核酸结构与功能精选PPT.ppt
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1、目目 录录关于核酸结构与功能第1页,讲稿共89张,创作于星期二核核 酸酸(nucleic acid)是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。携带和传递遗传信息。第2页,讲稿共89张,创作于星期二核酸的发现和研究工作进展核酸的发现和研究工作进展 1868年年 Fridrich Miescher从脓细胞中提取从脓细胞中提取“核素核素”1944年年 Avery等人等人证实证实DNA是遗传物质是遗传物质1953年年 Watson和和Crick发现发现DNA的双螺旋结构的双螺旋结构(1962)1968年年 Nirenberg发现发现遗传密码遗传密码
2、(1968)1975年年 Temin和和Baltimore发发现现逆转录酶逆转录酶(1975)1981年年 Gilbert和和Sanger建建立立DNA 测序方法测序方法(1980)1985年年 Mullis发明发明PCR 技术技术(1993)1990年年 美国启动美国启动人类基因组计划人类基因组计划(HGP)1994年年 中国人类基因组计划启动中国人类基因组计划启动2001年年 美、英等国美、英等国完成人类基因组计划基本框架完成人类基因组计划基本框架第3页,讲稿共89张,创作于星期二核酸的分类及分布核酸的分类及分布存在存在于细胞核和于细胞核和线粒体线粒体 分布于细胞核、细胞质、分布于细胞核、
3、细胞质、线粒体线粒体(deoxyribonucleic acid,DNA)(ribonucleic acid,RNA)脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸 核糖核酸核糖核酸携带遗传信息,并通过复制传递携带遗传信息,并通过复制传递给下一代。给下一代。是是DNADNA转录的产物,参与遗传信转录的产物,参与遗传信息的表达。某些病毒息的表达。某些病毒RNARNA也可作也可作为遗传信息的载体为遗传信息的载体第4页,讲稿共89张,创作于星期二第一节第一节核酸的化学组成及其一级结构核酸的化学组成及其一级结构The Chemical Component and Primary Structure of Nucleic A
4、cid第5页,讲稿共89张,创作于星期二核酸核酸(DNA和和RNA)核苷酸核苷酸核苷和脱氧核苷核苷和脱氧核苷磷酸磷酸戊糖戊糖碱基碱基嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶核糖核糖脱氧核糖脱氧核糖核酸组成核酸组成 第6页,讲稿共89张,创作于星期二分子组成分子组成碱基碱基(base):嘌呤碱,嘧啶碱:嘌呤碱,嘧啶碱戊糖戊糖(ribose):核糖,脱氧核糖:核糖,脱氧核糖磷酸磷酸(phosphate)一、核苷酸是构成核酸的基本组成单位一、核苷酸是构成核酸的基本组成单位第7页,讲稿共89张,创作于星期二碱基碱基(base)是含氮的杂环化合物。是含氮的杂环化合物。碱基碱基嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶腺嘌呤腺嘌呤鸟嘌呤鸟嘌呤尿嘧啶尿嘧啶
5、胸腺嘧啶胸腺嘧啶胞嘧啶胞嘧啶存在于存在于DNA和和RNA中中仅存在于仅存在于RNA中中仅存在于仅存在于DNA中中碱基碱基第8页,讲稿共89张,创作于星期二嘌呤嘌呤(purine,Pu)腺嘌呤腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤鸟嘌呤(guanine,G)第9页,讲稿共89张,创作于星期二嘧啶嘧啶(pyrimidine,Py)胞嘧啶胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(thymine,T)第10页,讲稿共89张,创作于星期二n碱基的互变异构体碱基的互变异构体第11页,讲稿共89张,创作于星期二N,N二甲基鸟嘌呤二甲基鸟嘌呤N6-异戊烯腺嘌呤异戊烯腺嘌呤双氢
6、尿嘧啶双氢尿嘧啶4-巯尿嘧啶巯尿嘧啶 稀有碱基稀有碱基 第12页,讲稿共89张,创作于星期二戊糖戊糖(构成(构成RNA)12345核糖核糖(ribose)(构成(构成DNA)脱氧核糖脱氧核糖(deoxyribose)第13页,讲稿共89张,创作于星期二脱氧核苷脱氧核苷嘌呤嘌呤N-9 或或嘧啶嘧啶N-1与脱氧核糖与脱氧核糖C-1 通过通过-N-糖苷糖苷键键相连形成相连形成脱氧核苷脱氧核苷(deoxyribonucleoside)。第14页,讲稿共89张,创作于星期二 嘌呤嘌呤N-9-9或或嘧啶嘧啶N-1-1与核糖与核糖C-1C-1 通过通过-N-糖苷键糖苷键相连形成相连形成核苷核苷(ribonu
