第02章蛋白质的结构与功能.pptx
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1、n什么是蛋白质?蛋蛋白白质质(protein)是是由由许许多多氨氨基基酸酸(amino acids)构构成成的的具具有有特特定定空空间结构的高分子有机物。间结构的高分子有机物。第1页/共136页蛋白质在生命活动中的重要作用1.生物催化作用2.免疫保护作用3.运动与支持作用4.运输和储存作用5.代谢调节作用6.控制生长和分化7.接收和传递信息生物膜高等动物记忆和识别氧化供能第2页/共136页抗冻蛋白(antifreeze protein)荧光抗冻蛋白装饰的冰晶体 抗冻蛋白,附着在冰晶体表面,抑制冰晶体生长,防止有机体冻伤。第3页/共136页蛋白质的分子组成蛋白质的分子组成The Molecula
2、r Component of Protein第一节第一节第4页/共136页n组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素主要有主要有C C、H H、O O、N N和和 S S。有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘有碘 。第5页/共136页 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为1616。由由于于体体内内的的含含氮氮物物质质以以蛋蛋白白质质为为主主,因因此此,只只要要测测定定生生物物样样品品中中的的含含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中
3、蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%n蛋白质元素组成的特点第6页/共136页举例:一个生物样品的含氮量为5%,它的蛋白质含量为:()第7页/共136页三聚氰胺事件第8页/共136页一、氨基酸 存在自然界中的氨基酸有300300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有2020种,且均属 L-L-氨基酸 (甘氨酸除外)。第9页/共136页H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式RC+NH3COO-H(一)氨基酸的结构特点第10页/共136页氨基酸的共同特点:(1)两性电解质(2)除甘氨酸外都是L 型氨基酸(3)侧链R
4、基团结构和性质不同第11页/共136页非极性疏水性氨基酸极性中性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸(二)氨基酸的分类1.1.依侧链R R基团的结构和理化性质分:第12页/共136页非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸第13页/共136页第14页/共136页 极性中性氨基酸极性中性氨基酸第15页/共136页带正电荷的碱性氨基酸带正电荷的碱性氨基酸第16页/共136页带负电荷的酸性氨基酸带负电荷的酸性氨基酸第17页/共136页n几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)CH2CHCOO-NH2+CH2CH2CH2CHCOO-NH2+CH2CH2第18页/共136页 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨
5、酸二硫键二硫键-HH-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-S+NH3S-CH2-CH-COO-+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3-OOC-CH-CH2-SH+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3HS-CH2-CH-COO-+NH3第19页/共136页2.营养学分类必需氨基酸:赖、色、苯丙、甲硫、苏、亮、异亮、缬非必需氨基酸:12种第20页/共136页3.根据氨基酸结构分类 (1)脂肪族氨基酸:甘、丙、丝、苏、半胱、甲硫、天冬酰胺、谷氨酰胺、天冬、谷、精、赖。(2)支链氨基酸:缬、亮、异亮。(3)芳香族氨基酸:苯丙、酪、色。(
6、4)杂环氨基酸:组、色。(5)杂环亚氨基酸:脯第21页/共136页(三)氨基酸的理化性质1.两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。处溶液的酸碱度。等电点等电点(isoelectric point,pI)在在某某一一pH的的溶溶液液中中,氨氨基基酸酸解解离离成成阳阳离离子子和和阴阴离离子子的的趋趋势势及及程程度度相相等等,成成为为兼兼性性离离子子,呈呈电电中性。此时溶液的中性。此时溶液的pH值值称为该氨基酸的称为该氨基酸的等电点等电点。第22页/共136页pH=pIpHpI+H+pHpI氨基酸的兼性离子氨基酸的
