生物化学第一蛋白质的结构与功能精选PPT.ppt
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1、关于生物化学第一蛋白质的结构与功能第1页,讲稿共121张,创作于星期二Protein Protein 来自希腊字母,意思是来自希腊字母,意思是“头等重头等重要的,原始的要的,原始的”蛋白质蛋白质 来源于对蛋清(清蛋白)的研究来源于对蛋清(清蛋白)的研究 分布广:分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的占人体干重的4545,某些组织含量更高,例如,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达脾、肺及横纹肌等高达8080。第2页,
2、讲稿共121张,创作于星期二 18331833年年 PayenPayen和和PersozPersoz分离出淀粉酶。分离出淀粉酶。18641864年年 Hoppe-SeylerHoppe-Seyler从血液分离出血红蛋白,并从血液分离出血红蛋白,并将其制成结晶。将其制成结晶。1919世纪末世纪末 FischerFischer证明蛋白质是由氨基酸组成的,并证明蛋白质是由氨基酸组成的,并将氨基酸合成了多种短肽将氨基酸合成了多种短肽。19381938年年 德国化学家德国化学家Gerardus J.MulderGerardus J.Mulder引用引用“Protein”Protein”一词来描述蛋白质。
3、一词来描述蛋白质。大事记:大事记:第3页,讲稿共121张,创作于星期二19511951年年 PaulingPauling采用采用X X(射)线晶体衍射发现了蛋白质的二级(射)线晶体衍射发现了蛋白质的二级结构结构-螺旋螺旋(-helix)(-helix)。19531953年年 Frederick SangerFrederick Sanger完成胰岛素一级序列测定。完成胰岛素一级序列测定。19621962年年 John Kendrew John Kendrew 和和 Max PerutzMax Perutz确定了血红蛋白的确定了血红蛋白的四级结构。四级结构。2020世纪世纪9090年代以后年代以后
4、 后基因组计划。后基因组计划。第4页,讲稿共121张,创作于星期二一、什么是蛋白质一、什么是蛋白质?蛋蛋 白白 质质(protein)(protein)是是 由由 许许 多多 氨氨 基基 酸酸(amino(amino acids)acids)通通过过肽肽键键(peptide(peptide bond)bond)相相连形成的高分子含连形成的高分子含氮氮化合物。化合物。第5页,讲稿共121张,创作于星期二1 1)酶的生物催化作用)酶的生物催化作用二、二、蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能第6页,讲稿共121张,创作于星期二2 2)调控作用)调控作用参与基因调控:组蛋白、非组蛋白等
5、参与基因调控:组蛋白、非组蛋白等参与代谢调控:如激素或生长因子等参与代谢调控:如激素或生长因子等第7页,讲稿共121张,创作于星期二3 3)运动与支持)运动与支持机体的结构蛋白:机体的结构蛋白:头发、骨骼、牙齿、肌肉等头发、骨骼、牙齿、肌肉等第8页,讲稿共121张,创作于星期二4 4)参与运输贮存的作用)参与运输贮存的作用血红蛋白血红蛋白 运输氧运输氧铜蓝蛋白铜蓝蛋白 运输铜运输铜铁蛋白铁蛋白 贮存铁贮存铁第9页,讲稿共121张,创作于星期二5 5)免疫保护作用)免疫保护作用抗原抗体反应抗原抗体反应凝血机制凝血机制第10页,讲稿共121张,创作于星期二6 6)参与细胞间信息传递)参与细胞间信息
6、传递信号传导中的受体、信息分子等信号传导中的受体、信息分子等7 7)氧化供能氧化供能第11页,讲稿共121张,创作于星期二蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 组组 成成The Molecular Component of Protein第第 一一 节节第12页,讲稿共121张,创作于星期二 组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素 有有些些蛋蛋白白质质还还含含有有少少量量的的P P、FeFe、CuCu、MnMn、ZnZn、SeSe、I I等等。C 50 55%H 6 7%O 19 24%N 13 19%S 0 4%主主要要元元素素组组成成第13页,讲稿共121张,创作于星期二 各种蛋白质的含氮量很接近
