实验酶的分离纯化幻灯片.ppt
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1、实验酶的分离纯化第1页,共170页,编辑于2022年,星期六酶的概念:酶的概念:酶是生物催化剂,是活细胞合成的具酶是生物催化剂,是活细胞合成的具有高度催化效率和高度特异性的一类蛋白有高度催化效率和高度特异性的一类蛋白质。质。知识回顾知识回顾第2页,共170页,编辑于2022年,星期六酶促反应的特点酶促反应的特点 它遵守一般催化剂的共同性质:它遵守一般催化剂的共同性质:1.在化学反应前后都没有质和量的改变;在化学反应前后都没有质和量的改变;2.只能促进热力学上允许进行的反应;只能促进热力学上允许进行的反应;3.只能加速可逆反应的速率,而不能改变反应的平衡点,只能加速可逆反应的速率,而不能改变反应
2、的平衡点,即不改变反应的平衡常数。即不改变反应的平衡常数。4.酶和一般催化剂都是通过降低反应活化能而使反应速酶和一般催化剂都是通过降低反应活化能而使反应速 率加快。率加快。第3页,共170页,编辑于2022年,星期六酶不同于一般催化剂的特点:酶不同于一般催化剂的特点:(一)酶的催化效率极高(一)酶的催化效率极高 通通常常比比非非催催化化反反应应高高1081012倍倍;比比一一般般催催化化剂剂高高 1071013倍。倍。催化剂催化剂每摩尔需活化能每摩尔需活化能无无18 000J18 000J胶态钯胶态钯11 700J11 700J过氧化氢酶过氧化氢酶2 000J2 000J过氧化氢分解反应所需活
3、化能过氧化氢分解反应所需活化能第4页,共170页,编辑于2022年,星期六催化剂催化剂每摩尔需活化能每摩尔需活化能无无18 000J18 000J胶态钯胶态钯11 700J11 700J过氧化氢酶过氧化氢酶2 000J2 000J第5页,共170页,编辑于2022年,星期六(二)酶具有高度特异性(二)酶具有高度特异性(二)酶具有高度特异性(二)酶具有高度特异性 1 1绝绝绝绝对对对对特特特特异异异异性性性性:有有有有的的的的酶酶酶酶只只只只能能能能作作作作用用用用于于于于特特特特定定定定结结结结构构构构的的的的底底底底物物物物,进进进进行行行行一一一一种种种种专专专专一一一一的的的的反反反反应
4、应应应生生生生成成成成特特特特定定定定结结结结构构构构的的的的产产产产物物物物,称之为绝对特异性(称之为绝对特异性(称之为绝对特异性(称之为绝对特异性(absolute specificityabsolute specificity)。)。)。)。2 2相相相相对对对对特特特特异异异异性性性性:大大大大多多多多数数数数酶酶酶酶作作作作用用用用于于于于一一一一类类类类化化化化合合合合物物物物或或或或一一一一种种种种化化化化学学学学键键键键,这这这这种种种种不不不不太太太太严严严严格格格格的的的的选选选选择择择择性性性性称称称称为为为为相相相相对对对对特特特特异性(异性(异性(异性(relativ
5、e specificityrelative specificity)。)。)。)。第6页,共170页,编辑于2022年,星期六绝对特异性绝对特异性第7页,共170页,编辑于2022年,星期六相对特异性相对特异性 图图5-9 5-9 蔗糖酶的水解作用蔗糖酶的水解作用第8页,共170页,编辑于2022年,星期六3立体异构特异性:一些酶仅能催化一种立体异构体进立体异构特异性:一些酶仅能催化一种立体异构体进行反应,或其催化的结果只产生一种立体异构体,酶对行反应,或其催化的结果只产生一种立体异构体,酶对立体异构物的选择性称为立体异构特异性立体异构物的选择性称为立体异构特异性(stereospecific
6、ity)。)。图图5-11 5-11 乳酸脱氢酶的立体异构特异性乳酸脱氢酶的立体异构特异性第9页,共170页,编辑于2022年,星期六主要内容主要内容 单底物酶处反应动力学单底物酶处反应动力学 酶的分离纯化酶的分离纯化第10页,共170页,编辑于2022年,星期六单底物酶促反应动力学单底物酶促反应动力学酶动力学是研究酶促反应的速度问题,即研究各种因素对酶促反应速度的影响。酶动力学理论与实验在生物化学领域,特别在酶学研究中,有十分重要的作用。例如,根据某些因素对酶促反应速度的影响,可推断该酶促反应的机制。又例如,要准确测定酶活力单位,就需要对最佳反应条件及各种因素的影响进行研究。酶促反应有单底物
