蛋白质分子化学修饰PPT课件.ppt
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1、关于蛋白质分子的化学修饰第一张,PPT共八十八页,创作于2022年6月第一节第一节 酶的活性中心酶的活性中心第二节第二节 酶化学修饰的目的酶化学修饰的目的第三节第三节 酶化学修饰的原理酶化学修饰的原理第四节第四节 酶化学修饰的设计酶化学修饰的设计第五节第五节 酶化学修饰的应用酶化学修饰的应用第六节第六节 酶的蛋白质工程酶的蛋白质工程第二张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 第一节第一节 酶的活性中心(酶的活性中心(active siteactive site)一、活性中心的概念一、活性中心的概念vv酶的必需基团酶的必需基团酶的必需基团酶的必需基团(essential group):(es
2、sential group):(essential group):(essential group):与酶活性有关的基团与酶活性有关的基团与酶活性有关的基团与酶活性有关的基团vv酶的活性中心酶的活性中心酶的活性中心酶的活性中心(active center):(active center):(active center):(active center):由必需基团构成的与酶催化活性有关的特定区域由必需基团构成的与酶催化活性有关的特定区域由必需基团构成的与酶催化活性有关的特定区域由必需基团构成的与酶催化活性有关的特定区域.第三张,PPT共八十八页,创作于2022年6月酶酶分分子子非必需基团非必需基
3、团必需基团必需基团活性中心活性中心必需基团必需基团活性中心外活性中心外必需基团必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团非活性中心非活性中心活活性性中中心心第四张,PPT共八十八页,创作于2022年6月活性中心的重要化学基团活性中心的重要化学基团 7 7种氨基酸出现的频率最高种氨基酸出现的频率最高 Lys Asp Glu Cys His Tyr SerLys Asp Glu Cys His Tyr Ser 某些功能基团某些功能基团,如(氨基、羧基、巯基、羟基如(氨基、羧基、巯基、羟基 和咪唑基)是酶的必需基团。和咪唑基)是酶的必需基团。赖氨酸的氨基赖氨酸的氨基 天冬氨酸和谷氨酸的羧基天冬氨酸和谷
4、氨酸的羧基 半胱氨酸的巯基半胱氨酸的巯基 组氨酸的咪唑基组氨酸的咪唑基 酪氨酸和丝氨酸的羟基酪氨酸和丝氨酸的羟基第五张,PPT共八十八页,创作于2022年6月OH第六张,PPT共八十八页,创作于2022年6月第七张,PPT共八十八页,创作于2022年6月活性部位只占酶分子很小的一部分活性部位只占酶分子很小的一部分第八张,PPT共八十八页,创作于2022年6月胰凝乳蛋白酶 第九张,PPT共八十八页,创作于2022年6月活性部位是一个三维实体活性部位是一个三维实体第十张,PPT共八十八页,创作于2022年6月二、活性中心的共性二、活性中心的共性(1)(1)活性部位只占酶分子很小的一部分(活性部位只
5、占酶分子很小的一部分(1-2%1-2%)。)。(2)(2)活性部位是一个三维实体。活性部位是一个三维实体。(3)(3)活性中心位于酶分子表面的疏水性裂缝中。活性中心位于酶分子表面的疏水性裂缝中。(4)(4)活性中心构象不是固定不变的(诱导契合)。活性中心构象不是固定不变的(诱导契合)。(5)(5)酶与底物通过盐键、氢键、范德华力和疏水作用等次酶与底物通过盐键、氢键、范德华力和疏水作用等次级键结合。级键结合。第十一张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 酶的稳定性酶的稳定性 1.1.酶稳定的分子原因酶稳定的分子原因 1 1)共价键:)共价键:肽键(肽键(peptide bondpeptide
