核酸的结构与功能医学生物化学上海交通大学医学院.pptx
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1、1第一节第一节 核苷酸核苷酸碱基碱基(bases)(嘌呤、嘧啶(嘌呤、嘧啶)N糖苷键糖苷键核苷核苷戊糖戊糖(pentose)(nucleoside)磷酸酯键磷酸酯键(脱氧核糖(脱氧核糖核糖)核糖)核苷酸核苷酸磷酸磷酸(nucleotide)(phosphate)第1页/共91页2第2页/共91页3一、一、碱基碱基1.碱基碱基是含氮杂环化合物,嘧啶和嘌呤两类是含氮杂环化合物,嘧啶和嘌呤两类腺嘌呤腺嘌呤(A,adenine)嘌呤嘌呤(purine)鸟嘌呤鸟嘌呤(G,guanine)胞嘧啶胞嘧啶(C,cytosine)嘧啶嘧啶(pyrimidine)胸腺嘧啶胸腺嘧啶(T,thymine)尿嘧啶尿嘧啶
2、(U,uracil)第3页/共91页4第4页/共91页5嘌呤嘌呤嘧啶嘧啶DNAAGCTRNAAGCU*核酸分子中含有稀有碱基核酸分子中含有稀有碱基(rarebases)第5页/共91页62.碱基可随碱基可随PH变化变化出现酮式,烯醇式互变。出现酮式,烯醇式互变。第6页/共91页73.嘧啶和嘌呤碱基均具有共轭双键,对波长为嘧啶和嘌呤碱基均具有共轭双键,对波长为260nm左右的紫外光有较强吸收左右的紫外光有较强吸收图图3-4第7页/共91页84.4.碱基的亚氨基中氢能与具有较大电负性碱基的亚氨基中氢能与具有较大电负性N 和羰基氧和羰基氧=O形成氢键形成氢键第8页/共91页9二二、戊糖戊糖*核酸中有
3、两种戊糖核酸中有两种戊糖DNA为为D-2-脱氧核糖脱氧核糖(D-2-deoxyribose)RNA为为D-核糖核糖(D-ribose)第9页/共91页101191三、核苷三、核苷 1.1.核苷是戊糖与碱基之间以糖苷键核苷是戊糖与碱基之间以糖苷键(glycosidicbond)相连接而成,称为相连接而成,称为N-N-糖苷键糖苷键第10页/共91页11表表3-1各种常见的核苷各种常见的核苷第11页/共91页12图图3-7稀有碱基与假尿苷稀有碱基与假尿苷2.RNA2.RNA中含有稀有碱基,还存在异构化的核苷中含有稀有碱基,还存在异构化的核苷 假尿苷(假尿苷()1115第12页/共91页13四、核苷酸
4、四、核苷酸 5第13页/共91页14第14页/共91页154.环核苷酸:环腺苷酸环核苷酸:环腺苷酸(cyclicAMP,cAMP)和环鸟苷酸和环鸟苷酸(cyclicGMPcGMP)第15页/共91页165.单核苷酸的生理作用单核苷酸的生理作用1)1)核酸的核酸的构件分子构件分子2)2)参与物质代谢参与物质代谢(UTP(UTP、CTP)CTP)、能量代谢、能量代谢(ATP)(ATP)3)3)作为第二信使作为第二信使(cAMP)(cAMP),在信号传递过程中起,在信号传递过程中起 重要作用重要作用,参与代谢调节参与代谢调节4)4)参与某些生物活性物质的组成参与某些生物活性物质的组成 (NAD(NA
5、D+、NADPNADP+)第16页/共91页17第二节第二节核酸的分子结构核酸的分子结构*核酸的核酸的构件分子构件分子是是核苷酸核苷酸组成组成RNA的核苷酸是核糖核苷酸的核苷酸是核糖核苷酸主要有四种主要有四种AMP、CMP、GMP、UMP组成组成DNA的核苷酸是的核苷酸是脱氧核糖核苷酸脱氧核糖核苷酸主要有四种主要有四种dAMP、dCMP、dGMP、dTMP*核酸中核苷酸以核酸中核苷酸以3,5磷酸二酯键磷酸二酯键相连相连第17页/共91页18一、核酸的一级结构一、核酸的一级结构1.概念:概念:核酸的一级结构是指其多核苷酸中的碱基核酸的一级结构是指其多核苷酸中的碱基的排列顺序的排列顺序*DNA的一
