大学生物化学课件 最全的.ppt
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1、大学生物化学课件最全的一一 蛋白质的结构和生物学功能蛋白质的结构和生物学功能(一)蛋白质的概述(一)蛋白质的概述v蛋白质(蛋白质(protein)是最基本的生命物质之一。是最基本的生命物质之一。v1、元素组成:平均含、元素组成:平均含N量约量约16%(特征代表)(特征代表)v2、基本结构单位:氨基酸、基本结构单位:氨基酸v3、大小:蛋白质是大分子化合物、大小:蛋白质是大分子化合物v4、空间结构:一级结构、二级结构、三级结构、空间结构:一级结构、二级结构、三级结构、四级结构四级结构v5、重要性:数量多、种类多、功能多、重要性:数量多、种类多、功能多v6、蛋白质的合成:、蛋白质的合成:AA顺序的遗
2、传编码顺序的遗传编码4.理化性质理化性质 (1)、物理性质:无色晶体、有味(甜、鲜、苦)、物理性质:无色晶体、有味(甜、鲜、苦)或无味,不同强度溶于水、稀酸、稀碱,但不溶于或无味,不同强度溶于水、稀酸、稀碱,但不溶于任何有机溶剂,酒精可使任何有机溶剂,酒精可使AA发生沉淀。发生沉淀。(2)、光学性质:具旋光性,有紫外吸收现象,)、光学性质:具旋光性,有紫外吸收现象,波长为波长为280nm,但仅有酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸但仅有酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸有此性质。有此性质。v除甘氨酸外,氨基酸均含有一个手性除甘氨酸外,氨基酸均含有一个手性-碳原子,因碳原子,因此都具有旋光性此都具有旋光性。比旋光度是
3、氨基酸的重要物理常。比旋光度是氨基酸的重要物理常数之一,是鉴别各种氨基酸的重要依据。数之一,是鉴别各种氨基酸的重要依据。(3 3)、两性解离:等电点)、两性解离:等电点)、两性解离:等电点)、两性解离:等电点PIPIAAAA分子所带的分子所带的分子所带的分子所带的净电荷为零(即分子内正电负电)时溶液的净电荷为零(即分子内正电负电)时溶液的净电荷为零(即分子内正电负电)时溶液的净电荷为零(即分子内正电负电)时溶液的PHPH值。值。值。值。PH 1 7 10净电荷净电荷 +1 0 -1 正离子正离子 两性离子两性离子 负离子负离子 等电点等电点PI(三)肽与肽键(三)肽与肽键 一个氨基酸的羧基与另
4、一个氨基酸的氨基之间一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基之间失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽。为肽。由两个氨基酸组成的肽称为由两个氨基酸组成的肽称为二肽二肽,由多个氨基酸,由多个氨基酸组成的肽则称为多肽。组成多肽的氨基酸单元称组成的肽则称为多肽。组成多肽的氨基酸单元称为为氨基酸残基氨基酸残基。1.1.肽键肽键(peptide bondpeptide bond):肽肽键键的的特特点点是是氮氮原原子子上上的的孤孤对对电电子子与与羰羰基基具具有有明显的共轭作用。明显的共轭作用。组成肽键的原子处于同一平面。组成肽键的原子处于同一平面。0.1270
5、.127nmnm键长键长=0.132=0.132nmnm 0.148nm0.148nm2.2.肽链中肽链中AAAA的排列顺序和命名的排列顺序和命名v在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为称为氨基酸顺序氨基酸顺序。v通常在多肽链的一端含有一个游离的通常在多肽链的一端含有一个游离的-氨基,称为氨基端或氨基,称为氨基端或N-N-端;在另一端含有一个游离的端;在另一端含有一个游离的-羧基,称为羧基端或羧基,称为羧基端或C-C-端。端。v氨基酸的顺序是从氨基酸的顺序是从N N端的氨基酸残基开始,以端的氨基酸残基开始,以C C端氨基酸残
