蛋白质合成.ppt
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1、蛋白蛋白质合成合成生生物物的的遗遗传传信信息息以以密密码码的的形形式式储储存存在在DNA分分子子上上,表表现现为为特特定定的的核核苷苷酸酸排排列列顺顺序序。在在细细胞胞分分裂裂的的过过程程中中,通通过过DNA复复制制把把亲亲代代细细胞胞所所含含的的遗遗传传信信息息忠忠实实地地传传递递给给两两个个子子代代细细胞胞。在在子子代代细细胞胞的的生生长长发发育育过过程程中中,这这些些遗遗传传信信息息通通过过转转录录传传递递给给RNA,再再由由RNA通通过过翻翻译译转转变变成成相相应应的的蛋蛋白白质质多多肽肽链链上上的的氨氨基基酸酸排排列列顺顺序序,由由蛋蛋白白质质执执行行各各种种各各样样的的生生物物学学
2、功功能能,使使后后代代表表现现出出与与亲亲代代相相似似的遗传特征的遗传特征。后后来来人人们们又又发发现现,在在宿宿主主细细胞胞中中一一些些RNA病病毒毒能能以以自自己己的的RNA为为模模板板复复制制出出新新的的病病毒毒RNA,还还有有一一些些RNA病病毒毒能能以以其其RNA为为模模板板合合成成DNA,称称为为逆逆转转录录这这是是中中心心法法则则的的补补充。充。2020/12/242 翻译翻译 translation 中心法则指出,遗传信息的表达最终是中心法则指出,遗传信息的表达最终是合成出具有合成出具有特定特定氨基酸顺序的蛋白质,这种氨基酸顺序的蛋白质,这种以以mRNA上所携带的遗传信息上所携
3、带的遗传信息,到多肽链上所到多肽链上所携带的遗传信息的传递,就好象以一种语言携带的遗传信息的传递,就好象以一种语言翻译成另一种语言时的情形相似。翻译成另一种语言时的情形相似。以以mRNA为模板的蛋白质合成过程为为模板的蛋白质合成过程为 翻译。翻译。2020/12/243 生命以蛋白质为基础,所有生物都含有生命以蛋白质为基础,所有生物都含有蛋白质。地球上的生物体含有蛋白质。地球上的生物体含有1010-1011种种不同的蛋白质,各种生物都有其特殊的蛋不同的蛋白质,各种生物都有其特殊的蛋白质。白质。一个高等生物的细胞内约有一个高等生物的细胞内约有3000多种不多种不同的蛋白质,这些蛋白质分别担负着不
4、同同的蛋白质,这些蛋白质分别担负着不同的生物功能。的生物功能。一个正常生长的细胞内,时刻都在进行一个正常生长的细胞内,时刻都在进行着蛋白质的生物合成。新的蛋白质分子不着蛋白质的生物合成。新的蛋白质分子不断地合成出来,旧的蛋白质分子不断地被断地合成出来,旧的蛋白质分子不断地被更新。更新。2020/12/244 蛋白质合成非常复杂,真核生物细胞合成蛋白质需蛋白质合成非常复杂,真核生物细胞合成蛋白质需要要70多种多种核糖体蛋白质核糖体蛋白质,20多种活化氨基酸的多种活化氨基酸的酶酶,10多种多种辅助酶辅助酶和其他和其他蛋白质因子蛋白质因子参加,同时还要参加,同时还要100多多种种附加的酶类附加的酶类
5、、40多种多种tRNAtRNA、r RNA r RNA,总计有,总计有300多多种不同的大分子参与种不同的大分子参与多肽多肽的合成的合成。一个典型细菌细胞干重的35%物质参与蛋白质的合成过程。蛋白质合成速度非常惊人,大肠杆菌在蛋白质合成速度非常惊人,大肠杆菌在37OC蛋白蛋白质合成速度质合成速度15个个aa/s(45bp/s RNA,800bp/s DNA)。)。蛋白质合成要消耗大量能量,约占全部生物合成反应总耗能量的90%(由ATP、GTP提供)。原核生物和真核生物的合成机制相似。2020/12/245遗遗传传信信息息流流动动示示意意图图核糖体核糖体DNAmRNAtRNA原核生物:细菌中mR