6、级结构是指的一级结构是指DNA中脱氧核糖中脱氧核糖核苷酸的排列顺序。核苷酸的排列顺序。*RNA的一级结构是指的一级结构是指RNA中核糖核苷中核糖核苷酸的排列顺序。酸的排列顺序。第18页/共91页195端端3端端3,5磷酸二酯键磷酸二酯键(a)第19页/共91页20P图图3-10DNA的分子书写方式的分子书写方式(a)分子结构式分子结构式(b)线条式线条式(c)字母式)字母式第20页/共91页212.书写方式书写方式*简写形式简写形式5-AGGCU-3(5末端含磷酸,末端含磷酸,3末端含羟基)末端含羟基)3.多核苷酸多核苷酸(polynucleotide)寡核苷酸寡核苷酸(oligonucleo
7、tide)第21页/共91页22二、二、DNADNA的空间结构的空间结构 1.DNA1.DNA的二级结构的二级结构 1 1)DNADNA双螺旋结构研究背景双螺旋结构研究背景 (double helix structuredouble helix structure)第22页/共91页23 Chargaff的碱基分析的碱基分析 不同种生物不同种生物DNADNA分子中的碱基组成不同分子中的碱基组成不同 同一生物不同组织其同一生物不同组织其DNADNA分子的分子的碱基组碱基组成相成相同同 某一特定生物其某一特定生物其DNADNA碱基组成是固定的碱基组成是固定的 任何生物任何生物DNADNA碱基组成都
8、符合碱基组成都符合 ChargaffChargaff 定律定律 A=TA=T,G=C G=C 即即 A+G=T+CA+G=T+C DNA纤维晶体的纤维晶体的x-衍射研究衍射研究显示显示DNADNA是双链是双链 的螺旋形分子的螺旋形分子第23页/共91页243355第24页/共91页252 2)DNADNA双螺旋(双螺旋(B B型)结构特点型)结构特点由两条由两条DNADNA互补链互补链反向平行反向平行。右手螺旋,直径为右手螺旋,直径为2nm2nm。DNADNA双螺旋亲水骨架是双螺旋亲水骨架是脱氧核糖和磷酸脱氧核糖和磷酸,在螺旋分子的在螺旋分子的外侧外侧,而疏水,而疏水碱基碱基对在对在 螺旋分子
9、螺旋分子内部。内部。第25页/共91页26 碱基对之间的碱基对之间的 距离为距离为0.34nm0.34nm,并有一个,并有一个 3636 的夹角,的夹角,每一螺旋内含每一螺旋内含1010个个 碱基对碱基对,螺距为螺距为3.4nm.3.4nm.螺旋表面有螺旋表面有大沟大沟 (major groove)(major groove)和和小沟小沟 (minor groove)(minor groove).是是DNADNA与蛋白质结合的部位与蛋白质结合的部位第26页/共91页27 DNA DNA双螺旋通过中的碱基氢键配对生成。双螺旋通过中的碱基氢键配对生成。A A与与T T 配对,形成配对,形成二二个氢
10、键。个氢键。G G与与C C 配对,形成配对,形成三三个氢键。个氢键。第27页/共91页28 3 3)维持)维持DNADNA二级结构稳定性的因素二级结构稳定性的因素 碱基对间的氢键碱基对间的氢键 碱基的堆积力碱基的堆积力(stacking forcestacking force)相邻碱基对相距相邻碱基对相距0.34nm0.34nm存在存在 Van der waalsVan der waals力。力。碱基对的疏水性使之在水溶液中相互碱基对的疏水性使之在水溶液中相互 间聚集而形成疏水键。间聚集而形成疏水键。第28页/共91页29 DNA DNA链上存在大量的磷酸基团链上存在大量的磷酸基团,带负电荷
