微生物生理精选PPT.ppt
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1、关于微生物生理第1页,讲稿共166张,创作于星期日 主要内容:生物的酶主要内容:生物的酶 微生物的营养微生物的营养 微生物的能量代谢微生物的能量代谢 微生物的合成代谢微生物的合成代谢第2页,讲稿共166张,创作于星期日 第一节第一节 酶酶 一、酶的概念一、酶的概念 催化剂催化剂 在化学中,能改变化学反应的速度而其本身在反应前后没有发在化学中,能改变化学反应的速度而其本身在反应前后没有发生变化的物质称为催化剂。生变化的物质称为催化剂。例如:蔗糖例如:蔗糖葡萄糖葡萄糖+果糖,少量盐酸(果糖,少量盐酸(HClHCl)可以大大)可以大大促进该反应的速度,即为催化剂。促进该反应的速度,即为催化剂。由催化
2、剂加速反应速度的现象称为催化作用由催化剂加速反应速度的现象称为催化作用。第3页,讲稿共166张,创作于星期日 一般的化学催化剂作用往往要求一定的条件,如一般的化学催化剂作用往往要求一定的条件,如高温、高压等。高温、高压等。如在合成氨工业中,使用以铁为主体的多成分催如在合成氨工业中,使用以铁为主体的多成分催化剂(铁触媒),反应条件要求:化剂(铁触媒),反应条件要求:500500、2102107 7 510 5107 7 Pa(Pa(约约200200500atm)500atm),这就对反应的容器,这就对反应的容器等提出较高的要求。等提出较高的要求。(1atm=101325Pa)(1atm=1013
3、25Pa)第4页,讲稿共166张,创作于星期日 在在生生物物体体内内不不断断地地进进行行着着大大量量而而复复杂杂的的化化学学反反应应(生生物物化化学学反反应应),这这些些反反应应要要求求以以极极快快的的速速度度进进行行,而而且且要要求求十十分分精精确确,才才能能适适应应生生物物体体生生理理活活动动的的要要求求。另另外外,生生物物体体内内的的条条件件是是温温和和的的。为为了了满满足足生生物物体体内内生生物物化化学学反反应应的的要要求求,必必须由特别的催化剂须由特别的催化剂酶来催化。酶来催化。定义:酶是生物体内合成的一种具有催化定义:酶是生物体内合成的一种具有催化性能的蛋白质,它是生物催化剂。性能
4、的蛋白质,它是生物催化剂。第5页,讲稿共166张,创作于星期日二、酶的催化特性二、酶的催化特性 1酶酶积积极极参参与与生生物物化化学学反反应应,加加速速反反应应速速度度,但但不不能能改改变变反反应应平平衡衡点点,在在反反应应前前后后无无变变化化;(催催化剂的一般特征)化剂的一般特征)2酶酶的的催催化化作作用用具具有有专专一一性性;一一种种酶酶只只能能作作用用于于一一种种物物质质或或一一类类物物质质,或或者者说说只只能能催催化化一一种种或或一一类类化化学学反应;反应;第6页,讲稿共166张,创作于星期日3酶酶的的催催化化作作用用条条件件温温和和;在在常常温温、常常压压和和近近中中性性的水溶液中进
5、行(生物体内环境);的水溶液中进行(生物体内环境);4酶酶对对环环境境条条件件极极为为敏敏感感;高高温温、强强酸酸、强强碱碱、重重金金属属离离子子等等会会能能使使酶酶丧丧失失活活性性;由由于于酶酶是是蛋蛋白白质,容易失活;质,容易失活;5酶酶具具有有极极高高的的催催化化效效率率;如如过过氧氧化化氢氢酶酶的的催催化化效效率比铁离子率比铁离子Fe3+(一般催化剂)要高(一般催化剂)要高1010倍。倍。第7页,讲稿共166张,创作于星期日 三、酶的组成三、酶的组成 按化学组成,酶分为按化学组成,酶分为单成分酶单成分酶和和全酶全酶两类。两类。单成分酶:酶蛋白单成分酶:酶蛋白,如淀粉酶、蛋白酶等水解酶。