7、兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子H+第23页/共136页2.2.紫外吸收性质色氨酸、酪氨酸的色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在最大吸收峰在 280 nm 附近。附近。大大多多数数蛋蛋白白质质含含有有这这两两种种氨氨基基酸酸残残基基,所所以以 测测 定定 蛋蛋 白白 质质 溶溶 液液280nm的的光光吸吸收收值值是是分分析析溶溶液液中中蛋蛋白白质质含含量量的的快速简便的方法。快速简便的方法。第24页/共136页3.3.氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物氨氨基基酸酸与与茚茚三三酮酮水水合合物物共共热热,可可生生成成蓝蓝紫紫色色化合物,其最大吸收峰在化合物,其最大吸收峰在570nm处。处。由由于于此此吸
8、吸收收峰峰值值与与氨氨基基酸酸的的含含量量存存在在正正比比关关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。系,因此可作为氨基酸定量分析方法。第25页/共136页第26页/共136页二、肽肽肽键键是是由由一一个个氨氨基基酸酸的的-羧羧基基与与另另一一个个氨氨基基酸酸的的-氨氨基基脱脱水水缩缩合合而而形形成成的的化学键。化学键。(一)肽 (peptide)(peptide)与肽键(peptide bond)(peptide bond)第27页/共136页+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键第28页/共136页肽肽是是由由氨氨基基酸酸通通过过肽肽键键缩缩合合而而形形成成的的化化合物。合物。两两分分子子氨氨基
9、基酸酸缩缩合合形形成成二二肽肽,三三分分子子氨氨基基酸缩合则形成三肽酸缩合则形成三肽肽肽链链中中的的氨氨基基酸酸分分子子因因为为脱脱水水缩缩合合而而基基团团不全,被称为氨基酸残基不全,被称为氨基酸残基(residue)。由由十十个个以以内内氨氨基基酸酸相相连连而而成成的的肽肽称称为为寡寡肽肽(oligopeptide),由由更更多多的的氨氨基基酸酸相相连连形形成成的的肽肽称多肽称多肽(polypeptide)。第29页/共136页N N 末端:多肽链中有游离-氨基端C C 末端:多肽链中有游离-羧基端n多肽链有两端:第30页/共136页丙氨酰酪氨酰天冬氨酰甘氨酸第31页/共136页(二)生物活
10、性肽 1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)第32页/共136页氧化型谷胱甘肽(GSSG)第33页/共136页GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+nGSH与与GSSG间的转换间的转换 第34页/共136页 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽第35页/共136页蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构The Molecular Structure of Protein 第二节第二节第36页/共136页n蛋白质的分子结构包
11、括蛋白质的分子结构包括:高级高级结构结构一级结构一级结构(primary structure)二级结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)第37页/共136页第38页/共136页n定义:蛋白质的一级结构指在蛋白质中氨基酸的数蛋白质的一级结构指在蛋白质中氨基酸的数目、排列顺序及共价连接。目、排列顺序及共价连接。氨基酸排列顺序从氨基酸排列顺序从N-端至端至C-端的端的。一、蛋白质的一级结构n主要的化学键:肽键肽键,有些蛋白质还包括,有些蛋白质还包括二硫键。二硫键。第39
12、页/共136页一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能功能的基础的基础。第40页/共136页二、蛋白质的空间结构 蛋白质构象又分为主链构象和侧链构象,主链构象指多肽链上各原子的排布及相互关系;侧链构象是指各氨基酸侧链基团中原子的排布及彼此关系。主链构象决定侧链基团的排布,侧链构象影响主链构象的卷曲和折叠,二者相互依存,相互影响。第41页/共136页第42页/共136页(一)蛋白质的二级结构(一)蛋白质的二级结构 (secondary structure)(secondary structure)蛋蛋白白质质分分子子中中某某一一段段肽肽链链的的局局部部空空间间
13、结结构构,即即该该段段肽肽链链主主链链骨骨架架原原子子的的相相对对空空间间位位置置,并并不不涉涉及及氨氨基基酸酸残残基基侧侧链链的的构构象象。n定义:n主要的化学键:氢键氢键 第43页/共136页肽单元参与肽键的6个原子C 1、C、O、N、H、C 2位于同一平面,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元(peptide unit)。第44页/共136页第45页/共136页 -螺旋螺旋 (-helix)-折叠折叠 (-pleated sheet)-转角转角 (-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)n蛋白质二级结构第46页/共136页蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其