7、cleoside)。核苷核苷NNNN9NH2OOHOHHHHCH2OHH12糖苷键糖苷键第15页,讲稿共89张,创作于星期二核苷或脱氧核苷与磷酸通过核苷或脱氧核苷与磷酸通过酯键酯键结合构成结合构成核苷酸核苷酸(ribonucleotide)或或脱氧核苷酸脱氧核苷酸(deoxyribonucleotide)。核苷酸核苷酸(ribonucleotide)NNNN9NH2OO HO HHHHCH2H1 2OPO-HOO糖苷键糖苷键酯键酯键第16页,讲稿共89张,创作于星期二多磷酸核苷酸多磷酸核苷酸第17页,讲稿共89张,创作于星期二环化核苷酸:环化核苷酸:cAMP、cGMP,是细胞信号转是细胞信号转
8、导中的第二信使。导中的第二信使。cAMP核苷酸衍生物核苷酸衍生物第18页,讲稿共89张,创作于星期二含核苷酸的生物活性物质:含核苷酸的生物活性物质:NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD 等都含有等都含有 AMPNADP+NAD+第19页,讲稿共89张,创作于星期二二、二、DNA是脱氧核苷酸通过是脱氧核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连磷酸二酯键连接形成的大分子接形成的大分子一一个个脱脱氧氧核核苷苷酸酸3 3 的的羟羟基基与与另另一一个个核核苷苷酸酸5 5 的的-磷磷 酸酸基基 团团 缩缩 合合 形形 成成磷磷 酸酸 二二 酯酯 键键(phosphodiester bond)。多多个个脱脱氧氧核
9、核苷苷酸酸通通过过磷磷酸酸二二酯酯键键构构成成了了具具有有方方向向性性的的线线性性分分子子,称称为为多多聚聚脱脱氧氧核核苷苷酸酸(polydeoxynucleotide),即即DNA链链。第20页,讲稿共89张,创作于星期二5-末末端端3-末末端端CGA磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键第21页,讲稿共89张,创作于星期二交交替替的的磷磷酸酸基基团团和和戊戊糖糖构构 成成 了了DNA的的 骨骨 架架 (backbone)。DNA链的方向是链的方向是5 5 3 3 第22页,讲稿共89张,创作于星期二三、三、RNA也是具有也是具有3,5-磷酸二酯键的线磷酸二酯键的线性大分子性大分子RNA也
10、也是是多多个个核核苷苷酸酸分分子子通通过过酯酯化化反反应应形形成成的的线性大分子,并且具有方向性;线性大分子,并且具有方向性;RNA的戊糖是核糖;的戊糖是核糖;RNA的嘧啶是胞嘧啶和尿嘧啶。的嘧啶是胞嘧啶和尿嘧啶。第23页,讲稿共89张,创作于星期二n定义定义核核酸酸中中核核苷苷酸酸的的排排列列顺序。顺序。由由于于核核苷苷酸酸间间的的差差异异主主要要是是碱碱基基不不同同,所所以以也也称为称为碱基序列碱基序列。55端端3端端CGA四、核酸的一级结构是核四、核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序苷酸的排列顺序第24页,讲稿共89张,创作于星期二A G P5 P T PG PC PT P OH 3 书写方
11、法:书写方法:5 pApCpTpGpCpT-OH 3 5 A C T G C T 3 第25页,讲稿共89张,创作于星期二核核酸酸分分子子的的大大小小常常用用碱碱基基(base或或kilobase)数数目目来来表示。表示。小小 的的 核核 酸酸 片片 段段(50bp)常常 被被 称称 为为 寡寡 核核 苷苷 酸酸(oligonucleotide)。自自然然界界中中的的DNA和和RNA的的长长度度可以高达几十万个碱基。可以高达几十万个碱基。第26页,讲稿共89张,创作于星期二DNA和和RNA的区别的区别核糖核糖 G、C、A、URNA脱氧核糖脱氧核糖 G、C、A、TDNA碱基碱基核糖核糖核酸核酸第
12、27页,讲稿共89张,创作于星期二第二节第二节DNA的空间结构与功能的空间结构与功能Dimensional Structure and Function of DNA第28页,讲稿共89张,创作于星期二DNADNA的的空空间间结结构构又又分分为为二二级级结结构构(secondary structure)和高级结构。和高级结构。DNA的空间结构的空间结构(spatial structure)构成构成DNA的所有原子在三维空间具的所有原子在三维空间具有确定的相对位置关系。有确定的相对位置关系。第29页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录一、一、DNA的二级结构的二级结构双螺旋结构双螺旋结构第30
13、页,讲稿共89张,创作于星期二(一)(一)DNA双螺旋结构的研究背景双螺旋结构的研究背景 碱基组成分析碱基组成分析Chargaff 规则:规则:A=TG=C 碱基的理化数据分析碱基的理化数据分析A-T、G-C以以氢键氢键配对较合理配对较合理 DNA纤维的纤维的X-线衍射图谱分析线衍射图谱分析 目目 录录第31页,讲稿共89张,创作于星期二(二)(二)DNA双螺旋结构模型要点双螺旋结构模型要点(Watson,Crick,1953)DNADNA分分子子由由两两条条相相互互平平行行但但走走向向相相反反的的脱脱氧氧多多核核苷苷酸酸链链组组成成,两两链链以以-脱脱氧氧核核糖糖-磷磷酸酸-为为骨骨架架,以