6、 bond)稳定蛋白质和酶主链的核心力量。稳定蛋白质和酶主链的核心力量。二硫键(二硫键(disulfide bonddisulfide bond)由两个由两个CysCys的侧链的侧链-SH-SH氧化而成,是某些蛋白氧化而成,是某些蛋白质维持结构稳定性的主要因素。质维持结构稳定性的主要因素。第十二张,PPT共八十八页,创作于2022年6月2 2)非共价键:)非共价键:疏水相互作用(疏水相互作用(hydrophobic interactionhydrophobic interaction):是维持蛋白质分子稳定的主要的作用力。是维持蛋白质分子稳定的主要的作用力。氢键(氢键(hydrogen bon
7、dhydrogen bond):):是稳定蛋白质分子的空间结构,特别是二级结构的重要是稳定蛋白质分子的空间结构,特别是二级结构的重要力量。力量。第十三张,PPT共八十八页,创作于2022年6月静电相互作用(静电相互作用(electrostatic interactionelectrostatic interaction):):又称离子键、盐键、盐桥,是正负电荷间的作用力。又称离子键、盐键、盐桥,是正负电荷间的作用力。对酶分子稳定性有关的盐键大部分形成于分子表面上。对酶分子稳定性有关的盐键大部分形成于分子表面上。范德华力:范德华力:在电中性分子之间的非共价结合。分子间形成的范德华在电中性分子之间
8、的非共价结合。分子间形成的范德华力越大越稳定。力越大越稳定。金属离子:金属离子:Ca2+Ca2+、MgMg2+2+和和ZnZn2+2+等高价阳离子与多肽链不稳定的弯等高价阳离子与多肽链不稳定的弯曲部分结合,可显著增加酶分子的稳定性。曲部分结合,可显著增加酶分子的稳定性。第十四张,PPT共八十八页,创作于2022年6月途径方法优点不足酶分子改造核酸水平蛋白质工程从根本上提高酶分子稳定性操作复杂,周期长蛋白质水平化学修饰适应所有酶,操作简单经济修饰过程破坏酶分子剂型固定化适应所有酶,稳定性高,可重复利用和连续生产载量较低,易失活交联酶晶体稳定性好,载量高,催化效率高成本高微环境改良稳定剂简单、经济
9、工作量大反应介质适用于特殊反应体系和酶类适合的酶类还不普遍2.稳定酶的方法稳定酶的方法第十五张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 三、研究酶活性中心的方法三、研究酶活性中心的方法 1.1.物理学方法:物理学方法:用用X X射线衍射法直接检测底物或其类射线衍射法直接检测底物或其类似物与酶形成的中间复合物(包括酶和似物与酶形成的中间复合物(包括酶和底物)的相对位置。底物)的相对位置。第十六张,PPT共八十八页,创作于2022年6月2.2.化学修饰法:化学修饰法:根据所用修饰试剂不同,分为根据所用修饰试剂不同,分为 1)1)非专一性化学修饰非专一性化学修饰 用非专一性的修饰试剂与氨基酸侧链基团
10、作用。用非专一性的修饰试剂与氨基酸侧链基团作用。若某基团被修饰后:若某基团被修饰后:酶活性不变酶活性不变该基团可能不是酶的必需基团该基团可能不是酶的必需基团酶活性降低或丧失酶活性降低或丧失该基团可能是酶的必需基团该基团可能是酶的必需基团但不能确定化学试剂是同活性中心内的必需基团结合。但不能确定化学试剂是同活性中心内的必需基团结合。第十七张,PPT共八十八页,创作于2022年6月活性中心基团的鉴定标准活性中心基团的鉴定标准 失活程度与修饰剂浓度成一定比例关系。失活程度与修饰剂浓度成一定比例关系。S S或可逆抑制剂有保护作用(活性中心)。或可逆抑制剂有保护作用(活性中心)。先加先加S S或竞或竞
