酶学基础知识.pptx
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1、一、酶的本质、组成、分类和命名一、酶的本质、组成、分类和命名酶的定义:由生物体活细胞产生的能加快反应速度酶的定义:由生物体活细胞产生的能加快反应速度的蛋白质及小分子的蛋白质及小分子RNARNA,是生物催化剂。,是生物催化剂。本质:本质:传统的酶(蛋白类酶):蛋白质传统的酶(蛋白类酶):蛋白质参与体内广泛参与体内广泛的的 生化反应生化反应核酶(核酸类酶):小分子核酶(核酸类酶):小分子RNA.RNA.参与参与RNARNA的剪的剪接接第1页/共136页酶的分子组成蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)(apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofactor)(cofactor
2、)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)(holoenzyme)单纯酶单纯酶 (simple enzyme)(simple enzyme)结构组成仅含氨基酸组分结构组成仅含氨基酸组分结合酶结合酶 (conjugated enzyme)(conjugated enzyme)J酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白决定反应的决定反应的决定反应的决定反应的特异性特异性特异性特异性J辅助因子辅助因子辅助因子辅助因子决定反应的决定反应的决定反应的决定反应的种类与性质种类与性质种类与性质种类与性质第2页/共136页辅助因子 a a 本身无催化作用本身无催化作用b b 负责运输转
3、移电子,原子等作用负责运输转移电子,原子等作用有些蛋白质具此作用称蛋白辅酶有些蛋白质具此作用称蛋白辅酶c c 可用透析法将辅助因子(辅酶)除去可用透析法将辅助因子(辅酶)除去d d 若辅助因子(辅基)以共价键和酶蛋白牢固结合,不易若辅助因子(辅基)以共价键和酶蛋白牢固结合,不易透析除去透析除去第3页/共136页金属酶金属酶(metalloenzyme)(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。失。金属激活酶金属激活酶(metal-activated enzyme)(metal-activated enzyme)金属离子为酶的活
4、性所必需,但与酶的结合金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。不甚紧密。辅助因子也可以是小分子有机化合物辅助因子也可以是小分子有机化合物 维生素或者维生素的衍生物维生素或者维生素的衍生物 第4页/共136页转移的基团转移的基团小分子有机化合物(辅酶或辅基)小分子有机化合物(辅酶或辅基)名称名称所含的维生素所含的维生素氢原子(质子)氢原子(质子)NAD(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸,辅酶苷酸,辅酶I尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP)之一)之一NADP(尼克酰胺腺嘌呤二(尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,辅酶核苷酸磷酸,辅酶II尼克酰胺(维生素尼克酰胺(维生素PP)之一)之一F
5、MN(黄素单核苷酸)(黄素单核苷酸)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)(黄素腺嘌呤二核苷酸)维生素维生素B2(核黄素)(核黄素)醛基醛基TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素)维生素维生素B1(硫胺素)(硫胺素)酰基酰基辅酶辅酶A(CoA)泛酸泛酸硫辛酸硫辛酸硫辛酸硫辛酸烷基烷基钴胺素辅酶类钴胺素辅酶类维生素维生素B12二氧化碳二氧化碳生物素生物素生物素生物素氨基氨基磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛吡哆醛(维生素吡哆醛(维生素B6之一)之一)甲基、甲烯基、甲炔基、甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基等一碳单位甲酰基等一碳单位四氢叶酸四氢叶酸叶酸叶酸某些辅酶(辅基)在催化中的作用第5页/
