究肽及由肽组成的蛋白质,则首先必须测定肽的结构。1肽结构的测定第三十一张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月首先用超离心法、渗透法和X-衍射法测定多肽的分子量.然后彻底水解为游离的氨基酸,色氨酸在这一过程中有部分水解。各种氨基酸的混合物
14、经纸层析分离.用茚三酮显色的方法与已知氨基酸比较可以鉴别氨基酸的存在,通过比色的方法测定各种氨基酸的相对含量,从而得到各种氨基酸的数目。1958年以来,由氨基酸自动分析仪来进行这一工作已经非常迅速方便,样品只要达到微克数量级就能测定。第三十二张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月含半胱氨酰基的多肽或蛋白质中的两个SH基常常氧化成二硫化物,或者是分子内成环,或者是两条肽链用-S-S-键联在一起。测定结构时可用过氧酸氧化断裂二硫键成磺酸或用过量的乙硫醇处理,生成的-SH基再用碘乙酸转变为硫醚,以免被氧化为二硫化物。根据多肽的分子量和所含氨基酸的相对含量,能够得出多肽的分子式。氨基酸在肽链中
15、的排列次序的测定一般是借助于部分水解和端基分析这两个方法来进行的。第三十三张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月部分水解法是将多肽分解成多个小分子肽,蛋白质水解酶通常只能水解一定类型的肽键,即它们都是高度专一性的。如,胰蛋白酶可以专门水解赖氨酸或精氨酸的羧基形成的肽键,因此用它来催化水解某一多胎,得到的肽C-端将肯定是赖氨酸或精氨酸。糜蛋白酶则专一性水解由芳香氨基酸如苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸的羧基形成肽链。胃蛋白酶,可水解苯丙氨酸、色氨酸、赖氨酸、谷氨酸、精氨酸的羧基形成的肽链。利用溴化氰水解法也可以得到由蛋氨酸羧基形成的肽键断裂后的小肽产物。第三十四张,PPT共一百六十七页,创作于2
16、022年6月端分析法可分为N-端C-端两种方法,可利用这两个氨基酸残端和专门的标记化合物反应,再经水解后来加以鉴定。如,肽链N-端和2,4-二硝基氟苯(DNFB)作用生成N-端带有2,4-二硝基氟苯的肽(DBP),水解后只有这个氨基酸带有该取代基团,而且各种带有DNFB的氨基酸都是黄色的,容易通过层析比较比移Rf值得到鉴定结果。通过这个方法,即可识别肽中的N-端氨基酸了。第三十五张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月还有一种标记N-端的化合物是硫氰酸苯酯,它和N-端的氨基酸反应生成苯胺基硫代甲酸衍生物。后者在无水氯化氢作用下发生关环作用,形成一个取代二氢噻唑酮的衍生物而从肽链上断裂下来
17、。取代二氢噻唑酮在酸性条件下重排为取代苯基乙内酰硫脲,后者经分离后用色谱或质谱方法可与标准样品比较。失去了N-端的肽键回收后再重复这个程序就可以再进行N-端氨基酸的标记和鉴别。应用这个原理设计成功的自动分析仪已能精确测定多达60个氨基酸以下的多肽结构,这被称为Edman降解法。第三十六张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月RSRROSN=C=SNHHCH-COOH+PITCPH8.3NH.CNHCHCOOHPIC-氨基酸苯氨基硫甲酰氨基酸无水HFNCCNHCH苯硫乙内酰脲氨基酸(酸中极稳定)第三十七张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月C-端的标记方法可由羧肽酶来进行。在这个酶
18、作用下,只有最靠近羧基的那个肽键水解。该方法虽然也可一步步重复操作,测定时从酶的水解液中定期取出一点样品,并以各种氨基酸出现的先后次序分析出氨基酸从C-端起排列的顺序,但肽链超过六七个以上时可靠性就开始差了。另一个方法是利用无水肼和多肽的反应,在105加热一段时间后,不在C-端的氨基酸都形成相应的肼化物,继续反应生成不溶水的苯腙衍生物被除去,C-端氨基酸得以鉴定。第三十八张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月肽链结构的确定主要利用小片断重叠的原理,即用两种或两种以上的方法将肽链切断,各自得到一系列肽段,将肽段分离纯化,测定其顺序,然后用找重叠肽的方法得出其顺序。RRORR-NHCHCO
19、NHCHCO2HNH2NH2-NHCHCNHNH2+.H2NCHCO2H第三十九张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月有一九肽,胰蛋白酶水解得下列肽段:Ala-Ala-Trp-Gly-Lys;Thr-Asn-Val-Lys。胰凝乳蛋白酶水解得肽段:Val-Lys-Ala-Ala-Trp;Thr-Asn;Gly-Lys。根据重叠肽推知九肽顺序:Thr-Asn-Val-Lys-Ala-Ala-Trp-Gly-Lys。第四十张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月官能团羧基和氨基的活化,使之在温和的条件下就能够反应。官能团保护,将同一个分子中的这两个官能团中的一个保护起来不反应,选择性
