如何应用经典检索工具幻灯片.ppt
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1、如何应用经典检索工具第1页,共144页,编辑于2022年,星期五v子宫内膜异位症(子宫内膜异位症(EndometriosisEndometriosis,EMEM)诱)诱导因素的研究进展及其相关问题导因素的研究进展及其相关问题近年来有关其诱导因素哪些是研究热点?近年来有关其诱导因素哪些是研究热点?哪些具有现实意义哪些具有现实意义?哪哪些些与与先先进进学学说说(分分子子生生物物学学、遗遗传传学学、生生化化)和技术(细胞纯度分析)有关?和技术(细胞纯度分析)有关?问题的提出问题的提出?第2页,共144页,编辑于2022年,星期五 PubMed网址网址vhttp:/pubmed.govvhttp:/w
2、ww.pubmed.govvhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMedv与其它数据库资源不同,为全免费系统与其它数据库资源不同,为全免费系统第3页,共144页,编辑于2022年,星期五v欲通过欲通过PubMed查找查找“利用利用抗抗生素(生素(antibiotics)治疗治疗耳痛耳痛(earache)”主题的文献,主题的文献,应如何进行操作应如何进行操作?第4页,共144页,编辑于2022年,星期五基本检索提问框特征栏提供辅助检索功能侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索执行检索第5页,共144页,编辑于2022年,星期五利用利用PubMed您
3、可以干什么?您可以干什么?v查找某一主题的文献:查找某一主题的文献:标准(默认)检索标准(默认)检索、主主题词检索题词检索以及以及文本词检索文本词检索方式;方式;v查找某一作者撰写的文献:查找某一作者撰写的文献:Zhong SZ;v查找某一期刊发表的文献:查找某一期刊发表的文献:Journal of Southern Medical University;第6页,共144页,编辑于2022年,星期五利用利用PubMed您可以干什么?您可以干什么?v查找某一篇特定文献:查找某一篇特定文献:Single Citation Matcher;v查找某疾病的临床相关信息:查找某疾病的临床相关信息:Cli
4、nical Queries;v定期获取预设的主题信息:定期获取预设的主题信息:My NCBI;v与与NCBI其它资源的链接信息。其它资源的链接信息。第7页,共144页,编辑于2022年,星期五第8页,共144页,编辑于2022年,星期五教学目标教学目标vv找出标准检索、字段限定和主题词检索方式查找文献找出标准检索、字段限定和主题词检索方式查找文献找出标准检索、字段限定和主题词检索方式查找文献找出标准检索、字段限定和主题词检索方式查找文献信息的区别与联系;信息的区别与联系;信息的区别与联系;信息的区别与联系;vv学会将筛选出的文献,按常用格式进行显示、存盘、学会将筛选出的文献,按常用格式进行显示
5、、存盘、学会将筛选出的文献,按常用格式进行显示、存盘、学会将筛选出的文献,按常用格式进行显示、存盘、打印、打印、打印、打印、EMAILEMAIL发送等输出操作;发送等输出操作;v掌握检索结果扩大或缩小的调整方法以及检索式掌握检索结果扩大或缩小的调整方法以及检索式的保存方式等。的保存方式等。vv熟悉常用功能按钮的使用;熟悉常用功能按钮的使用;熟悉常用功能按钮的使用;熟悉常用功能按钮的使用;v熟悉全文获取的方式。熟悉全文获取的方式。熟悉全文获取的方式。熟悉全文获取的方式。第9页,共144页,编辑于2022年,星期五 PubMedv概况概况v检索方式选择检索方式选择*v检索条件限制检索条件限制v检索
6、结果处理检索结果处理*:显示:显示 、输出、输出v检索式浏览与保存检索式浏览与保存*:个性化或定题服务:个性化或定题服务v全文获取技巧全文获取技巧*vPubMed特点分析特点分析第10页,共144页,编辑于2022年,星期五概况概况第11页,共144页,编辑于2022年,星期五v免费使用,免费使用,是查找众多与健康医学主题是查找众多与健康医学主题密切相关信息的优秀数据库系统;密切相关信息的优秀数据库系统;v19971997年年6 6月月2626日,美国副总统戈尔宣布免日,美国副总统戈尔宣布免费开放;费开放;v文摘型数据库,但能提供部分文献的全文摘型数据库,但能提供部分文献的全文链接信息(如文链
7、接信息(如PubMed CentralPubMed Central和其他和其他网站上的免费全文链接);网站上的免费全文链接);第12页,共144页,编辑于2022年,星期五v数据来自包括美国在内的数据来自包括美国在内的70多个国多个国家出版的约家出版的约4,900多种生物医学期多种生物医学期刊;刊;v记录从记录从1950年至今已超过年至今已超过1700多多万条;万条;第13页,共144页,编辑于2022年,星期五v数据周二至周六每天更新数据周二至周六每天更新,包括包括 MEDLINE(mid-1960s)、OLDMEDLINE(1950-1965)以及以及PREMEDLINE中的中的 Medl
8、ine references in process 和和 references supplied by publishers。第14页,共144页,编辑于2022年,星期五vMEDLINE数据库是美国国数据库是美国国立医学图书馆的重要书目数据立医学图书馆的重要书目数据库系统库系统,覆盖医学、护理、牙覆盖医学、护理、牙科、兽医、卫生保健等学科。科、兽医、卫生保健等学科。第15页,共144页,编辑于2022年,星期五PubMed提供的结果提供的结果v文献文献题录题录或或摘要摘要信息;信息;v文献免费或收费文献免费或收费全文链接信息全文链接信息。第16页,共144页,编辑于2022年,星期五检索方式
