结构与性能学习.pptx
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1、蛋白质的一级结构:就是氨基酸残基的排列顺序以及二硫键(如果存在)的位置。蛋白质的一级结构:就是氨基酸残基的排列顺序以及二硫键(如果存在)的位置。理论上,每种蛋白质具有唯一而确切的氨基酸顺序。理论上,每种蛋白质具有唯一而确切的氨基酸顺序。测定氨基酸顺序的意义:氨基酸顺序是决定蛋白质生物活性的分子基础氨基酸顺序将决定蛋白质的二级结构构象和三级结构;而其与三级结构之间的相互关系的分析,更揭露了控制多肽链折叠的一些规律如果蛋白质具有生理活性的话,氨基酸顺序的异常可能导致其功能异常和疾病氨基酸顺序指明该蛋白质的进化史第1页/共48页蛋白质一级结构的测定蛋白质一级结构的测定样品必需纯(97%以上);知道蛋
2、白质的分子量;知道蛋白质由几个亚基组成;测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每种氨基酸的个数。测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。1 1、测定蛋白质的一级结构的要求、测定蛋白质的一级结构的要求第2页/共48页测定方法很多,如总氮量法,福林酚试剂法,双缩脲法,紫外吸收法等。近来已有专用的蛋白质分析仪,但经典的凯氏定氮法仍是食品,饲料分析,种子鉴定及营养和生化研究中最广泛应用且具有足够精度的方法。蛋白质含量测定:第3页/共48页蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、碘、碘、锌和铜等。这些元素在蛋白质中的组成百分比约为:碳5
3、0氢7氧23氮16%硫03其他微量第4页/共48页可以将生物组织的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量。由于大多数蛋白质的含氮量接近于16%,所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量。蛋白质含量的测定:凯氏定氮法(测定氮的经典方法)优点:对原料无选择性,仪器简单,方法也简单;缺点:易将无机氮(如核酸中的氮)都归入蛋白质中,不精确。一般,样品含氮量平均在16%,取其倒数100/16=6.25,即为蛋白质换算系数,其含义是样品中每存在1g元素氮,就说明含有6.25g蛋白质)。三聚氰胺(化学式:C3H6N6)第5页/共48页实验原理:有机物中的氮在强热和CuSO4,浓H2SO4作用下,消化生
4、成(NH4)2SO4反应式为:H2SO4=SO2+H2O+OR.3NH32+mH2O2NH3+H2SO4=(NH4)2SO4在凯氏定氮器中与碱作用,通过蒸馏释放出NH3,收集于H3BO3溶液中反应式为:2NH4+OH-=NH3+H2ONH3+H3BO3=NH4+H2BO3-再用已知浓度的HCI标准溶液滴定,根据HCI消耗的量计算出氮的含量,然后乘以相应的换算因子,即得蛋白质的含量反应式为:H2BO3-+H+=H3BO3第6页/共48页2 2、测定步骤、测定步骤第7页/共48页(1)多肽链的拆分:由多条多肽链组成的蛋白质分子,必须先进行拆分。几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为寡聚蛋白质,如,
5、血红蛋白为四聚体,烯醇化酶为二聚体;可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即可分开多肽链(亚基)。第8页/共48页(2)二硫键的断裂 几条多肽链通过二硫键交联在一起。可在可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用过量的-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。第9页/共48页巯基(巯基(-SH)的保护)的保护第10页/共48页(3)测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比目前各大公司如Beckman,PerkinElmer,Waters等都有各自的自动进样、氨基酸分析和定量报告联为一体的商品化氨基酸自动分析仪出售。第1