14、以右右手手螺螺旋旋方方式式绕绕同同一一公公共共轴轴盘盘。螺螺旋旋直直径径为为2 2nm,形形成成大大沟沟(major groove)及及小小沟沟(minor groove)相间。相间。目目 录录 模型要点模型要点-15 3 第32页,讲稿共89张,创作于星期二碱碱基基垂垂直直螺螺旋旋轴轴居居双双螺螺旋旋内内側側,与与对对側側碱碱基基形形成成氢氢键键配配对对(互互补补配配对对形形式式:A=T;G C)。相邻碱基平面距离相邻碱基平面距离0.34nm,螺螺旋一圈螺距旋一圈螺距3.4nm,一圈,一圈10对对碱基。碱基。目目 录录 模型要点模型要点-2第33页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录碱基互
15、补配对碱基互补配对 TAGC第34页,讲稿共89张,创作于星期二氢氢键键维维持持双双链链横横向向稳稳定定性性,碱碱基基堆堆积积力力维维持持双双链链纵纵向向稳稳定性定性。目目 录录 模型要点模型要点-3第35页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录Watson-Crick双螺旋结构模型双螺旋结构模型(B-DNA)要点:要点:(1)反平行双链:脱氧核糖)反平行双链:脱氧核糖-磷酸骨架位于外侧,磷酸骨架位于外侧,碱基对位于内侧碱基对位于内侧(2)碱基互补配对:)碱基互补配对:AT配对(两个氢键),配对(两个氢键),GC配配对(三个氢键);碱基对平面垂直纵轴对(三个氢键);碱基对平面垂直纵轴(3)右手
16、双螺旋:螺距为)右手双螺旋:螺距为3.4 nm,直径为,直径为2.0 nm,10bp/圈圈第36页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录(4)表面功能区:小沟较浅;大沟较深,是蛋白)表面功能区:小沟较浅;大沟较深,是蛋白质识别质识别DNA碱基序列的基础碱基序列的基础(5)维持结构稳定的力量:氢键维持双链横向稳定,)维持结构稳定的力量:氢键维持双链横向稳定,碱基堆积力维持螺旋纵向稳定碱基堆积力维持螺旋纵向稳定(6)意义)意义:阐明了阐明了DNA的二级结构的二级结构;为复制机制作了解释为复制机制作了解释第37页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录(三)(三)DNA双螺旋结构的多样性双螺旋结构的多
17、样性第38页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录第39页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录 DNA double helix类型类型 helix type bp/turn rotation/bp vertical rise/bp helical d A 11 +34.7 2.56A 23A B 10 +34.0 3.38A 19A C 9.33 +38.6 3.32A 19A Z 12 -30.0 5.71A 18A第40页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录(四)(四)DNA的多链螺旋结构的多链螺旋结构在在酸酸性性的的溶溶液液中中,胞胞嘧嘧啶啶的的N-3原原子子被被质质子子化化,可可
18、与与鸟鸟嘌嘌呤呤的的N-7原原子子形形成成氢氢键键;同同时时,胞胞嘧嘧啶啶的的N-4的的氢氢原原子子也也可可与与鸟鸟嘌嘌呤呤的的O-6形形成成氢氢键键,这这种种氢键被称为氢键被称为Hoogsteen氢键。氢键。Hoogsteen氢键氢键Hoogsteen氢氢键键,不不破破坏坏Watson-Crick氢氢键键,由由此此形形成了成了CGC的三链结构的三链结构(triplex)。第41页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录三链结构三链结构第42页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录鸟嘌呤之间通过鸟嘌呤之间通过Hoogsteen氢键形成特殊的氢键形成特殊的四四链结构链结构(tetraplex)。四
19、四链结构链结构第43页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录真核生物真核生物DNA3 3-末端末端是是富含富含GT的多次重复序列,的多次重复序列,因而自身形成了折叠的四因而自身形成了折叠的四链结构。链结构。第44页,讲稿共89张,创作于星期二目目 录录二、二、DNA的超螺旋结构及其在染色质中的超螺旋结构及其在染色质中的组装的组装(一)(一)DNA的超螺旋结构的超螺旋结构超螺旋结构超螺旋结构(superhelix 或或supercoil)DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。正超螺旋正超螺旋(positive supercoil)盘绕盘绕方向与方向与DNA双螺旋方
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