6、共136页酶可按其所催化的反应类型进行分类酶可按其所催化的反应类型进行分类(一)催化氧化还原反应的酶属于(一)催化氧化还原反应的酶属于氧化还原酶类氧化还原酶类 氧氧化化还还原原酶酶类类(oxidoreductasesoxidoreductases)包包括括催催化化传传递递电电子子和和氢氢、以以及及需需氧氧参参加加反反应应的的酶酶。例例如如,脱脱氢氢酶类、加氧酶类、过氧化物酶和过氧化氢酶等。酶类、加氧酶类、过氧化物酶和过氧化氢酶等。第6页/共136页(二)催化分子间基团转移的酶属于(二)催化分子间基团转移的酶属于转移酶类转移酶类转转移移酶酶类类(transferasestransferases)
7、包包括括将将磷磷酸酸基基从从ATPATP转转到到另另外外底底物物的的激激酶酶、加加无无机机磷磷酸酸使使化化学学键键断断裂裂的的磷磷酸酸化化酶酶,以以及及糖糖基基转转移移酶酶、转转氨氨酶等。酶等。第7页/共136页(三)(三)水解酶类水解酶类催化加水分解化学键催化加水分解化学键 水解酶类水解酶类(hydrolaseshydrolases)按其所水解的底物不同按其所水解的底物不同 根据它们的作用部位根据它们的作用部位 蛋白酶、酯酶、蛋白酶、酯酶、磷酸酶、糖苷酶、磷酸酶、糖苷酶、核酸酶核酸酶 外切酶、内切酶外切酶、内切酶 第8页/共136页(四)(四)裂合酶裂合酶催化移出化学基团并形成双键催化移出化
8、学基团并形成双键或相反的过程或相反的过程 裂合酶或裂解酶类裂合酶或裂解酶类(lyaseslyases)是指催化一分子非)是指催化一分子非水解地分裂成两个分子并留有双键,或相反的酶。水解地分裂成两个分子并留有双键,或相反的酶。如:脱水酶、脱羧酶、醛缩酶如:脱水酶、脱羧酶、醛缩酶 合酶合酶(synthasessynthases)催化反应方向相反,一个底物去掉双键,并与另一底物结合催化反应方向相反,一个底物去掉双键,并与另一底物结合形成一个分子的酶。形成一个分子的酶。第9页/共136页(五)催化分子异构体互变的酶类属于(五)催化分子异构体互变的酶类属于异构酶类异构酶类 异构酶类异构酶类(isomer
9、asesisomerases):催化分子内部基团):催化分子内部基团的位置互变、几何或光学异构体互变、以及醛酮互的位置互变、几何或光学异构体互变、以及醛酮互变的酶类。变的酶类。如:变位酶、如:变位酶、表构酶、表构酶、异构酶。异构酶。第10页/共136页(六)催化两分子结合成一分子并偶联有高(六)催化两分子结合成一分子并偶联有高能键的水解供能的酶类属于能键的水解供能的酶类属于连接酶或连接酶或合成酶类合成酶类DNADNA连连接接酶酶、氨氨基基酰酰-rRNA-rRNA合合成成酶酶、谷谷氨氨酰酰胺胺合合成成酶酶属属于于连连接接酶酶或或合合成成 酶酶 类类(ligasesligases或或synthet
10、asessynthetases)。)。第11页/共136页第12页/共136页酶可按其所催化的反应类型予以命名酶可按其所催化的反应类型予以命名(一)系统名称给出酶促反应的各种信息,(一)系统名称给出酶促反应的各种信息,但较繁琐但较繁琐 习习惯惯命命名名法法,一一般般是是按按酶酶所所催催化化的的底底物物命命名名,在在其底物英文名词上加后缀其底物英文名词上加后缀“asease”作为酶的名称。作为酶的名称。如:蛋白酶(如:蛋白酶(proteaseprotease)、磷酸酶()、磷酸酶(phosphatasephosphatase)第13页/共136页原则:原则:1 1,绝大多数依据其底物来命名。绝大
11、多数依据其底物来命名。催化水解蛋白质的称为蛋白酶。催化水解蛋白质的称为蛋白酶。2 2,某些酶根据其所催化的反应性质来命名。某些酶根据其所催化的反应性质来命名。水解酶催化底物分子水解。水解酶催化底物分子水解。3 3,有的结合上述两个原则来命名。有的结合上述两个原则来命名。琥珀酸脱氢酶是催化琥珀酸脱氢反应的酶。琥珀酸脱氢酶是催化琥珀酸脱氢反应的酶。4 4,有的还加上酶的来源或酶的其他特点。有的还加上酶的来源或酶的其他特点。胃蛋白酶、胰蛋白酶胃蛋白酶、胰蛋白酶 第14页/共136页系统命名法:EC:1.4.1.3 EC-enzyme commission 1.-类(氧化还原酶类)4.-亚类 1.-亚
12、-亚类 3.-亚-亚类中的排序系系统统命命名名法法根根据据酶酶所所催催化化的的整整体体反反应应,按按酶酶的的分分类对酶命名类对酶命名,每个酶都有一个名称和一个编号每个酶都有一个名称和一个编号 。第15页/共136页酶的分类酶的分类系统名称系统名称编号编号催化的反应催化的反应推荐名称推荐名称1.1.氧化还原氧化还原酶类酶类(S)-(S)-乳酸:乳酸:NADNAD+-氧化还原氧化还原酶酶EC1.1.1.27EC1.1.1.27(S)-(S)-乳酸乳酸+NAD+NAD+丙酮酸丙酮酸+NADH+H+NADH+H+L-L-乳酸脱乳酸脱氢酶氢酶2.2.转移酶类转移酶类L-L-丙氨酸:丙氨酸:-酮酮戊二酸氨