7、,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为1616。由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点凯氏定氮法:凯氏定氮法:凯氏定氮法:凯氏定氮法:第14页,讲稿共121张,创作于星期二一、氨基酸一、氨基酸 组成蛋白质的基本单位组成蛋白质的基本单位存存在在自自然然界界中中的的氨氨基
8、基酸酸有有300300余余种种,但但组组成人体蛋白质的基本氨基酸仅有成人体蛋白质的基本氨基酸仅有2020种种第15页,讲稿共121张,创作于星期二H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式R第16页,讲稿共121张,创作于星期二 基基本本氨氨基基酸酸中中,除除脯脯氨氨酸酸和和甘甘氨氨酸酸外其余均属于外其余均属于L-L-氨基酸氨基酸。例外:Pro Pro 亚氨基酸亚氨基酸Gly Gly 没有手性没有手性第17页,讲稿共121张,创作于星期二1.1.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸2.2.极性中性氨基酸极性中性氨基酸3.3.酸性氨基酸酸性氨基酸4.4.碱性氨基酸碱性氨基酸
9、(一)氨基酸的分类(一)氨基酸的分类分类依据分类依据 :R R侧链基团的结构及理侧链基团的结构及理 化性质的不同化性质的不同第18页,讲稿共121张,创作于星期二甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98 异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸第19页,讲稿共12
10、1张,创作于星期二色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.602.极性中性氨基酸极性中性氨基酸第20页,讲稿共121张,创作于星期二侧链基团在中性溶液中解离后带负电荷。侧链基团在中性溶液中解离后带
11、负电荷。3.酸性氨基酸酸性氨基酸 Glu,Asp天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22第21页,讲稿共121张,创作于星期二4.碱性氨基酸碱性氨基酸 His,Arg,Lys侧链基团在中性溶液中解离后带正电荷。侧链基团在中性溶液中解离后带正电荷。组氨酸组氨酸 His(H)7.59赖氨酸赖氨酸Lys(K)9.74精氨酸精氨酸 Arg(R)10.76第22页,讲稿共121张,创作于星期二另外:1 1、蛋白质中的很多氨基酸是经过加工修、蛋白质中的很多氨基酸是经过加工修 饰的饰的修饰氨基酸修饰氨基酸 如:如:脯氨酸
12、脯氨酸 羟基化羟基化 成成 羟脯氨酸羟脯氨酸 赖氨酸赖氨酸 羟基化羟基化 成成 羟赖氨酸羟赖氨酸2 2、半胱氨酸半胱氨酸CysCys常以常以胱氨酸胱氨酸的形式存在的形式存在第23页,讲稿共121张,创作于星期二 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH第24页,讲稿共121张,创作于星期二(二)氨基酸的理化性质(二)氨基酸的理化性质1.1.两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。处溶液的酸碱度。+OH-+H+OH-+H+pHpI阴离子阴离子第25页,讲稿共121张,创作于星期二等电点等电点(isoel
13、ectric point,pI)(isoelectric point,pI)在在某某一一pHpH的的溶溶液液中中,氨氨基基酸酸解解离离成成阳阳离离子子和和阴阴离离子子的的趋趋势势及及程程度度相相等等,成成为为兼兼性性离离子子,呈呈电电中中性性。此此时时溶溶液液的的pHpH值值称称为为该该氨氨基基酸酸的的等等电点电点。第26页,讲稿共121张,创作于星期二2.2.紫外吸收紫外吸收 色氨酸色氨酸和和酪氨酪氨酸酸的最大吸收峰在的最大吸收峰在 280 nm280 nm 附近。附近。第27页,讲稿共121张,创作于星期二紫外分分光度法:紫外分分光度法:大多数蛋白质含有这大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基,
