基因重组和基因工程精选PPT.ppt
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1、关于基因重组和基因工程第1页,讲稿共126张,创作于星期日 掌握掌握:基因重组和基因工程的概念,细菌基:基因重组和基因工程的概念,细菌基因转移的接合作用、转化作用和转导作用,因转移的接合作用、转化作用和转导作用,DNADNA克克隆、限制性核酸内切酶、基因载体、隆、限制性核酸内切酶、基因载体、cDNAcDNA文库、文库、基因组基因组DNADNA文库的概念,目的基因的来源,基因载文库的概念,目的基因的来源,基因载体的类型,重组体的类型,重组DNADNA技术的操作程序。技术的操作程序。熟悉熟悉:同源重组、特异位点的基因重组、:同源重组、特异位点的基因重组、转座重组的概念和基本过程,重组转座重组的概念
2、和基本过程,重组DNADNA技术的操技术的操作步骤。作步骤。了解了解:重组:重组DNADNA技术与医学的关系。技术与医学的关系。目目 的的 要要 求求第2页,讲稿共126张,创作于星期日基因重组基因重组 (gene recombination)(gene recombination)是指是指DNADNA片段在细胞内、细胞间,甚至在不片段在细胞内、细胞间,甚至在不同物种之间进行交换,交换后的片段仍然具有复同物种之间进行交换,交换后的片段仍然具有复制和表达的功能。制和表达的功能。基因工程基因工程 (genetic engineering(genetic engineering)是指采用人工方法将不
3、同来源的是指采用人工方法将不同来源的DNADNA进行进行重组,并将重组后的重组,并将重组后的DNADNA引入宿主细胞中进行引入宿主细胞中进行增殖和表达的过程。增殖和表达的过程。基本概念基本概念第3页,讲稿共126张,创作于星期日第一节第一节自然界自然界DNA重组和基因转移重组和基因转移是经常发生的是经常发生的 DNA Recombination and Gene Transfer Occur Frequently in Nature第4页,讲稿共126张,创作于星期日 DNA重组重组位点特异的重组位点特异的重组(site-specific recombination)转座转座重组重组(tran
4、sposition recombination)接合作用接合作用 (conjugation)转导作用转导作用 (transduction)同源重组同源重组(homologous recombination)转化作用转化作用 (transformation)第5页,讲稿共126张,创作于星期日发发 生生 在在 同同 源源 序序 列列 间间 的的 重重 组组 称称 为为同同 源源 重重 组组(homologous recombination),又又 称称 基基 本本 重重 组组(general recombination)。通通过过链链的的断断裂裂和和再再连连接接,在在两两个个DNA分分子子同同源
5、源序序列列间间进进行行单单链链或或双双链片段的交换。链片段的交换。以以E.coli的的同同源源重重组组为为例例,了了解解同同源源重重组组机机制制的的Holliday模型。模型。一、同源重组是最基本的一、同源重组是最基本的DNA重组方式重组方式第6页,讲稿共126张,创作于星期日Holliday模型的模型的4个关键步骤:个关键步骤:两个同源染色体两个同源染色体DNA排列整齐;排列整齐;片段重组体片段重组体(patch recombinant)拼接重组体拼接重组体(splice recombinant)一个一个DNA的一条链断裂、并与另一个的一条链断裂、并与另一个DNA对应对应的链连接,形成的链连
6、接,形成Holliday中间体中间体;通过分支移动产生异源双链通过分支移动产生异源双链DNA;Holliday中间体切开并修复,形成两个双链中间体切开并修复,形成两个双链重组体重组体DNA,分别为:,分别为:第7页,讲稿共126张,创作于星期日片段重组体片段重组体(见模型图右边产物):(见模型图右边产物):切开的链与原来断裂的是同一条链,重切开的链与原来断裂的是同一条链,重组体中间含有一段异源双链区,其两侧组体中间含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本来自同一亲本DNA。拼接重组体(见模型图左边产物):拼接重组体(见模型图左边产物):切开的链并非原来断裂的链,重组体异源双链切开的链并非原来断裂