6、1页/共48页Sanger法法。2,4-二二硝硝基基氟氟苯苯在在碱碱性性条条件件下下,能能够够与与肽肽链链N-端端的的游离氨基作用,生成二硝基苯衍生物(游离氨基作用,生成二硝基苯衍生物(DNP)。)。在在酸酸性性条条件件下下水水解解,得得到到黄黄色色DNP-氨氨基基酸酸。该该产产物物能能够够用用乙乙醚醚抽提分离。不同的抽提分离。不同的DNP-氨基酸可以用色谱法进行鉴定。氨基酸可以用色谱法进行鉴定。(4)分析多肽链的N-末端和C-末端末端氨基酸的测定:N-端氨基酸和C-端氨基酸。在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。二硝基氟苯(二硝基氟苯(DNFBDNFB)法)法第12页/共48
7、页在在碱碱性性条条件件下下,丹丹磺磺酰酰氯氯(二二甲甲氨氨基基萘萘磺磺酰酰氯氯)可可以以与与N-N-端端氨氨基酸的游离氨基作用,得到丹磺酰基酸的游离氨基作用,得到丹磺酰-氨基酸。氨基酸。此此法法的的优优点点是是丹丹磺磺酰酰-氨氨基基酸酸有有很很强强的的荧荧光光性性质质,检检测测灵灵敏敏度度可以达到可以达到1 1 1010-9-9molmol。丹磺酰氯法丹磺酰氯法第13页/共48页此法是多肽链此法是多肽链C-端氨基酸分析法。多肽与肼在无水条件下加热,端氨基酸分析法。多肽与肼在无水条件下加热,C-端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸则变成肼化物。端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸则变成肼
8、化物。肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与C-端氨基酸分离。端氨基酸分离。肼解法肼解法第14页/共48页氨氨肽肽酶酶是是一一种种肽肽链链外外切切酶酶,它它能能从从多多肽肽链链的的N-N-端端逐逐个个的的向里水解。向里水解。根根据据不不同同的的反反应应时时间间测测出出酶酶水水解解所所释释放放出出的的氨氨基基酸酸种种类类和和数数量量,按按反反应应时时间间和和氨氨基基酸酸残残基基释释放放量量作作动动力力学学曲曲线线,从而知道蛋白质的从而知道蛋白质的N-N-末端残基顺序。末端残基顺序。最最常常用用的的氨氨肽肽酶酶是是亮亮氨氨酸酸氨氨肽肽酶酶,水水解解以以
9、亮亮氨氨酸酸残残基基为为N-N-末端的肽键速度最大。末端的肽键速度最大。氨肽酶法氨肽酶法第15页/共48页羧羧肽肽酶酶是是一一种种肽肽链链外外切切酶酶,它它能能从从多多肽肽链链的的C-C-端端逐逐个个的的水水解解。根根基基不不同同的的反反应应时时间间测测出出酶酶水水解解所所释释放放出出的的氨氨基基酸酸种种类类和和数数量量,从从而而知知道道蛋蛋白白质质的的C-C-末末端端残残基基顺顺序。序。目目前前常常用用的的羧羧肽肽酶酶有有四四种种:A,B,CA,B,C和和Y Y;A A和和B B来来自自胰胰脏脏;C C来自柑桔叶;来自柑桔叶;Y Y来自面包酵母。来自面包酵母。羧羧肽肽酶酶A A能能水水解解除
10、除Pro,ArgPro,Arg和和LysLys以以外外的的所所有有C-C-末末端端氨氨基酸残基;基酸残基;B B只能水解只能水解ArgArg和和LysLys为为C-C-末端残基的肽键。末端残基的肽键。羧肽酶法羧肽酶法第16页/共48页(5)多肽链断裂成多个肽段,可采用两种或多种不同的断裂方法将多肽样品断裂成两套或多套肽段或肽碎片,并将其分离开来。酶解法:胰蛋白酶,糜蛋白酶,胃蛋白酶,嗜热菌蛋白酶,羧肽酶和氨肽酶第17页/共48页 化学法:(Cyanogen Bromide)溴化氰水解法,它能选择性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成的肽键。第18页/共48页 羟胺裂解法羟胺(NH2OH)在碱性条件下(
