微生物的代谢与环境工程精选PPT.ppt
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1、关于微生物的代谢与环境工程第1页,讲稿共93张,创作于星期日代谢(metabolism):细胞内发生的各种化学反应的总称。代谢分解代谢(catabolism)合成代谢(anabolism)分解代谢复 杂 分 子(有机物)简单分子ATPH合成代谢+第六章 微生物的代谢与环境工程第2页,讲稿共93张,创作于星期日第一节 微生物的酶酶是动物、植物及微生物等生物体内合成的、催化生物化学反应的、并传递电子、原子和化学基团的生物催化剂。蛋白酶 常见核酸酶 很少,主要作用域核酸。第3页,讲稿共93张,创作于星期日一、酶的组成按照酶的化学组成可将酶分为单纯酶和全酶两大类。单纯酶分子中只有氨基酸残基组成的肽链,
2、全酶分子中则除了多肽链组成的蛋白质酶,还有非蛋白成分(辅助因子),如金属离子、铁卟啉或含B族维生素的小分子有机物。全酶=酶蛋白+辅助因子,只有全酶才有催化作用。酶蛋白在酶促反应中起着决定反应特异性作用,而辅助因子则决定反应类型,参与电子,原子及基团的传递第4页,讲稿共93张,创作于星期日(一)酶的组成形式辅助因子辅酶辅基与酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤的方法去除与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法去除。辅助因子的化学本质是金属离子或小分子有机化合物,按其与酶蛋白结合的紧密程度不同可分为辅酶与辅基第5页,讲稿共93张,创作于星期日一、酶的组成(二)几种重要辅基和辅酶见(P121124)常见
3、的辅酶和辅基有:辅酶I(NAD)和辅酶II(NADP)、辅酶A(CoA或CoASH)、FMN(黄素单核苷酸)和FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)、辅酶Q(CoQ)、磷酸腺苷及其他核苷酸类(包括AMP、ADP、ATP、GTP、UTP、CTP等)。专性厌氧菌特有的辅酶:辅酶M、F420(辅酶420)、F430(辅酶430)等。第6页,讲稿共93张,创作于星期日二、酶的必需基团活性中心活性中心外必需基团必需基团活性中心内必需基团结合基团催化基团结合底物催化底物概念:酶与底物直接结合并发挥催化作用的区域。不参与活性中心构成,稳定酶分子的空间结构第7页,讲稿共93张,创作于星期日活性中心活性中心外必需基外必需
4、基团团 酶的活性中心 多肽链底物分子 活性中心活性中心内必需基内必需基团团 催化基团 结合基团结合基团 二、酶的必需基团活性中心第8页,讲稿共93张,创作于星期日三、酶的催化特性酶作为生物催化剂,具有一般催化剂的特征:(1)能加快化学反应的速度,而本身在反应前后没有结构和性质的改变;(2)只能缩短反应达到平衡所需要的时间而不能改变反应的平衡点。酶作为一种生物大分子又有其不同与一般催化剂之处第9页,讲稿共93张,创作于星期日三、酶的催化特性1专一性高酶对底物及催化的反应有严格的选择性(专一性),一种酶仅能作用于一种物质或一类结构相似的物质,发生一定的化学反应,这种对底物的选择性称为酶的专一性。如
5、蛋白酶只能水解蛋白质、脂肪酶只能水解脂肪、而淀粉酶只能作用于淀粉。2反应条件温和酶催化的反应是在常温、常压和近中性的溶液条件下进行。酶本身是蛋白质,故强酸、强碱、高温、高压、紫外线、重金属盐等一切导致蛋白质不可逆变性的因素,都能使酶受到破坏而丧失其催化活性。第10页,讲稿共93张,创作于星期日3、催化效率高酶催化反应的速率比非催化反应高108-1020倍,比非生物催化剂高107-1013倍。如过氧化氢酶催化过氧化氢分解的的反应,若用铁离子作为催化剂,反应速率为610-4;若用过氧化氢酶催化,反应速率为6106。酶能高效催化主要是能降低反应的活化能。4、酶积极参与生物化学反应,不改变反应的平衡点