9、选择检索方式选择第17页,共144页,编辑于2022年,星期五v主题检索主题检索(Subject Search)*v作者检索作者检索(Author Search)*v期刊检索期刊检索(Journal Search)v截词检索截词检索(Truncation)v词组检索词组检索(Phrase Search)v单个引文匹配器单个引文匹配器(Single Citation Matcher)*v临床信息查询临床信息查询(Clinical Queries)v相关文献相关文献(Related articles)第18页,共144页,编辑于2022年,星期五主题检索主题检索v标准检索标准检索(Standard
10、 Search):默认的:默认的智能检索方式智能检索方式v文本词检索文本词检索(Text Word):字段限定:字段限定v主题词检索主题词检索(MeSH Database)第19页,共144页,编辑于2022年,星期五标准检索提问框标准检索提问框(The standard search box)v检索词检索词:逻辑式、叙述性语句、实质意义词;:逻辑式、叙述性语句、实质意义词;v作者名作者名:查找:查找2002年以前文献需采用年以前文献需采用姓全姓全称、名缩写称、名缩写方式,如:方式,如:Zhong SZ;v刊物名刊物名:全称、简称、:全称、简称、ISSN号。号。第20页,共144页,编辑于20
11、22年,星期五第21页,共144页,编辑于2022年,星期五布尔逻辑运算符布尔逻辑运算符(大写大写)ORANDNOTOtitis media ANDantibioticsOtitis media ORantibioticsOtitis media NOTantibiotics第22页,共144页,编辑于2022年,星期五v在在PubMed中中,逻辑运算遵循从左到右的逻辑运算遵循从左到右的次序:次序:antibiotics AND(earache OR otitis)不同于不同于 antibiotics AND earache OR otitis第23页,共144页,编辑于2022年,星期五Pu
12、bMed检索结果页面检索结果页面第24页,共144页,编辑于2022年,星期五链接图标链接图标(Icon links)v表示是否有文摘或免费全文。表示是否有文摘或免费全文。第25页,共144页,编辑于2022年,星期五第26页,共144页,编辑于2022年,星期五v输词方式输词方式:earache TW 此外,利用此外,利用*截词功能也将只运行截词功能也将只运行文本词检索。文本词检索。文本词检索文本词检索(Text Word)第27页,共144页,编辑于2022年,星期五PubMed记录字段说明记录字段说明文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号出版商提供文献识别号著者群著
13、者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期第28页,共144页,编辑于2022年,星期五电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMedPubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者全称文献相关注释文献相关注释基金编号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书
14、馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称第29页,共144页,编辑于2022年,星期五最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版国期刊出版国数据库文献编号数据库文献编号第30页,共144页,编辑于2022年,星期五作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出
15、版模式(纸张或电子)出版模式(纸张或电子)参考文献数参考文献数已撤回的文献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写标准期刊缩写文献标题文献标题翻译标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新文献正在更新期刊卷号期刊卷号第31页,共144页,编辑于2022年,星期五v利用标题利用标题ti字段限定方式查
16、找字段限定方式查找维生维生素素C(vitamin c)与与感冒感冒(common cold)主题的文献。主题的文献。第32页,共144页,编辑于2022年,星期五第33页,共144页,编辑于2022年,星期五v查找标题中含有查找标题中含有acupuncture 一词且一词且2000年出版的文献。年出版的文献。第34页,共144页,编辑于2022年,星期五第35页,共144页,编辑于2022年,星期五vMeSH:Medical Subject Headings;v医学主题词医学主题词(MeSH)是由标引员为所有的是由标引员为所有的PubMed 记录所指定的词;记录所指定的词;v标引员使用能恰当描
17、述文章内容的最相关标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词;词;v通常一篇文章可有几个通常一篇文章可有几个MeSH词。词。主题词检索主题词检索(MeSH Database)第36页,共144页,编辑于2022年,星期五主要标题词主要标题词(Major Topic)v当标引员为一篇文章确定当标引员为一篇文章确定MeSH词的词的同时,通常要进一步分析它为文章的同时,通常要进一步分析它为文章的主要论点还是次要论点;主要论点还是次要论点;v限制检出文献量的一种方法是将检索限限制检出文献量的一种方法是将检索限制在制在major MeSH字段,这意味着检字段,这意味着检出文献虽少但内容更相关。出文献
