蛋白质工程制药.pptx
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1、S1 S1 蛋白质工程制药概述蛋白质工程制药概述从基因工程药物到蛋白质工程药物从基因工程药物到蛋白质工程药物蛋白质工程的诞生、概念蛋白质工程的诞生、概念蛋白质工程的基本过程蛋白质工程的基本过程蛋白质分子设计蛋白质分子设计第1页/共54页基因工程药物基因工程药物蛋白质工程药物蛋白质工程药物19821982年第一个基因工程药物:重组人胰岛素年第一个基因工程药物:重组人胰岛素n 重组蛋白存在问题:重组蛋白存在问题:1 1、稳定性差:体内半衰期短、稳定性差:体内半衰期短2 2、药理活性不够强:使用剂量偏大、药理活性不够强:使用剂量偏大3 3、毒副作用大、毒副作用大4 4、生产工艺复杂、生产工艺复杂蛋白
2、质工程药物蛋白质工程药物第2页/共54页蛋白质工程的诞生蛋白质工程的诞生1970S1970S末,末,SmithSmith等人建立了等人建立了寡核苷酸点突变寡核苷酸点突变改变改变DNADNA序列的方法序列的方法19821982年,一些实验室用此技术来改造蛋白质分子,研究蛋白质的功能年,一些实验室用此技术来改造蛋白质分子,研究蛋白质的功能19831983年,年,UlmerUlmer发表了题为发表了题为“Protein EngineeringProtein Engineering”的专论的专论目前已应用于医药领域,并有多种产品上市目前已应用于医药领域,并有多种产品上市第3页/共54页已上市的蛋白质工
3、程药物已上市的蛋白质工程药物1 1、体内半衰期短、体内半衰期短2 2、药理活性不够强、药理活性不够强3 3、毒副作用大、毒副作用大4 4、生产工艺复杂、生产工艺复杂第4页/共54页已上市的蛋白质工程药物已上市的蛋白质工程药物1 1、体内半衰期短、体内半衰期短2 2、药理活性不够强、药理活性不够强3 3、毒副作用大、毒副作用大4 4、生产工艺复杂、生产工艺复杂第5页/共54页已上市的蛋白质工程药物已上市的蛋白质工程药物1 1、体内半衰期短、体内半衰期短2 2、药理活性不够强、药理活性不够强3 3、毒副作用大、毒副作用大4 4、生产工艺复杂、生产工艺复杂第6页/共54页蛋白质工程的概念蛋白质工程的
4、概念蛋白质工程蛋白质工程(Protein EngineeringProtein Engineering)(第二代基因工程第二代基因工程)是以是以蛋白质结构功能关系的知识蛋白质结构功能关系的知识为基础,通过周密的为基础,通过周密的分子设计分子设计以及以及DNADNA重组技重组技术术,把天然的蛋白质改造成合乎人类需要的新的,把天然的蛋白质改造成合乎人类需要的新的突变蛋白质突变蛋白质(mutein)(mutein)的一的一项技术。项技术。第7页/共54页蛋白质工程的概念蛋白质工程的概念内涵:内涵:1 1、从、从DNADNA水平改变基因,改造蛋白质水平改变基因,改造蛋白质2 2、一个或多个氨基酸残基、
5、一个或多个氨基酸残基 结构域结构域 全新蛋白质全新蛋白质3 3、有目的地改造,获得期望功能、有目的地改造,获得期望功能 强调分子设计强调分子设计4 4、结合、结合DNADNA重组技术重组技术从不同尺度改造从不同尺度改造第8页/共54页蛋白质工程的基本过程蛋白质工程的基本过程第9页/共54页蛋白质工程的基本过程蛋白质工程的基本过程1 1、分离纯化所需改造的目的蛋白、分离纯化所需改造的目的蛋白2 2、对蛋白进行氨基酸序列测定、对蛋白进行氨基酸序列测定、X X射线晶体衍射线晶体衍射分析、核磁共振分析等射分析、核磁共振分析等结构和功能信结构和功能信息息3 3、根据结构和功能信息、生物信息学信息,、根据
6、结构和功能信息、生物信息学信息,运用蛋白质分子预测技术提出蛋白质设计方运用蛋白质分子预测技术提出蛋白质设计方案案4 4、分离克隆该蛋白编码基因,并进行突变改、分离克隆该蛋白编码基因,并进行突变改造造5 5、插入适当的载体表达、插入适当的载体表达6 6、分离纯化表达产物,检测其生物学功能、分离纯化表达产物,检测其生物学功能实验实验设计设计实验实验第10页/共54页蛋白质分子设计蛋白质分子设计三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第11页/共54页蛋白质分子设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计的三个基本条件:蛋白
7、质分子设计的三个基本条件:1 1、蛋白质分子的基本知识:理化性质、结构与、蛋白质分子的基本知识:理化性质、结构与功能、构象规律功能、构象规律2 2、对具体改造的蛋白质分子必须有一个系统、对具体改造的蛋白质分子必须有一个系统、全面和深入的了解全面和深入的了解3 3、分子设计的基本工具:高性能的计算机硬件、分子设计的基本工具:高性能的计算机硬件、功能齐全的计算机软件功能齐全的计算机软件只有在此基础上,才能应用蛋白质分子预测只有在此基础上,才能应用蛋白质分子预测技术,提出合理的设计方案技术,提出合理的设计方案三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计
8、蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第12页/共54页蛋白质分子设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计的分类蛋白质分子设计的分类1 1、小范围改造:、小范围改造:对已知结构的蛋白质进行对已知结构的蛋白质进行少数几个残基的替换、部分片段的缺失,少数几个残基的替换、部分片段的缺失,改善蛋白质的性质和功能。改善蛋白质的性质和功能。2 2、较大程度的改造:、较大程度的改造:根据需求对来源于不根据需求对来源于不同蛋白质的结构域进行拼接组装,或在蛋同蛋白质的结构域进行拼接组装,或在蛋白质分子中进行大范围肽链替换、结构域白质分子中进行大范围肽链替换、结构域替换,获得多功能复合体。替换,获得多功能复合体。3 3、蛋
