sp微生物的分类和鉴定食品微生物学.pptx

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1、一、微生物在生物界的地位 生物的两大界生物的两大界动物界动物界和和植物界植物界。随着人们对微生物认识的逐步深入，从两界系统经历过随着人们对微生物认识的逐步深入，从两界系统经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，直到三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，直到20世纪世纪70年代后期，年代后期，Woese等发现了地球上的第三生命等发现了地球上的第三生命形式（形式（古菌古菌），导致了），导致了生命三域学说生命三域学说的诞生。的诞生。生命进化一直是人们所关注的热点，有人认为生命的共生命进化一直是人们所关注的热点，有人认为生命的共同祖先是一个原生物。同祖先是一个原生物。原生物在进化过程中产生

2、两个分原生物在进化过程中产生两个分支，一个是原核生物（细菌和古菌），一个是真核生物。支，一个是原核生物（细菌和古菌），一个是真核生物。在之后的进化过程中细菌和古菌首先向两个不同的方向在之后的进化过程中细菌和古菌首先向两个不同的方向进化，然后原真核生物经吞食一个古菌，并由古菌的进化，然后原真核生物经吞食一个古菌，并由古菌的DNA取代寄主的取代寄主的RNA基因组而产生真核生物。基因组而产生真核生物。从进化从进化的角度，微生物是一切生物的老前辈。的角度，微生物是一切生物的老前辈。（此观点，你（此观点，你认为怎样？）认为怎样？）第1页/共19页生物的界级分类学说生物的界级分类学说（提出时间、提出者、内

3、容）（提出时间、提出者、内容）两界系统：两界系统：1753年林奈提出，将生物分为植物界和动物年林奈提出，将生物分为植物界和动物界。界。三界系统：三界系统：1866年海克尔（年海克尔（Haeckel）将生物分成动物将生物分成动物界、植界、植 物界和原生生物界（低等生物）。物界和原生生物界（低等生物）。四界系统：四界系统：柯普兰（柯普兰（Copeland，1938，1956）提出植提出植物界、动物界、原生生物界和菌界；李德尔（物界、动物界、原生生物界和菌界；李德尔（Leedel，1974）提出植物界、动物界、真菌界和原核界的四界系提出植物界、动物界、真菌界和原核界的四界系统。统。第2页/共19页生

4、物的界级分类学说生物的界级分类学说（续）（续）五界系统：五界系统：1969年年Whittaker提出原核生物界、原生生提出原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界、动物界的五界系统。物界、真菌界、植物界、动物界的五界系统。六界系统：六界系统：1977年王大耒提出植物界、动物界、真菌界、年王大耒提出植物界、动物界、真菌界、原核生物界、原生生物界和病毒界的六界系统；原核生物界、原生生物界和病毒界的六界系统；1996年，美国的年，美国的P.H.Raven 等则提出包括动物界、植物界、等则提出包括动物界、植物界、原生生物界、真菌界、真细菌界和古细菌界。原生生物界、真菌界、真细菌界和古细菌界。三域（三原界

5、三总界、三超界）学说：三域（三原界三总界、三超界）学说：1977年罗斯年罗斯（Woses）提出古细菌、真细菌和真核生物三原界学说。提出古细菌、真细菌和真核生物三原界学说。第3页/共19页三原界学说第4页/共19页二、分类学规则1.种以上的系统分类单元 七级分类单元（taxon,taxa;category）界界界界 Kingdom Kingdom（拉：拉：拉：拉：RegnumRegnum）门门门门 PhylumPhylum（拉：拉：拉：拉：phylumphylum）或（拉：或（拉：或（拉：或（拉：DivisioDivisio）纲纲纲纲 ClassClass（拉：拉：拉：拉：ClassisClas

6、sis）目目目目OrderOrder（拉：拉：拉：拉：OrdoOrdo）科科科科 FamilyFamily（拉：拉：拉：拉：FamiliaFamilia）属属属属 GenusGenus（拉：拉：拉：拉：GenusGenus）种种种种 SpeciesSpecies（拉：拉：拉：拉：SpeciesSpecies）第5页/共19页2、种的概念：种种是一个基本分类单位，它是一大群表型特征是一个基本分类单位，它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。他种有着明显差异的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株

7、(type strain)来作具体标本，故这一典型菌株就是该种的模式种(type species)。种的定义应建立在遗传物质即DNA鉴定的基础上，把DNA同源性的大小作为划分种的标准。第6页/共19页种的分类地位举例：种的分类地位举例：灰色链霉菌：灰色链霉菌：原核生物界(Procaryotae)、厚壁菌门(Tenericutes)、枝形细菌纲(Thallobacteria)、放线菌目(Actinomycetales)、链霉菌科(Streptomycetaceae)、链霉菌属(Streptomyces)、灰色链霉菌(S.griseus)。第7页/共19页种的分类地位举例 三种微生物的分类地位举例