6、,如淀粉酶、蛋白酶等水解酶。全酶:酶蛋白全酶:酶蛋白+不含氮的小分子有机物不含氮的小分子有机物 如多种脱氢酶类如多种脱氢酶类 酶蛋白酶蛋白+不含氮的小分子有机物不含氮的小分子有机物+金属离子金属离子 如丙酮酸如丙酮酸脱氢酶脱氢酶 酶蛋白酶蛋白+金属离子金属离子 如细胞色素氧化酶如细胞色素氧化酶第8页,讲稿共166张,创作于星期日 根据全酶中非蛋白成分与酶蛋白的结合程根据全酶中非蛋白成分与酶蛋白的结合程度,分为度,分为辅酶辅酶和和辅基辅基,前者是指与酶蛋白,前者是指与酶蛋白结合比较疏松的小分子有机物,如辅酶结合比较疏松的小分子有机物,如辅酶和辅酶和辅酶等;后者是以共价键与酶蛋白结等;后者是以共价
7、键与酶蛋白结合、不容易与酶蛋白分开的一类物质,如合、不容易与酶蛋白分开的一类物质,如铁卟啉等。铁卟啉等。第9页,讲稿共166张,创作于星期日 常见的辅基和辅酶:常见的辅基和辅酶:1.铁卟啉铁卟啉:细胞色素氧化酶、过氧化氢酶等细胞色素氧化酶、过氧化氢酶等的辅基,其中含有铁离子,当铁离子在二价与的辅基,其中含有铁离子,当铁离子在二价与三价之间变化时,电子被传递。三价之间变化时,电子被传递。2.辅酶辅酶A(CoA或或CoASH):由腺嘌呤核苷酸、:由腺嘌呤核苷酸、泛酸和氨基乙硫醇等组成,在糖代谢和脂代谢泛酸和氨基乙硫醇等组成,在糖代谢和脂代谢中起重要作用,它通过巯基(中起重要作用,它通过巯基(-SH
8、)的受酰和)的受酰和脱酰参与转酰基反应。脱酰参与转酰基反应。第10页,讲稿共166张,创作于星期日3.NAD(Co)和)和NADP(Co):辅酶:辅酶是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶是烟是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸。两者是多种脱酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸。两者是多种脱氢酶的辅酶,在反应中起传递氢的作用。氢酶的辅酶,在反应中起传递氢的作用。4.FMN(黄素单核苷酸)和(黄素单核苷酸)和FAD(黄素腺嘌(黄素腺嘌呤二核苷酸):呤二核苷酸):氨基酸氧化酶和琥珀酸脱氨基酸氧化酶和琥珀酸脱氢酶的辅基。电子传递体系的组成部分,氢酶的辅基。电子传递体系的组成部分,起传递氢的作用。起传递氢的
9、作用。第11页,讲稿共166张,创作于星期日 5.辅酶辅酶Q(CoQ):):又称泛醌,电子传递体又称泛醌,电子传递体系的组成部分,起传递氢和电子的作用。系的组成部分,起传递氢和电子的作用。6.硫辛酸(硫辛酸(L)焦磷酸硫胺素()焦磷酸硫胺素(TPP):):两两者结合成者结合成LTPP,为,为-酮酸脱羧酶和糖类转酮酸脱羧酶和糖类转酮酶的辅酶,参与丙酮酸和酮酶的辅酶,参与丙酮酸和-酮戊二酸的酮戊二酸的氧化脱羧反应,起传递酰基和氢的作用。氧化脱羧反应,起传递酰基和氢的作用。第12页,讲稿共166张,创作于星期日 7.腺苷磷酸及其他核苷酸类腺苷磷酸及其他核苷酸类 腺苷磷酸:腺苷磷酸:AMP、ADP、A
10、TP;其他核苷酸类其他核苷酸类:GTP、UTP、GTP等。等。它们都含有高能磷酸键,在转化过程中能它们都含有高能磷酸键,在转化过程中能量被吸收或释放,在能量代谢过程中起重量被吸收或释放,在能量代谢过程中起重要作用。要作用。第13页,讲稿共166张,创作于星期日 8.磷酸砒哆醛和磷酸砒哆胺:磷酸砒哆醛和磷酸砒哆胺:磷酸砒哆醛磷酸砒哆醛是氨基酸转氨酶、消旋酶、脱羧酶的辅是氨基酸转氨酶、消旋酶、脱羧酶的辅酶,磷酸砒哆胺与转氨作用有关。酶,磷酸砒哆胺与转氨作用有关。9.生物素(维生素生物素(维生素H):):是很多需要是很多需要ATP的羧化酶的辅基,催化的羧化酶的辅基,催化CO2的固定和和的固定和和转移
