生物化学的生物合成精选PPT.ppt
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1、目录目录关于生物化学的生物合成第1页,讲稿共82张,创作于星期二复制复制复制复制翻译翻译翻译翻译 蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质 (病毒)(病毒)(病毒)(病毒)RNA RNA(病毒)(病毒)(病毒)(病毒)逆转录逆转录逆转录逆转录中心法则(中心法则(The central dogma):遗传信息从遗传信息从DNA经经经经RNARNA流向蛋白质的过程。流向蛋白质的过程。流向蛋白质的过程。流向蛋白质的过程。转录转录转录转录RNARNA翻译翻译翻译翻译蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质DNADNA复制复制复制复制19581958年年CrickCrick,19701970年年TeminTemin第2页,讲稿共82张
2、,创作于星期二复制复制(replication)是指是指使子代细胞得到和亲代使子代细胞得到和亲代使子代细胞得到和亲代使子代细胞得到和亲代相一致的遗传物质相一致的遗传物质相一致的遗传物质相一致的遗传物质,DNADNA复制复制是是以母链以母链DNADNA为模板合为模板合成子链成子链DNADNA的过程。的过程。复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA第3页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录第十四章第十四章DNA的生物合成的生物合成DNA Biosynthesis(Replication)第4页,讲稿共82张,创作于星期二【目的要求目的要求】n n一、掌握半保留复制的概念。n n二、掌握DNA复制的基本
3、特征和过程。n n三、掌握DNA复制的原料、参与的因子和各 种酶类。n n四、熟悉逆转录的概念及基本过程。第5页,讲稿共82张,创作于星期二执考大纲要求的知识点n n中心法则 (1)DNA生物合成的概念(2)DNA的复制(参与体系和过程?)(3)逆转录(4)DNA的损伤与修复第6页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n本章主要内容:本章主要内容:n DNA DNA复制的基本特征复制的基本特征(重点掌握)重点掌握)n DNA复制的酶学和拓扑学变化复制的酶学和拓扑学变化(重点掌握)重点掌握)n 原核生物原核生物DNADNA复制过程复制过程(重点掌握)重点掌握)重点掌握)重点掌握)n真核生物真核生物
4、DNADNA生物合成过程生物合成过程n 逆转录和其他复制方式逆转录和其他复制方式第7页,讲稿共82张,创作于星期二DNA复制的基本特征复制的基本特征Basic Rules of DNA Replication第第 一一 节节第8页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录半保留复制半保留复制(semi-conservative replication)双向复制双向复制(bidirectional replication)半不连续复制半不连续复制(semi-discontinuous replication)nDNA复制的主要特征复制的主要特征 第9页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录一、一、DNA
5、以半保留方式进行复制以半保留方式进行复制 DNADNA合合成成时时,母母链链DNA解开为两股单链,各自作为模板,按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代的DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。子代DNA和和亲亲代代DNA碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制。n半保留复制半保留复制的概念的概念:第10页,讲稿共82张,创作于星期二AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACT
6、GGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA复制过程中形成复制过程中形成的复制叉的复制叉子代子代DNA第11页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n子链继承母链遗传信息的几种可能方式子链继承母链遗传信息的几种可能方式:全保留式全保留式 半保留式半保留式 混合式混合式 第12页,讲稿共82张,创作于星期二第14页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录按按半半保保留留复复制制方方式式,子子代代DNA与与亲亲代代DNA A的的碱碱基基序序列列一一致致,即即子子代代保保留留了了亲亲代代的的全全部部遗遗传传信信息息,体现了遗传的体现了遗传的保守性保守性。n半保留复制的意义半保留复制的意义:遗传的保守
