第四章连锁遗传和性连锁bibl.pptx
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1、第第4 4章章 连锁遗传和性连锁连锁遗传和性连锁W.Bateson(1906)在香豌豆在香豌豆两对相对性状杂交试验中发两对相对性状杂交试验中发现连锁遗传现连锁遗传(linkage)现象。现象。T.H.Morgan et al.(1910)提提出连锁遗传规律以及连锁与出连锁遗传规律以及连锁与交换的遗传机理,并创立基交换的遗传机理,并创立基因论因论(theory of the gene)。1第4章 连锁遗传和性连锁第一节第一节 连锁与交换连锁与交换第二节第二节 交换值及其测定交换值及其测定第三节第三节 基因定位与连锁遗传图基因定位与连锁遗传图第四节第四节 真菌类的连锁与交换真菌类的连锁与交换第五节
2、第五节 连锁遗传规律的应用连锁遗传规律的应用第六节第六节 性别决定与性连锁性别决定与性连锁2第第1节节 连锁与交换连锁与交换一、一、连锁遗传现象连锁遗传现象香豌豆香豌豆(Lathyrus odoratus)两对相对性状杂交试验两对相对性状杂交试验.花色花色:紫花紫花(P)对红花对红花(p)为显性;为显性;花粉粒形状:花粉粒形状:长花粉粒长花粉粒(L)对圆花粉粒对圆花粉粒(l)为显为显性。性。1.紫花、长花粉粒紫花、长花粉粒红花、圆花粉粒红花、圆花粉粒.2.紫花、圆花粉粒紫花、圆花粉粒红花、长花粉粒红花、长花粉粒.3组合一:组合一:紫花、长花粉粒红花、圆花粉粒组合一:组合一:紫花、长花粉粒紫花、
3、长花粉粒红花、圆花粉粒红花、圆花粉粒4组合二:组合二:紫花、圆花粉粒红花、长花粉粒6连锁遗传现象连锁遗传现象杂交试验中,原来为同一亲本所具有的两个性状在杂交试验中,原来为同一亲本所具有的两个性状在F2中不符合独立分配规律,而常有连在一起遗传的倾中不符合独立分配规律,而常有连在一起遗传的倾向,这种现象叫做向,这种现象叫做连锁连锁(linkage)(linkage)遗传现象遗传现象。相引组相引组(coupling phase)与与相斥组相斥组(repulsion phase).描述描述亲本亲本花色花色花粉粒形状花粉粒形状两个显性性状连在一起遗传两个显性性状连在一起遗传P1紫花紫花(显显)长花粉粒长
4、花粉粒(显显)两个隐性性状连在一起遗传两个隐性性状连在一起遗传P2红花红花(隐隐)圆花粉粒圆花粉粒(隐隐)一个显性性状与另一个隐性性状一个显性性状与另一个隐性性状P1紫花紫花(显显)圆花粉粒圆花粉粒(隐隐)一个隐性性状与另一个显性性状一个隐性性状与另一个显性性状P2红花红花(隐隐)长花粉粒长花粉粒(显显)相引组相引组相斥组相斥组描述描述亲本亲本花色花色花粉粒形状花粉粒形状两个显性性状连在一起遗传两个显性性状连在一起遗传P1紫花紫花(显显)长花粉粒长花粉粒(显显)两个隐性性状连在一起遗传两个隐性性状连在一起遗传P2红花红花(隐隐)圆花粉粒圆花粉粒(隐隐)一个显性性状与另一个隐性性状一个显性性状与
5、另一个隐性性状P1紫花紫花(显显)圆花粉粒圆花粉粒(隐隐)一个隐性性状与另一个显性性状一个隐性性状与另一个显性性状P2红花红花(隐隐)长花粉粒长花粉粒(显显)相引组相引组7二、连锁遗传的解释二、连锁遗传的解释每对相对性状是否符合分离规律?每对相对性状是否符合分离规律?8两对相对性状自由组合?两对相对性状自由组合?摩尔根等的果蝇遗传试验摩尔根等的果蝇遗传试验果蝇果蝇(Drosophila melanogaster)眼色与翅长的连锁遗传:眼色与翅长的连锁遗传:眼色:红眼眼色:红眼(pr+)对紫眼对紫眼(pr)为显性;为显性;翅长:长翅翅长:长翅(vg+)对残翅对残翅(vg)为显性。为显性。相引组杂