18、虽少但内容更相关。第37页,共144页,编辑于2022年,星期五vPubMed能自动地为输入的检索词寻找能自动地为输入的检索词寻找相应的相应的MeSH词;词;v用户利用一个用户利用一个MeSH词能找出所有含有词能找出所有含有该主题的文献;该主题的文献;v多数多数MeSH词还包括副主题词词还包括副主题词(subheadings)。第38页,共144页,编辑于2022年,星期五副主题词副主题词(MeSH Subheadings)v一个一个MeSHMeSH词的某特定方面词的某特定方面词的某特定方面词的某特定方面,如如如如:cost-effectivenesscost-effectiveness 或或
19、或或 adverse effectsv用户可根据课题内容挑选专门的副主题词。用户可根据课题内容挑选专门的副主题词。这这些副主题词不仅适用于用户输入的些副主题词不仅适用于用户输入的MeSH词,而词,而且还适用于该且还适用于该MeSH词的其它下位词。词的其它下位词。第39页,共144页,编辑于2022年,星期五MeSH词优点词优点v不同拼写不同拼写:paediatric/pediatric;v同义词同义词:tumor,tumour,cancer,neoplasm;v同音异义词同音异义词:depression;v排除不相关的文献;排除不相关的文献;第40页,共144页,编辑于2022年,星期五MeS
20、H词独有特征词独有特征v扩展扩展(EXPLODE):选择选择MeSH词及其更加词及其更加专指的下位词检索。专指的下位词检索。v主要标题词主要标题词(MAJOR TOPIC):MeSH词为词为文章的主要研究内容文章的主要研究内容(*)。v副主题词副主题词(SUBHEADINGS)第41页,共144页,编辑于2022年,星期五MEDLINE-MeSH Headings第42页,共144页,编辑于2022年,星期五举例:通过举例:通过MeSH查找查找“利用抗生素利用抗生素(antibiotics)治疗耳痛治疗耳痛(earache)”主题的文献主题的文献第43页,共144页,编辑于2022年,星期五第
21、44页,共144页,编辑于2022年,星期五第45页,共144页,编辑于2022年,星期五第46页,共144页,编辑于2022年,星期五v利用利用MeSH数据库构建讨论数据库构建讨论 economics of community-acquired pneumonia主题文主题文献。献。第47页,共144页,编辑于2022年,星期五第48页,共144页,编辑于2022年,星期五作者检索作者检索(Author Search)v用于查找某一特定作者撰写的文献。用于查找某一特定作者撰写的文献。v格式为作者格式为作者姓全称在前、名缩写在后姓全称在前、名缩写在后,如,如 SMITH BJ。v利用作者全称可
22、检索利用作者全称可检索2002年以来出版的年以来出版的文献,但采用第一作者进行检索时,需用文献,但采用第一作者进行检索时,需用传统的名字书写方式。传统的名字书写方式。第49页,共144页,编辑于2022年,星期五v检索词后加上作者字段标识符,如检索词后加上作者字段标识符,如FOOT AU,则系统只在作者字段进,则系统只在作者字段进行检索。行检索。v利用利用History 功能可将作者字段检索功能可将作者字段检索与其它检索词进行组配。与其它检索词进行组配。第50页,共144页,编辑于2022年,星期五期刊检索期刊检索(Journals Database)v用于查找某特定期刊中的文献。用于查找某特
23、定期刊中的文献。v可输入刊名全称、可输入刊名全称、MEDLINE简称或期刊简称或期刊的的 ISSN号,如:号,如:MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL(full name)MOL BIOL CELL(abbreviation)。第51页,共144页,编辑于2022年,星期五v如若在检索词后加上期刊的字段名,则如若在检索词后加上期刊的字段名,则系统只在该字段进行检索,如系统只在该字段进行检索,如 CHEST TA,BLOOD TA 等。等。第52页,共144页,编辑于2022年,星期五v利用期刊数据库(利用期刊数据库(Journals Database)查看)查看PubMe
24、d是否收是否收录了期刊录了期刊 Protein Science。若若是,从是,从Journals Database 对该对该刊进行检索。刊进行检索。第53页,共144页,编辑于2022年,星期五第54页,共144页,编辑于2022年,星期五截词截词(Truncation)vvPubMedPubMed中的截词符是中的截词符是“*”,用于查找具有相同词,用于查找具有相同词根的词根的词(150)150),如输入,如输入cell*会查出文章中包含有会查出文章中包含有会查出文章中包含有会查出文章中包含有cell,celliferous,cellophane,cells,cellularcell,cell
25、iferous,cellophane,cells,cellular等内等内容文献。容文献。vv注意:使用截词功能后,将关闭注意:使用截词功能后,将关闭注意:使用截词功能后,将关闭注意:使用截词功能后,将关闭MeSHMeSH自动扩展及检自动扩展及检索词匹配功能。索词匹配功能。第55页,共144页,编辑于2022年,星期五词组检索词组检索(Phrase Searching)v需使用引号标记词组需使用引号标记词组“.”,如:如:“glue ear”。v由于词组检索将关闭自动匹配和由于词组检索将关闭自动匹配和MeSH扩展功能,检索时将不包含更加专指的扩展功能,检索时将不包含更加专指的词即下位词。词即下
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