6、NA转录翻译降解同时进行。0分钟分钟,转录开始;,转录开始;分钟分钟,核糖体开始,核糖体开始翻译;翻译;分钟分钟,5端端mRNA开始降解;开始降解;分钟分钟,RNA聚合酶聚合酶在在3端终止端终止;分钟,分钟,mRNA继续继续降解,核糖体完成降解,核糖体完成翻译。翻译。37OCmRNA转录速度45bp/s,蛋白质15aa/s,转录和翻译 5000bp mRNA相当于180KDa的蛋白质,整个过程需要2分钟.2020/12/246真核生物真核生物动物细胞中转录速度同细菌动物细胞中转录速度同细菌,45个核苷酸个核苷酸/秒秒,真真核生物很多基因很大核生物很多基因很大,转录一个转录一个10000bp基因
7、需基因需5分钟分钟,mRNA半衰期半衰期4-24小时小时.真核生物真核生物mRNA平均长度平均长度1500bp1分钟内分钟内,转录起始转录起始,5端被修饰端被修饰;6分钟分钟,3端被切割释放端被切割释放;20分钟分钟,3端加端加poly(A);25分钟分钟,mRNA被转运到细胞质被转运到细胞质;4小时小时,核糖体翻译核糖体翻译mRNA2020/12/247一、一、蛋白质的生物合成体系蛋白质的生物合成体系 q 原料原料:20种氨基酸种氨基酸q 模板模板:mRNA(信使核糖核酸)q 场所场所:核蛋白体:核蛋白体q 氨基酸的氨基酸的“搬运工具搬运工具”:tRNAq 酶与蛋白质因子酶与蛋白质因子:启动
8、、延长、终止因子:启动、延长、终止因子 q 能量能量:ATP、GTPq 无机离子无机离子 2020/12/248(原核生物)2020/12/2491、模板、模板mRNA mRNA(messenger RNA)是蛋白质生物合成过程中是蛋白质生物合成过程中直接直接指令指令氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体。氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体。原核生物和真核生物原核生物和真核生物mRNA的比较的比较每个mRNA分子带有多于一条多肽链的遗传信息分子带有多于一条多肽链的遗传信息2020/12/24102020/12/2411 (1)遗传密码)遗传密码(genetic code)遗传密码遗传密码:DNAD
9、NA(或(或mRNAmRNA)中的核苷酸序列与蛋)中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的白质中氨基酸序列之间的对应关系对应关系称为遗传密码称为遗传密码。密码子密码子(codon):):mRNAmRNA上每上每3 3个个相邻相邻的核苷酸编码的核苷酸编码蛋白质多肽链中的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为蛋白质多肽链中的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为一个密码子或三联体密码。一个密码子或三联体密码。P2952020/12/2412 (2)遗传密码的特点)遗传密码的特点 通用性通用性:对所有生物都适用,部分生物的线粒体、叶绿体对所有生物都适用,部分生物的线粒体、叶绿体密码子除外;密码子除外;方向性方向性:
10、5端端3端;端;UAU、UAC酪氨酸、酪氨酸、CAU组氨酸组氨酸 连续性连续性:密码子与密码子之间是没有间隔的,阅读:密码子与密码子之间是没有间隔的,阅读密码子时从一个密码子时从一个特定的起点特定的起点一直读下去,中间不能留一直读下去,中间不能留空,碱基的插入或缺失可导致移码。空,碱基的插入或缺失可导致移码。不重叠性:不重叠性:密码是无标点符号的且相邻密码子互不密码是无标点符号的且相邻密码子互不重叠;重叠;。起始密码起始密码:5端第一个端第一个AUG表示起动信号,表示起动信号,并代表并代表甲酰蛋氨酸甲酰蛋氨酸(细菌细菌)或蛋氨酸或蛋氨酸(高等动物高等动物);终止密码终止密码:UAA、UAG或或