8、：分类单元海扇脊螺旋体灰色链霉菌八孢裂殖酵母界原核生物界原核生物界真菌界门薄壁菌门厚壁菌门真菌门亚门子囊菌亚门纲暗细菌纲枝形细菌纲半子囊菌纲目螺旋体目放线菌目内孢霉目科螺旋体科链霉菌科内孢霉科属脊螺旋体属链霉菌属裂殖酵母属种海扇脊螺旋体灰色链霉菌八孢裂殖酵母分类系统伯杰氏手册（1984）伯杰氏手册（1984）Aingsworth(1971)第8页/共19页3.学名(双命名法）1753年，瑞典植物学家林奈创立学名 属名种的加词（首次定名人）现名定名人定名年份 (必要，用斜体排字）（可省略，均用正体排字）举例：金黄葡萄菌：Staphylococcus aureus Rosenback猪霍乱沙门氏菌

9、 ：Salmonella cholerae-suis(Smith)Weldin,1927 Bacillus cholerae-suis Smith,1894蜡状芽孢杆菌荧光变种：把Bacillus cereus var.fluorescens Laubachvariety三名法 subsp 和var学名的发音第9页/共19页4.亚种以下的分类单元亚种亚种(subspecies)：当某一个种内的不同菌株存在少数明当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状而有不足以区分成新种时，显而稳定的变异特征或遗传性状而有不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成亚种。变种是亚种的同义词，现在

10、可以将这些菌株细分成亚种。变种是亚种的同义词，现在不再使用该词。不再使用该词。型型(form)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。同的型。群群(group)：有些微生物种类的特性介于两种微生物之间，有些微生物种类的特性介于两种微生物之间，彼此之间难以区分开来，就把这两种微生物和介于它们之彼此之间难以区分开来，就把这两种微生物和介于它们之间的种类统称为一个间的种类统称为一个“群群”。菌株菌株(strain)或品系：是指不同来源的相同的种（或

11、型）。或品系：是指不同来源的相同的种（或型）。即从自然界中分离到的每一个微生物的纯培养都可以称为即从自然界中分离到的每一个微生物的纯培养都可以称为一个菌株。菌株名称常用数字编号、字母、人名、地名等一个菌株。菌株名称常用数字编号、字母、人名、地名等表示。如生产蛋白酶的枯草杆菌表示。如生产蛋白酶的枯草杆菌1.3981.398，生产淀粉酶的枯，生产淀粉酶的枯草杆菌草杆菌7.6287.628。第10页/共19页三、微生物的分类鉴定方法1.1.分类鉴定的基本方法分类鉴定的基本方法特征对比是分类的基本方法。特征对比是分类的基本方法。通常可把微生物的分类鉴定方法分成通常可把微生物的分类鉴定方法分成4 4个不

12、同水平。个不同水平。（1 1）细胞的形态和习性水平。）细胞的形态和习性水平。（2 2）细胞组分水平。）细胞组分水平。（3 3）蛋白质水平。）蛋白质水平。（4 4）核酸水平。）核酸水平。当然，还有其他方法，如数值分类法等。当然，还有其他方法，如数值分类法等。第11页/共19页2.2.微生物的经典鉴定内容微生物的经典鉴定内容（1 1）培养特征：培养特征：菌落的形状、大小、颜色、隆起、表面菌落的形状、大小、颜色、隆起、表面状况、质地、光泽、水溶性色素等，在半固体或液体培状况、质地、光泽、水溶性色素等，在半固体或液体培养基中的生长状态。养基中的生长状态。（2 2）形态特征：形态特征：个体细胞形态、大小

13、、排列方式、运动个体细胞形态、大小、排列方式、运动性、特殊构造和染色反应等。性、特殊构造和染色反应等。（3 3）生理、生化反应：生理、生化反应：营养要求、酶、代谢产物、环境营养要求、酶、代谢产物、环境要求、对药物的敏感性。要求、对药物的敏感性。（4 4）繁殖方式与生活史：繁殖方式与生活史：无性与有性繁殖。无性与有性繁殖。（5 5）血清学反应血清学反应（6 6）噬菌体敏感性噬菌体敏感性（7 7）其他其他第12页/共19页四、各大类微生物的分类系统纲要分类依据：形态特征、培养特征、生理生化特征以及血分类依据：形态特征、培养特征、生理生化特征以及血分类依据：形态特征、培养特征、生理生化特征以及血分类