11、加共价修饰剂加共价修饰剂 透析除去透析除去S S或竞或竞 活性不丧失活性不丧失第十八张,PPT共八十八页,创作于2022年6月差别标记:差别标记:底物或抑制剂存在底物或抑制剂存在 活性基团不与修饰剂作用活性基团不与修饰剂作用 去除底物或抑制剂去除底物或抑制剂 原来被保护的基团带同位素标记原来被保护的基团带同位素标记 可直接得到蛋白质发挥功能作用的必需基团。可直接得到蛋白质发挥功能作用的必需基团。化学修饰化学修饰含同位素标记含同位素标记 的同样试剂的同样试剂第十九张,PPT共八十八页,创作于2022年6月2)2)专一性化学修饰(基团专一性修饰)专一性化学修饰(基团专一性修饰)用专一性化学修饰剂修
12、饰酶活性中心的某一氨基酸残用专一性化学修饰剂修饰酶活性中心的某一氨基酸残基的侧链基团。基的侧链基团。3)3)亲和标记(位点专一性修饰)亲和标记(位点专一性修饰)采用的修饰试剂是根据底物的化学结构设计合成采用的修饰试剂是根据底物的化学结构设计合成的含有活泼反应基团的底物类似物。的含有活泼反应基团的底物类似物。作用机制:利用酶对底物的特殊亲和力将酶加以修饰作用机制:利用酶对底物的特殊亲和力将酶加以修饰标记。标记。第二十张,PPT共八十八页,创作于2022年6月化学修饰的专一性化学修饰的专一性第二十一张,PPT共八十八页,创作于2022年6月亲和修饰剂:亲和修饰剂:与与S S结构相似结构相似,与活性
13、中心的氨基酸残基,与活性中心的氨基酸残基 亲和力大,而与活性中心以外的氨基酸亲和力大,而与活性中心以外的氨基酸 残基亲和力小。残基亲和力小。具有活泼的化学基团具有活泼的化学基团(如卤素)可与活性(如卤素)可与活性 中心的基团形成稳定的共价键。中心的基团形成稳定的共价键。第二十二张,PPT共八十八页,创作于2022年6月3.3.蛋白质工程:蛋白质工程:将酶相应的将酶相应的cDNAcDNA定点突变,突变的定点突变,突变的cDNAcDNA只表达一个或几个氨基酸被置换的酶只表达一个或几个氨基酸被置换的酶蛋白,测定其活性可知被置换的氨基酸是蛋白,测定其活性可知被置换的氨基酸是否为活力所必需。否为活力所必
14、需。第二十三张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 第二节第二节 酶化学修饰及修饰目的酶化学修饰及修饰目的 一、酶化学修饰一、酶化学修饰 1.1.限制酶大规模应用的原因:限制酶大规模应用的原因:第二十四张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 酶作为生物催化剂,其高效性和专一性是其他催化剂所无法比酶作为生物催化剂,其高效性和专一性是其他催化剂所无法比拟的。因此,日益增多的酶制剂已用于食品发酵、疾病诊治和预防、拟的。因此,日益增多的酶制剂已用于食品发酵、疾病诊治和预防、环境保护和监测、化工产品的生产,以及基因工程等生物技术领域。环境保护和监测、化工产品的生产,以及基因工程等生物技术领域。但
15、是但是酶在实际应用中有酶在实际应用中有局限性局限性:1 1、作为异体蛋白在体内作为异体蛋白在体内难于吸收难于吸收、易引起、易引起免疫反应免疫反应和和被识别降解被识别降解(具有抗原性具有抗原性);2 2、酶蛋白经不起温度、酸碱、有机溶剂及时间的考验,酶蛋白经不起温度、酸碱、有机溶剂及时间的考验,半衰期短、半衰期短、易变性失活易变性失活(细胞外稳定性差细胞外稳定性差);3 3、酶的活性、作用专一性和最适条件酶的活性、作用专一性和最适条件不一定能适应生产工艺要不一定能适应生产工艺要求,求,限制了酶制剂的应用范围限制了酶制剂的应用范围(酶活性不够高酶活性不够高)。第二十五张,PPT共八十八页,创作于2