11、及脂肪合成反应。转移及脂肪合成反应。第14页,讲稿共166张,创作于星期日 10.四氢叶酸(辅酶四氢叶酸(辅酶F,THFA):):转移转移一碳一碳基团,基团,如羟甲基、甲酰基等。如羟甲基、甲酰基等。11.金属离子:金属离子:酶的辅基,激活剂,许多酶酶的辅基,激活剂,许多酶中含有铁、铜、镁等离子。中含有铁、铜、镁等离子。第15页,讲稿共166张,创作于星期日专性厌氧菌的辅酶:专性厌氧菌的辅酶:(1)辅酶辅酶M:有三种存在形式,即有三种存在形式,即2-巯基巯基乙烷磺酸,乙烷磺酸,2,2-二硫乙烷磺酸和二硫乙烷磺酸和2-甲基甲基硫乙烷磺酸。在硫乙烷磺酸。在260nm处有吸收峰。它为处有吸收峰。它为产
12、甲烷菌所特有,是甲基转移酶的辅酶,产甲烷菌所特有,是甲基转移酶的辅酶,是活性甲基的载体。是活性甲基的载体。第16页,讲稿共166张,创作于星期日(2)F420(辅酶(辅酶420,CoF420):):是一种黄素衍是一种黄素衍生物,其化学结构类似生物,其化学结构类似FMN。氧化型的。氧化型的F420的吸收光谱为的吸收光谱为420nm,可产生荧光,当呈还原态,可产生荧光,当呈还原态时,荧光消失。时,荧光消失。F420是甲基转移酶的的辅酶,是是甲基转移酶的的辅酶,是活性甲基的载体。活性甲基的载体。(3)F430(辅酶(辅酶430,Co F430):):是含有一个是含有一个Ni原子的四吡咯环结构的化合物
13、,原子的四吡咯环结构的化合物,在在430nm 处有最大吸收峰。是甲基辅酶处有最大吸收峰。是甲基辅酶M还原酶组分还原酶组分C的弥的弥补基,参与甲烷形成的末端反应。补基,参与甲烷形成的末端反应。第17页,讲稿共166张,创作于星期日 (4)MPT:即甲烷蝶呤。:即甲烷蝶呤。是一种含有蝶呤环产甲是一种含有蝶呤环产甲烷菌辅酶,在烷菌辅酶,在342nm处呈现浅蓝色荧光。有多种处呈现浅蓝色荧光。有多种衍生物,如四氢甲烷蝶呤(衍生物,如四氢甲烷蝶呤(THMP)。作用与叶酸)。作用与叶酸相似,参与相似,参与C1还原反应,使甲酰基还原为甲基。还原反应,使甲酰基还原为甲基。(5)MFR:即甲烷呋喃。:即甲烷呋喃。
14、由酚、谷氨酸、二羧基由酚、谷氨酸、二羧基脂肪酸和呋喃环四种分子结合而成。在甲烷和乙酸脂肪酸和呋喃环四种分子结合而成。在甲烷和乙酸形成过程中起甲基载体作用。形成过程中起甲基载体作用。第18页,讲稿共166张,创作于星期日 四、酶蛋白的结构四、酶蛋白的结构 与与所所有有的的蛋蛋白白质质一一样样,酶酶蛋蛋白白也也是是由由氨氨基基酸组成的。酸组成的。在在生生物物体体中中的的蛋蛋白白质质,由由20种种氨氨基基酸酸组组成(极少例外):成(极少例外):第19页,讲稿共166张,创作于星期日Ala(丙氨酸)(丙氨酸)Arg(精氨酸)(精氨酸)Asn(天门冬酰胺)(天门冬酰胺)Asp(天天门门冬冬氨氨酸酸)Cy
15、s(半半胱胱氨氨酸酸)Gln(谷谷氨氨酰酰胺胺)Glu(谷氨酸)(谷氨酸)Gly(甘氨酸)(甘氨酸)His(组氨酸)(组氨酸)Ile(异亮氨酸)(异亮氨酸)Leu(亮氨酸)(亮氨酸)Lys(赖氨酸)(赖氨酸)Met(蛋氨酸)(蛋氨酸)Phe(苯丙氨酸)(苯丙氨酸)Pro(脯氨酸)(脯氨酸)Ser(丝氨酸)(丝氨酸)Thr(苏氨酸)(苏氨酸)Trp(色氨酸)(色氨酸)Tyr(酪氨酸)(酪氨酸)Val(缬氨酸)(缬氨酸)第20页,讲稿共166张,创作于星期日 氨氨基基酸酸之之间间通通过过肽肽键键(-NH-CO-)连连接接成成多多肽肽链链。多多肽肽链链之之间间或或一一条条多多肽肽链链卷卷曲曲后后相相