6、三、酶的催化特性第11页,讲稿共93张,创作于星期日四、酶的分类与命名(一)酶的分类1、国际系统分类法及酶的编号按酶所催化的化学反应类型,把酶化分为6类,即1、水解酶类:是催化大分子有机物水解成小分子的酶。2、氧化还原酶类:是催化氧化还原反应的酶。3、转移酶类:是催化底物因团转移到另一有机物上的酶。4、异构酶类:催化同分异构分子内的基团重新排列。5、裂解酶类:催化有机物裂解分小分子有机物。6、合成酶类:催化底物的合成反应。第12页,讲稿共93张,创作于星期日四、酶的分类与命名(二)酶的命名1、按酶在细胞的不同部位,可把酶分为:胞外酶、胞内酶和表面酶。2、按酶作用底物的不同,可把酶分为:淀粉酶、
7、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶、核糖核酸酶。第13页,讲稿共93张,创作于星期日四、酶的分类与命名(三)根据酶蛋白分子特点又可将酶分为三类1、单体酶只有一条多肽链,属于这一类的酶很少,一般都是催化水解反应酶,分子量在13,00035,000之间,如溶菌酶、胰蛋白酶等。2、寡聚酶由几个甚至几十个亚基组成,这些亚基可以是相同的多肽链,也可以是不同的多肽链。亚基之间不是共价结合,彼此很容易分开。寡聚酶分子量从35,000到几百万。3、多酶体系是由几种酶彼此嵌合形成的复合体。它有利于一系列反应的连续进行。例如在脂肪合成中的脂肪酸合成酶复合体。第14页,讲稿共93张,创作于星期日第二节酶促反应动力学1.米氏方
8、程I)20世纪,提出的酶底物复合物的形成和过度态概念E+SESE+PE、S、ES、P分别代表酶、底物、中间产物和最终产物II)1894年Fischer提出了锁和钥匙模型III)1958年Koshland提出了诱导契合模型第15页,讲稿共93张,创作于星期日锁钥学说:第16页,讲稿共93张,创作于星期日诱导契合学说:底物的诱导才形成互补形状第17页,讲稿共93张,创作于星期日第二节 酶促反应动力学1913年Michaelis和Menten提出三假设1)反应速度为初速度,即反应刚刚开始,产物生成量极少,忽略逆反应;2)底物浓度(S)远远大于酶的浓度(E);3)反应处于稳态,即中间产物生成和分解的速
9、率相等。Km 米氏常数米氏常数 Vmax 最大反应速率最大反应速率一、米氏方程第18页,讲稿共93张,创作于星期日一、米氏方程Km的物理意义Km值是当酶反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。单位是底物浓度的单位,一般用mol/L或mmolL表示。计算:底物浓度反应速度第19页,讲稿共93张,创作于星期日当pH、温度和离子强度等因素不变时,Km是恒定的。Km是酶的特征性常数之一,Km值的大小,可以近似地表示酶和底物的亲和力。Km值大,意味着酶和底物亲和力小。米氏方程只适应于较为简单的酶促反应。一、米氏方程第20页,讲稿共93张,创作于星期日莫诺德模式Monod基质浓度(S)比增殖速率()一级反
10、应区(n=1)混合级反应区(0n1)零级反应区(n=0)Ks莫诺德于1942年和1950年曾两次进行了单一基质的纯菌种培养试验,关联出微生物比增殖速率和基质浓度之间的关系,如右图所示。活性污泥反应动力学方程l莫诺德发现微生物比增殖速率和基质浓度之间的关系与酶促反应速度与基质浓度之间的关系相同,从而提出了与米门方程式相似的莫诺德模式第21页,讲稿共93张,创作于星期日1微生物比增殖速率,d-1;max微生物最大比增殖速率,d-1;S溶液中限制微生物生长的基质浓度,mg/L、g/m3;莫诺模式Monod基质浓度(S)比增殖速率()一级反应区(n=1)混合级反应区(0n1)零级反应区(n=0)KsK
11、s饱和常数。即当=ax/2时的基质浓度,故又称为半速度常数,mg/L、g/m3。活性污泥反应动力学方程第22页,讲稿共93张,创作于星期日假设:微生物比增殖速率()与基质比降解速率(v)呈比例关系,即式中:基质比降解速率,d-1;基质最大比降解速率,d-1。基质比降解速率(v),可以用莫诺模式加以描述:对废水处理来说,有机物的降解是其基本目的,因此,式2的实际意义较大2活性污泥反应动力学方程第23页,讲稿共93张,创作于星期日三、影响酶促反应速率的因素1、底物浓度对酶反应速度的影响在底物浓度很低时,一级反应随着底物浓度升高,混合级反应继续增大底物浓度,零级反应基质浓度(S)比增殖速率()一级反