13、基转移戊二酸氨基转移酶酶EC2.6.1.2EC2.6.1.2L-L-丙氨酸丙氨酸+-酮戊二酸酮戊二酸 丙酮酸丙酮酸+L-+L-谷氨酸谷氨酸丙氨酸转丙氨酸转氨酶氨酶3.3.水解酶类水解酶类1,4-1,4-D-D-葡聚糖葡聚糖-聚糖水解酶聚糖水解酶EC3.2.1.1EC3.2.1.1水解有水解有3 3个以上个以上1,4-1,4-D-D-葡萄糖葡萄糖基的多糖中基的多糖中1,4-1,4-D-D-葡糖苷键葡糖苷键-淀粉酶淀粉酶4.4.裂合酶类裂合酶类D-D-果糖果糖-1,6-1,6-二磷二磷酸酸D-D-甘油醛甘油醛-3-3-磷酸裂合酶磷酸裂合酶EC4.1.2.13EC4.1.2.13D-D-果糖果糖-1
14、,6-1,6-二磷酸二磷酸 磷酸磷酸二羟丙酮二羟丙酮+D-+D-甘油醛甘油醛-3-3-磷酸磷酸果糖二磷果糖二磷酸醛缩酶酸醛缩酶5.5.异构酶类异构酶类D-D-甘油醛甘油醛-3-3-磷磷酸醛酸醛-酮酮-异构酶异构酶EC5.3.1.1EC5.3.1.1D-D-甘油醛甘油醛-3-3-磷酸磷酸磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮丙糖磷酸丙糖磷酸异构酶异构酶6.6.连接酶类连接酶类L-L-谷氨酸:氨连谷氨酸:氨连接酶(生成接酶(生成ADPADP)EC6.3.1.2EC6.3.1.2ATP+L-ATP+L-谷氨酸谷氨酸+NH+NH3 3 ADP+PADP+Pi i+L-+L-谷氨酰胺谷氨酰胺谷氨酸谷氨酸-氨连接酶氨连
15、接酶 酶的分类与命名举例酶的分类与命名举例 第16页/共136页(二)推荐名称简便而常用(二)推荐名称简便而常用 由于系统名称较烦琐,国际酶学委员会还由于系统名称较烦琐,国际酶学委员会还同时为每一个酶从常用的习惯名称中挑选出一同时为每一个酶从常用的习惯名称中挑选出一个推荐名称(个推荐名称(recommended namerecommended name)系统名称:系统名称:L-L-乳酸:乳酸:NADNAD+氧化还原酶氧化还原酶推荐名称:乳酸脱氢酶推荐名称:乳酸脱氢酶 第17页/共136页(三三)其它习惯归类命名法其它习惯归类命名法 1.1.单体酶和寡聚酶单体酶和寡聚酶单单体体酶酶通通常常仅仅由
16、由一一条条肽肽链链组组成成;体体内内多多数数酶酶是是由由相同或不同亚基组成的,称为寡聚酶。相同或不同亚基组成的,称为寡聚酶。大大多多数数寡寡聚聚酶酶是是代代谢谢途途径径的的关关键键酶酶,其其活活性性可可通通过多种方式进行调控。过多种方式进行调控。第18页/共136页按分子组成酶的分类:单体酶单体酶单体酶单体酶(monomeric enzyme)(monomeric enzyme)(monomeric enzyme)(monomeric enzyme):由由由由单条肽链单条肽链单条肽链单条肽链构成构成构成构成,仅具有三级结构的酶,多是水解酶仅具有三级结构的酶,多是水解酶仅具有三级结构的酶,多是水
17、解酶仅具有三级结构的酶,多是水解酶 。寡聚酶寡聚酶寡聚酶寡聚酶(oligomeric enzyme)(oligomeric enzyme)(oligomeric enzyme)(oligomeric enzyme):由由由由多个相同或不同亚基多个相同或不同亚基多个相同或不同亚基多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。以非共价键连接组成的酶。以非共价键连接组成的酶。以非共价键连接组成的酶。多酶体系(多酶体系(多酶体系(多酶体系(multienzyme system)multienzyme system)multienzyme system)multienzyme system):由由由由几种不
18、同功能的酶几种不同功能的酶几种不同功能的酶几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。彼此聚合形成的多酶复合物。彼此聚合形成的多酶复合物。彼此聚合形成的多酶复合物。多功能酶或串联酶多功能酶或串联酶多功能酶或串联酶多功能酶或串联酶 (multifunctional enzyme or tandem enzyme)(multifunctional enzyme or tandem enzyme)(multifunctional enzyme or tandem enzyme)(multifunctional enzyme or tandem enzyme):一些一些一些一些多酶体系多酶体系多酶体系多
19、酶体系在进化过程中由于在进化过程中由于在进化过程中由于在进化过程中由于基因的融合,基因的融合,基因的融合,基因的融合,多种不多种不多种不多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。第19页/共136页 (multienzyme system)(multienzyme system)(multienzyme system)(multienzyme system):由几种不同功能的由几种不同功能的由几种不同功能的由几种不同功能的酶彼此聚合