14、所以测两种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液定蛋白质溶液280nm280nm的光的光吸收值是分析溶液中蛋吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的白质含量的快速简便的方法。方法。芳香族氨基酸的紫外吸收芳香族氨基酸的紫外吸收第28页,讲稿共121张,创作于星期二3 3显色反应显色反应 茚茚三三酮酮反反应应:氨氨基基酸酸可可与与茚茚三三酮酮缩缩合合产产生生蓝紫色化合物蓝紫色化合物,最大吸收峰在,最大吸收峰在570nm570nm。该该反反应应可可作作为为蛋蛋白白质质定定性性、定定量量分分析析的的基基础。础。第29页,讲稿共121张,创作于星期二二、肽二、肽(一)肽(一)肽(peptide)(peptide
15、)肽肽是由氨基酸通过是由氨基酸通过肽键肽键缩合而形缩合而形成的化合物。成的化合物。第30页,讲稿共121张,创作于星期二+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键第31页,讲稿共121张,创作于星期二肽肽键键(peptide(peptide bond)bond):是是由由一一个个氨氨基基酸酸的的-羧羧基基与与另另一一个个氨氨基基酸酸的的-氨氨基基脱脱水水缩缩合合而而形形成成的的化化学键,本质为学键,本质为酰胺键酰胺键。氨氨基基酸酸残残基基(residue)(residue):肽肽链链中中的的氨氨基基酸酸分分子子因为脱水缩合而基团不全,被称为因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基。氨基酸残基。第3
16、2页,讲稿共121张,创作于星期二*两分子氨基酸缩合形成两分子氨基酸缩合形成二肽二肽,三分子氨基酸,三分子氨基酸缩合则形成缩合则形成三肽三肽*由十个以内氨基酸相连而成的肽称为由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽寡肽(oligopeptide)(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的由更多的氨基酸相连形成的肽称肽称多肽多肽(polypeptide)(polypeptide)。*多多肽肽链链(polypeptide(polypeptide chain)chain)是是指指许许多多氨氨基基酸之间以肽键连接而成的一种结构。酸之间以肽键连接而成的一种结构。第33页,讲稿共121张,创作于星
17、期二N N 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由氨基自由氨基的一端的一端C C 末端:多肽链中有末端:多肽链中有自由羧基自由羧基的一端的一端多肽链有方向性:多肽链有方向性:Ala-Tyr-Asp-Gly Ala-Tyr-Asp-GlyN CN端C端第34页,讲稿共121张,创作于星期二N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶第35页,讲稿共121张,创作于星期二(二)(二)几种生物活性肽几种生物活性肽 1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)第36页,讲稿共121张,创作于星期二GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H
18、+NADP+GSH 有抗氧化剂的作用,可还原细胞内产生的过有抗氧化剂的作用,可还原细胞内产生的过氧化氢氧化氢第37页,讲稿共121张,创作于星期二谷胱甘肽的生理功用:谷胱甘肽的生理功用:解毒作用:解毒作用:参与氧化还原反应:参与氧化还原反应:保护巯基酶的活性:保护巯基酶的活性:抗氧化剂作用,维持红细胞膜的稳定:抗氧化剂作用,维持红细胞膜的稳定:第38页,讲稿共121张,创作于星期二 体内许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)2.2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽第39页,讲稿共121张,创作于星期二三、蛋白质的分类三、蛋白质的分类 *根据蛋
19、白质组成成分根据蛋白质组成成分 单纯蛋白质:单纯蛋白质:如,血清清蛋白如,血清清蛋白结合蛋白质结合蛋白质 =蛋白质部分蛋白质部分 +非蛋白质部分非蛋白质部分 如:糖蛋白、脂蛋白、磷蛋白、金属蛋白等如:糖蛋白、脂蛋白、磷蛋白、金属蛋白等*根据蛋白质形状根据蛋白质形状 纤维状蛋白质:纤维状蛋白质:多为多为结构蛋白结构蛋白,难溶于水,难溶于水球状蛋白质:球状蛋白质:多数具有多数具有生理活性,生理活性,多数可溶多数可溶 如酶、免疫球蛋白等等如酶、免疫球蛋白等等第40页,讲稿共121张,创作于星期二分类辅基举例脂蛋白脂类血浆脂蛋白(VLDL、LDL、HDL等)糖蛋白糖基或糖链胶原蛋白、纤连蛋白等核蛋白核