6、基端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为:为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为:Ser-Val-Tyr-Asp-GlnSer-Val-Tyr-Asp-Gln3.3.肽的颜色反应肽的颜色反应v多多肽肽可可与与多多种种化化合合物物作作用用,产产生生不不同同的的颜颜色色反反应应。这这些些显显色色反应,可用于多肽的定性或定量鉴定。反应,可用于多肽的定性或定量鉴定。如如黄黄色色反反应应,是是由由硝硝酸酸与与氨氨基基酸酸的的苯苯基基(酪酪氨氨酸酸和和苯苯丙丙氨氨酸酸)反应生成二硝基苯衍生物而显黄色。反应生成二硝基苯衍生物而显黄色。v多多肽肽的的双双缩缩脲脲反反应应是是多多肽肽特特有有的的颜颜色色
7、反反应应;双双缩缩脲脲是是两两分分子子的尿素经加热失去一分子的尿素经加热失去一分子NHNH3 3而得到的产物。而得到的产物。双缩脲双缩脲能够与碱性硫酸铜作用,产生兰色的铜能够与碱性硫酸铜作用,产生兰色的铜-双缩脲络合双缩脲络合物,称为双缩脲反应。含有两个以上肽键的多肽,具有与双物,称为双缩脲反应。含有两个以上肽键的多肽,具有与双缩脲相似的结构特点,也能发生双缩脲反应,生成紫红色或缩脲相似的结构特点,也能发生双缩脲反应,生成紫红色或蓝紫色络合物。蓝紫色络合物。这是多肽定量测定的重要反应。这是多肽定量测定的重要反应。(四)蛋白质的分子结构(四)蛋白质的分子结构1.蛋白质一级结构蛋白质一级结构v蛋白
8、质的一级结构蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组包括组成蛋白质的多肽链数目成蛋白质的多肽链数目.v多肽链的氨基酸数目、种类和顺序。多肽链的氨基酸数目、种类和顺序。v以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。v其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。白质生物功能的基础。2.蛋白质二级结构蛋白质二级结构v蛋白质的二级蛋白质的二级(Secondary)Secondary)结构是指多肽链的主链结构是指多肽链的主链在空间的排列在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。或规则的几何走向、
9、旋转及折叠。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。v主要有主要有-螺旋、螺旋、-折叠、折叠、-转角。转角。(1 1)、)、-螺旋螺旋v(1 1)螺旋走向,稳定以氢键连)螺旋走向,稳定以氢键连接,氢键与轴平行。接,氢键与轴平行。v(2 2)侧基)侧基R R伸向螺旋外侧。伸向螺旋外侧。v(3 3)棒状结构,高度压缩,紧)棒状结构,高度压缩,紧密排列。密排列。v(4 4)规律排列)规律排列v(5 5)由)由1 1条充分伸展的肽链的肽条充分伸展的肽链的肽键平面折叠成的右手螺旋。键平面折叠成的右手螺旋。v(6 6)每隔)每隔3.63.6个氨基酸残基螺
10、旋个氨基酸残基螺旋上升一圈,螺距上升一圈,螺距0.540.54nmnm。v(7 7)1 1个螺圈内有个螺圈内有1313个原子。个原子。v蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构(Tertiary Structure)是指在是指在二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。主链和侧链构象在内的特征三维结构。v维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水键,在蛋白离子键和范德华力等。尤其是疏水
11、键,在蛋白质三级结构中起着重要作用。质三级结构中起着重要作用。3.蛋白质三级结构蛋白质三级结构v蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构(Quaternary Structure)是指由多是指由多条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共价键条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式;各个亚基在这些蛋白质中的连接起来的结构形式;各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。v这种蛋白质分子中,最小的单位通常称为亚基或亚这种蛋白质分子中,最小的单位通常称为亚基或亚单位单位Subunit,它一般由一条肽链构成,无生理活它一般由一条肽链