11、UGA(不编码氨基酸);(不编码氨基酸);2020/12/2413遗传密码字典遗传密码字典UACGUCAGUCAG第二位第二位 第一位第一位(5)第三位第三位(3)UCAGUCAGUCAG2020/12/2414一个氨基酸序列为Met-Leu亮-Arg精-Asn天冬酰胺-Ala丙-Val缬-Glu谷-Ser丝-Ile异亮-Phe苯丙-Thr苏的短肽的核糖核苷酸序列?(起始终止密码子)可能的序列:5AUG UUA CGU AAU GCU GUC GAA UCU AUU UUU ACA 5AUG UUA CGU AAU GCU GUC GAA UCU AUU UUU ACA UAA 3 原则:原则
12、:在在mRNA的序列中位于上游的潜在的序列中位于上游的潜在的起始位点(如的起始位点(如AUG)决定着阅读的框架)决定着阅读的框架起始密码?2020/12/2415 简并性简并性(degenerate):一个以上密码子体现一个氨基:一个以上密码子体现一个氨基酸遗传信息(酸遗传信息(Trp和和Met除外,仅有除外,仅有1个密码子个密码子)。其)。其原因是由于密码子与反密码子之间存在不稳定配对原因是由于密码子与反密码子之间存在不稳定配对(摆动性或摇摆性)。(摆动性或摇摆性)。对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子(Synonymous codon)密码的简并性可
13、以减少有害突变密码的简并性可以减少有害突变。摇摆性摇摆性(wobble):):mRNA密码子的第三个核苷密码子的第三个核苷酸(酸(3端)端)与与tRNA反密码子第一个核苷酸(反密码子第一个核苷酸(5端)端)配对时,有时不遵守严格的碱基配对原则,除配对时,有时不遵守严格的碱基配对原则,除A-U、G-C外,还可有其它配对方式。外,还可有其它配对方式。I(次黄嘌呤)(次黄嘌呤)是最常是最常见的摆动现象。见的摆动现象。2020/12/2416反密码子与密码子之间的碱基配对反密码子与密码子之间的碱基配对A UC G反密码子第一位碱基反密码子第一位碱基 密码子第三位碱基密码子第三位碱基GUCUAGIUCA
14、2020/12/24172、氨基酸的搬运工具、氨基酸的搬运工具tRNA v 一种一种tRNA可携带一种氨基酸;而一种氨基酸可由数可携带一种氨基酸;而一种氨基酸可由数种种tRNA携带携带(大肠杆菌(大肠杆菌60种,高等真核生物种,高等真核生物120-130种)种)(1)tRNA与蛋白质合成的功能区与蛋白质合成的功能区 氨基酸臂氨基酸臂与氨基酸结合与氨基酸结合 DHU环环与氨酰与氨酰-tRNA合成酶合成酶(忠实性和保守性忠实性和保守性)结合结合反密码环反密码环识别密码子识别密码子 TC环环.与核蛋白体结合与核蛋白体结合 (2)反密码子)反密码子(anticodon)tRNA反密码环中间的反密码环中
15、间的3个核苷酸,可与个核苷酸,可与mRNA密密码子配对码子配对。反密码子的第一位核苷酸(反密码子的第一位核苷酸(5端)常为端)常为I。P21P2992020/12/2418搬运工具搬运工具tRNA(核酸和氨基酸联系的适配器)(核酸和氨基酸联系的适配器)(核酸和氨基酸联系的适配器)(核酸和氨基酸联系的适配器)二级结构:五臂四环三叶草型二级结构:五臂四环三叶草型(二氢尿嘧啶环)(二氢尿嘧啶环)反密码环反密码环反密码子位点反密码子位点氨基酸臂氨基酸臂3tRNA与氨基酸结与氨基酸结合位点合位点核蛋白体的结合位点与氨酰与氨酰-tRNA合成酶合成酶结合结合氨基酸接受位点2020/12/2419搬运工具搬运