14、氨基酸残基的侧链适合形成-螺旋或-折叠,它就会出现相应的二级结构。第47页/共136页1.-螺旋(-helix)第48页/共136页Linus Pauling Robert Corey第49页/共136页-螺旋的结构特点:(1)为一右手螺旋,螺旋每圈包含3.6个氨基酸残基,螺距为0.54nm,每个氨基酸残基向上平移0.15nm,直径0.23nm。(2)相邻2圈螺旋间第1个肽单位的C=O与第4个肽单位的N-H形成氢键,氢键方向与螺旋纵轴平行。(3)肽链中氨基酸残基的R基团均伸向螺旋的外侧,其空间形状、大小及电荷对-螺旋的形成和稳定有重要的影响。第50页/共136页2.2.-折叠(sheet)sh
15、eet)Tu第51页/共136页-折叠的结构特点(1)多肽链充分伸展,由若干条肽段或肽链平行或反平行排列组成片状结构。相邻肽平面呈110夹角,主链骨架伸展呈锯齿状。(2)相邻主链之间靠氢键维系。氢键的方向与肽链长轴垂直。肽链中氨基酸的残基的R侧链分布在片层上下。(3)两端肽链可以是平行的,也可以是反平行的。反平行式更为稳定。第52页/共136页第53页/共136页第54页/共136页-转角转角 第一个氨基酸残基的C=O与第四个残基的NH形成氢键3.3.-转角(转角(-turn)-turn)第55页/共136页无规卷曲(random coil)无规卷曲是用来阐述没有确定规律性无规卷曲是用来阐述没
16、有确定规律性的那部分肽链结构。的那部分肽链结构。第56页/共136页蛋白质分子中各种二级结构第57页/共136页(二)超二级结构(supersecondary structure)超二级结构又称模体(超二级结构又称模体(motifmotif),是指在多),是指在多肽链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间肽链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间折叠中靠近,彼此相互作用,形成规则的二级折叠中靠近,彼此相互作用,形成规则的二级结构聚集体。结构聚集体。第58页/共136页n模体常见的形式第59页/共136页钙结合蛋白中结合钙结合蛋白中结合钙离子的模体钙离子的模体锌指结构锌指结构第60页/共136页(三
17、)蛋白质三级结构(tertiary structure)(tertiary structure)整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。n定义:第61页/共136页磷酸甘油酸激酶的结构域 结构域(domain)(domain):是蛋白质构象中特定空间区域。在较大蛋白质分子中,由多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,形成独立的结构单位。第62页/共136页主要的化学键(次级键):1.氢键2.离子键3.疏水相互作用 又称疏水键,是稳定三级结构最主要的作用力4.范德华力5.二硫键(共价键)
18、第63页/共136页A氢键;B.二硫键;C.疏水作用;D.盐键;E.范德华力第64页/共136页第65页/共136页 肌红蛋白肌红蛋白(Mb)一级结构:153:153个氨基酸的排列顺序二级结构:A-H:A-H 共8 8个-螺旋,之间以无规卷曲相连三级结构:球状分子,亲水R R基位于表面,疏水R R基位于分子内部,形成疏水口袋,血红素位于口袋中第66页/共136页亚基之间的结合主要是疏水作用亚基之间的结合主要是疏水作用,氢键和离氢键和离子键。子键。四、四、蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为触部位的布
19、局和相互作用,称为蛋白质的四级蛋白质的四级结构结构。有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的质的亚基亚基 (subunit)。第67页/共136页由由2个个亚亚基基组组成成的的蛋蛋白白质质四四级级结结构构中中,若若亚亚基基分分子子结结构构相相同同,称称之之为为同同二二聚聚体体(homodimer),若若亚亚基基分分子结构不同,则称之为子结构不同,则称之为异二聚体异二聚体(heterodimer)。血红蛋白的血红蛋白的四级结构四级结构第68页/共136页 某些蛋白质分子可进一步聚合
20、成聚合体(polymer)。聚合体中的重复单位称为单体(monomer),聚合体可按其中所含单体的数量不同而分为二聚体、三聚体寡聚体(oligomer)和多聚体(polymer)。第69页/共136页蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系The Relation of Structure and Function of Protein第三节第三节第70页/共136页(一)一级结构是空间构象的基础一、蛋白质一级结构与功能的关系牛核糖核酸酶的牛核糖核酸酶的一级结构一级结构二二硫硫键键第71页/共136页 天然状态,天然状态,有催化活性有催化活性 尿素、尿素、-巯基乙醇巯基乙醇 去除尿素、去除
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- 02 蛋白质 结构 功能
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