12、构成,无生理活性;性;v维持亚基之间的化学键主要是疏水力。维持亚基之间的化学键主要是疏水力。v由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白;由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白;4.蛋白质四级结构蛋白质四级结构(五)蛋白质的性质(五)蛋白质的性质 1.蛋白质的两性解离和等电点蛋白质的两性解离和等电点v蛋白质与多肽一样,能够发生两性离解,也有等电蛋白质与多肽一样,能够发生两性离解,也有等电点。在等电点时,蛋白质的溶解度最小,在电场中点。在等电点时,蛋白质的溶解度最小,在电场中不移动。不移动。v在电场中,如果蛋白质分子所带正电荷多于负电荷,在电场中,如果蛋白质分子所带正电荷多于负电荷,净电荷为
13、正,则向负电极移动,反之,净电荷为负,净电荷为正,则向负电极移动,反之,净电荷为负,向正极移动,这种泳动现象称电泳。向正极移动,这种泳动现象称电泳。v蛋白质在等电点蛋白质在等电点PH条件下,不发生电泳现象,利用条件下,不发生电泳现象,利用蛋白质的电泳现象,可以将蛋白质的电泳现,可以蛋白质的电泳现象,可以将蛋白质的电泳现,可以将蛋白质进行分离纯化将蛋白质进行分离纯化。2.这是蛋白质特有的性质这是蛋白质特有的性质-胶体胶体。v由于蛋白质的分子量很大,它在水中能够形成由于蛋白质的分子量很大,它在水中能够形成胶体溶液。蛋白质溶液具有胶体溶液的典型性胶体溶液。蛋白质溶液具有胶体溶液的典型性质,如丁达尔现
14、象、布郎运动等。质,如丁达尔现象、布郎运动等。v由于胶体溶液中的蛋白质不能通过半透膜,因由于胶体溶液中的蛋白质不能通过半透膜,因此可以应用透析法将非蛋白的小分子杂质除去此可以应用透析法将非蛋白的小分子杂质除去 3.3.蛋白质的沉淀作用蛋白质的沉淀作用v蛋白质胶体溶液的稳定性与它的分子量大小、所带蛋白质胶体溶液的稳定性与它的分子量大小、所带的电荷和水化作用有关。的电荷和水化作用有关。v改变溶液的条件,将影响蛋白质的溶解性质改变溶液的条件,将影响蛋白质的溶解性质v在适当的条件下,蛋白质能够从溶液中沉淀出来。在适当的条件下,蛋白质能够从溶液中沉淀出来。v蛋白质的沉淀分为蛋白质的沉淀分为可逆沉淀可逆沉
15、淀和和不可逆沉淀不可逆沉淀。4.蛋白质的变性作用蛋白质的变性作用v天然蛋白质因受物理或化学因素的影响,分子构天然蛋白质因受物理或化学因素的影响,分子构象发生变化,致使蛋白质的理化性质和生物学功象发生变化,致使蛋白质的理化性质和生物学功能随之发生变化,但一级结构未遭破坏,这种现能随之发生变化,但一级结构未遭破坏,这种现象称为象称为变性作用变性作用。v变性后的蛋白质称为变性蛋白。变性后的蛋白质称为变性蛋白。v导致蛋白质变性的因素:热、紫外光、激烈的搅导致蛋白质变性的因素:热、紫外光、激烈的搅拌以及强酸和强碱等。拌以及强酸和强碱等。v类型:不可逆变性、可逆变性(可复性)类型:不可逆变性、可逆变性(可
16、复性)(六)蛋白质的生物学功能(六)蛋白质的生物学功能(1)作为酶,蛋白质具有催化功能。(2)作为结构成分,它规定和维持细胞的构造。(3)作为代谢的调节者(激素或阻遏物),它能 协调和指导细胞内的化学过程。(4)作为运输工具,它能在细胞内或者透过细胞 膜传递小分子或离子。(5)作为抗体,它起着保护有机体,防御外物入 侵的作用。二 核酸的结构和生物学功能 核酸是生物体内极其重要的生物大分子,是生命的最基本的物质之一。最早是瑞士的化学家米歇尔于1870年从脓细胞的核中分离出来的,由于它们是酸性的,并且最先是从核中分离的,故称为核酸。核酸的发现比蛋白质晚得多。核酸分为脱氧核糖核酸(简称DNA)和核糖
17、核酸(简称RNA)两大类,基本结构单位都是核苷酸(一)(一)核甘酸核甘酸v核苷酸是核苷的磷酸酯。作为核苷酸是核苷的磷酸酯。作为DNADNA或或RNARNA结构单结构单元的核苷酸分别是元的核苷酸分别是5-5-磷酸磷酸-脱氧核糖核苷和脱氧核糖核苷和5-5-磷酸磷酸-核糖核苷。核糖核苷。1.核甘核甘v糖与碱基之间的糖与碱基之间的C-NC-N键,称为键,称为C-NC-N糖苷键糖苷键2.组成核甘的戊糖组成核甘的戊糖v组成核酸的戊糖有两种。组成核酸的戊糖有两种。DNADNA所含的糖为所含的糖为-D-D-2-2-脱氧核糖;脱氧核糖;RNARNA所含的糖则为所含的糖则为-D-D-核糖。核糖。腺嘌呤腺嘌呤Ade
