原核生物的转录及调控幻灯片.ppt
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1、原核生物的转录及调控第1页,共67页,编辑于2022年,星期五转录:转录:在在DNADNA指导的指导的RNARNA聚合酶催化下,以聚合酶催化下,以DNADNA链的一链的一条链为模板,按照碱基配对原则合成条链为模板,按照碱基配对原则合成RNARNA链的过程链的过程。不对称转录不对称转录:在:在DNADNA双链分子中,转录通常只在双链分子中,转录通常只在DNADNA的的一条链上进行,另一条链则不能转录,但可能对转录一条链上进行,另一条链则不能转录,但可能对转录起调节作用,这种转录方式称不对称转录。起调节作用,这种转录方式称不对称转录。转录单位转录单位:就是从启动子到终止子的一段:就是从启动子到终止
2、子的一段DNADNA序列。序列。第一节第一节 转录概述转录概述第2页,共67页,编辑于2022年,星期五一、基因的编码链和有意义链一、基因的编码链和有意义链模板链:模板链:用于转录用于转录RNARNA的链称为模板链,或负的链称为模板链,或负()链,又称无义链。()链,又称无义链。编码链编码链:与模板链互补的:与模板链互补的DNADNA链称为编码链,链称为编码链,或正()链,又称有义链。或正()链,又称有义链。第3页,共67页,编辑于2022年,星期五二、转录的基本要点二、转录的基本要点底物:底物:NTP;模板:反义链;模板:反义链;方向:方向:53;酶:酶:RNA pol;产物:产物:RNA单
3、链单链第4页,共67页,编辑于2022年,星期五转录和复制:转录和复制:都是遗传信息的传递都是遗传信息的传递第5页,共67页,编辑于2022年,星期五三、转录起始位点三、转录起始位点转录起点位点核苷酸为转录起点位点核苷酸为1 1。上游序列上游序列upstreamupstream :转录起点的前面的序列:转录起点的前面的序列,用负用负数码()表示,数码()表示,起点前一个核苷酸为起点前一个核苷酸为1 1。下游序列下游序列downstreamdownstream:转录起点的后面的序列转录起点的后面的序列,用正用正数码()表示。数码()表示。没有编号为没有编号为的碱基。的碱基。第6页,共67页,编辑
4、于2022年,星期五第7页,共67页,编辑于2022年,星期五第二节第二节 原核生物转录的相关酶类原核生物转录的相关酶类一、一、E.coli RNA聚合酶聚合酶E.coli只有一种聚合酶;只有一种聚合酶;E.coli RNA pol全酶全酶由由5种亚基组成,即种亚基组成,即2,480kD;2 构成核心酶构成核心酶,核心酶与核心酶与因子构成全酶因子构成全酶。第8页,共67页,编辑于2022年,星期五E.coli RNA聚合酶的基本性质聚合酶的基本性质第9页,共67页,编辑于2022年,星期五RNA polymerase in prok.Core EnzymeHolo Enzyme for elo
5、ngationfor initiation依靠静电作用力依靠静电作用力依靠空间结构依靠空间结构非专一性与非特异非专一性与非特异DNA 结合结合专一性与专一性与 特异特异DNA结合结合半衰期;半衰期;60半衰期;数小时半衰期;数小时cover60bp 第10页,共67页,编辑于2022年,星期五Richard Burgess and Andrew Travers(1969)150 kD160 kD 70 kD 40 kDCartoon illustrating separation of the subunits of E.coli RNA polymerase by SDS-PAGE第11页,
6、共67页,编辑于2022年,星期五1、核心酶:催化磷酸二酯键的形成、核心酶:催化磷酸二酯键的形成亚基亚基:2个,功能多样(核心酶的组建因子、促进双个,功能多样(核心酶的组建因子、促进双链的解开和重新聚合、启动子识别、促进链的解开和重新聚合、启动子识别、促进RNA pol与与DNA 模板链上游转录因子结合)模板链上游转录因子结合)亚基亚基:1个,结合核苷酸底物,催化磷酸二酯键的形个,结合核苷酸底物,催化磷酸二酯键的形成;成;亚基亚基:碱性强,与模板链结合;:碱性强,与模板链结合;二、二、RNA聚合酶各亚基的功能聚合酶各亚基的功能第12页,共67页,编辑于2022年,星期五2、因子因子:Reusa
7、ble;修饰修饰 RNA pol 的构型;的构型;识别启动子,但无催化活性。识别启动子,但无催化活性。不同原核生物具有不同原核生物具有基本相同的核心酶基本相同的核心酶,但,但亚基有所亚基有所差别差别,决定了原核生物基因的选择性表达。,决定了原核生物基因的选择性表达。第13页,共67页,编辑于2022年,星期五3、原核生物、原核生物RNA聚合酶抑制剂聚合酶抑制剂:利福平(利福平(Rifampin):与细菌:与细菌RNA pol 亚亚基结合,阻碍转录的基结合,阻碍转录的起始起始作用;作用;利链菌素利链菌素(streptolydigin):与细菌与细菌RNA pol 亚基结合,抑制转录的亚基结合,抑
