酶与底物分子的相互作用.ppt

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1、关于酶与底物分子的相互作用现在学习的是第1页，共27页酶酶+底物底物 酶酶-底物复合物底物复合物 产物产物+酶酶*现在学习的是第2页，共27页在反在反应应中，中，E与与S通通过过某种方式某种方式结结合形成合形成ES时时，使使底物分子内某底物分子内某些化学些化学键键呈不呈不稳稳定状定状态态，从而降低了活化能。，从而降低了活化能。ES复合物复合物还还可可转变为转变为酶酶与与产产物的复合物物的复合物EP，继继而而EP分解出分解出P和和E。ES复合复合物的形成是决定反应速率的关键步骤。物的形成是决定反应速率的关键步骤。许多实验事实证明了许多实验事实证明了ES复合物的存在，复合物的存在，如：已如：已获获

2、得得ES结结晶晶、X线线衍射法描出衍射法描出ES图图象象、同位素同位素标记标记底物底物实验实验、光光谱谱分析分析分析分析现在学习的是第3页，共27页酶和底物之间结合的作用力静电引力酶分子中带正或负电荷的基团与底物分子中带相反电荷的基团相互作用该作用力大小与正负电荷量成正比，与介电常数成反比，在疏水环境比在亲水环境中更强。现在学习的是第4页，共27页氢键 键能高、有方向性 能诱导底物基团的价 键状态发生变形和极化现在学习的是第5页，共27页酶和底物之间结合的作用力疏水键蛋白质分子侧链含大量亲水性和疏水性基团。酶分子的活性中心处于一定程度的疏水环境。活性中心的疏水键与底物分子的疏水部分结合，并且能

3、够维持活性中心空间结构稳定性。现在学习的是第6页，共27页酶和底物之间结合的作用力此外，微环境也会影响酶和底物的结合酶活性中心处于一个非极性环境中，从而有利于同底物的结合。（水的极性和形成氢键的能力都较强，能够减弱极性基团间的相互作用）现在学习的是第7页，共27页酶和底物分子相互作用的形式及意义（1）邻近效应与定向效应（2）与过渡态的结合作用（3）多功能催化作用（4）酶催化作用学说 锁钥学说 诱导契合学说 三点结合理论现在学习的是第8页，共27页邻近效应与定向效应邻近效应与定向效应变分子间反应为分子内反应。酶把底物分子从溶液中富集出来，使它们固定在活性中心附近，反应基团相互邻近，同时使反应基团

4、的分子轨道以正确方位相互交叠，反应易于发生。现在学习的是第9页，共27页邻近效应邻近效应邻近效应（Proximity effect）酶酶与底物形成中与底物形成中间间复合物后使底物之复合物后使底物之间间、酶酶的催化基的催化基团团与底物之与底物之间间相互靠近相互靠近，提高了反，提高了反应应基基团团的有效的有效浓浓度度，使反，使反应速率大大增加。应速率大大增加。现在学习的是第10页，共27页邻近效应咪唑催化对硝基苯酯的水解，分子内反应比分子间反应快24倍。说明咪唑基与酯基的相对位置对反应速率影响很大现在学习的是第11页，共27页定向效应定向效应定向效应（Orientation effect）由于由于

5、酶酶的构象作用，的构象作用，当底物和酶的反应中心结合后，在酶的反当底物和酶的反应中心结合后，在酶的反应中心活性基团的作用和诱导下，使底物的反应基团应中心活性基团的作用和诱导下，使底物的反应基团按照最佳按照最佳方式定向和定位方式定向和定位，大大增加反应速率。，大大增加反应速率。现在学习的是第12页，共27页反应基团定向和定向程度越高，反应速率越大。反之，反应基团定位程度低，则反应速率减小。现在学习的是第13页，共27页邻近定向效应小结邻近定向效应是指两种或两种以上的底物（特别是双底物）同时结合在酶活性中心上，相互靠近（邻近（邻近），并采取正确的空间取向（定向）（定向），这样大大提高了底物的有效浓

6、度，使分子间反应近似分子内反应从而加快了反应速度，可使可使双分子反应双分子反应速率提高速率提高104108倍倍。底物与活性中心的结合不仅使底物与酶催化基团或其它底物接触，而且强行“冻结”了底物的某些化学键的平动和转动，促使它们采取正确的方向，有利于键的形成。现在学习的是第14页，共27页与反应过渡态结合作用按SN2历程进行的反应，反应速度与形成的过渡状态稳定性密切相关。在酶催化的反应中，与酶的活性中心形成复合物的实际上是底物形成的过渡状态酶与过渡状态的亲和力要大于酶与底物或产物的亲和力。现在学习的是第15页，共27页与反应过渡态结合作用张力学说张力学说许多情况下，过渡态的形成与底物分子内的价键