16、邻邻的的基基团团之之间间通通过过氢氢键键、盐盐键键、酯酯键键、疏疏水水键键、范范德德华华引引力力及及金金属属键键等等相相连连接接,形成蛋白质的空间结构。形成蛋白质的空间结构。第21页,讲稿共166张,创作于星期日 第22页,讲稿共166张,创作于星期日一级结构一级结构 是指多肽链的氨基酸残基的排列顺序,也是蛋白质最是指多肽链的氨基酸残基的排列顺序,也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的,各种氨基酸按遗传密码的顺序通过肽键连决定的,各种氨基酸按遗传密码的顺序通过肽键连接起来。接起来。二级结构二级结构(secondary stru
17、cture)二级结构是指多肽链借助于氢键沿一维方向排列成具二级结构是指多肽链借助于氢键沿一维方向排列成具有周期性的结构的构象,是多肽链局部的空间结构有周期性的结构的构象,是多肽链局部的空间结构(构象),主要有(构象),主要有螺旋、螺旋、折叠、折叠、转角等转角等几种形式,它们是构成蛋白质高级结构的基本要素。几种形式,它们是构成蛋白质高级结构的基本要素。第23页,讲稿共166张,创作于星期日三级结构(三级结构(tertiary structure)三级结构主要针对球状蛋白质而言的,是三级结构主要针对球状蛋白质而言的,是指整条多肽链由二级结构元件构建成的指整条多肽链由二级结构元件构建成的总三维结构。
18、总三维结构。蛋白质特定的空间构象是由氢键、离子键、蛋白质特定的空间构象是由氢键、离子键、偶极与偶极间的相互作用、疏水作用等偶极与偶极间的相互作用、疏水作用等作用力维持的,疏水作用是主要的作用作用力维持的,疏水作用是主要的作用力。有些蛋白质还涉及到二硫键。力。有些蛋白质还涉及到二硫键。第24页,讲稿共166张,创作于星期日 四级结构四级结构(quaternary structure)亚基是由一条或几条多肽链在三级结构基亚基是由一条或几条多肽链在三级结构基础上形成的小单位。础上形成的小单位。四级结构是指在亚基和亚基之间通过疏水四级结构是指在亚基和亚基之间通过疏水作用等次级键结合成为有序排列的特定作
19、用等次级键结合成为有序排列的特定的空间结构。的空间结构。少数酶具有四级结构。少数酶具有四级结构。第25页,讲稿共166张,创作于星期日第26页,讲稿共166张,创作于星期日第27页,讲稿共166张,创作于星期日 五、酶的活性中心五、酶的活性中心 酶的活性中心酶的活性中心是是指在酶蛋白分子中与底物结指在酶蛋白分子中与底物结合,并起催化作用的小部分氨基酸微区。合,并起催化作用的小部分氨基酸微区。组组成成酶酶的的活活性性中中心心,可可以以是是蛋蛋白白质质多多肽肽链链上上不同位置的氨基酸区域。不同位置的氨基酸区域。第28页,讲稿共166张,创作于星期日核糖核酸酶(牛胰)核糖核酸酶(牛胰)A由由124个
20、氨基酸组成,各氨基个氨基酸组成,各氨基酸的排列顺序均已确定:酸的排列顺序均已确定:第29页,讲稿共166张,创作于星期日第30页,讲稿共166张,创作于星期日 活性中心可分为活性中心可分为结合部位结合部位和和催化部位催化部位。只只有有酶酶蛋蛋白白保保持持一一定定的的空空间间构构型型,酶酶的的活活性中心才能存在。性中心才能存在。如果酶蛋白发生变性,构成酶活性中心的基如果酶蛋白发生变性,构成酶活性中心的基团互相分开,酶与底物将无法形成结合,酶团互相分开,酶与底物将无法形成结合,酶促反应也就无法进行。促反应也就无法进行。第31页,讲稿共166张,创作于星期日 在酶(双成分酶)的非蛋白成分上,具有在酶