9、白质从头设计、蛋白质从头设计 (de novode novo protein design protein design)三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第13页/共54页概念:概念:从蛋白质分子一级结构出发,设计制造自然界中不存在的从蛋白质分子一级结构出发,设计制造自然界中不存在的全新蛋白全新蛋白,使之具有特定的空间结构和预期的生物功能。使之具有特定的空间结构和预期的生物功能。1 1、需要扎实的理论基础、需要扎实的理论基础2 2、在在分子设计分子设计与与试验验证试验验证之间交互进行之间交互进行蛋白
10、质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第14页/共54页PDAPDA循环循环(P Protein rotein D Design esign A Automationutomation)1 1、设计设计模拟模拟实验实验分析分析2 2、不断循环:一步步的修正最终获得成功、不断循环:一步步的修正最终获得成功蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计计算机模拟计算机模拟基因构建基因构建突变蛋白质产物突变蛋白质产物功能分析功能分析三个基本条件三个基
11、本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第15页/共54页蛋白质从头合成的范例蛋白质从头合成的范例 凋亡诱导肽:凋亡诱导肽:C CNGRNGRC-GGC-GGn n-(KLAKLAKKLAKLAK)2 2KLAKLAKKLAKLAK:可形成典型的两亲可形成典型的两亲-螺螺旋结构,进入细胞后,可破坏线粒旋结构,进入细胞后,可破坏线粒体膜引起细胞凋亡体膜引起细胞凋亡NGRNGR:与新生血管的内皮细胞特异结与新生血管的内皮细胞特异结合,起到靶向弹头的作用合,起到靶向弹头的作用蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计
12、三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第16页/共54页 利用利用NGRNGR为弹头,将为弹头,将KLALAKKLALAK肽特异地导向肿瘤部位肽特异地导向肿瘤部位的新血管内皮细胞,通过抑制新血管的生成,从而的新血管内皮细胞,通过抑制新血管的生成,从而抑制肿瘤的形成,且对其他细胞没有明显的毒性。抑制肿瘤的形成,且对其他细胞没有明显的毒性。300300 mol/L mol/L 3 3 mol/Lmol/L蛋白质从头合成的范例蛋白质从头合成的范例 凋亡诱导肽:凋亡诱导肽:C CNGRNGRC-GGn-C-GGn
13、-(KLAKLAKKLAKLAK)2 2蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第17页/共54页蛋白质从头合成的范例蛋白质从头合成的范例 凋亡诱导肽:凋亡诱导肽:C CNGRNGRC-GGn-C-GGn-(KLAKLAKKLAKLAK)2 2蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计考虑的其他因素考虑的其他因素1 1、Gly-GlyGly-Gly接头:接头:防止两功能部位的立体结构相互影响。防止两功能部位的立体结构相互影响。2 2、L-
14、L-型氨基酸(型氨基酸(D-D-型):型):防止蛋白酶的降解防止蛋白酶的降解三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第18页/共54页蛋白质从头合成的范例蛋白质从头合成的范例 凋亡诱导肽:凋亡诱导肽:C CNGRNGRC-GGn-C-GGn-(KLAKLAKKLAKLAK)2 2蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计蛋白质分子设计实验结果实验结果1 1、特异地被激活的新生血管内皮细胞内吞,引起凋亡、特异地被激活的新生血管内皮细胞内吞,引起凋亡2 2、在小鼠肿瘤模型中,可抑制肿瘤的生长,明显延长、在小鼠肿
15、瘤模型中,可抑制肿瘤的生长,明显延长治疗组小鼠的存活时间治疗组小鼠的存活时间3 3、对健康小鼠超剂量使用时,没有毒副作用的产生、对健康小鼠超剂量使用时,没有毒副作用的产生三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第19页/共54页1 1、顺式思维理性化设计、顺式思维理性化设计 合理化设计合理化设计2 2、基于各种功能筛选平台的非理性逆向改造策略、基于各种功能筛选平台的非理性逆向改造策略 非理性的体外进化非理性的体外进化3 3、两种策略的结合、两种策略的结合蛋白质分子设计的策略蛋白质分子设计的策略蛋白质分子设计
16、蛋白质分子设计三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第20页/共54页1 1、顺式思维理性化设计顺式思维理性化设计 合理化设计合理化设计基于现有知识信息:蛋白质的结构与功能;基于现有知识信息:蛋白质的结构与功能;因此,受到已有认识水平的制约。因此,受到已有认识水平的制约。蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计的策略蛋白质分子设计的策略蛋白质分子设计蛋白质分子设计三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第21页/共5
17、4页2 2、基于各种功能筛选平台的非理性逆向改造策略基于各种功能筛选平台的非理性逆向改造策略非理性的体外进化非理性的体外进化1 1)构建包含众多突变蛋白的文库:)构建包含众多突变蛋白的文库:随机突变、随机突变、DNADNA改改组等组等2 2)筛选文库:)筛选文库:从功能入手进行筛选所需要的蛋白从功能入手进行筛选所需要的蛋白3 3)进行蛋白质基本结构、序列信息的分析)进行蛋白质基本结构、序列信息的分析蛋白质分子设计的策略蛋白质分子设计的策略蛋白质分子设计蛋白质分子设计三个基本条件三个基本条件蛋白质蛋白质分子设计的分类分子设计的分类蛋白质从头设计蛋白质从头设计蛋白质分子设计策略蛋白质分子设计策略第
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