7、张力有关许多情况下，过渡态的形成与底物分子内的价键张力有关当当 RCH3 时，其反应时，其反应 速度比速度比 RH的情况快的情况快 315倍。倍。由于由于-CH3 体积比较大，与反应基团之间产生一种立体排斥张力，从而使反应基团体积比较大，与反应基团之间产生一种立体排斥张力，从而使反应基团之间更容易形成稳定的五元环过渡状态。之间更容易形成稳定的五元环过渡状态。现在学习的是第16页，共27页与反应过渡态结合作用根据过渡态的结构设计的过渡态类似物可作为酶的强抑制剂，抑制效果远高于竞争性抑制剂。利用过渡态类似物作为抗原或半抗原，去免疫动物，由此产生的抗体可能有类似酶的催化作用。酶与过渡态的结合主要有两

8、种方式:非共价结合方式和共价结合方式，后者被称为共价催化。现在学习的是第17页，共27页脯氨酸消旋酶的过渡态及其过渡态类似物抑制剂脯氨酸消旋酶的过渡态及其过渡态类似物抑制剂现在学习的是第18页，共27页多功能催化作用酶的活性中心部位，一般含有多个起催化作用的基团，这些基团在空间有特殊的排列和取向，可以对底物价键的形变和极化及调整底物基团的位置等起到协同作用，从而使底物达到最佳反应状态。现在学习的是第19页，共27页多功能催化作用多官能团相互作用可使反应速率提高在吡啶酮存在下，O-四甲基-D葡萄糖的变旋速率可以提高7000倍。而相同浓度的酸和吡啶则对反应影响很小现在学习的是第20页，共27页锁钥

9、学说19801980年年E.FisherE.Fisher曾用曾用“模板模板”或称或称“锁与钥匙锁与钥匙”学说学说 （lock and key lock and key theory)theory)来解释酶作用的专一性来解释酶作用的专一性认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的，酶表面具有特定的形状。酶与底认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的，酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样物的结合如同一把钥匙对一把锁一样锁钥模型较好地解释了立体异构专一性。但不能解释可逆反应。锁钥模型较好地解释了立体异构专一性。但不能解释可逆反应。酶催化作用的三个学说现在学习的是第21页，共27

10、页诱导契合学说 1964年年Koshland提出了提出了诱导诱导契合学契合学说说（induced-fit hypothesis):该该学学说认为说认为酶酶表面并没有一种与底物互表面并没有一种与底物互补补的固定的固定形状，而只是由于底物的形状，而只是由于底物的诱导诱导才形成了互才形成了互补补形状形状。现在学习的是第22页，共27页现在学习的是第23页，共27页诱导诱导契合学契合学说说的中心思想的中心思想归纳归纳起来有起来有以下几点以下几点1、酶有其原来的形状，它一定一开始就是底物的模板。、酶有其原来的形状，它一定一开始就是底物的模板。2、底物能诱导酶的形状发生一定的变化、底物能诱导酶的形状发生一

11、定的变化3、当酶形状发生变化以后，就能使其中的基团形成正确的排列；、当酶形状发生变化以后，就能使其中的基团形成正确的排列；4、在酶反应过程中活性中心的这种构象的变化是可逆的，当它与、在酶反应过程中活性中心的这种构象的变化是可逆的，当它与底物结合时被诱导生成一种新的构象，而当反应结束并且产物从底物结合时被诱导生成一种新的构象，而当反应结束并且产物从酶分子表面脱落下来时，又恢复了原来的构象。酶分子表面脱落下来时，又恢复了原来的构象。现在学习的是第24页，共27页三点结合理论手性催化作用机制手性催化作用机制三点结合理论三点结合理论酶酶分子活性中心部位，一般都含有多个具有催化分子活性中心部位，一般都含

12、有多个具有催化活性的手性中心，能活性的手性中心，能够够识别底物识别底物分子中等价的前分子中等价的前手性手性原子或原子或基基团团。这这些手性中心些手性中心对对底物分子构型底物分子构型取向起着取向起着诱导和定向的作用，使反的作用，使反应应可以按可以按单单一一方向方向进进行行，不对称催化作用可以实现。，不对称催化作用可以实现。认为酶与底物的结合处至少有三点，且只有一种认为酶与底物的结合处至少有三点，且只有一种情况是完全结合的形式。因此称为三点结合理论情况是完全结合的形式。因此称为三点结合理论现在学习的是第25页，共27页三点结合理论认为立体异构的一对认为立体异构的一对底物底物，虽然基团相同，但空间排列不同。因而与，虽然基团相同，但空间排列不同。因而与酶活性中心基团不能同时互补，只有三点都匹酶活性中心基团不能同时互补，只有三点都匹配互补，才能结合而互补，才能结合而发生作用。用它来解释甘油激酶的作用发生作用。用它来解释甘油激酶的作用。现在学习的是第26页，共27页感感谢谢大大家家观观看看现在学习的是第27页，共27页