12、应区(n=1)混合级反应区(0n1)零级反应区(n=0)Ks第24页,讲稿共93张,创作于星期日2酶浓度对酶促反应的影响 在一定温度和pH条件下,当底物浓度大大超过酶的浓度时,酶的浓度与反应速率呈正比,但在一定条件下,酶的浓度很高时,曲线会逐渐向平缓,这可能是高浓度的酶分子影响了分子扩散,阻碍了酶的活性中心和底物的结合。三、影响酶促反应速率的因素第25页,讲稿共93张,创作于星期日3、温度对酶促反应速度的影响各种酶在最适温度范围内,酶活性最强,酶促反应速度最大。在适宜的温度范围内,温度每升高100C,酶促反应速度可相应提高12倍。用温度系数Q10来表示温度对酶促反应的影响。Q10表示温度每升高
13、100C,酶反应速度随之相应提高的因素。三、影响酶促反应速率的因素第26页,讲稿共93张,创作于星期日一般微生物的温度最适范围在25-60。温度的影响存在三基点:最高、最适、最低。温度过高会破坏酶蛋白,造成变性;(约60)温度过低会使酶作用降低或停止,但可以恢复。(约4)不同微生物的温度适应范围不同。三、影响酶促反应速率的因素第27页,讲稿共93张,创作于星期日4、pH对酶促反应速度的影响酶反应介质pH可影响酶分子,特别是活性中心上必需基团的解离程度和催化基团中质子供体或质子受体所需的离子化状态,同时也可影响底物和酶的解离程度,从而影响酶与底物的结合。三、影响酶促反应速率的因素第28页,讲稿共
14、93张,创作于星期日5、抑制剂对酶促反应速度的影响 酶是蛋白质,凡使酶蛋白变性而起酶活力丧失的作用称为失活作用。凡使酶活力下降,但并不引起酶蛋白变性的作用称为抑制作用。所以,抑制作用与变性作用是不同的。引起酶蛋白变性,但能与酶分子上的某些必需基团(主要是指酶活性中心上的一些基团)发生化学反应,因而引起酶活力下降,甚至丧失,致使酶反应速度降低。能引起这种抑制作用的物质叫做酶的抑制剂。三、影响酶促反应速率的因素第29页,讲稿共93张,创作于星期日根据抑制剂与酶作用方式及抑制作用是否可逆,可将抑制作用分为两大类。(1)不可逆的抑制作用:这类抑制剂通常以比较牢固的共价键与酶蛋白中的基团结合,而使酶失活
15、。不能用透析、超滤等方法除去抑制剂而恢复酶活性。2)可逆的抑制作用:这类抑制剂与酶蛋白的结合是可逆的,可用透析法除去抑制剂,恢复酶的活性。根据抑制剂与底物的关系,可逆抑制作用分为三种类型:三、影响酶促反应速率的因素第30页,讲稿共93张,创作于星期日 概念:抑制剂与底物竞争酶的结合部位,从而影响了底物与酶的正常结合。最常见的一种可逆抑制作用。原因:抑制剂与底物的结构类似,与酶可形成可逆的复合物,但此复合物不可能分解成产物,酶反应速率下降。增加底物浓度可解除这种抑制。(一)竞争性抑制作用(Competitiveinhibition)第31页,讲稿共93张,创作于星期日 竞争性抑制的特征(一)竞争
16、性抑制作用(Competitiveinhibition)1.抑制剂结构与底物相似;2.抑制剂结合的部位是酶的活性中心;3.抑制作用的大小取决于抑制剂与底物的相对浓度,在抑制剂浓度不变时,通过增加底物浓度可以减弱甚至解除竞争性抑制;4.Vmax不变,Km增大第32页,讲稿共93张,创作于星期日 概念:底物和抑制剂同时与酶结合,两者没有竞争作用。抑制剂(I)和底物(S)可以同时结合在酶分子(E)的不同部位上,形成ESI三元复合物。但是,中间产物ESI三元复合物不能进一步分解为产物,酶活力降低。(二)非竞争性抑制作用noncompetitiveinhibition)第33页,讲稿共93张,创作于星期
17、日特征1.抑制剂与底物结构不相似;2.抑制剂结合的部位在酶活性中心外;3.抑制作用的强弱取决于抑制剂的浓度,此种抑制不能通过增加底物浓度而减弱或消除;4.Vmax下降,Km不变(二)非竞争性抑制作用noncompetitiveinhibition)第34页,讲稿共93张,创作于星期日概念酶只有与底物结合后,才能与抑制剂结合。与抑制剂结合后的三元复合物不能形成产物。(二)反竞争性抑制(uncompetitiveinhibition)特征Vmax和Km值均降低。第35页,讲稿共93张,创作于星期日微生物从外界不断地吸收营养物质,在体内发生的各种化学反应,将复杂的有机物分解成简单的有机物的同时,也将