11、,带负电荷,能使两条互补链分开,在生理条件下,双能使两条互补链分开,在生理条件下,双 螺旋表面存在着可中和磷酸基团的碱性蛋螺旋表面存在着可中和磷酸基团的碱性蛋 白质和带正电荷的白质和带正电荷的NaNa+,降低静电斥力。降低静电斥力。第29页/共91页304)DNA双螺旋的种类:双螺旋的种类:DNA构象与核苷酸顺序、碱基组成有构象与核苷酸顺序、碱基组成有关,并取决于环境条件(盐类、相对关,并取决于环境条件(盐类、相对湿度)湿度)生理条件下,右手生理条件下,右手DNA双螺旋大多以双螺旋大多以 B型形式存在型形式存在,还有还有A型、型、C型、型、D型、型、E型型第30页/共91页31第31页/共91
12、页32第32页/共91页33左手双螺旋左手双螺旋DNA Z-DNA发现发现:1979年,年,Rich等人工合成六聚体等人工合成六聚体d(CGCGCG)单晶进行)单晶进行X射线衍射射线衍射分析,数据表明主链的走向呈分析,数据表明主链的走向呈“之之”字型,字型,左手双螺旋左手双螺旋DNA第33页/共91页34ZDNA的结构特点的结构特点:a.每个螺旋由每个螺旋由12个碱基对个碱基对构成,螺距构成,螺距4.46nm直径直径1.8nmb.碱基组成特殊,为嘌呤和嘧啶交替碱基组成特殊,为嘌呤和嘧啶交替排列,如排列,如CGCGCG主链呈锯齿状主链呈锯齿状(Zig-Zag)走向。)走向。c.只有一条只有一条沟
13、沟d.体内体内ZDNA的存在的存在ZDNA的功能:与基因转录调节有关的功能:与基因转录调节有关第34页/共91页35(4)三股螺旋)三股螺旋DNA概念:概念:三股螺旋三股螺旋DNA中通常是一条同型寡核苷酸中通常是一条同型寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸与寡嘧啶核苷酸-寡嘌呤核苷酸双螺旋的大寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟结合,三股螺旋中的第三股可以来自分沟结合,三股螺旋中的第三股可以来自分子间,也可以来自分子内。子间,也可以来自分子内。三股螺旋三股螺旋DNA存在于基因调控区和其他存在于基因调控区和其他重要区域,具有重要生理意义。重要区域,具有重要生理意义。第35页/共91页36图3-14三股螺旋三股螺旋DNA嘧
14、啶核苷酸嘧啶核苷酸嘌呤核苷酸嘌呤核苷酸第36页/共91页372.DNA2.DNA的三级结构的三级结构超螺旋结构超螺旋结构1)DNA三级结构是指三级结构是指DNA链进一步扭曲盘链进一步扭曲盘 旋形成超螺旋结构旋形成超螺旋结构 2 2)大多数原核生物和病毒的基因组大多数原核生物和病毒的基因组DNADNA以双以双 链环状链环状DNADNA形式存在。真核细胞中的线粒形式存在。真核细胞中的线粒 体体DNADNA、叶绿体、叶绿体DNADNA都是环状的都是环状的 第37页/共91页38 3)超螺旋可分超螺旋可分正超螺旋和负超螺旋。几乎正超螺旋和负超螺旋。几乎所有天然所有天然DNADNA中都存在负超螺旋结构中
15、都存在负超螺旋结构图图3-15原核生物原核生物DNA超螺旋超螺旋第38页/共91页393.DNA3.DNA的四级结构的四级结构DNADNA与蛋白质形成复合物与蛋白质形成复合物 1 1)真核生物基因组)真核生物基因组DNADNA折叠第一层是核小体,折叠第一层是核小体,图图3-16核小体结构核小体结构第39页/共91页40 *核小体的结构核小体的结构 a.a.由由146bp146bp长的双链长的双链DNADNA绕组蛋白八聚体绕组蛋白八聚体 核心核心(H(H2A2A,H,H2B2B,H,H3 3,H,H4 4)2 2 1.75 1.75 圈组成圈组成 核心颗粒。核心颗粒。b.b.各核心颗粒间有一个连