6、交与测交相引组杂交与测交 相斥组杂交与测交相斥组杂交与测交9果蝇眼色与翅长连锁遗传:相引组果蝇眼色与翅长连锁遗传:相引组P pr+pr+vg+vg+prprvgvg F1 pr+prvg+vg prprvgvg(测交测交)Ft pr+prvg+vg 1339 prprvgvg 1195 pr+prvgvg 151 prprvg+vg 15410果蝇眼色与翅长连锁遗传:相斥组果蝇眼色与翅长连锁遗传:相斥组Ppr+pr+vgvgprprvg+vg+F1pr+prvg+vgprprvgvg(测交测交)Ft pr+prvg+vg 157 prprvgvg 146 pr+prvgvg 965 prprv
7、g+vg 106711连锁遗传现象的解释连锁遗传现象的解释连锁遗传规律:连锁遗传规律:连锁遗传的相对性状是由位于同连锁遗传的相对性状是由位于同一对染色体上的非等位基因间控制,具有连锁关系,一对染色体上的非等位基因间控制,具有连锁关系,在形成配子时倾向于连在一起传递;交换型配子是在形成配子时倾向于连在一起传递;交换型配子是由于非姊妹染色单体间交换形成的。由于非姊妹染色单体间交换形成的。控制果蝇眼色和翅长的两对非等位基因位于同一控制果蝇眼色和翅长的两对非等位基因位于同一同源染色体上。即:同源染色体上。即:相引相中,相引相中,pr+vg+连锁在一条染色体上,而连锁在一条染色体上,而prvg连锁在另一
8、条染色体,杂种连锁在另一条染色体,杂种F1一对同源染色体分一对同源染色体分别具有别具有pr+vg+和和prvg。12三、三、完全连锁和不完全连锁完全连锁和不完全连锁完全连锁完全连锁(complete linkage):如果如果连锁基因的连锁基因的杂种杂种F1(双杂合体双杂合体)只只产生两种亲本类型的配子,而不产生产生两种亲本类型的配子,而不产生非亲本类型的配子,就称为完全连锁。非亲本类型的配子,就称为完全连锁。不完全连锁不完全连锁(incomplete linkage):指指连锁基因的杂种连锁基因的杂种F1不仅产生亲本类不仅产生亲本类型的配子,还会产生重组型配子型的配子,还会产生重组型配子(例
9、子例子见前见前)。13完全连锁完全连锁(complete linkage)14不完全连锁(incomplete linkage)不完全连锁(incomplete linkage)15C-Sh基因间的连锁与交换C-Sh基因间的连锁与交换基因间的连锁与交换16四、交换与不完全连锁的形成四、交换与不完全连锁的形成PF1(复制复制)同源染色体联会同源染色体联会(偶线期偶线期)非姊妹染色单体交换非姊妹染色单体交换(偶线期到双线期偶线期到双线期)终变期终变期 四分体四分体17重组型配子的比例重组型配子的比例19重组型配子的比例重组型配子的比例尽管在发生交换的孢尽管在发生交换的孢(性性)母细胞所产生的配子中
10、,亲本型和重母细胞所产生的配子中,亲本型和重组型配子各占一半,但是双杂合体所产生的四种配子的比例并不组型配子各占一半,但是双杂合体所产生的四种配子的比例并不相等,因为并不是所有的孢母细胞都发生两对基因间的交换。相等,因为并不是所有的孢母细胞都发生两对基因间的交换。重组型配子比例是发生交换的孢母细胞比例的一半,并且两种重组型配子比例是发生交换的孢母细胞比例的一半,并且两种重组型配子的比例相等,两种亲本型配子的比例相等。重组型配子的比例相等,两种亲本型配子的比例相等。总配子数总配子数亲型配子亲型配子重组型配子重组型配子CShcshCshcSh93个胞母细胞连锁基因内不个胞母细胞连锁基因内不发生交换
