核酸代谢蛋白质合成精选PPT.ppt
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1、关于核酸代谢蛋白质合成第1页,讲稿共65张,创作于星期二8.4蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成ProteinBiosynthesis掌握蛋白质生物合成的概况:原料、三类掌握蛋白质生物合成的概况:原料、三类RNA在蛋在蛋白质生物合成中的作用、遗传密码的概念及其白质生物合成中的作用、遗传密码的概念及其特点;特点;熟悉蛋白质的生物合成过程;熟悉蛋白质的生物合成过程;了解蛋白质合成后的加工和转运方式。了解蛋白质合成后的加工和转运方式。重点、难点:三类重点、难点:三类RNA在蛋白质生物合成中的作在蛋白质生物合成中的作用、遗传密码的概念及其特点;蛋白质合成的用、遗传密码的概念及其特点;蛋白质合成的基本过程
2、。基本过程。第2页,讲稿共65张,创作于星期二A G C C T GA G C C T GU C G G A CU C G G A CSer AspSer Asp以以mRNA为模板的蛋白质合成过程被称为为模板的蛋白质合成过程被称为翻译(翻译(translation)。第3页,讲稿共65张,创作于星期二vTranslationisthesecondstepofgeneexpressionv蛋白质合成的蛋白质合成的场所场所是核糖体是核糖体(Ribosomes)v原料原料是是20种种L-氨基酸,反应所需氨基酸,反应所需能量能量由由ATP、GTP提提供,此外还有供,此外还有Mg2+、K+等金属离子参与
3、。等金属离子参与。v蛋白质合成体系主要由蛋白质合成体系主要由mRNA、tRNA、rRNA、有关、有关的酶以及几十种蛋白质因子组成。的酶以及几十种蛋白质因子组成。第4页,讲稿共65张,创作于星期二蛋白质合成体系的组分蛋白质合成体系的组分l遗传密码遗传密码lmRNAltRNAlrRNA和核糖体和核糖体l参与合成的蛋白因子参与合成的蛋白因子第5页,讲稿共65张,创作于星期二8.4.1遗传密码遗传密码GeneticCodelmRNA分子中四种不同碱基(分子中四种不同碱基(A、G、C和和U)构)构成特定顺序成特定顺序决定蛋白质决定蛋白质分子中分子中20种种AA所构成的所构成的序序列。列。lmRNA上上相
4、邻三个碱基编码一种相邻三个碱基编码一种AA,因而被称,因而被称为为碱基三联体或密码子碱基三联体或密码子。四种核苷酸,能有四种核苷酸,能有43=64组密码子组密码子l1966年已经完全查清了年已经完全查清了20种基本氨基酸所对应的种基本氨基酸所对应的61个密码子,其中有一个密码子也作为肽链合成个密码子,其中有一个密码子也作为肽链合成的起始密码子的起始密码子,另外还有三个终止密码子。另外还有三个终止密码子。第6页,讲稿共65张,创作于星期二遗遗传传密密码码Thirdletter书本书本209面面第7页,讲稿共65张,创作于星期二8.4.1.1遗传密码的特点遗传密码的特点密码子的方向性密码子的方向性
5、密码子的阅读方向为密码子的阅读方向为5-3,与,与mRNA链合成时延伸方向相链合成时延伸方向相同。同。密码子的简并性密码子的简并性大多数的大多数的aa都有几组不同的密码子,都有几组不同的密码子,Trp及及Met只只有一个密码子。有一个密码子。一个氨基酸可以由几种不同密码子编码:简并性一个氨基酸可以由几种不同密码子编码:简并性编码同一氨基酸的密码子:编码同一氨基酸的密码子:同义密码子同义密码子简并性可以减少有害的突变简并性可以减少有害的突变第8页,讲稿共65张,创作于星期二l (3)密码子的摆动性(变偶性)密码子的摆动性(变偶性)l密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱密码子的专一性基本取
