-真核生物基因表达调控课件.ppt
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1、第八章第八章 真核生物基因真核生物基因 表达调控表达调控教学目的:教学目的:了解真核基因表达调控的特点了解转录前的调控,掌握增强子的作用特点掌握反式作用因子的DNA结合域的结构花式;了解转录后加工水平的调控方式,掌握可变剪接、反式剪接、RNA编辑的概念;了解翻译水平的调控方式及特点。第一节第一节 概述概述第二节第二节 转录水平转录水平的调控的调控第三节第三节 转录后加工水平转录后加工水平的调控的调控第四节第四节 翻译的调控翻译的调控第一节第一节 概述概述染色质结构染色质结构DNA的甲基化的甲基化第一节第一节 概述概述第二节第二节 转录水平的调控转录水平的调控第三节第三节 转录后加工水平的调控转
2、录后加工水平的调控第四节第四节 翻译的调控翻译的调控1 顺式作用元件顺式作用元件2 反式作用因子反式作用因子第二节第二节 真核基因转录水平的调控真核基因转录水平的调控1.1 启动子启动子启动子(启动子(promoter):):是一段提供是一段提供RNA聚合酶识别和结合聚合酶识别和结合的的DNA序列,它位于基因的上游。序列,它位于基因的上游。RNA聚合酶正是通过与它的结合而启动基因的转录。聚合酶正是通过与它的结合而启动基因的转录。*启动子的特征启动子的特征序列特异性序列特异性方向性方向性位置特性位置特性种属特异性种属特异性TTGACATATAAT转录起始点转录起始点53-35-1016-19 b
3、p5-9 bpT80A95T45A60A50T96T82T84G78A65C54A45原核生物的Promoter真核启动子含有不同的序列,不同序列的位置、种类、真核启动子含有不同的序列,不同序列的位置、种类、距离和方向都不完全相同;距离和方向都不完全相同;SV40 早期启动子早期启动子胸苷激酶胸苷激酶组蛋白组蛋白H2B-140 -120 -100 -80 -60 -40 -20 +1Oct CAAT GC TATA1.2 增强子增强子 EnhancerEnhancer又称远端上游序列远端上游序列(far upstream sequence)。最早最早SV40病毒中发现,可使旁侧基因转录提高病毒
4、中发现,可使旁侧基因转录提高100倍。倍。组成:组成:100-200bp,单拷贝或多拷贝串连形式,单拷贝或多拷贝串连形式存在。存在。正性调控元件,转录因子结合,促进转录。正性调控元件,转录因子结合,促进转录。增强子的作用特点:增强子的作用特点:促进基因的转录效率远距离发挥作用促进基因的转录效率远距离发挥作用 (100500bp,10Kb)促进转录,不具有启动子专一性促进转录,不具有启动子专一性功能与方向、位置无关功能与方向、位置无关具有组织或细胞特异性具有组织或细胞特异性对同源或异源基因均有功能。对同源或异源基因均有功能。1.4 转座子转座子转座子-跳跃基因跳跃基因的移动,有时候能够的移动,有
5、时候能够激活或抑制某些结构基因的表达。激活或抑制某些结构基因的表达。v一一组组受受到到共共同同调调控控的的基基因因,都都有有一一个个相相同同的的元元件件(序序列列),此此元元件件能能与与某某一一个个(类类)专专一一蛋蛋白白因因子子结结合合,使使基基因因对对其其作作出反应。出反应。1.5 效应元件效应元件(Response element):表表 真核生物的效应元件和相应的蛋白因子真核生物的效应元件和相应的蛋白因子调节剂调节剂效效应应元件元件保守序列保守序列DNADNA长度长度因子因子大小大小(DaDa)热激热激HSEHSECNNGAANNTCCNNGCNNGAANNTCCNNG27bp27bp
6、HSTFHSTF93,00093,000糖皮质激素糖皮质激素GREGRETGGTACAAATGTTCTTGGTACAAATGTTCT20bp20bp受体受体94,00094,000弗波酯弗波酯TRETRETGACTCATGACTCA22bp22bpAP1AP139,00039,000血清血清SRESRECCATATTAGGCCATATTAGG20bp20bpSRFSRF52,00052,000效应元件的特点:效应元件的特点:有短的保守顺序;有短的保守顺序;是启动子或增强子的上游元件。是启动子或增强子的上游元件。在不同基因中,拷贝相似,有时有多个拷在不同基因中,拷贝相似,有时有多个拷贝;贝;与转
7、录起点距离不固定。与转录起点距离不固定。类固醇激素信号类固醇激素信号接受金属刺激接受金属刺激增强子增强子应答佛波酯应答佛波酯应答元件应答元件肿瘤诱导剂肿瘤诱导剂1 顺式作用元件顺式作用元件2 反式作用因子反式作用因子第二节第二节 真核基因转录水平的调控真核基因转录水平的调控 2 反式作用因子(反式作用因子(trans-acting factors)反式作用因子反式作用因子:通过扩散自身表达产物(酶、通过扩散自身表达产物(酶、调节蛋白)控制其他基因的表达,调节蛋白)控制其他基因的表达,其编码基因其编码基因与其识别或结合的靶序列不在同一个与其识别或结合的靶序列不在同一个DNA分子分子上。上。包括:
8、包括:转录因子、转录因子、RNA聚合酶、调控蛋白等。聚合酶、调控蛋白等。2.1 反式作用因子的分类反式作用因子的分类2.2 反式作用因子的调控作用反式作用因子的调控作用(3)诱导型因子:诱导型因子:和和效应元件效应元件(特异调控序列特异调控序列)结合的结合的蛋白因子蛋白因子。表表 真核生物的效应元件真核生物的效应元件调节剂调节剂元件元件保守顺序保守顺序DNADNA长度长度作用因子作用因子大小大小(DaDa)热激热激HSEHSECNNGAANNTCCNNGCNNGAANNTCCNNG27bp27bpHSTFHSTF93,00093,000糖皮质激素糖皮质激素GREGRETGGTACAAATGTT
9、CTTGGTACAAATGTTCT20bp20bp受体受体94,00094,000弗波酯弗波酯TRETRETGACTCATGACTCA22bp22bpAP1AP139,00039,000血清血清SRESRECCATATTAGGCCATATTAGG20bp20bpSRFSRF52,00052,000蛋白质和蛋白质和DNA相互作用;相互作用;蛋白质和配基结合;蛋白质和配基结合;蛋白质之间的相互作用蛋白质之间的相互作用;蛋白质的修饰。蛋白质的修饰。2.2 反式作用因子的调控作用反式作用因子的调控作用DNA结合域结合域,binding domain,BD:100aa,大沟大沟转录激活域转录激活域,ac
10、tive domain,AD:30-100aa2.2.1 蛋白质和蛋白质和DNA相互作用相互作用(2)DNA结合域的结构花式结合域的结构花式/基元(基元(motif)锌指结构(锌指结构(Zinc finger)螺旋螺旋-转角转角-螺旋结构螺旋结构(helix-turn-helix,HTH)同源异形结构域同源异形结构域(Homeodomains,HD)螺旋螺旋-环环-螺旋结构螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)亮氨酸亮氨酸“拉链拉链”(leucine zipper)锌指(锌指(zinc finger)由一小组保守的由一小组保守的氨基酸氨基酸和锌离子和锌离子结合,形成了结合,形成了
11、相对独立的功能域,像相对独立的功能域,像一根根手指伸向一根根手指伸向DNA的的大沟大沟。有两种基本构型;有两种基本构型;-螺旋螺旋-折叠折叠 SP1SP1与与GC盒结合的转录因子盒结合的转录因子SP1中有连续中有连续的的3个锌指重复结构。个锌指重复结构。表表 带带有有Cis/His锌锌指指结结构的构的转录转录因子和因子和DNA结结合蛋白合蛋白蛋白蛋白来源来源大小大小指指结结合的合的DNA靶靶启启动动子子功能功能TFA哺乳哺乳动动物物37,000950bp5S基因基因pol 5S基因基因转录转录因子因子SP1哺乳哺乳动动物物105,000310bpGC boxpol II一般的一般的转录转录因子
12、因子ADR1果果蝇蝇150,000222bpADH2基因基因pol II激活激活ADH基因基因Kruppel果果蝇蝇60,0005??胚的分化胚的分化B.Cys2/Cys2B.Cys2/Cys2Zn2+与与4个个Cys结合结合共有序列:共有序列:Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys无大量重复性锌指无大量重复性锌指 表表 Cys2/Cys2型的作用因子型的作用因子蛋白蛋白大小大小指指靶靶糖皮糖皮质质激素受体激素受体94,0002GRE中中20bp雌激素受体雌激素受体66,0002ERE中中20bpGAL4(酵母酵母)99,0001UAS中中17bp例如:甾类激素受体家族例如:甾类激
13、素受体家族糖皮质激素特异性糖皮质激素特异性雌激素特异性雌激素特异性v甾类激素受体以二聚体形式发甾类激素受体以二聚体形式发挥其促进转录的作用。挥其促进转录的作用。v两个锌指的功能不同:两个锌指的功能不同:与与DNA结合结合形成二聚体形成二聚体(2)DNA结合域的结构花式结合域的结构花式/基元(基元(motif)锌指结构(锌指结构(Zinc finger)螺旋螺旋-转角转角-螺旋结构螺旋结构(helix-turn-helix,HTH)同源异形结构域同源异形结构域(Homeodomains,HD)螺旋螺旋-环环-螺旋结构螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)亮氨酸亮氨酸“拉链拉链”(l
14、eucine zipper)螺旋螺旋-转角转角-螺旋螺旋(helix-turn-helix,HTH)至少有两个至少有两个螺旋,其间由短肽段形成的螺旋,其间由短肽段形成的转角连接,转角连接,二聚体形式存在,二聚体形式存在,距离正好相当于距离正好相当于DNA一个螺距(一个螺距(3.4nm),两个),两个螺旋刚螺旋刚好分别嵌入好分别嵌入DNA的深沟。的深沟。许多调控蛋白都有许多调控蛋白都有HTHHTHLacO的阻抑蛋白的阻抑蛋白阻遏蛋白与阻遏蛋白与cro蛋白蛋白CAP酵母接合型调控蛋白酵母接合型调控蛋白1,2玉米的玉米的Kn1水稻的水稻的OSH1(2)DNA结合域的结构花式结合域的结构花式/基元(基