7、的链,重组体异源双链区的两侧来自不同亲本区的两侧来自不同亲本DNA。第8页,讲稿共126张,创作于星期日 内切酶内切酶(recBCD)DNA侵扰侵扰(recA)分支迁移分支迁移 (recA)内切酶内切酶(recBCD)DNA 连接酶连接酶535353535353535353535353535333535335535353Holiday中间体中间体53535353第9页,讲稿共126张,创作于星期日HolidayHoliday中间体中间体中间体中间体55335533553355335555335555333333335555555533333333555555553333335555555533
8、3333335555555533333333内切酶内切酶内切酶内切酶(ruvC)(ruvC)内切酶内切酶内切酶内切酶(ruvC)(ruvC)DNA DNA连接酶连接酶连接酶连接酶 DNA DNA连接酶连接酶连接酶连接酶片片片片段段段段重重重重组组组组体体体体拼拼拼拼接接接接重重重重组组组组体体体体第10页,讲稿共126张,创作于星期日Holliday intermediate的电镜照片的电镜照片第11页,讲稿共126张,创作于星期日二、细菌的基因转移与重组二、细菌的基因转移与重组(一)(一)接合作用接合作用当当细细胞胞与与细细胞胞、或或细细菌菌通通过过菌菌毛毛相相互互接接触触时时,质质粒粒DN
9、A从从一一个个细细胞胞(细细菌菌)转转移移至至另另一一细细胞胞(细细菌菌)的的DNA转转移移称称为为接接合合作用作用(conjugation)。有四种方式:有四种方式:接合接合、转化转化、转导转导和和细胞融合细胞融合。第12页,讲稿共126张,创作于星期日可接合质粒如可接合质粒如 F 因子因子(F factor)细菌染色体外的小型环状双链细菌染色体外的小型环状双链DNA分子。分子。质粒质粒第13页,讲稿共126张,创作于星期日(二)(二)转化作用转化作用通通过过自自动动获获取取或或人人为为地地供供给给外外源源DNA,使使细细胞胞或或培培养养的的受受体体细细胞胞获获得得新新的的遗遗传传表表型型,
10、称称为为转化作用转化作用(transformation)。例:溶菌时,裂解的例:溶菌时,裂解的例:溶菌时,裂解的例:溶菌时,裂解的DNADNA片段被另一细菌摄取。片段被另一细菌摄取。片段被另一细菌摄取。片段被另一细菌摄取。第14页,讲稿共126张,创作于星期日(三)(三)转导作用转导作用当当病病毒毒从从被被感感染染的的(供供体体)细细胞胞释释放放出出来来、再再次次感感染染另另一一(供供体体)细细胞胞时时,发发生生在在供供体体细细胞胞与与受受体体细细胞胞之之间间的的DNA转转移移及及基基因因重重组组即即为为转转导作用导作用(transduction)。第15页,讲稿共126张,创作于星期日噬菌体
11、的生活史噬菌体的生活史溶菌生长途径溶菌生长途径(lysis pathway)溶源菌生长途径溶源菌生长途径(lysogenic pathway)第16页,讲稿共126张,创作于星期日三、位点特异重组,即特异位点间三、位点特异重组,即特异位点间发生的整合发生的整合位点特异重组位点特异重组(site-specific recombination)是由整合酶催化,在两个是由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位序列的特异位点间发生的整合。点间发生的整合。第17页,讲稿共126张,创作于星期日噬噬菌菌体体的的整整合合酶酶识识别别噬噬菌菌体体和和宿宿主主染染色色体体的的特特异异靶靶位位点点发发生生选选择择性
12、性整整合合;反反转转录录病病毒毒整整合合酶酶可可特特异异地地识识别别、整整合合反反转转录录 病病 毒毒 cDNA的的长长 末末 端端 重重 复复 序序 列列(long terminal repeat,LTR)。(一)(一)噬菌体噬菌体DNADNA的整合的整合第18页,讲稿共126张,创作于星期日 噬菌体的重组噬菌体的重组噬菌体的重组噬菌体的重组位点位点位点位点attatt P P与大肠杆菌与大肠杆菌与大肠杆菌与大肠杆菌的重组位点的重组位点的重组位点的重组位点attatt B B之间之间之间之间有有有有15bp15bp核心序列相同,核心序列相同,核心序列相同,核心序列相同,在整合酶(在整合酶(在
13、整合酶(在整合酶(Int)、)、整整整整合酶宿主因子(合酶宿主因子(合酶宿主因子(合酶宿主因子(IHFIHF)作用下发生整合;作用下发生整合;作用下发生整合;作用下发生整合;切除还需要切除还需要切除还需要切除还需要XisXis蛋白蛋白蛋白蛋白的参与。的参与。的参与。的参与。第19页,讲稿共126张,创作于星期日(二)细菌的特异位点重组(二)细菌的特异位点重组沙门菌沙门菌H片段倒位决定鞭毛相转变。片段倒位决定鞭毛相转变。第20页,讲稿共126张,创作于星期日沙门菌沙门菌H片段倒位决定鞭毛相转变片段倒位决定鞭毛相转变hixhixhixhix为为为为反反反反向向向向重重重重复复复复序序序序列列列列,