8、制转录的延伸延伸。肝素肝素:与细菌:与细菌RNA pol 亚基结合,阻碍亚基结合,阻碍其与其与模板模板DNA的结合的结合。第14页,共67页,编辑于2022年,星期五第三节第三节 原核生物转录的过程原核生物转录的过程RNA的转录包括的转录包括promotion,elongation,termination 三过程;三过程;从从promoter到到terminator称为称为transcriptional unit;原核生物中的转录单位多为原核生物中的转录单位多为 polycistron;转录起始点记为转录起始点记为+1,其上游记为,其上游记为负值负值,下游记为,下游记为正值正值。+1-10+1
9、0upstreamstart pointdownstream第15页,共67页,编辑于2022年,星期五一、转录的起始一、转录的起始关键:全酶能以关键:全酶能以很高的亲和性很高的亲和性结合在结合在启动子启动子promoter;启动子启动子:RNA聚合酶识别、结合并起始转聚合酶识别、结合并起始转录的一段录的一段DNA序列。序列。第16页,共67页,编辑于2022年,星期五promoter 由两个重要部分组成由两个重要部分组成(一)原核启动子的结构(一)原核启动子的结构第17页,共67页,编辑于2022年,星期五-70 -40:up element(上游元件)上游元件)CAP-cAMP bindi
10、ng site -35 -10:core promoter(核心启动子)核心启动子)RNA pol.binding site基因表达调控的正控制位点基因表达调控的正控制位点CAP:Catabolite gene Activator ProteincAMP Acceptor Protein(cAMP受体蛋白受体蛋白)(分解代谢基因激活蛋白分解代谢基因激活蛋白)第18页,共67页,编辑于2022年,星期五 1、核心启动子:核心启动子:Sextama Box:(R site)TTGAC(Sextama Box)-35 site。RNA pol.loosely binding sitePribnow
11、Box:TATAAT(pribnow Box)-10 site。RNA pol.firmly binding site(B site)Initiation site:+1 site。RNA transcriptional startpoint(I site)A/G-35(R)-10(B)+1(I)RNA第19页,共67页,编辑于2022年,星期五lSextama Box与与Pribnow Box间距间距17bp,有利于有利于RNA pol启动启动l-35 Box or-10 Box mut.间距间距趋近趋近于于17 bp,up mutation间距间距远离远离于于17 bp,down muta
12、tion17bp的的间距间距比比17bp的的序列序列对转录更为重要对转录更为重要-35 Box and-10 Box mut.转录效率下降转录效率下降100倍倍 转录效率下降转录效率下降1000倍倍第20页,共67页,编辑于2022年,星期五2、上游元件:上游元件:CAP-cAMP binding site(Activator region,AR)当:当:ARI+CAP-cAMP AR I:CAP-cAMP 的强结合位点(的强结合位点(-70 -50)AR II:CAP-cAMP 的弱结合位点(的弱结合位点(-50 -40)cooperative effect提高提高ARII 的结合效率的结合
13、效率IR-70 ARI-40ARII IR-50第21页,共67页,编辑于2022年,星期五 RNA pol AR II+CAP-cAMP 复合体:复合体:促使促使-35 box附近附近GC岛区的双螺旋结构稳定性降低,岛区的双螺旋结构稳定性降低,-10 box的解链温度降低,有利于转录启动的解链温度降低,有利于转录启动ARI ARII GC Island -35 -10 Null AR II RNA pol.into-10 Box but transcription off ARII+CAP-cAMPpromotionRNA pol.into-35 Boxinto-10 Boxstarting
14、 transcription RNA pol RNA pol第22页,共67页,编辑于2022年,星期五-CTDCAP-cAMPARI ARIIARI ARIIActivation transcription Up element+CAP-cAMP RNA PolymeraseRNA Polymerase复合体复合体 CAP-cAMP CAP-cAMP 与与RNA PolymeraseRNA Polymerase的的-CTD结合,激活转录结合,激活转录 第23页,共67页,编辑于2022年,星期五(二)(二)原核基因转录的起始原核基因转录的起始1、因子的作用:因子的作用:降低降低全酶与一般全酶