20、酸核糖体磷蛋白磷酸基团酪蛋白(casein)血红素蛋白血红素(铁卟啉)血红蛋白、细胞色素c黄素蛋白黄素核苷酸(FAD、FMN)琥珀酸脱氢酶金属蛋白铁铁蛋白锌乙醇脱氢酶钙钙调蛋白锰丙酮酸羧化酶铜细胞色素氧化酶结合蛋白质及其辅基结合蛋白质及其辅基 第41页,讲稿共121张,创作于星期二蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构The Molecular Structure of Protein 第第 二二 节节第42页,讲稿共121张,创作于星期二蛋白质是由许多蛋白质是由许多氨基酸氨基酸单位通过单位通过肽键肽键连接起连接起来的,具有来的,具有特定分子结构特定分子结构的的高分子化合物高分子化合物。构象构象是由
21、于有机分子中是由于有机分子中单键单键的旋转所形成的。的旋转所形成的。蛋白质的构象通常由蛋白质的构象通常由非共价键(次级键)非共价键(次级键)来来维系维系第43页,讲稿共121张,创作于星期二蛋白质的分子结构包括(人为划分)蛋白质的分子结构包括(人为划分)一级结构一级结构(primary structure)(primary structure)二级结构二级结构(secondary structure)(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure
22、)(quaternary structure)高级高级结构结构第44页,讲稿共121张,创作于星期二定义:定义:蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。(包括蛋白质分子中所有的二硫键的位置)包括蛋白质分子中所有的二硫键的位置)二、蛋白质的一级结构二、蛋白质的一级结构主要的维系键:主要的维系键:肽键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,有些蛋白质还包括二硫键。一级结构是蛋白一级结构是蛋白质空间构象和特异生质空间构象和特异生物学功能的基础。物学功能的基础。但但不是决定蛋白质空不是决定蛋白质空间构象的唯一因素间构象的唯一因素第45页,讲稿共121张,创作于星
23、期二三、蛋白质的二级结构三、蛋白质的二级结构蛋蛋白白质质分分子子中中某某一一段段肽肽链链的的局局部部空空间间结结构构,即即该该段段肽肽链链主主链链骨骨架架原原子子的的相相对对空空间间位位置置,并并不不涉涉及及氨氨基基酸酸残残基基侧侧链链的的构构象象。定义定义 主要的维系键主要的维系键:氢键氢键 第46页,讲稿共121张,创作于星期二 由由于于C=OC=O双双键键中中的的电电子子云云与与N N原原子子上上的的未未共共用用电电子子对对发发生生“电电子子共振共振”,使肽键具有,使肽键具有部分双键部分双键的性质,的性质,不能自由旋转不能自由旋转。蛋蛋白白质质立立体体结结构构原原则则第47页,讲稿共12
24、1张,创作于星期二肽肽键键平平面面由由于于肽肽键键具具有有部部分分双双键键的的性性质质,使使参参与与肽肽键键构构成成的的六六个个原原子子被被束束缚缚在在同同一一平平面面上上,这这一平面称为肽键平面或肽单元。一平面称为肽键平面或肽单元。(一)肽单元(一)肽单元第48页,讲稿共121张,创作于星期二l由于由于-碳原碳原子与其他原子之子与其他原子之间均形成间均形成单键单键,因此因此两相邻的两相邻的肽键平面可以肽键平面可以作相对旋转作相对旋转第49页,讲稿共121张,创作于星期二(二)蛋白质二级结构的主要形式二)蛋白质二级结构的主要形式 -螺旋螺旋 (-helix)-helix)-折叠折叠 (-ple
25、ated sheet)-pleated sheet)-转角转角 (-turn)-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)(random coil)第50页,讲稿共121张,创作于星期二1.-螺旋螺旋:-螺旋是螺旋是多肽链的主多肽链的主链原子沿一链原子沿一中心轴盘绕中心轴盘绕所形成的有所形成的有规律的螺旋规律的螺旋构象构象第51页,讲稿共121张,创作于星期二 结构特征:结构特征:为一为一右手螺旋右手螺旋,侧链伸,侧链伸向螺旋向螺旋外侧外侧 螺旋每圈包含螺旋每圈包含3.63.6个氨基个氨基酸残基酸残基,螺距螺距 0.54nm0.54nm;螺旋以螺旋以氢键氢键维系(氨基酸维系(氨基酸
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