21、(双成分酶)的非蛋白成分上,具有催化功能的那一部分,称为活性基,它决催化功能的那一部分,称为活性基,它决定着催化反应的性质,担负着传递电子、定着催化反应的性质,担负着传递电子、原子或化学基团的功能。原子或化学基团的功能。单独的酶蛋白没有酶活性或活性很低,只单独的酶蛋白没有酶活性或活性很低,只有与活性基结合,才显示出酶的高度专一有与活性基结合,才显示出酶的高度专一性和强大催化效率。性和强大催化效率。第32页,讲稿共166张,创作于星期日酶与底物结合的机理酶与底物结合的机理第33页,讲稿共166张,创作于星期日第34页,讲稿共166张,创作于星期日 六、酶的分类与命名六、酶的分类与命名 1、酶的分
22、类、酶的分类 (1)根据酶所催化反应的类型分类)根据酶所催化反应的类型分类 将酶分为将酶分为六大类,六大类,分别用分别用1、2、3、4、5、6的编号来表的编号来表示。再根据底物中被作用的基团或键的特点将每一大类分示。再根据底物中被作用的基团或键的特点将每一大类分为若干个亚类,每一个亚类又按顺序编成为若干个亚类,每一个亚类又按顺序编成1、2、3、4等数字。每一个亚类可再分为若干个亚亚类,仍用等数字。每一个亚类可再分为若干个亚亚类,仍用1、2、3、4编号。编号。第35页,讲稿共166张,创作于星期日 所以每一个酶的分类编号由四个数字组所以每一个酶的分类编号由四个数字组成,数字间由成,数字间由“”隔
23、开;第一个数字隔开;第一个数字指出该酶属于六个大类中的哪一类;第指出该酶属于六个大类中的哪一类;第二个数字指出该酶属于哪一亚类;第三二个数字指出该酶属于哪一亚类;第三个数字指出该酶属于哪一个亚亚类;第个数字指出该酶属于哪一个亚亚类;第四个数字则表明该酶在一定的亚亚类中四个数字则表明该酶在一定的亚亚类中的排号。编号之前往往冠以的排号。编号之前往往冠以EC(酶学委(酶学委员会)之缩写。如乳酸:员会)之缩写。如乳酸:NAD+氧化还原氧化还原酶的编号酶的编号EC1.1.1.27。第36页,讲稿共166张,创作于星期日 六个大类的酶介绍如下:六个大类的酶介绍如下:1)氧化还原酶类(氧化还原反应)氧化还原
24、酶类(氧化还原反应)AH2+BA+BH2 还可进一步分为氧化酶和脱氢酶。还可进一步分为氧化酶和脱氢酶。2)转移酶类(底物的基团转移到另一有机物上)转移酶类(底物的基团转移到另一有机物上)A-R+BA+B-R R可以是氨基、醛基、酮基、磷酸基等。可以是氨基、醛基、酮基、磷酸基等。第37页,讲稿共166张,创作于星期日 3)水解酶类(大分子有机物水解)水解酶类(大分子有机物水解)A-B+HOHAOH+BH 4)裂解酶类(有机物裂解成小分子物质)裂解酶类(有机物裂解成小分子物质)ABA+B 5)异构酶类(同分异构体之间的转化)异构酶类(同分异构体之间的转化)AA 6)合成酶类(底物的合成反应,需要能
25、量)合成酶类(底物的合成反应,需要能量)A+B+nATPAB+nADP+nPi第38页,讲稿共166张,创作于星期日(2)按酶的作用部位分类)按酶的作用部位分类 可分为胞外酶、胞内酶和表面酶等。可分为胞外酶、胞内酶和表面酶等。(3)按酶作用的底物不同分类)按酶作用的底物不同分类 可分为淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶等。可分为淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶等。(4)按照酶在生物体内存在的状况分类)按照酶在生物体内存在的状况分类 可分为组成酶和诱导酶:可分为组成酶和诱导酶:组成酶(组成酶(constitutive enzyme),无论培养基中有无它),无论培养基中有无它们的底物,这种酶都能形成
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