7、反应和多底物反应之分。单底物酶促反应包括异构酶、水解酶及大部分裂合酶催化的反应。第11页,共170页,编辑于2022年,星期六各种因素对酶反应速度的影响各种因素对酶反应速度的影响2、底物浓度、底物浓度3、pH (最适(最适 pH的概念)的概念)4、温度温度 (最适温度的概念)(最适温度的概念)5、激活剂、激活剂6、抑制剂、抑制剂1、酶浓度、酶浓度当当S足够过量,其它条件固定且无不利因素时,足够过量,其它条件固定且无不利因素时,v=kE第12页,共170页,编辑于2022年,星期六第一节第一节 动力学方程推导动力学方程推导酶反应的基本动力学关系,是指酶反应速度与酶酶反应速度与酶和底物间和底物间的
8、动力学关系。因为酶和底物是构成酶反应系统最基本的因素,它们决定酶反应的基本性质、酶反应的速度规律,而其他各种因素也正是通过它们产生影响的;而且,这种动力学关系是整个酶反应动力学的基础。描写这种基本动力学关系的是米氏方程米氏方程(Michaelis-Mentenequation)。v=vmaxS/(Km+S)第13页,共170页,编辑于2022年,星期六单分子酶促反应的米氏方程及单分子酶促反应的米氏方程及Km推导推导原则原则:从酶被底物饱和的现象出发,按照从酶被底物饱和的现象出发,按照 “稳态平稳态平 衡衡”假说的设想进行推导。假说的设想进行推导。米氏方程米氏方程:米氏常数米氏常数:第14页,共
9、170页,编辑于2022年,星期六米米氏氏方方程程的的推推导导令令:将将(4)代入代入(3),则,则:ES生成速度生成速度:,ES分解速度分解速度:即即:则则:(1)经整理得经整理得:由于酶促反应速度由由于酶促反应速度由ES决定,即决定,即,所以所以(2)将将(2)代入代入(1)得得:(3)当酶反应体系处于当酶反应体系处于恒态恒态时时:当当Et=ES时时,(4)所以所以第15页,共170页,编辑于2022年,星期六酶反应速度与底物浓度的关系曲线酶反应速度与底物浓度的关系曲线第16页,共170页,编辑于2022年,星期六当底物浓度较低时当底物浓度较低时反应速度与底物浓度成正比。反应速度与底物浓度
10、成正比。SVVmax目目 录录第17页,共170页,编辑于2022年,星期六随着底物浓度的增高随着底物浓度的增高反应速度不再成正比例加速。反应速度不再成正比例加速。SVVmax目目 录录第18页,共170页,编辑于2022年,星期六当底物浓度高达一定程度当底物浓度高达一定程度反应速度不再增加,达最大速度。反应速度不再增加,达最大速度。SVVmax目目 录录第19页,共170页,编辑于2022年,星期六第二节第二节实验数据的处理实验数据的处理分析酶促反应速度的作图法分析酶促反应速度的作图法一、一、Lineweaver-Burk法法(双倒数作图法双倒数作图法)将实验所得的一些初速度数据将实验所得的
11、一些初速度数据v和和S取倒数,得各种取倒数,得各种1/v和和1/S,将将1/v对对1/S作图,得一直线。该直线纵截距作图,得一直线。该直线纵截距1/Vmax,斜率,斜率Km/Vmax,横截距,横截距-1/Km。应用双倒数作图法处理实验数据求。应用双倒数作图法处理实验数据求Km和和Vmax等动力学常数比较方便,也是最广泛应用的一种方法,但欲要获得较准确等动力学常数比较方便,也是最广泛应用的一种方法,但欲要获得较准确的结果,实验时必须注意底物浓度范围,一般所选底物浓度需在的结果,实验时必须注意底物浓度范围,一般所选底物浓度需在Km附近。附近。第20页,共170页,编辑于2022年,星期六1.下图是
12、根据S在0.332.0Km范围时的实验结果而作的双倒数图,从此图可准确地测量出-1/Km和1/Vmax等。S在0.332.0Km的范围的实验结果而作出的双倒数图。第21页,共170页,编辑于2022年,星期六2.如果所选底物浓度比Km大得多,则所得双倒数图的直线基本上是水平的。这种情况虽可测得1/Vmax,但由于直线斜率近乎零,-1/Km则难以测得。S在3.320Km的范围的实验结果而作出的双倒数图。第22页,共170页,编辑于2022年,星期六3.如果S比Km小得多,则所作双倒数图的直线与两轴的交点都接近原点,使-1/Km和1/Vmax,都难以测准。S在0.0330.2Km的范围的实验结果而