20、形成的多酶复酶彼此聚合形成的多酶复酶彼此聚合形成的多酶复酶彼此聚合形成的多酶复合物。合物。合物。合物。多酶体系多酶体系:第20页/共136页v一些多酶体系一些多酶体系在进化过在进化过程中由于程中由于基因的融合基因的融合,多,多种不同催化功能存在于一种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为条多肽链中,这类酶称为多功能酶。多功能酶。v由由单肽链单肽链构成的,含有构成的,含有若干个酶活性的结构域若干个酶活性的结构域v多功能酶或串联酶多功能酶或串联酶(multifunctional or tandem enzyme)(multifunctional or tandem enzyme):第21页/共
21、136页2.2.恒态酶和调节酶恒态酶和调节酶恒态酶是指构成代谢途径和物质转化体系基本组恒态酶是指构成代谢途径和物质转化体系基本组成成分的酶,其在细胞内的含量相对恒定,活性成成分的酶,其在细胞内的含量相对恒定,活性仅受基本反应动力学及组成因素的调节。仅受基本反应动力学及组成因素的调节。调调节节酶酶是是指指在在代代谢谢途途径径和和物物质质转转化化体体系系中中,起起调调节节作作用用的的关关键键酶酶,其其含含量量与与组组成成常常因因机机体体的的机机能能状况而改变,活性受多方调控。状况而改变,活性受多方调控。第22页/共136页3.3.组成酶与诱导酶组成酶与诱导酶组成酶是细胞中天然存在的酶,其合成速度恒
22、组成酶是细胞中天然存在的酶,其合成速度恒定,与环境变化及诱导物无关。定,与环境变化及诱导物无关。诱导酶是天然条件下酶的合成速度较低,一旦诱导酶是天然条件下酶的合成速度较低,一旦在底物或衍生物等诱导物存在时,酶蛋白的合在底物或衍生物等诱导物存在时,酶蛋白的合成速度激增,以适应环境的改变和需要。成速度激增,以适应环境的改变和需要。第23页/共136页二、酶的结构与功能二、酶的结构与功能酶的活性中心酶的活性中心酶的必需基团酶的必需基团酶原与酶的激活酶原与酶的激活同工酶同工酶第24页/共136页酶酶的的活活性性中中心心酶的活性中心第25页/共136页或称或称活性部位活性部位(active site)(
23、active site),指必需,指必需基团在一级结构上可能相距遥远,但在空间基团在一级结构上可能相距遥远,但在空间结构上彼此靠近,组成具有结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的特定空间结构的区域区域,能,能与底物特异结合与底物特异结合并并将底物转化为产将底物转化为产物。物。酶的活性中心酶的活性中心(active center)(active center)第26页/共136页1 1酶的活性中心由许多必需基团组成酶的活性中心由许多必需基团组成 必需基团必需基团(essential group)(essential group)酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团
24、中,与酶活性密切相关的化学基团。与酶活性密切相关的化学基团。常见的必需基团常见的必需基团 丝氨酸残基的丝氨酸残基的羟基羟基组氨酸残基的组氨酸残基的咪唑基咪唑基半胱氨酸残基的半胱氨酸残基的巯基巯基酸性氨基酸残基的酸性氨基酸残基的羧基羧基 第27页/共136页活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团(binding groupbinding group)与底物相结合与底物相结合与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalytic group)(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物转变成产物 位于活性中心以外,维持
25、酶活性中心应有位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。的空间构象所必需。活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团第28页/共136页底物活性中心以外的必需基团结合基团催化基团活性中心第29页/共136页2 2酶的活性中心是酶分子中具有三维结构的很小区域酶的活性中心是酶分子中具有三维结构的很小区域 组成酶活性中组成酶活性中心的必需基团在心的必需基团在一一级结构上可能相距级结构上可能相距很远很远,但在形成,但在形成三三级结构时相互接近级结构时相互接近,形成具有三维结构形成具有三维结构的区域,且多是酶的区域,且多是酶分子中的裂隙或凹分子中的裂隙或
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