16、工具tRNA实验表明,tRNAtRNA必须具备倒必须具备倒必须具备倒必须具备倒“L”L”型的三级结构才具型的三级结构才具型的三级结构才具型的三级结构才具有携带氨基酰的功能有携带氨基酰的功能有携带氨基酰的功能有携带氨基酰的功能T-CG与核糖体与核糖体结合位点结合位点2020/12/2420搬运工具搬运工具tRNA适配器2020/12/2421 核糖体核糖体是由是由rRNA(ribosomal ribonucleic asid)和和多种蛋白质结合而成的一种大的核糖核蛋多种蛋白质结合而成的一种大的核糖核蛋白颗粒,蛋白质白颗粒,蛋白质肽键肽键的合成就是在这种核的合成就是在这种核糖体上进行的。糖体上进行
17、的。3、多肽链的、多肽链的装配机装配机核蛋白体核蛋白体 两类核蛋白体两类核蛋白体:结合型结合型:位于粗面内质网,合成分泌蛋白(含信号肽):位于粗面内质网,合成分泌蛋白(含信号肽).游离型游离型:游离于胞质中:游离于胞质中,参与细胞固有蛋白的合成参与细胞固有蛋白的合成2020/12/2422 (1)组成)组成:蛋白质蛋白质r RNA 真核生物核蛋白体(真核生物核蛋白体(40S+60S=80S)原核生物核蛋白体(原核生物核蛋白体(30S+50S=70S)mRNA结合部位结合部位:位于小亚基,序列特异识别:位于小亚基,序列特异识别受受位位(A位位):位位于于大大、小小亚亚基基结结合合处处,结结合合A
18、A-tRNA;给给位位(P位位):主主要要位位于于大大亚亚基基,结结合合肽肽酰酰-tRNA和和起始起始Met-tRNA,肽基转移部位肽基转移部位;转转肽肽酶酶中中心心、GTP:位位于于大大亚亚基基,形形成成肽肽键键的的部部位位。(2)功能区功能区核蛋白体核蛋白体2020/12/242316S rRNA5S rRNA23S rRNA30S subunit50S subunit70S prokaryoticribosome18S rRNA5S rRNA28S rRNA5.8S rRNA40S subunit60S subunit80S eukaryoticribosomeProkaryoticEu
19、karyoticL2L3L32S1S2S3S21L132 proteins oflarge subunit(L1 L32)21 proteins ofsmall subunit(S1 S21)L2L3L50S1S2S3S33L150 proteins oflarge subunit(L1 L50)33 proteins ofsmall subunit(S1 S33)核糖体的组成核糖体的组成2020/12/2424核蛋白体核蛋白体P位小亚基小亚基负责特异序列识别,起始部分识别、密码子与反密码子的相互作用等,负责特异序列识别,起始部分识别、密码子与反密码子的相互作用等,mRNA结合位点在小亚基上;
20、结合位点在小亚基上;大亚基大亚基负责氨基酸及携带等,功能:肽键的形成、负责氨基酸及携带等,功能:肽键的形成、AA-tRNA 与肽基与肽基tRNA结合等。结合等。A、P转肽酶中心主要在大亚基上。转肽酶中心主要在大亚基上。2020/12/2425 16SrRNA结构保守,全部压缩在全部压缩在30S小亚基小亚基内内,与小亚基中蛋白质结合成为小亚基的主要成分。16SrRNA 3端一段端一段ACCUCCUUA,与,与mRNA 5端翻译起始区富含嘌端翻译起始区富含嘌呤的序列互补,在呤的序列互补,在mRNA分子与小亚基结合时充当主要分子与小亚基结合时充当主要“接待者接待者”。在16SrRNA临近3端处还有一