14、它它它它们们们们之之之之间间间间的的的的H H H H片片片片段段段段可可可可在在在在HinHinHinHin控控控控制制制制下下下下进进进进行行行行特特特特异异异异位位位位点点点点重重重重组组组组(倒倒倒倒位位位位)。H H H H片片片片段段段段上上上上有有有有两两两两个个个个启启启启动动动动子子子子P P P P,其其其其一一一一驱驱驱驱动动动动hinhinhinhin基基基基因因因因表表表表达达达达,另另另另一一一一正正正正向向向向时时时时驱驱驱驱动动动动H2H2H2H2和和和和rH1rH1rH1rH1基基基基因因因因表表表表达达达达,反反反反向向向向(倒倒倒倒位位位位)时时时时H2H
15、2H2H2和和和和rH1rH1rH1rH1不不不不表表表表达达达达。rH1rH1rH1rH1为为为为H1H1H1H1的阻遏蛋白基因。的阻遏蛋白基因。的阻遏蛋白基因。的阻遏蛋白基因。第21页,讲稿共126张,创作于星期日(三)免疫球蛋白基因的重排(三)免疫球蛋白基因的重排免疫球蛋白免疫球蛋白免疫球蛋白免疫球蛋白(Ig)(Ig)(Ig)(Ig),由两条轻链,由两条轻链,由两条轻链,由两条轻链(L(L(L(L链链链链)和两条重链和两条重链和两条重链和两条重链(H(H(H(H链链链链)组成,分别由三个独立的基因族编码,其组成,分别由三个独立的基因族编码,其组成,分别由三个独立的基因族编码,其组成,分别
16、由三个独立的基因族编码,其中两个编码轻链中两个编码轻链中两个编码轻链中两个编码轻链(和和和和 ),一个编码重链。,一个编码重链。,一个编码重链。,一个编码重链。轻链的基因片段:轻链的基因片段:重链的基因片段:重链的基因片段:L V J C L V D J C 第22页,讲稿共126张,创作于星期日重重重重链链链链(IgH)(IgH)基基基基因因因因的的的的V-D-JV-D-J重重重重排排排排和和和和轻轻轻轻链链链链(IgL)(IgL)基基基基因因因因的的的的V-JV-J重重重重排排排排均均均均发发发发生生生生在在在在特特特特异异异异位位位位点点点点上上上上。在在在在V V片片片片段段段段的的的
17、的下下下下游游游游,J J片片片片段段段段的的的的上上上上游游游游以以以以及及及及D D片片片片段段段段的的的的两两两两侧侧侧侧均均均均存存存存在在在在保保保保守守守守的的的的重重重重组组组组信信信信号号号号序序序序列列列列(recombination(recombination signal signal sequence,sequence,RSS)RSS)。此此重重排排的的重重组组酶酶基基因因rag(recombination activating gene)共共有有两两个,分别产生蛋白质个,分别产生蛋白质RAG1和和RAG2。CACAGTG(12/23)ACAAAAACCCACAGTG(
18、12/23)ACAAAAACCGTGTCCAC TGTTTTTGGGTGTCCAC TGTTTTTGG重组信号序列重组信号序列重组信号序列重组信号序列基因片段基因片段基因片段基因片段第23页,讲稿共126张,创作于星期日V片段片段J片段片段RSSRSS间插间插DNAOHOHVJ单链切开单链切开RAG1RAG2分子内转酯反应分子内转酯反应单链切开单链切开转移核苷酸转移核苷酸修复、连接修复、连接免免疫疫球球蛋蛋白白基基因因重重排排过过程程第24页,讲稿共126张,创作于星期日四、转座重组四、转座重组大多数基因在基因组内的位置是固定的,大多数基因在基因组内的位置是固定的,但有些基因从一个位置移动到另
19、一位置。但有些基因从一个位置移动到另一位置。这些可移动的这些可移动的DNA序列包括插入序列和转序列包括插入序列和转座子。座子。由插入序列和转座子介导的基因移位或重由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为排称为转座转座(transposition)。第25页,讲稿共126张,创作于星期日 插入序列插入序列(insertion sequences,IS)组成:组成:IRTransposase GeneIR(一)插入序列(一)插入序列二个反向重复二个反向重复(inverted repeats,IR)序列序列特有的正向重复序列特有的正向重复序列一个转座酶(一个转座酶(transposase)编码基因