6、决于前两位碱基,第三位碱基有较大灵活性基有较大灵活性,如如Ala:GCU,GCC,GCA,GCG。ltRNA上的反密码子与上的反密码子与mRNA上的密码子配对时,密上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的摆动性密码的摆动性或变偶性(或变偶性(wobble)。)。第9页,讲稿共65张,创作于星期二(4)密码子的连续性(读码)(无标点、无重叠)密码子的连续性(读码)(无标点、无重叠)读码框是连续的,若:移码,则:移码突变。读码框是连续的,若:移码,则:移码突变。
7、(5)密码子的基本通用性)密码子的基本通用性(近于完全通用,(近于完全通用,普适性)普适性)对于高等、低等生物都适用。对于高等、低等生物都适用。例外:例外:真核生物线粒体真核生物线粒体DNA。一些原核生物中利用终止密码翻译一些原核生物中利用终止密码翻译AA(如:支原体(如:支原体UGA-Trp)33起始密起始密码子码子55无无间间隔隔、不不中中断断第10页,讲稿共65张,创作于星期二密码子密码子反密码子反密码子第11页,讲稿共65张,创作于星期二(6)起始密码子起始密码子AUG-Met终止密码子:终止密码子:UAG、UAA、UGA(无义密码子)(无义密码子)终终止止密密码码子子:核核糖糖体体遇
8、遇到到这这三三个个密密码码子子则则蛋蛋白白质质终终止合成止合成起始密码子:起始密码子:mRNA的第一个的第一个AUG密码子密码子第12页,讲稿共65张,创作于星期二8.4.1.2阅读框架阅读框架mRNA分子的序列是以分子的序列是以3个核苷酸一组,从个核苷酸一组,从5端开始阅端开始阅读,那么有读,那么有3种可能的阅读框架,但是实际上,通常种可能的阅读框架,但是实际上,通常只有一种阅读方式产生有功能蛋白,另外的只有一种阅读方式产生有功能蛋白,另外的2种含有种含有几个终止密码子几个终止密码子一段碱基通常只编码单一的蛋白质一段碱基通常只编码单一的蛋白质正确阅读框架:核糖体识别在编码序列开头处的起始正确
9、阅读框架:核糖体识别在编码序列开头处的起始密码子密码子AUG第13页,讲稿共65张,创作于星期二1)mRNA结构结构 1.原核原核mRNA结构结构 在在起起始始密密码码子子AUG上上游游9-13个个核核苷苷酸酸处处,有有一一段段可可与与核核糖糖体体结结合合、富富含含嘌嘌呤呤的的3-9个个核核苷苷酸酸的的保保守守序序列列AGGA,此序列称,此序列称SD序列。序列。它它与与核核糖糖体体小小亚亚基基内内16S rRNA的的3端端一一段段富富含含嘧嘧啶啶的的序序列列GAUCACCUCCUUA-OH互互补补,使使得得结结合合于于小小亚亚基基上上的的起起始始tRNA能能正正确确地地定定位位于于mRNA的的
10、起起始始密密码码子子AUG。8.4.2mRNA第14页,讲稿共65张,创作于星期二SD序列与序列与16S rRNA结合结合第15页,讲稿共65张,创作于星期二2.真核真核mRNA结构结构真核真核mRNA具有具有m7GpppN帽子结构,帽子结构,无无SD序列。序列。帽子结构具有增强翻译效率的作用。帽子结构具有增强翻译效率的作用。若起始若起始AUG与帽子结构间的距离太近(小于与帽子结构间的距离太近(小于12个核苷酸),就不能有效利用这个个核苷酸),就不能有效利用这个AUG,会从下,会从下游适当的游适当的AUG起始翻译。当距离在起始翻译。当距离在17-80个核苷个核苷酸之间时,离体翻译效率与距离成正