13、作出的双倒数图。第23页,共170页,编辑于2022年,星期六二、其它线性作图法二、其它线性作图法1.Hanes-Woolf作图法即把米氏方程重排成线性方程第24页,共170页,编辑于2022年,星期六2.Woolf-Augustinsson-Hofstee作图法作图法将米氏方程重排为线性方程:第25页,共170页,编辑于2022年,星期六3.Eadie-Scatchard作图法作图法将米氏方程重排为线性方程第26页,共170页,编辑于2022年,星期六以上三种作图法也应注意选择底物浓度,不要使S比Km高得多或低得多。上述几种线性作图法各有其优缺点。双倒数作图法应用最广泛。但此法有两个缺点:第
14、一,在vS图上,由相等增值而给出的等距离各点,在双倒数图上变成非等距离的点,且多数点集中在1/v轴附近,而远离1/v轴的地方只有少数几个点,恰好这些点又正是主观目测以确定直线最权重的那些点。第二,在测定v时产生的小误差,当取倒数时会放大。在低底物浓度下更为敏感,因在高1/S值所得的一两个不准确的点,会给图的斜率带来显著误差。第一个缺点可通过选择适当的S,使1/S为等距离增值而得到克服。对第二个缺点关键要注意在低底物浓度下使所测初速度误差尽可能减小。第27页,共170页,编辑于2022年,星期六S/v对S作图,S未取倒数。另两个线性作图法,v未取倒数。前者对等距离S增值所测数据作图较双倒数法更优
15、越。后者在低底物浓度下测定误差较大时使用,比其它方法更可靠。三、三、Eisenthal-Cornish-Bowden作图法作图法这是根据米氏方程的性质而提出的一种直接作图法。该法是把S值标在横轴的负半轴上,而把测得的v值标在纵轴上,然后把相应的v和S连成直线,这样所得的一簇直线交于一点,该交点坐标为Km和Vmax。第28页,共170页,编辑于2022年,星期六Lee和和Wilson改良双倒数方程对数据的处理改良双倒数方程对数据的处理改良的双倒数方程形式与双倒数方程相似,为其中是t这一段时间内的平均速度;为反应过程中底物浓度的算术平均值。由于积分方程对任何反应程度的数据处理都是准确的处理实验数据
16、的准确性如何,用可以通过与对比:第29页,共170页,编辑于2022年,星期六从以上计算可以看出,用改良的双倒数方程作图法处理实验数据时,即使反应已进行到30,所引入的误差也不过1左右。很明显,如果所有酶是饱和的,而且反应显著不可逆,而且没有产物抑制的情况,用改良双倒数法处理实验数据来测定Km和Vmax,可获得准确结果。如有必要,可用捕获剂或偶联酶使产物不断移去,迫使反应不可逆,并使产物抑制成为最小。第30页,共170页,编辑于2022年,星期六酶促反应速度的测定与酶的活力单位酶促反应速度的测定与酶的活力单位1、测定酶促反应的速度必需测初速度、测定酶促反应的速度必需测初速度2、酶活力、酶活力3
17、、酶活力的表示方法酶活力的表示方法4、酶活力测定方法酶活力测定方法:终点法终点法 动力学法动力学法 检测酶含量及存在,很难直接用酶的检测酶含量及存在,很难直接用酶的“量量”(质量、体积、(质量、体积、浓浓度度)来来表表示示,而而常常用用酶酶催催化化某某一一特特定定反反应应的的能能力力来来表表示示酶酶量量,即即用用酶酶的的活活力表示。力表示。酶催化一定化学反应的能力称酶活力,酶活力通常以最适条件下酶所催化的化酶催化一定化学反应的能力称酶活力,酶活力通常以最适条件下酶所催化的化学反应的速度来确定。学反应的速度来确定。第31页,共170页,编辑于2022年,星期六酶活力测定方法酶活力测定方法 终终点
18、点法法:酶酶反反应应进进行行到到一一定定时时间间后后终终止止其其反反应应,再再用用化学或物理方法测定产物或反应物量的变化。化学或物理方法测定产物或反应物量的变化。动动力力学学法法:连连续续测测定定反反应应过过程程中中产产物物底底物物或或辅辅酶酶的的变化量,直接测定出酶反应的初速度。变化量,直接测定出酶反应的初速度。第32页,共170页,编辑于2022年,星期六 酶活力的表示方法酶活力的表示方法活力单位活力单位(active unit)习惯单位(习惯单位(U):底物底物(或产物或产物)变化量变化量/单位时间单位时间 国际单位(国际单位(IU):1moL变化量变化量/分钟分钟 Katal(Kat)
19、:):1moL变化量变化量/秒秒比活力比活力=总活力单位总活力单位总蛋白总蛋白mg数数=U(或或IU)mg蛋白蛋白量度酶催化能力大小量度酶催化能力大小转换系数转换系数(Kcat)底物(底物(moL)/秒秒每个酶分子每个酶分子量度酶纯度量度酶纯度比活力比活力(specific activity)量度转换效率量度转换效率第33页,共170页,编辑于2022年,星期六第四第四节 酶的分析和检测一、酶促反应初速度随一、酶促反应初速度随Et的变化的变化酶促反应的初速度随Et的变化而变化。通常在离体测定条件下,Et一般为10-1210-7mol/L,而St为10-610-2mol/L。可将米氏方程转变为以