21、段与23SrRNA互补的序列,在30S与50S亚基的结合中起作用。一些细菌和病毒一些细菌和病毒mRNA5端的富含嘌呤碱基的端的富含嘌呤碱基的SD核苷酸序列核苷酸序列核核蛋蛋白白体体(原(原(原(原核生核生核生核生物)物)物)物)与起始与起始tRNA配对的部位配对的部位与与16SrRNA配对部位配对部位R17噬菌体噬菌体A蛋白蛋白P3012020/12/2426大肠杆菌大肠杆菌5S、16S、23S rRNA分别含有120、1542、2904个核苷酸。5S rRNA一个区域含有保守序列一个区域含有保守序列CGAAC,功能功能:与:与tRNA分子分子T C 环上的环上的GT CG序列相互序列相互作用
22、的部位作用的部位另一个区域含有保守序列另一个区域含有保守序列GCGCCGAAUGGUAGU,与与 23SrRNA中一段序列互补,中一段序列互补,功能功能:5S rRNA与与50S核糖体大亚基相互作用的位点。核糖体大亚基相互作用的位点。23S rRNA50S大亚基34 protein有一段能与tRNA Met序列序列 互补的片段互补的片段23S rRNA靠近5端有一段12个核苷酸的序列与5S rRNA上的序列互补。上的序列互补。2020/12/2427核蛋白体核蛋白体(原核生物)(原核生物)(原核生物)(原核生物)多肽链34种蛋白质5021种蛋白质302020/12/2428核蛋白体核蛋白体(原
23、核生物)(原核生物)(原核生物)(原核生物)多核糖体多核糖体:一个:一个mRNA分子与一定数目的分子与一定数目的单个核糖体结合形成念珠状,每个核糖体单个核糖体结合形成念珠状,每个核糖体可以独立完成一条肽链合成。可以独立完成一条肽链合成。2020/12/2429原核细胞原核细胞70S核糖体的核糖体的A位、位、P位及位及mRNA结合部位示意图结合部位示意图anticodonanticodonanticodonCodonCodonCodon密码子密码子密码子密码子密码子密码子30S30S与与mRNA结合部位结合部位P P P P位位位位(结结合或接受肽合或接受肽基的部位)基的部位)A A A A位位
24、位位(结合或结合或接受接受AA-tRNA的部位)的部位)50S50S5 5 3 3 mRNAmRNA一个一个 核糖体中占有核糖体中占有2个个tRNA和和40bp长的长的mRNA2020/12/24304、辅助性蛋白、辅助性蛋白 在蛋白质的合成体系中,除了在蛋白质的合成体系中,除了mRNA、tRNA、rRNA和核糖体外,还需要一系和核糖体外,还需要一系列辅助因子,这些因子都是蛋白质。列辅助因子,这些因子都是蛋白质。2020/12/2431真核和原核细胞参与翻译的蛋白质因子真核和原核细胞参与翻译的蛋白质因子阶段阶段阶段阶段原核原核原核原核 真核真核真核真核 功功功功 能能能能IF1IF1IF2IF
25、2 eIF2 eIF2 参与起始复合物的形成参与起始复合物的形成参与起始复合物的形成参与起始复合物的形成IF3IF3 eIF3eIF3、eIF4CeIF4C起始起始起始起始CBP I CBP I 与与与与mRNAmRNA帽子结合帽子结合帽子结合帽子结合 因子因子因子因子eIF4A B F eIF4A B F 参与寻找第一个参与寻找第一个参与寻找第一个参与寻找第一个AUGAUGeIF5 eIF5 协助协助协助协助eIF2 eIF2、eIF3eIF3、eIF4CeIF4C的释放的释放的释放的释放eIF6 eIF6 协助协助协助协助60S60S亚基从无活性的核糖体上解离亚基从无活性的核糖体上解离亚基
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- 蛋白质 合成
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