15、与一般DNA的的非专一性非专一性结合力(结合力(20000倍倍););增强增强全酶与启动子全酶与启动子R site、B site的的专一性专一性结合力结合力(100倍倍););导致导致RNA链的延伸缓慢链的延伸缓慢第24页,共67页,编辑于2022年,星期五Promoter与与 factor 间的结合专效性间的结合专效性决定了决定了 strong promoter&weak promoter;-35 box,-10 box的差异影响启动子与的差异影响启动子与RNA pol 中中因因子的子的结合能力结合能力;不同启动子的不同启动子的-35,-10 box间存在较为间存在较为保守的标准保守的标准序
16、列(标准启动子)序列(标准启动子);factor is responsible for recognition of consensus sequence of promoter and only required for initiation.第25页,共67页,编辑于2022年,星期五2、RNA pol与启动子的结合与启动子的结合因子识别启动子上结合位点。因子识别启动子上结合位点。RNA pol全酶与全酶与-35 box结合结合封闭型启动复合物封闭型启动复合物;酶向酶向-10 box移动,并与之牢固结合,促使移动,并与之牢固结合,促使-10 box及起始位点处发生局部解链及起始位点处发生局
17、部解链开放型启动复合物开放型启动复合物;DNA解螺旋扩展到解螺旋扩展到-10 box下游下游17bp范围。范围。第26页,共67页,编辑于2022年,星期五3、转录起始位点的决定、转录起始位点的决定酶与酶与-10 box 的结合,决定了第一个起始碱基的结合,决定了第一个起始碱基的选择。的选择。第一个被转录的碱基离第一个被转录的碱基离-10 box 的保守的保守T约约69nts。mRNA的起始位点多为的起始位点多为G,其次为其次为A,很少为很少为U,起始点核苷酸的两侧分别为起始点核苷酸的两侧分别为C 和和T。第27页,共67页,编辑于2022年,星期五4、三元复合物的形成和、三元复合物的形成和因
18、子的解离因子的解离RNA合成一开始,就形成合成一开始,就形成模板模板-RNA pol-RNA的的三元复合物三元复合物。因子解离,核心酶与模板的亲和性下降到非特因子解离,核心酶与模板的亲和性下降到非特异性结合的水平,异性结合的水平,RNA pol在在DNA链上变得容易链上变得容易移动,为链的延伸创造了条件;移动,为链的延伸创造了条件;游离的游离的因子可以重新进行功能循环。因子可以重新进行功能循环。第28页,共67页,编辑于2022年,星期五转录的起始转录的起始核心酶在核心酶在因子帮助下特异性结合到因子帮助下特异性结合到DNA上;上;RNA pol与启动子与启动子-35 box 结合,形成结合,形
19、成封闭型起始复合封闭型起始复合物物;酶滑动到酶滑动到-10 box,转变成为转变成为开放型起始复合物开放型起始复合物,启动,启动子活化,双链解开,模板链暴露,插入最初的子活化,双链解开,模板链暴露,插入最初的2个个核苷酸;核苷酸;酶继续加上开头的几个酶继续加上开头的几个NTP,形成形成三元起始复合物三元起始复合物,在在RNA链合成了链合成了89个碱基后,个碱基后,因子解离,转录开因子解离,转录开始。始。第29页,共67页,编辑于2022年,星期五Model of the interaction between E.coil RNA polymerase holoenzyme and a pro
20、moterDNAIncorporating the first few Nt第30页,共67页,编辑于2022年,星期五二、原核生物转录的延伸二、原核生物转录的延伸RNA pol沿着模板链移动,沿着模板链移动,RNA链不断延伸,并链不断延伸,并保持三元复合物的结构;保持三元复合物的结构;转录泡中的转录泡中的DNA螺旋前开、后合,螺旋前开、后合,RNA延长,不延长,不断脱离断脱离DNA;RNA链的延伸速度不是恒定的,在模板富含链的延伸速度不是恒定的,在模板富含GC的区的区域,转录就会减慢域,转录就会减慢/停顿。停顿。第31页,共67页,编辑于2022年,星期五17bp螺旋解开长度螺旋解开长度12
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- 关 键 词:
- 生物 转录 调控 幻灯片
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