16、接区,由各核心颗粒间有一个连接区,由60bp60bp 的的DNADNA和和1 1个分子组蛋白个分子组蛋白H H1 1构成。构成。第40页/共91页41图图3-17真核生物染色体真核生物染色体DNA组装不同层次的结构组装不同层次的结构2 2)核小体又进一步盘绕折叠,最后形成染色体)核小体又进一步盘绕折叠,最后形成染色体第41页/共91页42 三、三、基因和基因组基因和基因组1.1.基因(基因(genegene)基因的现代分子生物学概念是指能编码有基因的现代分子生物学概念是指能编码有 功能的蛋白质多肽链或合成功能的蛋白质多肽链或合成RNARNA所必需的所必需的 全部核酸序列,是核酸分子的功能单位。
17、全部核酸序列,是核酸分子的功能单位。第42页/共91页43图图3-18真核生物基因结构示意真核生物基因结构示意第43页/共91页442.基因组(基因组(genome)基因组是指一个细胞或病毒所有基因及间隔基因组是指一个细胞或病毒所有基因及间隔序列,储存了一个物种所有的遗传信息。序列,储存了一个物种所有的遗传信息。第44页/共91页45病毒基因组病毒基因组病毒病毒DNA的大小差别很大的大小差别很大每种病毒只有一种核酸,每种病毒只有一种核酸,DNA或或RNA组成组成肝炎病毒(肝炎病毒(hepatitisvirus):甲肝病毒(甲肝病毒(HAV)RNA病毒病毒乙肝病毒乙肝病毒(HBV)DNA病毒病毒
18、丙肝病毒(丙肝病毒(HCV)RNA病毒病毒丁肝病毒丁肝病毒(HDV)RNA病毒病毒戊肝病毒戊肝病毒(HEV)RNA病毒病毒第45页/共91页46病毒基因组最病毒基因组最 大的特点是出大的特点是出 现重叠基因现重叠基因第46页/共91页47原核生物基因组原核生物基因组原核生物基因组多为环状双链原核生物基因组多为环状双链DNA原核生物基因组原核生物基因组大部分为结构基因,编码大部分为结构基因,编码 生存所必需的蛋白质和生存所必需的蛋白质和RNA各种生物的的基因数目与各种生物的的基因数目与DNA量的比较量的比较大肠杆菌大肠杆菌基因数基因数2350DNA分子大小分子大小4.2106编码序列编码序列占基
19、因组占基因组%98以上5酵母酵母果蝇果蝇610087501.31071.4108人人30000-350003.2109270第47页/共91页48原核生物基因组最大的特点是具有操纵子原核生物基因组最大的特点是具有操纵子 (operon)结构结构大肠埃希菌乳糖操纵子大肠埃希菌乳糖操纵子第48页/共91页49 真核生物基因组真核生物基因组基因组比原核生物大得多基因组比原核生物大得多 真核生物中进化的复杂程度与真核生物中进化的复杂程度与DNADNA含量并含量并 不完全一致不完全一致 存在大量非编码的间隔序列,基因序列存在大量非编码的间隔序列,基因序列 占整个基因组占整个基因组1010不到不到 第49
20、页/共91页50真核生物基因组的最大的特点是出现分真核生物基因组的最大的特点是出现分 隔开的基因隔开的基因 外显子外显子(exon)(exon):编码氨基酸序列的:编码氨基酸序列的DNADNA片段片段 内含子内含子(intronintron):不编码氨基酸序列的:不编码氨基酸序列的 DNADNA插入片段插入片段外显子外显子1外显子外显子2外显子外显子3第50页/共91页51真核生物基因组中存在单拷贝序列真核生物基因组中存在单拷贝序列 和低度重复序列、中度重复序列和和低度重复序列、中度重复序列和 高度重复序列高度重复序列 第51页/共91页52四、各类四、各类RNARNA的结构的结构 RNARN
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