6酶化学学习教程.pptx
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1、23 三月 20231酶及化学本质酶的催化特性酶的组成及分类第一节 概 述第1页/共131页第一页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 20232一、酶的概念1.酶是生物催化剂2.酶的化学本质绝大多数酶是蛋白质(蛋白质类酶 P)依据:少数酶是核酸RNA(核酸类酶 ribozyme 核酶 R)3.酶和生命活动密切相关参与生命过程生物进化和组织功能分化的基础酶的活性调节机制第2页/共131页第二页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 20233酶的缺陷症苯丙酮尿症白化症鲟鱼第3页/共131页第三页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 20234蛋白质类酶的发现历史1783年,意大利科学
2、家斯巴兰让尼1857年,巴斯德(Pasteur)就酒的发酵提出存在“ferments”(酵素)。1878年,库恩(Kuhne)提出Enzyme。1926年 美国 萨姆纳Sumner 从刀豆种子中提取了脲酶的结晶。19301936年,Northrop和Kunitz得到了胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶结晶。1949年Sumner 和Northrop共同获得诺贝尔化学奖。J.B.SumnerJ.H.Northrop第4页/共131页第四页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 20235核酸类酶的发现(ribozyme ribozyme 核酶 R R)1982年,Cech等研究原生动物四膜虫。1
3、983年Altman 等人在研究细菌 RNase P(20%的蛋白质和80%的RNA组成)时发现Cech和Altman也因此获得了1989年的诺贝尔奖。Thomas Cech University of Colorado at Boulder,USA Sidney Altman Yale University New Haven,CT,USA 第5页/共131页第五页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 20236二、酶的催化特性101页(一)酶和一般催化剂的比较共性:10-4 S-110-6 S-1AB反应速率常数(基态)(过渡态)(活化能)第6页/共131页第六页,编辑于星期五:八点
4、十三分。23 三月 20237(二)酶作为生物催化剂的特点1.酶易失活2.酶催化效率高转换数(Kcat):是指在一定条件下每秒钟每个酶分子转换底物的分子数。3%过氧化氢溶液少许铁粉生马铃薯块反应速率常数为610-4mol/s反应速率常数为6106mol/s第7页/共131页第七页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 20238第8页/共131页第八页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202393.酶具有高度专一性4.酶的活性受到调节和控制调节酶的浓度:诱导或抑制酶的合成;降解。通过激素调节酶活性:反馈抑制调节酶活性:抑制剂和激活剂对酶活性的调节:别构调控、酶原激活、酶的可逆共价修饰
5、和同工酶。第9页/共131页第九页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202310三、酶的组成及分类(蛋白类酶)1.按组成成分分单纯酶(简单蛋白质)结合酶(结合蛋白质)全酶(holoenzyme)=酶蛋白+辅因子决定酶反应的专一性及催化的高效率主要作用是作为电子、原子或某些基团的载体参与反应并促进整个催化过程。多数辅酶或辅基的前体物质是维生素表62第10页/共131页第十页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202311第11页/共131页第十一页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202312第12页/共131页第十二页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202313
6、2.2.根据酶的结构特点及分子组成形式分为单体酶(monomeric enzymes)卵溶菌酶第13页/共131页第十三页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202314寡聚酶(oligomeric enzymesoligomeric enzymes)第14页/共131页第十四页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202315第15页/共131页第十五页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202316第16页/共131页第十六页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202317多酶体系(multienzymes systemmultienzymes system):由几个
7、功能相关的酶嵌合而成的复合体。E1E2E3E4EnABCDEP第17页/共131页第十七页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023183.3.酶的命名与分类(1)习惯命名法(2)国际系统命名法(1961年国际生化学会)系统名应包括:底物(构型)、酶作用的基团、催化反应的类型习惯名称系统名称谷丙转氨酶丙氨酸 :酮戊二酸氨基转移酶乙醇脱氢酶 乙醇:NAD+氧化还原酶第18页/共131页第十八页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202319(3)国际系统分类法及酶的编号(蛋白类酶)氧化还原酶(1)AH2BABH2转移酶(2)ABCABC水解酶(3)ABH2OAOHBH裂合酶(4)A