15、元(motif)锌指结构(锌指结构(Zinc finger)螺旋螺旋-转角转角-螺旋结构螺旋结构(helix-turn-helix,HTH)同源异形结构域同源异形结构域(Homeodomains,HD)螺旋螺旋-环环-螺旋结构螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)亮氨酸亮氨酸“拉链拉链”(leucine zipper)编码编码60aa的序列,几乎存在于所的序列,几乎存在于所有真核生物中;有真核生物中;有有3个个-helix,H1与与H2平行平行H3位于大沟中,与位于大沟中,与DNA特异结合特异结合N端多余臂部分与小沟结合,稳定端多余臂部分与小沟结合,稳定性高。性高。同源异形结构域
16、(同源异形结构域(Homeodomains,HD)HD与与HTH的不同:的不同:(1)HD的的C端由端由3个个-螺旋构成,螺旋螺旋构成,螺旋3结合于结合于大沟;大沟;而而HTH至少至少2个个-螺旋构成;螺旋构成;(2)HD以单体形式与以单体形式与DNA结合,靶序列不是回结合,靶序列不是回文结构,文结构,而而HTH以二聚体形式与以二聚体形式与DNA结合,靶序列结合,靶序列是回文结构。是回文结构。(2)DNA结合域的结构花式结合域的结构花式/基元(基元(motif)锌指结构(锌指结构(Zinc finger)螺旋螺旋-转角转角-螺旋结构螺旋结构(helix-turn-helix,HTH)同源异形结
17、构域同源异形结构域(Homeodomains,HD)螺旋螺旋-环环-螺旋结构螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)亮氨酸亮氨酸“拉链拉链”(leucine zipper)螺旋螺旋-环环-螺旋结构(螺旋结构(helix-loop-helix,HLH)4050aa含含2个个-helix(1516aa),由连接由连接区(区(1228aa)连接;)连接;两亲性;通过疏水面作用形成二聚两亲性;通过疏水面作用形成二聚体;体;NH2端为端为DNA结合区,结合区,16aa,其其中中6aa6aa为保守序列为保守序列。-COOH,每隔,每隔7个氨基酸出现一个氨基酸出现一个个Leu,所有,所有Leu出
18、现在同一侧出现在同一侧面,成直线排列,形成疏水面面,成直线排列,形成疏水面依靠依靠Leu的疏水作用的疏水作用,2个个helix 相互缠绕,相互缠绕,形成拉链结构形成拉链结构-NH2,富含碱性氨基酸,富含碱性氨基酸,螺旋状螺旋状,+,DNA结合域,结合域,与与DNA双螺旋链上带负双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合电荷的磷酸基团结合碱性碱性-亮氨酸拉链亮氨酸拉链(leucine zipper,ZIP)ZIP motif Y形结构形结构在真核生物中广泛存在在真核生物中广泛存在C/EBP 家族:家族:与增强子与增强子、CAAT盒结合GCN4 酵母激活因子酵母激活因子CREB(cAMP应答元件结合应答元件
19、结合蛋白)蛋白)2.2 反式作用因子的调控方式反式作用因子的调控方式(1)蛋白质和蛋白质和DNA相互作用相互作用 各种各种转录因子和顺式作用元件转录因子和顺式作用元件的的相互识别、相互相互识别、相互作用。作用。表表 哺乳动物哺乳动物RNA Pol启动子上游转录因子结合的序列元件启动子上游转录因子结合的序列元件顺式作用顺式作用元件元件保守顺序保守顺序DNA长度长度转录因子转录因子大小大小(Da)丰度(丰度(/细胞)细胞)分布分布TATA boxTATAAAA10bpTBP27,000?普遍普遍CAAT boxGGCCAATCT22bpCTF/NF160,000300,000普遍普遍GC boxG
20、GGCGG20bpSP1165,00060,000普遍普遍OctamerATTTGCAT20bpOct-176,000?普遍普遍OctamerATTTGCAT 23bpOct-252,000?淋巴细胞淋巴细胞KBGGGACTTTCC10bpNFKB44,000?淋巴细胞淋巴细胞 通常转录因子与通常转录因子与DNA的大沟内的碱基或磷酸的大沟内的碱基或磷酸接触,通过接触,通过a-螺旋的一个区域与螺旋的一个区域与DNA结合。结合。锌指结构锌指结构螺旋螺旋-转角转角-螺旋结构螺旋结构同源异形结构域同源异形结构域螺旋螺旋-环环-螺旋结构螺旋结构亮氨酸亮氨酸“拉链拉链”2.2 反式作用因子的调控方式反式作
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- 生物 基因 表达 调控 课件
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