11、发生交换 93 X 4=372个配子个配子1861867个胞母细胞个胞母细胞 连锁基因内发生连锁基因内发生交换交换 7 X 4=28个配子个配子7777400个配子个配子1931937720交换的细胞学证据21第第2节节 交换值及其测定交换值及其测定一、一、交换值的概念交换值的概念二、二、交换值的测定交换值的测定三、交换值与遗传距离三、交换值与遗传距离四、影响交换值的因素四、影响交换值的因素22一、一、交换值的概念交换值的概念交换值交换值(cross-over value),也称重组率也称重组率/重组值,重组值,是指重组型配子占总配子的百分率。即:是指重组型配子占总配子的百分率。即:亲本型配子
12、亲本型配子+重组型配子重组型配子交换值(交换值(%)=重组型配子数重组型配子数100%总配子数总配子数用哪些方法可以测定各种配子的数目?用哪些方法可以测定各种配子的数目?23二、交换值的测定(一一)、测交法、测交法测交后代测交后代(Ft)的表现型的种类和比例直接反映被测的表现型的种类和比例直接反映被测个体个体(如如F1)产生配子的种类和比例。产生配子的种类和比例。相引相与相斥相的测交结果:相引相与相斥相的测交结果:C-Sh相引相的交换值为相引相的交换值为3.6%;C-Sh相斥相的交换值为相斥相的交换值为3.0%。(二二)、自交法、自交法测交法与自交法的应用比较测交法与自交法的应用比较;自交法的
13、原理与过程:自交法的原理与过程:(以香豌豆花色与花粉粒形以香豌豆花色与花粉粒形状两对相对性状,状两对相对性状,P-L交换值测定为例。交换值测定为例。)24(一)、测交法:C-Sh基因间的连锁与交换25香豌豆P-L基因间交换值测定(1)设设F1产生的四种配子产生的四种配子PL,Pl*,pL*,pl的比例分的比例分别为:别为:a,b,c,d;则有:;则有:a+b+c+d=1a=d,b=c(二二)自交法:自交法:香豌豆香豌豆P-LP-L基因间交换值测定基因间交换值测定(1)(1)26香豌豆P-L基因间交换值测定(2)F2的的4种表现型种表现型(9种基因型种基因型)及其理论比例为:及其理论比例为:P_
14、L_(PPLL,PPLl,PpLL,PpLl):a2+2ab+2ac+2bc+2adP_ll (PPll,Ppll):b2+2bdppL_ (ppLL,ppLl):c2+2cdppll:d2d227香豌豆香豌豆P-L基因间交换值测定基因间交换值测定(3)而而F2中双隐性个体中双隐性个体(ppll)的实际数目是可出直的实际数目是可出直接观测得到的接观测得到的(本例中为本例中为1338),其比例也可出,其比例也可出直接计算得到直接计算得到(1338/6952),因此有:,因此有:28香豌豆香豌豆P-L基因间交换值测定基因间交换值测定(4)相斥相的分析:d2PL(a)Pl(b)pL(c)pl(d)P
15、L(a)Pl(b)pL(c)pl(d)*2930三、交换值与遗传距离三、交换值与遗传距离1.1.1.1.非姊妹染色单体间交换数目及位置是随机的;非姊妹染色单体间交换数目及位置是随机的;2.两个连锁基因间交换值的变化范围是两个连锁基因间交换值的变化范围是0,50%,其,其变化反映基因间的连锁强度、基因间的相对距离;变化反映基因间的连锁强度、基因间的相对距离;两基因间的距离越远,基因间的连锁强度越小,交两基因间的距离越远,基因间的连锁强度越小,交换值就越大;反之,基因间的距离越近,基因间的换值就越大;反之,基因间的距离越近,基因间的连锁强度越大,交换值就越小。连锁强度越大,交换值就越小。3.通常用