8、BAB异构酶(5)AB 连接酶或合成酶(6):催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成A AB BATPATPABABADPADPPiPi或 A AB BATPATPABABAMPAMPPPiPPi亚类编号依次为 1.2.3.4.5.6.亚亚类编号依次为 1.2.3.4.5.6.第19页/共131页第十九页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202320酶的编号的举例ATP葡萄糖磷酸转移酶(已糖激酶)EC 2.7.1.1 表示第二大类,即转移酶表示亚类,转移磷酸基团表示亚亚类,OH为受体表示此酶在此亚亚类中的顺序号第20页/共131页第二十页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三
9、月 202321第二节 酶的结构与功能的关系酶的一级结构与催化功能的关系酶的高级结构与活性的关系第21页/共131页第二十一页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202322酶分子的结构特点裂缝、亲水区与疏水区、沟槽与洞穴。配体:酶的底物、辅酶或辅基、各种调节因子。第22页/共131页第二十二页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202323一、酶的一级结构与催化功能的关系1.必需基团常见的有:咪唑基、羟基(丝氨酸)、巯基2.酶原激活酶原与酶原激活:表633.共价修饰要求:修饰剂的要求,酶的要求,反应条件的要求。第23页/共131页第二十三页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月
10、 202324或胃蛋白酶肠激酶或胰蛋白酶胰蛋白酶糜蛋白酶胰蛋白酶胰蛋白酶第24页/共131页第二十四页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202325酶原激活胰蛋白酶原肠激酶 六肽胰蛋白酶弹性蛋白酶原胰凝乳蛋白酶原胰凝乳蛋白酶弹性蛋白酶羧肽酶原羧肽酶第25页/共131页第二十五页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202326胰凝乳蛋白酶原的激活第26页/共131页第二十六页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202327胰蛋白酶原的激活肠激酶酶活性中心第27页/共131页第二十七页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202328胃蛋白酶原激活过程第28页/共131页第
11、二十八页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202329酶级联反应:一种酶原的激活常常会引发一系列酶的激活,这样的系列激活反应称之酶级联反应。第29页/共131页第二十九页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202330共价修饰(1)体外常用的化学试剂有:二异丙基氟磷酸、碘乙酸、二硝基氟苯等(2)体细胞内磷酸化与脱磷酸乙酰化与脱乙酰甲基化与脱甲基腺苷化与脱腺苷等蛋白磷酸化酶蛋白激酶第30页/共131页第三十页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202331二、酶的活性与高级结构的关系1.活性中心(active center)酶分子中直接和底物结合并起催化反应的空间部位结合部位
12、催化部位决定酶专一性决定酶催化反应性质第31页/共131页第三十一页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202332245His57Ser195Asp10213161461494258182168例:胰凝乳蛋白酶的肽链折叠(示活性中心)Ser195(丝氨酸)His57(组氨酸)及Asp102(精氨酸)第32页/共131页第三十二页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202333第33页/共131页第三十三页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023342.2.二、三级结构与活性中心的关系牛胰核糖核酸酶的拆分试验(RNase,水解RNA的酶)由124个氨基酸组成,有4对二硫键
13、。活性中心:119和12 位的组氨酸残基构成S肽(120)、S蛋白第34页/共131页第三十四页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202335酶活性中心的特点在酶分子的总体中只占小部分。是一个三维实体。催化部位一般只由23个氨基酸残基组成,结合部位的残基数因酶而异。表101。和底物的形状并不是正好互补,需-诱导契合。位于结构域或亚基之间的裂隙或是表面的凹陷部位。底物通过次级键结合到酶上。具有柔性或可运动性。第35页/共131页第三十五页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202336酶的必需基团与活性中心必需基团包括活性中心的基团对维持酶的活性中心的空间构象所必要的那些基团.第3
14、6页/共131页第三十六页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202337酶的调控部位(Regulatory site)(Regulatory site)。第37页/共131页第三十七页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202338CCCCCRR3.3.聚合与解聚(四级结构与酶活性的关系)第38页/共131页第三十八页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023394.4.同工酶指能催化相同化学反应,但其酶蛋白本身的分子组成、结构、理化性质和免疫性能等方面都存在明显差异的一组酶。1959年Markert首次用电泳分离法发现动物的乳酸脱氢酶CH3CHOHCOONADCH3CC