20、编码基因第26页,讲稿共126张,创作于星期日插入序列发生转座的形式:插入序列发生转座的形式:保守性转座保守性转座(conservative transposition)复制性转座复制性转座(duplicative transposition)是插入序列从原位迁至新位。是插入序列从原位迁至新位。是插入序列复制后,其中的一个复制本是插入序列复制后,其中的一个复制本迁移至新位,另一个仍保留在原位。迁移至新位,另一个仍保留在原位。第27页,讲稿共126张,创作于星期日插插入入序序列列的的复复制制性性转转座座第28页,讲稿共126张,创作于星期日转座子转座子(transposons)从一个染色体位点从
21、一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列。转移到另一位点的分散重复序列。IRIRIRIRTransposase GeneTransposase Gene有用基因有用基因有用基因有用基因(二)转座子转座(二)转座子转座转座子组成:转座子组成:反向重复序列反向重复序列转座酶编码基因转座酶编码基因抗生素抗性等有用的基因抗生素抗性等有用的基因第29页,讲稿共126张,创作于星期日 细菌的可流动性元件细菌的可流动性元件A插入序列:转座酶编码基因两侧连接反向末端重复序列插入序列:转座酶编码基因两侧连接反向末端重复序列(箭头所示箭头所示)B转座子转座子Tn3:含有转座酶、:含有转座酶、-内酰胺酶及阻遏蛋白
22、编码基因内酰胺酶及阻遏蛋白编码基因C转座子转座子Tn10:含四环素抗性基因及两个相同的插入序列:含四环素抗性基因及两个相同的插入序列IS10L第30页,讲稿共126张,创作于星期日由转座子介导的转座由转座子介导的转座第31页,讲稿共126张,创作于星期日DNA Recombination Technique is also Called DNA Cloning or Molecular Clone 第二节第二节 重组重组DNA技术技术,又称又称DNA克隆克隆或分子克隆或分子克隆第32页,讲稿共126张,创作于星期日重组重组DNA技术的发展史技术的发展史18651865年年年年 G.J.Mend
23、elG.J.Mendel的豌豆杂交试验。的豌豆杂交试验。的豌豆杂交试验。的豌豆杂交试验。19441944年年年年 O.T.AveryO.T.Avery的肺炎球菌转化实验。的肺炎球菌转化实验。的肺炎球菌转化实验。的肺炎球菌转化实验。19731973年年年年 美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组DNADNA分子。分子。分子。分子。19771977年年年年 美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家遗传工美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家遗传工美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家
24、遗传工美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家遗传工程公司,应用重组程公司,应用重组程公司,应用重组程公司,应用重组DNADNA技术制造医学上重要药物。技术制造医学上重要药物。技术制造医学上重要药物。技术制造医学上重要药物。19801980年年年年 建造第一家应用重组建造第一家应用重组建造第一家应用重组建造第一家应用重组DNADNA技术生产胰岛素的工厂。技术生产胰岛素的工厂。技术生产胰岛素的工厂。技术生产胰岛素的工厂。19971997年年年年 英国罗林研究所成功的克隆了多莉。英国罗林研究所成功的克隆了多莉。英国罗林研究所成功的克隆了多莉。英国罗林研究所成功的克隆了多莉。第33页,讲稿共126
25、张,创作于星期日转基因猪进行人体器官移植转基因猪进行人体器官移植由于猪的器官,如由于猪的器官,如心脏与人心脏与人的大小和活动能力类似,且的大小和活动能力类似,且猪的数量充足,容易繁殖猪的数量充足,容易繁殖,可以充分满足临床需要,被可以充分满足临床需要,被医学界认为是人类器官移植医学界认为是人类器官移植的最佳提供者。的最佳提供者。在人体器官移植手术中,灵在人体器官移植手术中,灵长类猿猴的内脏普遍为人们长类猿猴的内脏普遍为人们所看好。但医学研究发现,所看好。但医学研究发现,猿猴身上的一些病毒对人类猿猴身上的一些病毒对人类十分有害。十分有害。第34页,讲稿共126张,创作于星期日图:美国哈佛医学院的
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