11、pH9.0)能专一性裂解-Asn-Gly-间的肽键,也能部分裂解-Asn-Leu-或-Asn-Ala-间的肽键;在酸性条件可以断裂-Asp-Pro-间的肽键,产率可达80%。部分酸水解一般认为酸水解没有什么专一性而被忽视,后来发现部分酸水解还是有一定的专一性。在稀酸的条件下,也即在高浓度胍的甲酸中(pH2.5),可裂解-Asp-Pro-间的肽键,产率高达80%90%。在浓酸条件下,含羟基氨基酸氨基端肽键容易断裂。但是终究部分酸水解的专一性差,副反应多,此法比较难掌握。第19页/共48页Edman法(异硫氰酸苯酯法)氨基酸顺序分析法实际上也是一种N-端分析法。此法的特点是能够不断重复循环,将肽链
12、N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。(6)测定每个肽段的氨基酸顺序(自动序列分析仪测序)第20页/共48页第21页/共48页(7)确定肽段在多肽链中的次序:利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。16肽,N端HC端S法裂解:QNSPSEQVERLAHQWT法裂解:SEQWTQNVERLAPSHQ重叠法确定序列:HQWTQNSEQVERLAPS第22页/共48页(8)确定原多肽链中二硫键的位置一般采用胃蛋白酶处理没有断开二硫键的多肽链;再利用双向电泳技术分离出各个肽段,用过甲酸处理后,将每个肽段进行组成及顺序分析;然后同其它方法分析的肽段进行比较,确定二硫键
13、的位置。第23页/共48页蛋白质的化学修饰蛋白质的化学修饰蛋蛋白白质质的的化化学学修修饰饰:是是指指在在较较温温和和的的条条件件下下,以以可可控控制制的的方方式式使使蛋蛋白白质质与与某某种种试试剂剂(称称化化学学修修饰饰剂剂)起起特特异异反反应应,以以引引起蛋白质中个别氨基酸侧链或功能团发生共价化学改变。起蛋白质中个别氨基酸侧链或功能团发生共价化学改变。理想情况下,修饰试剂只是有选择地与某一特定的残基反应,很少或几乎不引起蛋白质分子的构象变化。在此基础上,从该基团的修饰对蛋白质分子的生物活性所造成的影响,就可以推测出被修饰的残基在该蛋白质分子中的功能。只有具有极性的氨基酸残基的侧链基团才能够进
14、行化学修饰,这些基团的反应性取决于它们的亲核性。第24页/共48页1 1、化学修饰的主要作用、化学修饰的主要作用(1)探测蛋白质的必需氨基酸残基的性质和数目。蛋白质的化学修饰可以很快地揭示蛋白质分子中哪些侧链基团是表现酶活性所必需的。它可以帮助人们初步认识该蛋白质分子中哪些残基能处于活性部位并为其表现功能所必需。(2)用于蛋白质纯度分析与鉴定。(3)用于蛋白质一级序列的测定。序列分析时,首先必须了解N-末端的残基。多肽链N-末端残基的分析常用的修饰试剂有二硝基氟苯、丹氟酰氯,即二甲基氨基萘磺酰氯(DNS)和苯异硫氰酸酯(PITC)。PITC也是测定蛋白质序列的Edman降解法的关键试剂。此外,
15、在氨基酸组成分析中的半胱氨酸残基的测定、二硫键的断裂、侧链基团的保护等均采用各种方法的化学修饰。(4)探测蛋白质分子的构象变化和运动性。探测某些基因的暴露程度,以分析蛋白质分子的构象变化,如利用5,5-二硫双(2-硝基苯甲酸)(DTNB)测定不同去折叠状态的反应巯基数目,可以探测其去折叠的程度,还可以通过监测A412随时间的变化探测去折叠的动力学。(5)利用亲和标记探测活性部位局部区域的构象状态。有些化学试剂可专一性地修饰酶的活性部位的侧链基团,从而在活性部位引入探测基团(如具有荧光性或顺磁性基团),以探明活性部位的构象状态及构象变化。第25页/共48页(6)探索蛋白质和酶作用的化学机理。通过
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