20、的留下一个羧基或氨基去构成所需的肽键结构,反应完后再定量地去掉保护基,同时还不影响分子中的其他部分特别是已接好的的肽链。2.肽的合成氨基酸侧链上的官能团在反应成肽前后不受影响第四十一张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月常用的保护氨基的方法是将其和氯甲酸苄酯反应OROROR ORRORRPhCH2OCClH2NCHCO2HPhCH2OCNHCHCO2HPhCH2OCNHCHCNHCHCO2HH2Pd/CPhCH3CO2H2NCHCNHCHCO2H+H2NCHCO2H第四十二张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月用氯甲酸叔丁酯ORORORO RRORR(CH3)3COCClH2N
21、CHCO2H(CH3)3COCNHCHCO2H(CH3)3COCNHCHCNHCHCO2HH2Pd/CCO2H2NCHCNHCHCO2H+H2NCHCO2H(CH3)2C=CH2第四十三张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月羧基一般可将其作为酯基保护起来。常见的如甲酯、乙酯和苄酯,酯基比酰胺键易于水解,可由稀碱催化水解为羧酸盐。氨基酸侧链中的巯基、羟基可将其转化为苄硫和苄基醚的形式,反应后分别用Na/NH3和氢解的方法除去苄基保护基,侧链中的氨基可转变为对甲基苯磺酰基,反应成肽后也可以用Na/NH3作用分解除去对甲苯磺酰基。第四十四张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月常用的活
22、化方法是将羧基转变为酰氯或酯或混合酸酐以增加羧基的亲电能力。酰氯的活性太大,易产生其它副反应,故用得最多的是酯和酸酐。利用高效专一的缩合剂或脱水剂如二环己基碳二亚胺(DCC),也可以使羧基和氨基有效组成酰胺键,这是应用最为广泛也最为有效的一种方法。反应在常温下进行,中间体无需分离,产率也很高。此外,N-羟基丁二酰亚胺也是一个活化羧基的优良试剂。第四十五张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月NOOOHNOORCHCO2NHCbzNHCbzRCHCO2HDCCRNHCHRCO2RRCHCONRCHRCO2R+第四十六张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月多肽的合成例:(Cbz)第四
23、十七张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月例:第四十八张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月多肽固相合成法以快速简便的操作和较高的产率显示了这一方法的优越性和新颖性。该方法主要是在不溶性的由苯乙烯和对苯二乙烯共聚树脂(P)的表面上进行反应。第四十九张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月树脂表面上已经进行了氯甲基化,它和一个氨基酸反应时,苄基氯反应生成苄酯并接在树脂上,该树脂和氨基已用叔丁氧甲基(BOC)基团保护过的另一种氨基酸在DCC存在下振荡,生成一个仍挂在树脂上的氨基被保护的二肽,用三氟乙酸或HAc/HCl去掉BOC基团后再和另一个氨基酸反应,如此重复不断构成新的肽
24、键,直到达到所需的肽的氨基酸数目和类型,最后一步用氢溴酸和三氟乙酸处理,使肽链从树脂上分裂下来,树脂也恢复为溴甲基化的树脂,可以继续用于固相合成。第五十张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月固相多肽合成的方法已经应用于自动化的仪器操作上,使合成速度大大加快,过去需要几年时间才能完成的合成工作在仪器上进行只要十几天就可以了。Merrifield也因其出色的多肽固相合成工作而荣获1984年诺贝尔化学奖。第五十一张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月固相合成方法的优点是可以用过量的试剂,使偶联反应更快、更有效,多余的试剂、副产物、溶剂容易洗涤除去,只有产物在树脂上,省去了重结晶和层析
25、的分离操作,操作相对较为简单并可实现自动化。缺点是生成的多肽在最后一步完成后才进行提纯,即使每步的产率99%,也有1%未起反应,而且得到的多肽中会混有缺少一个或多个杂质肽,这给提纯工作带来很大的困难。第五十二张,PPT共一百六十七页,创作于2022年6月通过重组DNA技术还可得到肽类药物、疫苗等。越来越多的小肽可作为药物,具有重要的应用价值,但由于它们天然存在量极微而难以提取及纯化,故化学合成小肽成为重要的途径。如化学合成的二肽L-天冬酰苯丙氨酰甲酯(L-aspartyl-L-phenylalanylmethylester),就是一种人造甜味剂,其商品名“NutraSweet”。其结构式如下:
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 氨基酸 蛋白质 核酸
限制150内