7、性,是物种稳定性的分子基础,但遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的不是绝对的。第15页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录原原核核生生物物基基因因组组是是环环状状DNA,只只有有一一个个复复制制起起点点(origin)。复复制制从从起起点点开开始始,向向两两个个方方向向进进行行解解链,进行的是单点起始链,进行的是单点起始双向复制双向复制。二、二、DNA复制从起点向两个方向延伸复制从起点向两个方向延伸复制中的放射自显影图象复制中的放射自显影图象第16页,讲稿共82张,创作于星期二A.环状双链环状双链DNA及复制起始点及复制起始点B.复制中的两个复制叉复制中的两个复制叉C.复制接近终
8、止点复制接近终止点(termination,ter)oriterA B C第17页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录真真核核生生物物每每个个染染色色体体有有多多个个起起始始点点,是是多多复复制制子子的的复复制制。从从一一个个DNA复复制制起起点点起起始始的的DNA复复制制区区称称为为一一个个复复制制子子(replicon)。复复制制子子是是独独立立完完成成复复制制的功能单位。的功能单位。53oriorioriori53第18页,讲稿共82张,创作于星期二53oriorioriori535533553复制复制3第19页,讲稿共82张,创作于星期二3 5 3 5 解链方向解链方向335 5 3
9、3 3355领头链领头链领头链领头链(leading strand)(leading strand)随从链随从链随从链随从链(lagging strand)(lagging strand)顺解链方向生成的子链,顺解链方向生成的子链,顺解链方向生成的子链,顺解链方向生成的子链,复制为连续进行,称为复制为连续进行,称为复制为连续进行,称为复制为连续进行,称为领头领头领头领头链链链链。另一股链复制方向与另一股链复制方向与另一股链复制方向与另一股链复制方向与解链方向相反,不能顺着解链方向相反,不能顺着解链方向相反,不能顺着解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,称为解链方向连续延长,称为解链方向连续延
10、长,称为解链方向连续延长,称为随从链随从链随从链随从链。复制中不连续片段称为复制中不连续片段称为复制中不连续片段称为复制中不连续片段称为岡崎片岡崎片岡崎片岡崎片段段段段(okazaki fragment)(okazaki fragment)。领头链连续复制而随从链领头链连续复制而随从链领头链连续复制而随从链领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的不连续复制,就是复制的不连续复制,就是复制的不连续复制,就是复制的半不半不半不半不连续性连续性连续性连续性。三、半不连续复制三、半不连续复制第20页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录DNA复制的酶学和拓扑学变化复制的酶学和拓扑学变化第第 二二 节
11、节The Enzymology and Topology of DNA Replication第21页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n参与参与DNA复制的物质复制的物质:n底物底物(substrate):dATP,dGTP,dCTP,dTTP;n聚聚合合酶酶(polymerase):依依赖赖DNA的的DNA聚聚合合酶酶,简简写写为为 DNA-pol;n模板模板(template):解开成单链的解开成单链的DNA母链;母链;n引物引物(primer):提供提供3-OH末端使末端使dNTP可以依次聚合;可以依次聚合;n其他的其他的酶和蛋白质因子酶和蛋白质因子。第22页,讲稿共82张,创作于星
12、期二复制的基本化学反应复制的基本化学反应是生成磷酸二酯键生成磷酸二酯键(dNMP)n+dNTP (dNMP)n+1+PPi第23页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n聚合反应的特点聚合反应的特点:DNA 新链生成需新链生成需RNA引物引物和和模板模板;新链的延长只可沿新链的延长只可沿5 3 方向进行。方向进行。第24页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录一、一、DNA聚合酶催化脱氧核苷酸间的聚合聚合酶催化脱氧核苷酸间的聚合全称:全称:依赖依赖DNA的的DNA聚合酶聚合酶(DNA-dependent DNA polymerase)简称:简称:DNA-poln活性:活性:1.53 的聚合活性的聚
13、合活性2.核酸外切酶活性核酸外切酶活性第25页,讲稿共82张,创作于星期二5 A G C T T C A G G A T A 3|3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5n3 5 外切酶活性外切酶活性:n5 3 外切酶活性外切酶活性:?能切除突变的能切除突变的 DNA片段。片段。能辨认错配的碱基对,并将其水解。能辨认错配的碱基对,并将其水解。n核酸外切酶活性核酸外切酶活性:第26页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录(一)原核生物有(一)原核生物有3种种DNA聚合酶聚合酶nDNA-pol nDNA-pol nDNA-pol 第27页,讲稿共82张,创作于星期二目录