16、交换值通常用交换值/重组率来度量基因间的相对距离,也重组率来度量基因间的相对距离,也称为遗传距离称为遗传距离(genetic distance)。通常以通常以1%的重组率作为一个遗传距离单位的重组率作为一个遗传距离单位/遗传单遗传单位(位(centi-Moegan,cM)。)。31四、影响交换值的因素四、影响交换值的因素1.年龄对交换值的影响年龄对交换值的影响老龄雌果蝇的重组率明显下降。老龄雌果蝇的重组率明显下降。2.性别对交换值的影响性别对交换值的影响雄果蝇和雌家蚕的进行减数分裂时很少发生交换。雄果蝇和雌家蚕的进行减数分裂时很少发生交换。3.环境条件对交换值的影响环境条件对交换值的影响高等植
17、物的干旱条件下重组率会下降,一定范围内,高等植物的干旱条件下重组率会下降,一定范围内,增加温度可以提高交换值。增加温度可以提高交换值。32第第3节节 基因定位与连锁遗传图基因定位与连锁遗传图一、基因定位一、基因定位 (一)、两点测验(一)、两点测验 (二)、三点测验(二)、三点测验 (三)、干扰和符合(三)、干扰和符合二、连锁遗传图二、连锁遗传图33一、基因定位(一、基因定位(gene location/localization)广义的基因定位有三个层次:广义的基因定位有三个层次:染色体定位染色体定位(单体、缺体、三体定位法单体、缺体、三体定位法);染色体臂定位染色体臂定位(端体分析法端体分析
18、法);连锁分析连锁分析(linkage analysis)。基因定位基因定位(gene location/localization):确定基因在染色体:确定基因在染色体上的相对位置和排列次序。上的相对位置和排列次序。根据两个基因位点间的交换值能够确定两个基因间的相根据两个基因位点间的交换值能够确定两个基因间的相对距离,但并不能确定基因间的排列次序。对距离,但并不能确定基因间的排列次序。因此,一次基因定位工作常涉及三对或三对以上基因位因此,一次基因定位工作常涉及三对或三对以上基因位置及相互关系。置及相互关系。34两对基因间的排列次序两对基因间的排列次序根据上述信息可知:根据上述信息可知:C-Sh
19、间遗传距离为间遗传距离为3.6个遗传单位;个遗传单位;但不能确定它们在染色体上的排列次序,但不能确定它们在染色体上的排列次序,因而有两种可能的排列方向,如下图所因而有两种可能的排列方向,如下图所示:示:35连锁分析连锁分析的方法的方法基因连锁分析的主要方法:基因连锁分析的主要方法:(一一)、两点测验、两点测验(two-point testcross)通过三次测验,获得三对基因两两间交换值、估计其通过三次测验,获得三对基因两两间交换值、估计其遗传距离;每次测验两对基因间交换值;根据三个遗传距离;每次测验两对基因间交换值;根据三个遗传距离推断三对基因间的排列次序。遗传距离推断三对基因间的排列次序。
20、(二二)、三点测验、三点测验(three-point testcross)一次测验就考虑三对基因的差异,从而通过一次测验一次测验就考虑三对基因的差异,从而通过一次测验获得三对基因间的距离并确定其排列次序。获得三对基因间的距离并确定其排列次序。36(一)两点测验(一)两点测验 步骤步骤 1通过三次通过三次亲本间两两杂交,杂种亲本间两两杂交,杂种F1与双隐性亲本与双隐性亲本测交,测交,考察测交子代的类型与比例。考察测交子代的类型与比例。例:玉米第例:玉米第9染色体上三对基因间连锁分析:染色体上三对基因间连锁分析:子粒颜色:子粒颜色:有色有色(C)对无色对无色(c)为显性;为显性;饱满程度:饱满程度
21、:饱满饱满(SH)对凹陷对凹陷(sh)为显性;为显性;淀粉粒:淀粉粒:非糯性非糯性(Wx)对糯性对糯性(wx)为显性为显性.(1).(CCShShccshsh)F1ccshsh(2).(wxwxShShWxWxshsh)F1wxwxshsh(3).(wxwxCCWxWxcc)F1wxwxcc3738(一)两点测验(一)两点测验 步骤步骤 2计算计算三对基因两两间的交换值三对基因两两间的交换值39(一)两点测验(一)两点测验 步骤步骤 3根据基因间的遗传距离确定基因间的排列次序并根据基因间的遗传距离确定基因间的排列次序并作连锁遗传图谱。作连锁遗传图谱。C-Sh:3.6C-Sh:3.6Wx-Sh:
22、20Wx-Sh:20Wx-C:22Wx-C:2240(一)两点测验(一)两点测验局限性局限性1.工作量大,需要作三次杂交,三次测交;工作量大,需要作三次杂交,三次测交;2.不能排除双交换的影响,准确性不够高。不能排除双交换的影响,准确性不够高。当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点测验的准确性就不够高。测验的准确性就不够高。当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点测验的准确性就不够高。当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点测验的准确性就不够高。当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点测验的准确性就不够高。当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点测验的准确性就不够
23、高。41(二二)三点测验:步骤三点测验:步骤(1/7-2/7)仍以玉米仍以玉米C/c、Sh/sh、Wx/wx三对基因连锁分析为例,三对基因连锁分析为例,在描述时用在描述时用“+”代表各基因对应的显性基因。代表各基因对应的显性基因。1.用三对性状差异的两个纯系作亲本进行杂交、测交:用三对性状差异的两个纯系作亲本进行杂交、测交:P:凹陷、非糯性、有色凹陷、非糯性、有色 饱满、糯性、无色饱满、糯性、无色shsh +wxwx cc F1及测交及测交:饱满、非糯性、有色饱满、非糯性、有色凹陷、糯性、无色凹陷、糯性、无色 +sh +wx +c shsh wxwx cc 2.考察考察测交后代的表现型、进行分
24、类统计。测交后代的表现型、进行分类统计。在不完全连锁的情况下测交后代有多少种表现型?在不完全连锁的情况下测交后代有多少种表现型?423.按各类表现型的个体数,对测交后代进行分组;按各类表现型的个体数,对测交后代进行分组;4.进一步确定两种亲本类型和两种双交换类型;进一步确定两种亲本类型和两种双交换类型;(二)三点测验:步骤(3/7-4/7)43三点测验:步骤三点测验:步骤(5/7)5.确定三对基因在染色体上的排列顺序。确定三对基因在染色体上的排列顺序。用两种亲本型配子与两种双交换型配子比较:用两种亲本型配子与两种双交换型配子比较:双交换配子与亲本型配子中不同的基因位点位双交换配子与亲本型配子中
25、不同的基因位点位于中间。于中间。如:如:+wx c与与sh wx c相比只有相比只有sh位点不同,因此可以位点不同,因此可以断定断定sh位点位于位点位于wx和和c之间;之间;同理,同理,sh+与与+相比也只有相比也只有sh位点不同,也表明位点不同,也表明sh位点位于位点位于wx和和c之间。之间。44基因间排列顺序确定基因间排列顺序确定45三点测验:步骤三点测验:步骤(6/7)6.计算基因间的交换值。计算基因间的交换值。由于双交换实际上在两个区域均发生交换,由于双交换实际上在两个区域均发生交换,所以在估算每个区域交换值时,都应加上双所以在估算每个区域交换值时,都应加上双交换值,才能够正确地反映实
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