20、下形式:这样,当S为常数时,则初速度v与Et成正比。但一个酶促反应速度,常因S的改变而改变。因此反应时间必须尽可能短,使S几乎处于恒态(即只有5以下的底物形成产物),才能得到真正的初速度,v与Et之间的关系才会是线性的。第34页,共170页,编辑于2022年,星期六二、酶活力单位和比活力二、酶活力单位和比活力是指酶在一定作用条件下,单位时间内,使底物转化的量或产物生成的量。也就是说,酶量的多少是采用其催化能力来度量;换句话说,是采用酶催化反应的速度来度量,因为在适当的条件下,v vEE。为了使酶单位的文献报道能统一,并具有可比性,国际酶学会议曾制订了一个标准单位:在特定条件下,1分钟内能转化1
21、微摩尔底物所需的酶量为一个酶单位。所谓特定条件,温度定为25,pH、底物浓度等其它条件均定为最适条件。该酶单位称为国际单位IU)。酶制剂中的酶量一般用U/mg或U/ml等表示。酶的比活力(specificactivity)是指每毫克蛋白中所含的酶单位数,用U/mg蛋白表示。第35页,共170页,编辑于2022年,星期六三、酶的转换数三、酶的转换数转换数可用两种方法表示。其一是以分子活性(molecularactivity)来定义,即在最适条件下、每摩尔酶每分钟所转变的底物摩尔数(即每微摩尔酶的酶单位数)。其二是许多酶为寡聚体。含几个亚基,因此可用另一种方式来表示转换数,即在最适条件下,每摩尔活
22、性亚基或催化中心每分钟所转变的底物摩尔数。这两个值有时简单以min-1表示,即:酶的kp值约在50107min-1。碳酸酐酶是己知转换数最高的酶之一(36106min-1)。1/kp=1.7sec,即该酶一个催化周期为1.7微秒。第36页,共170页,编辑于2022年,星期六第五节第五节酶促反应的稳态前动力学酶促反应的稳态前动力学一、快反应技术一、快反应技术酶促反应动力学研究有两条途径:一是稳态动力学。它是监测整个反应,得到关于反应的笼统信息。二是稳态前动力学,它能更直接地研究整个反应中的基本步骤或部分反应,提供可用于分析复杂反应机制的更有效的数据,但需要特殊的仪器来测量快反应。所谓快反应,是
23、相对于普通的混合和观察方法所需要的时间而言。完成总反应量的一半,即所谓反应半时间,为秒或更短时间,则属快反应。采用手工混合启动反应,用普通的分光光度计等仪器所能测量的反应半时间为分和小时。而酶促反应常常是反应半时间短于一秒的快反应,采用普通方法是不行的。限制仪器测定能力的主要因素有:混合样品并充满反应池所需的时间,观察和记录变化所需的第37页,共170页,编辑于2022年,星期六时间。快速反应动力学技术因此应运而生,并得到不断发展。目前,甚至已能测定反应半时间与分子振动和转动所需时间相当的反应。化学反应半时间不可能短于10-11秒,故可认为已没有哪个化学反应是快得无法测定的。流动法和弛豫法,是
24、为研究溶液中快反应动力学而建立起来的方法。前者包括常流法、加速流动法、停流法和淬灭法;后者包括温度、压力、电磁场的跳变或周期性变化法等。由于这些方法采用与停流相似的液体处理系统和相同的快响应探测和数据采集系统,所以常在一台仪器上更换相应的附件实施上述多种测量,构成组合式仪器。第38页,共170页,编辑于2022年,星期六酶的分离纯化酶的分离纯化第39页,共170页,编辑于2022年,星期六 酶分离纯化的目的是使酶制剂产酶分离纯化的目的是使酶制剂产品达到应用所需的纯度。品达到应用所需的纯度。第40页,共170页,编辑于2022年,星期六分离纯化过程包括分离纯化过程包括3 3个基本步骤:个基本步骤
25、:1 1 抽提抽提2 2 纯化纯化3 3 制剂制剂第41页,共170页,编辑于2022年,星期六Crude product concentration versus selling price(Dwyer,1984)第42页,共170页,编辑于2022年,星期六某些生化物质在原料液中的某些生化物质在原料液中的浓度与价格的关系浓度与价格的关系(1984年年)物质名浓度(C)价格(P,)尿激酶51053108荧光素酶81032106胰岛素41019104头孢菌素10102乙醇11023101第43页,共170页,编辑于2022年,星期六在分离纯化中必须注意:在分离纯化中必须注意:1 1 防止酶的变
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