14、依据：形态特征、培养特征、生理生化特征以及血清学反应和噬菌体敏感性等。清学反应和噬菌体敏感性等。清学反应和噬菌体敏感性等。清学反应和噬菌体敏感性等。新的分类方法：核酸分析法、数值分类法和新的分类方法：核酸分析法、数值分类法和新的分类方法：核酸分析法、数值分类法和新的分类方法：核酸分析法、数值分类法和DNADNADNADNA体外杂体外杂体外杂体外杂交法等。交法等。交法等。交法等。1、原核微生物分类系统纲要伯杰氏鉴定细菌学手册1923、1974、1994（第九版）（1）手册中的高级分类单元，有四个门（2）手册所包括的主要科属（3)重要原核微生物类群简介伯杰氏系统细菌学手册1984-1989、200

15、0（1）表型、实用性鉴定指标向鉴定遗传型的系统进化分类体系转变（2）内容丰富、5卷2界(古生菌界和细菌界）第13页/共19页2、真菌的分类系统纲要、真菌的分类系统纲要（1）真菌界：）真菌界：真菌自成一界的原因真菌自成一界的原因真菌的营养方式：分解吸收式真菌的营养方式：分解吸收式细细胞胞结结构构和和化化学学成成分分：独独特特，如如细细胞胞壁壁主主要要成成分分为为几几丁丁质；细胞中无叶绿体；线粒体、核糖体不同于植物。质；细胞中无叶绿体；线粒体、核糖体不同于植物。组组织织分分化化程程度度差差，一一般般有有发发达达的的菌菌丝丝体体和和各各种种子子实实体体构构造。造。核核分分裂裂方方式式简简单单，除除正

16、正常常有有性性生生殖殖外外，还还有有准准性性生生殖殖（发发生生在在体体细细胞胞间间的的基基因因重重组组方方式式，从从而而导导致致了了变变异异和和广广泛适应不同环境的特性）。泛适应不同环境的特性）。真真菌菌细细胞胞色色素素c的的结结构构比比较较接接近近动动物物而而远远于于植植物物，它它与与动动物的差别要大与动物与植物的差异。物的差别要大与动物与植物的差异。第14页/共19页（2）Ainsworth系统（系统（1966年）年）Ainsworth（ed.7,1983）的真菌分类系统纲要的真菌分类系统纲要:Dictionary of the fungi(Hawksworth,D.L.et al.198

17、3)菌物界：两大门（粘菌门和真菌门），真菌门又分五亚门（鞭菌物界：两大门（粘菌门和真菌门），真菌门又分五亚门（鞭毛菌亚门、结合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌毛菌亚门、结合菌亚门、子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌亚门亚门）。）。Dictionary of the fungi(ed.8,Hawksworth,D.L.et al.1995)真核生物域的菌物：原生动物界、假菌界界、真菌界。真核生物域的菌物：原生动物界、假菌界界、真菌界。真菌界：子囊菌门（真菌界：子囊菌门（Ascomycota）、担子菌门）、担子菌门（Basidiomycota）、壶菌门（）、壶菌门（Chytridiomycota

18、）、结）、结合菌门（合菌门（Zygomycota）和有丝孢菌类（）和有丝孢菌类（Mitosporic Fungi）。）。Dictionary of the fungi(ed.9,Kirk,P.M.et al.2001)Dictionary of the fungi(ed.10,Kirk,P.M.et al.2009)第15页/共19页五、微生物形态结构的观察方法1、肉眼观察：群体2、显微镜观察：光学、电子3、染色法：步骤：涂片、固定、染色、水洗、吸干 染色方法：简单染色法 鉴别染色法：革兰氏染色法、抗酸性染色法 特殊染色法：芽孢、荚膜、鞭毛第16页/共19页复习思考题：复习思考题：1.1.种以上通用分类单元分几级？种以上通用分类单元分几级？2.2.什么是种什么是种?为何微生物种的定义比高等生物难下为何微生物种的定义比高等生物难下？3.3.什么是双命名法？有何规定？什么是双命名法？有何规定？4.4.什么是菌株、模式菌株？菌株名称用什么表示？什么是菌株、模式菌株？菌株名称用什么表示？5.5.真菌为何自成一界？真菌为何自成一界？6.6.熟记一些最基本的微生物学名或属名。熟记一些最基本的微生物学名或属名。第17页/共19页第18页/共19页感谢您的观看！第19页/共19页