16、022年6月2.2.改变酶特性有两种主要的方法改变酶特性有两种主要的方法:1)1)通过分子修饰的方法来改变已分离出来的通过分子修饰的方法来改变已分离出来的天然酶的活性。天然酶的活性。2)2)通过基因工程方法改变编码酶分子的基通过基因工程方法改变编码酶分子的基因而达到改造酶的目的。因而达到改造酶的目的。第二十六张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 3.酶化学修饰的概念酶化学修饰的概念 (原理(原理 、方法、应用)、方法、应用)酶的化学修饰(酶的化学修饰(chemical modificationchemical modification):):通过化学基团的引入或除去,使蛋白质共价结构发生
17、改变。通过化学基团的引入或除去,使蛋白质共价结构发生改变。化学修饰是分子酶工程的重要手段之一。只要选择合适的修饰剂和修饰化学修饰是分子酶工程的重要手段之一。只要选择合适的修饰剂和修饰条件,在保持酶活性的基础上,能够在较大范围内改变酶的性质,创造天然条件,在保持酶活性的基础上,能够在较大范围内改变酶的性质,创造天然酶所不具备的优良特性,甚至创造出新的活性。酶所不具备的优良特性,甚至创造出新的活性。酶选择性化学修饰:酶选择性化学修饰:肽链侧链基团被化学试剂专一性地修饰肽链侧链基团被化学试剂专一性地修饰 化学修饰方法虽多,但基本都是利用修饰剂所具有的各种化学基团化学修饰方法虽多,但基本都是利用修饰剂
18、所具有的各种化学基团特性,特性,或直接或经过一定的活化过程或直接或经过一定的活化过程,与酶分子上某氨基酸残基(一般尽,与酶分子上某氨基酸残基(一般尽量选酶活性非必需基团)产生化学反应,对酶分子结构进行改造。量选酶活性非必需基团)产生化学反应,对酶分子结构进行改造。第二十七张,PPT共八十八页,创作于2022年6月二、酶化学修饰的目的二、酶化学修饰的目的 1.1.研究酶的结构与功能的关系。(研究酶的结构与功能的关系。(5050年代末)年代末)2.2.人为改变天然酶的某些性质,扩大酶的应用人为改变天然酶的某些性质,扩大酶的应用 范围。(范围。(7070年代末之后)年代末之后)1 1)提高酶的生物活
19、性(酶活力)。)提高酶的生物活性(酶活力)。2 2)增强酶的稳定性(热稳定性、体内半衰期)。)增强酶的稳定性(热稳定性、体内半衰期)。3 3)消除抗原性(针对特异性反应降低生物识别能力)。)消除抗原性(针对特异性反应降低生物识别能力)。4 4)产生新的催化能力。)产生新的催化能力。第二十八张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 第三节第三节 酶化学修饰的原理酶化学修饰的原理 凡通过化学基团的引入或除去而使酶蛋白共价结凡通过化学基团的引入或除去而使酶蛋白共价结构发生改变构发生改变(侧链基团的取代、肽链的限制性水解、分(侧链基团的取代、肽链的限制性水解、分子内或分子间的交联),子内或分子间的交
20、联),都可称为蛋白质的化学修饰。都可称为蛋白质的化学修饰。达到:达到:改造酶的作用特性改造酶的作用特性(包括改变酶活性、专一性、对效(包括改变酶活性、专一性、对效应物响应性能及对辅助因子的要求)应物响应性能及对辅助因子的要求)提高酶的稳定性提高酶的稳定性扩大在体内应用可能性扩大在体内应用可能性(防止在体内非专一性水解、减(防止在体内非专一性水解、减少和消除免疫原性以利于医疗应用)少和消除免疫原性以利于医疗应用)第二十九张,PPT共八十八页,创作于2022年6月一、如何增强酶天然构象的稳定性与耐热性一、如何增强酶天然构象的稳定性与耐热性 修饰剂分子存在多个反应基团,可与酶修饰剂分子存在多个反应基