15、OONADHHO乳酸丙酮酸LDH第39页/共131页第三十九页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202340乳酸脱氢酶同工酶(LDHLDH,存在于哺乳动物中的有五种)五种同工酶的亚基组成分别为H H H HH H H HH H HH H H M MH HH H M MM MH H M M MM M M M M M MM M M M第40页/共131页第四十页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202341M4 HM3 H2M2 H2M H3M H4第41页/共131页第四十一页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202342乳酸脱氢酶同工酶电泳图谱肝骨骼肌肾红细胞心肌阴级阳
16、级第42页/共131页第四十二页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202343研究同工酶的意义为细胞分化、发育、遗传等方面的研究提供了分子基础通过测定血清中某些酶的同工酶为某些疾病的诊断提供证据第43页/共131页第四十三页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202344第三节酶催化反应的机制酶促反应的本质酶反应机制第44页/共131页第四十四页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202345一、酶促反应的本质本质是降低反应的活化能。酶是如何工作的呢?第45页/共131页第四十五页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202346中间产物假说-酶的工作方式在酶催化的反应
17、中,第一步是酶与底物形成酶底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发生化学变化后(过渡态),中间复合物再分解成产物和酶。E +S E-SE-S E-SE-S P +E过渡态物质注意:1.底物同酶结合成中间复合物是一种非共价结合 2.底物过渡态物质与酶的亲合力比底物更强第46页/共131页第四十六页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202347速度时间PESES中间产物假说证据 获得了结晶ES复合物第47页/共131页第四十七页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202348二、酶反应机制.酶作用专一性的机制 锁钥假说诱导契合假说.酶作用高效性的机制(17)第48页/共131页第四十八
18、页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202349.酶作用专一性的机制锁钥假说(lock and key hypothesis):刚性模式,Emil Fisher提出第49页/共131页第四十九页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202350诱导契合假说(inducedinducedfit hypothesis)fit hypothesis)第50页/共131页第五十页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202351“三点结合”的催化理论第51页/共131页第五十一页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023522.酶作用高效性的机制底物与酶的邻近效应与定向效应底物
19、形变和诱导契合共价催化酸碱催化金属离子催化作用多元催化和协同效应活性部位微环境的影响第52页/共131页第五十二页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023531.1.底物与酶的邻近效应与定向效应(反应速率提高10108 8)邻近效应:ES的形成分子内反应定向效应:反应基团之间的正确取位第53页/共131页第五十三页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023542.2.底物形变和诱导契合第54页/共131页第五十四页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023553.3.共价催化(covalent catalysis)(covalent catalysis)110110页
20、亲核催化剂或亲电子催化剂酶中参与共价催化的基团主要包括 His 的咪唑基,Cys 的硫基,Asp 的羧基,Ser 的羟基等.第55页/共131页第五十五页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023564.4.酸碱催化(acid-base catalysis)(acid-base catalysis)广义酸碱与狭义酸碱氨基、羧基、硫氢基、酚羟基及咪唑基表His 的咪唑基是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团第56页/共131页第五十六页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202357广义酸基团广义酸基团 广义碱基团广义碱基团(质子供体)(质子供体)(质子受体)(质子受体)第57
21、页/共131页第五十七页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202358第58页/共131页第五十八页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 2023595.5.金属离子催化作用需金属的酶分类:金属酶;金属激活酶;金属离子参加催化作用途径第59页/共131页第五十九页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202360第60页/共131页第六十页,编辑于星期五:八点 十三分。23 三月 202361第四节 酶促反应动力学111页基本问题:反应进行的方向、可能性和限度;反应进行的速率和反应机制。化学动力学的研究:理论上:阐明化学反应的机制(过程和途径)。应用上:根据反应速率来估计反应进
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