18、其中一部分转化为细胞自身的物质成分,维系自身的生长和繁殖;同时将产生的废物排出体外,这一过程称之为新陈代谢。第三节 微生物的代谢概述第36页,讲稿共93张,创作于星期日新陈代谢(metabolism)1、按活细胞内进行的化学反应分:分解代谢(catabolism)大分子小分子(能量,细胞组分的前体)合成代谢(anabolism)小分子大分子(酶,结构组分等)第三节 微生物的代谢概述第37页,讲稿共93张,创作于星期日第三节 微生物的代谢概述能量与代谢关系示意图第38页,讲稿共93张,创作于星期日(一)微生物的生物氧化和产能 微生物的生物氧化本质是氧化还原反应,这过程中有能量的产生和转移、还原力
19、H的产生、小分子中间代谢物的产生。微生物产生各种能量如电能、化学能、机械能、光能等。在所产生的能量中,一部分变为热量丧失,一部分供给合成反应和生命活动,另一部分贮存在ATP中。微生物的能源主要包括有机物、无机物和日光,能量代谢的主要内容就是研究微生物如何利用这三类能源转化为ATP的。第四节 微生物的分解代谢第39页,讲稿共93张,创作于星期日1、底物水平磷酸化:厌氧或兼性厌氧微生物在底物氧化过程中,产生多种含有高能磷酸键化合物,这些高能化合物能将能量转移给ADP,成为ATP,如1,3-二磷酸甘油酸和磷酸烯醇式丙酮酸。2、呼吸链与氧化磷酸化:是主要的能量来源。氧化磷酸化作用是将生物氧化过程中释放
20、出的自由能转移形成高能ATP的作用,能量的转移通过电子传递链实现,ATP的生成基于与电子传递相偶联的磷酸化作用。氧化磷酸化的全过程可表示为:NADH+H+3ADP+3Pi+1/2O2NAD+4H2O+3ATP(二)ATP的生成方式有:第四节 微生物的分解代谢第40页,讲稿共93张,创作于星期日呼吸链:在分解过程中,代谢物脱下的氢经多种酶和辅酶所催化的连锁反应逐步传递,最终于氧结合生成水,并产生可利用的能量。这一系列递氢体或电子的酶和辅酶/辅基形成电子传递体系叫呼吸链。电子传递链的位置,原核生物中电子传递链与细胞质膜相连,真核微生物在线粒体上。基本功能:a、接受电子供体释放出的电子,电子沿各组分
21、传递,最后由细胞色素氧化酶将电子传给氧;b、合成ATP。第四节 微生物的分解代谢脱氢酶黄素蛋白第41页,讲稿共93张,创作于星期日3、光合磷酸化:光引起叶绿素、菌绿素或菌紫素逐出电子,通过电子传递产生ATP的过程叫光合磷酸化。这种产能方式同氧化磷酸化的主要区别在于:氧化磷酸化是由高能化合物分子氧化驱动的,而光合磷酸化是由光子驱动的第四节 微生物的分解代谢第42页,讲稿共93张,创作于星期日 产能(ATP)生物氧化的功能:产还原力H产小分子中间代谢物(一)、异养微生物的生物氧化 呼吸生物氧化的二种类型:发酵二、微生物的氧化类型有氧呼吸无氧呼吸以分子态的氧作为最终电子受体的生物氧化过程。彻底氧化,
22、放能最多以无机氧化物作为最终电子受体的生物氧化过程,如NO2-、NO3-、SO42-、CO32-及CO2等。不需要氧气,放能多。电子供体是有机化合物,而最终电子受体也是有机化合物的生物氧化过程。不彻底氧化,放能最少。第43页,讲稿共93张,创作于星期日微生物细胞将有机物氧化释放的电子直接交给底物未完全氧化的某中间产物,同时释放能量,并产生各种不同的代谢产物的呼吸类型叫发酵在发酵条件下,有机化合物只是部分地被氧化,只释放出一小部分的能量。发酵的过程是与有机物的还原偶联在一起的,被还原的物质来自初始发酵的分解代谢,不需要外界提供电子受体。发酵的种类很多,可发酵的底物有糖类、有机酸、氨基酸等。1.发
23、酵第44页,讲稿共93张,创作于星期日(1)糖酵解(EMP)糖酵解作用:无氧条件下,微生物通过一系列的酶促反应对葡萄糖进行分解,将1分子葡萄糖分解成2分子丙酮酸并提供能量的过程称为糖酵解作用。1.发酵1.EMP途径(Embden-Meyerhof-ParnasPathway)即糖酵解(Glycolysis)途径,指在细胞质中分解葡萄糖生成丙酮酸的过程,此过程中伴有少量ATP的生成。在缺氧条件下丙酮酸被还原为乳酸,有氧条件下丙酮酸可进一步氧化分解生成乙酰辅酶A(乙酰CoA)进入三羧酸循环,生成CO2和H2O。第45页,讲稿共93张,创作于星期日6碳阶段无氧化还原反应无ATP生成耗能3碳阶段氧化还
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