21、团,可与酶形成多点交联。使酶的天然构象产生形成多点交联。使酶的天然构象产生“刚性刚性”结构。结构。二、如何保护酶活性部位与抗抑制剂二、如何保护酶活性部位与抗抑制剂 大分子修饰剂与酶结合后,产生的空间障碍大分子修饰剂与酶结合后,产生的空间障碍或静电斥力阻挡抑制剂,或静电斥力阻挡抑制剂,“遮盖遮盖”了酶的活性了酶的活性部位部位。第三十张,PPT共八十八页,创作于2022年6月三、如何维持酶功能结构的完整性与抗蛋白水解酶三、如何维持酶功能结构的完整性与抗蛋白水解酶 酶化学修饰后通过两种途径抗蛋白水解酶:酶化学修饰后通过两种途径抗蛋白水解酶:1.1.大分子修饰剂产生空间障碍阻挡蛋白水解酶接近大分子修饰
22、剂产生空间障碍阻挡蛋白水解酶接近酶分子。酶分子。“遮盖遮盖”酶分子上敏感键免遭破坏。酶分子上敏感键免遭破坏。2.2.酶分子上许多敏感基团交联上修饰剂后,减少酶分子上许多敏感基团交联上修饰剂后,减少了受蛋白水解酶破坏的可能性。了受蛋白水解酶破坏的可能性。第三十一张,PPT共八十八页,创作于2022年6月四、如何消除酶的抗原性及稳定酶的微环境四、如何消除酶的抗原性及稳定酶的微环境1.1.酶蛋白氨基酸组成的抗原决定簇,与修饰剂形成了共价键。酶蛋白氨基酸组成的抗原决定簇,与修饰剂形成了共价键。破坏了抗原决定簇破坏了抗原决定簇抗原性降低乃至消除抗原性降低乃至消除 “遮盖遮盖”了抗原决定簇了抗原决定簇阻碍
23、抗原、抗体结合阻碍抗原、抗体结合2.2.大分子修饰剂本身是多聚电荷体,能在酶分子表面大分子修饰剂本身是多聚电荷体,能在酶分子表面形成形成“缓冲外壳缓冲外壳”,抵御外界环境的极性变化,维持,抵御外界环境的极性变化,维持酶活性部位微环境相对稳定。酶活性部位微环境相对稳定。第三十二张,PPT共八十八页,创作于2022年6月 第四节第四节 酶化学修饰的设计酶化学修饰的设计 一、充分认识酶分子的特性一、充分认识酶分子的特性 包括酶的包括酶的 1.1.活性部位情况活性部位情况 2.2.稳定条件及反应最佳条件稳定条件及反应最佳条件 3.3.侧链基团的化学性质及反应活泼性侧链基团的化学性质及反应活泼性第三十三
24、张,PPT共八十八页,创作于2022年6月二、二、修饰剂的选择修饰剂的选择 要考虑要考虑 1.1.修饰剂的分子量及链的长度(要求有较大的分修饰剂的分子量及链的长度(要求有较大的分子量)子量)2.2.修饰剂上反应基团的数目及位置(要求有较修饰剂上反应基团的数目及位置(要求有较多的反应活性基团)多的反应活性基团)3.3.修饰剂上反应基团的活化方法与条件修饰剂上反应基团的活化方法与条件第三十四张,PPT共八十八页,创作于2022年6月三、反应条件的选择三、反应条件的选择 要注意要注意 1.1.酶与修饰剂的分子比例酶与修饰剂的分子比例 2.2.反应体系的溶剂性质、盐浓度、反应体系的溶剂性质、盐浓度、p
25、HpH条件条件 3.3.反应温度及时间反应温度及时间第三十五张,PPT共八十八页,创作于2022年6月第五节第五节 酶化学修饰的种类及应用酶化学修饰的种类及应用 一、酶的表面化学修饰一、酶的表面化学修饰 (一)大分子修饰(大分子结合修饰)(一)大分子修饰(大分子结合修饰)是目前应用最广的酶分子修饰方法。是目前应用最广的酶分子修饰方法。1.1.定义:利用水溶性大分子与酶结合,使酶的空间定义:利用水溶性大分子与酶结合,使酶的空间结构发生某些精细的改变,从而改变酶的特性与功结构发生某些精细的改变,从而改变酶的特性与功能的方法。能的方法。第三十六张,PPT共八十八页,创作于2022年6月2.2.修饰剂
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