11、比。酸之间时,离体翻译效率与距离成正比。第16页,讲稿共65张,创作于星期二真真核核mRNA具具有有“第第一一AUG规规律律”,即即当当5端端具具有有数数个个AUG时时,其其中中只只有有一一个个AUG为为主主要要开开放放阅阅读读框框架架的的翻翻译译起起点。点。起始起始AUG二个特点:二个特点:(1)AUG上游的上游的-3经常是嘌呤,尤其是经常是嘌呤,尤其是A。(2)紧跟)紧跟AUG的的+4常常是常常是G。起始起始AUG邻近序列中,以邻近序列中,以ANNAUGGN的频率最高。的频率最高。若若-3不不是是A,则则+4必必须须是是G。无无此此规规律律的的AUG,则则无无起起始功能。始功能。第17页,
12、讲稿共65张,创作于星期二8.4.3tRNAv同工同工tRNA:一种氨基酸可以有一种以上一种氨基酸可以有一种以上tRNA作为运载工作为运载工具。把携带相同氨基酸而反密码子不同的一组具。把携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA称为称为同工同工tRNA。(。(20种氨基酸,种氨基酸,60-120种种tRNA)35ICCA-OH53CCA-OHGGCCCG第18页,讲稿共65张,创作于星期二tRNA分子有二个功能分子有二个功能:A.专专一一性性地地结结合合氨氨基基酸酸,生生成成氨氨酰酰-tRNA,使使氨氨基基酸酸活活化。化。B.识识别别氨氨基基酸酸密密码码子子,依依靠靠核核糖糖体体的的特特定定位
13、位点点对对 mRNA的密码子进行识别。的密码子进行识别。每一个细菌细胞内约有每一个细菌细胞内约有60种不同种不同tRNA(至少有(至少有31-32种),真核细胞内可达种),真核细胞内可达100-120种。种。第19页,讲稿共65张,创作于星期二l校正校正tRNA某些某些tRNA能校正基因的有害突变,称为能校正基因的有害突变,称为校正校正tRNA。校正校正tRNA通常由于反密码子的突变,破坏了译码规则,不按常通常由于反密码子的突变,破坏了译码规则,不按常规引入规引入AA,却恰好起到了校正功能,却恰好起到了校正功能。回复突变(回复突变(reversemutation):):突变型生物重新获得其原有
14、突变型生物重新获得其原有的性状。的性状。如:如:mRNA:5GAG(Gln)3UAG(无义突变)(无义突变)tRNATyr上的反密码子为:上的反密码子为:3AUG5tRNATyr反密码子突反密码子突变:变:3AUC5,它可以将,它可以将mRNA上的上的UAG读成读成Tyr,从而,从而使肽链继续合成。使肽链继续合成。第20页,讲稿共65张,创作于星期二核糖体是蛋白质合成的场所。核糖体是蛋白质合成的场所。核糖体是由几十种蛋白核糖体是由几十种蛋白质和几种质和几种rRNA组成的亚细胞颗粒组成的亚细胞颗粒,其中蛋白质与其中蛋白质与rRNA的重量比约为的重量比约为1:2。真核生物:游离核糖体或与内质网结合
15、真核生物:游离核糖体或与内质网结合原核生物:游离核糖体或与原核生物:游离核糖体或与mRNA结合成串状的结合成串状的多核糖体多核糖体(提高翻译效率提高翻译效率)。8.4.4rRNA及核糖体及核糖体细菌细菌mRNA 寿命很短,寿命很短,mRNA必须以最高效率被翻译。必须以最高效率被翻译。翻译的高效性表现在两方面:翻译的高效性表现在两方面:a转录和翻译偶联转录和翻译偶联 b多个核糖体翻译同一条多个核糖体翻译同一条mRNA链链第21页,讲稿共65张,创作于星期二1.不同来源核糖体的大小和不同来源核糖体的大小和rRNA组成组成原核生物原核生物核糖体核糖体(S)S)亚基(亚基(S)S)rRNA(S)rRN
16、A(S)真核生物真核生物806040285.851850703023516在在16S rRNA的的3端有一段富含嘧啶的序列,可以端有一段富含嘧啶的序列,可以识别、结合识别、结合mRNA的的S.D序列。序列。第22页,讲稿共65张,创作于星期二PA53E.coli.中,中,30S的小亚基能单独与的小亚基能单独与mRNA结合成结合成30S核糖体核糖体-mRNA复合体,后者与复合体,后者与tRNA可以专一性结合。可以专一性结合。核糖体大亚基两个核糖体大亚基两个tRNA的结合部位(大肠杆菌)的结合部位(大肠杆菌)P位和位和A位,二者紧密连接,各占一个密码子的距离。位,二者紧密连接,各占一个密码子的距离