14、目录原核生物的原核生物的DNADNA聚合酶聚合酶第28页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n个核心酶个核心酶n1个个-复合物(复合物(、6种亚基)种亚基)n1对对-亚基(可滑动的亚基(可滑动的DNA夹子)夹子)DNA聚合酶聚合酶全酶结构全酶结构全酶结构包括:全酶结构包括:第29页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n功能:功能:nDNA-pol (109kD)对复制中的错误进行校读,对复制和修复对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。中出现的空隙进行填补。二级结构以二级结构以二级结构以二级结构以 螺旋为主,螺旋为主,螺旋为主,螺旋为主,只能延长约只能延长约只能延长约只能延长
15、约2020个核苷酸。个核苷酸。个核苷酸。个核苷酸。第30页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录323个氨基酸个氨基酸小片段小片段5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 604个氨基酸个氨基酸DNA聚合酶活性聚合酶活性 5 核酸外切酶活性核酸外切酶活性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol nKlenow片段是实验室合成片段是实验室合成DNA,进行分,进行分子生物学研究中常用的工具酶。子生物学研究中常用的工具酶。第31页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录nDNA-pol(120kD)nDNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。基因发生突变,细菌
16、依然能存活。nDNA-pol 对模板的特异性不高,即使在已发生损伤对模板的特异性不高,即使在已发生损伤的的DNA模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此认为,它模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此认为,它参与参与DNA损伤的应急状态修复。损伤的应急状态修复。第32页,讲稿共82张,创作于星期二(二)常见的真核细胞(二)常见的真核细胞DNA聚合酶有聚合酶有5种种第33页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录二、二、DNA聚合酶的碱基选择和校对功能实聚合酶的碱基选择和校对功能实现复制的保真性现复制的保真性n复制按照碱基配对规律进行,是遗传信息能准确传复制按照碱基配对规律进行,是遗传信息能准确传代的基本原理。
17、代的基本原理。n此外还需酶学的机制来保证复制的保真性。此外还需酶学的机制来保证复制的保真性。第34页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n遵守严格的碱基配对规律;遵守严格的碱基配对规律;n聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;n复制出错时有即时校对功能。复制出错时有即时校对功能。nDNA复制的保真性至少要依赖三种机制:复制的保真性至少要依赖三种机制:第35页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录 1.严格遵守碱基配对规律;DNA聚合酶的高度专一性(严格遵循碱基配对原则,但错配率为7 10-6)第36页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录n复制保真性的酶学机制:2
18、 2、DNA-polDNA-pol的核酸外切酶活性和及时校读的核酸外切酶活性和及时校读的核酸外切酶活性和及时校读的核酸外切酶活性和及时校读(二)复制的保真性依赖(二)复制的保真性依赖(二)复制的保真性依赖(二)复制的保真性依赖DNA-polDNA-pol对对对对碱基的正确选择碱基的正确选择DNA pol IIIDNA pol III在催化磷酸二酯键形成之前完成对碱基的选择。在催化磷酸二酯键形成之前完成对碱基的选择。3 3 3 3、复制的保真性依赖复制的保真性依赖复制的保真性依赖复制的保真性依赖DNA-polDNA-pol对对对对碱基的正确选择碱基的正确选择碱基的正确选择碱基的正确选择第37页,
19、讲稿共82张,创作于星期二目录目录三、复制中的解链伴有三、复制中的解链伴有DNA 分子拓扑分子拓扑学变化学变化DNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把DNA解解成单链,它才能起模板作用。成单链,它才能起模板作用。第38页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录(一)多种酶参与(一)多种酶参与DNA解链和稳定单链状态解链和稳定单链状态第39页,讲稿共82张,创作于星期二目录目录1、解旋酶解旋酶(helicase)功能功能:断裂互补碱基间的氢键,使断裂互补碱基间的氢键,使DNADNA双链分双链分 离成单链。离成单链。解螺旋酶解螺旋酶ATP解旋酶解旋酶RepRep蛋白,Dn
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