17、。P位:结合起始氨酰位:结合起始氨酰-tRNA和肽酰和肽酰-tRNA,A位:结合新掺入的氨酰位:结合新掺入的氨酰-tRNA。核糖体结构模型核糖体结构模型 50S 亚基上有两个亚基上有两个tRNA位点:氨酰基位点(位点:氨酰基位点(A)和肽酰基位点(和肽酰基位点(P)。)。50S与与30S接触面上有一个接触面上有一个mRNA结合位点。结合位点。第23页,讲稿共65张,创作于星期二第24页,讲稿共65张,创作于星期二第25页,讲稿共65张,创作于星期二8.4.5参与蛋白质合成的辅助因子(大肠杆菌)参与蛋白质合成的辅助因子(大肠杆菌)蛋白质合成体系中,有一些蛋白质因子,在蛋白质合蛋白质合成体系中,有
18、一些蛋白质因子,在蛋白质合成的不同阶段起作用。主要有:成的不同阶段起作用。主要有:起始因子、延长因子、起始因子、延长因子、终止因子(或释放因子)。终止因子(或释放因子)。此外还有此外还有ATP、GTP、Mg2+等参与。等参与。原核:原核:InitiationFactor(IF1,IF2,IF3)ElongationFactor(EF-Tu,EF-Ts,EF-G)Termination/ReleasingFactor(RF1,RF2,RF3)第26页,讲稿共65张,创作于星期二 IF1:协助协助IF2、IF3起作用起作用1、起始因子起始因子IF2:促进氨酰促进氨酰-tRNA结合在起结合在起始密始
19、密码子上码子上IF3:促进小亚基与促进小亚基与mRNA结合结合(起始因子协助起始复合物的形成)(起始因子协助起始复合物的形成)2、延长因子延长因子(促进肽(促进肽链延长)链延长)EF-Tu:将氨酰将氨酰-tRNA结合在核糖体结合在核糖体A位点位点EF-Ts:重新生成重新生成EF-Tu-GTPEF-G:依赖于依赖于GTP,又称移位因子,又称移位因子,协协助核糖体移位助核糖体移位第27页,讲稿共65张,创作于星期二 RF RF1 1:识别终止密码子识别终止密码子UAAUAA和和UAGUAG3.3.终止终止/释放因子释放因子 RFRF2 2:识别终止密码子识别终止密码子UAAUAA和和UGAUGA
20、RF RF3 3:刺激刺激RFRF1 1和和RFRF2 2活性,协助活性,协助 肽链释放肽链释放,不识别终止密码子不识别终止密码子 真核终止因子:真核终止因子:RF一种。识别三个终止密码子一种。识别三个终止密码子原核原核第28页,讲稿共65张,创作于星期二8.4.6蛋白质的合成过程蛋白质的合成过程v 氨基酸的活化氨基酸的活化v肽链合成的起始肽链合成的起始v肽链的延伸肽链的延伸v肽链合成的终止与释放肽链合成的终止与释放第29页,讲稿共65张,创作于星期二8.4.6.1氨基酸的活化氨基酸的活化-合成氨酰合成氨酰-tRNAl氨氨基基酸酸的的活活化化是是指指各各种种参参加加蛋蛋白白质质合合成成的的AA
21、与与携携带带它它的的相相应应的的tRNA结结合合成成氨氨酰酰-tRNA合合成成氨氨酰酰-tRNA的过程。活化反应在的过程。活化反应在氨酰氨酰-tRNA合成酶合成酶的催化下进行。的催化下进行。氨基酸在掺入肽链前,必须活化,获得足够的能量。氨基酸在掺入肽链前,必须活化,获得足够的能量。第30页,讲稿共65张,创作于星期二v氨基酸活化的总反应式是:氨基酸活化的总反应式是:氨基酸氨基酸+ATP+tRNA+H2O氨酰氨酰-tRNA+AMP+PPi书写如:书写如:Ile-tRNAIle异亮氨酰异亮氨酰-tRNAIlev每每一一种种AA都都有有各各自自特特异异的的氨氨酰酰-tRNA合合成成酶酶。氨氨酰酰-t
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