18、nine鸟嘌呤鸟嘌呤guanine尿嘧啶尿嘧啶uracil胞嘧啶胞嘧啶cytosine 胸腺嘧啶胸腺嘧啶thymine3.组成核甘的碱基组成核甘的碱基(二)(二)核酸的分子结构核酸的分子结构1.1.DNADNA的分子结构的分子结构(1 1)DNADNA的一级结构的一级结构v概念概念:DNADNA的一级结构是指的一级结构是指DNADNA分子中脱氧核苷酸的排列顺序。分子中脱氧核苷酸的排列顺序。不同的不同的DNADNA分子(或片段)其一级结构不同,即脱氧核苷酸排分子(或片段)其一级结构不同,即脱氧核苷酸排列顺序不同,也就是碱基排列顺序不同。列顺序不同,也就是碱基排列顺序不同。v意义:意义:遗传信息遗
19、传信息v基本结构单位基本结构单位:脱氧核糖核苷酸:脱氧核糖核苷酸v连接键连接键:3 3,5 5磷酸二酯键磷酸二酯键v书写及阅读方向书写及阅读方向:从:从5 5端到端到3 3端端(2)DNA的二级结构概念:DNA的二级结构是指DNA的双螺旋结构。DNADNA双螺旋结构双螺旋结构lDNADNA分子由两条分子由两条DNADNA单单链组成。链组成。lDNADNA的双螺旋结构是分的双螺旋结构是分子中两条子中两条DNADNA单链之间基单链之间基团相互识别和作用的结团相互识别和作用的结果。果。l双螺旋结构是双螺旋结构是DNADNA二级二级结构的最基本形式结构的最基本形式。.DNA.DNA双螺旋结构的特点双螺
20、旋结构的特点a.DNAa.DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称简称DNADNA单链单链)组成。组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反,即其。螺旋中的两条链方向相反,即其中一条链的方向为中一条链的方向为5353,而另一条链的方向为,而另一条链的方向为3535。vb.b.嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成
21、环平面成9090角角vC.C.螺旋横截面的直径约为螺旋横截面的直径约为2 2 nmnm,每条链相邻两个碱基平面之每条链相邻两个碱基平面之间的距离为间的距离为3.4 3.4 nmnm,每每1010个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈)高度为(即螺旋旋转一圈)高度为34 34 nmnm。vd.d.两条两条DNADNA链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键。碱基的相互结合具有严格的配对规律,即腺嘌形成的氢键。碱基的相互结合具有严格的配对规律,即腺嘌呤(呤(A A)与胸腺嘧啶(与胸腺嘧啶(T T)结合,鸟嘌
22、呤(结合,鸟嘌呤(G G)与胞嘧啶(与胞嘧啶(C C)结合,这种配对关系,称为碱基互补。结合,这种配对关系,称为碱基互补。A A和和T T之间形成两个氢之间形成两个氢键,键,G G与与C C之间形成三个氢键。之间形成三个氢键。v在在DNADNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。(3)(3)核酸的紫外吸收核酸的紫外吸收v在核酸分子中,由于在核酸分子中,由于嘌呤碱和嘧啶碱具有嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系,因而共轭双键体系,因而具有独特的紫外线吸具有独特的紫外线吸收光谱,一般在收光谱,一般在260260nmnm左右有最大吸左右有最大吸收峰,可以
23、作为核酸收峰,可以作为核酸及其组份定性和定量及其组份定性和定量测定的依据测定的依据(4)(4)核酸的变性与复性核酸的变性与复性v A.A.核酸的变性核酸的变性v核酸的变性是指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢核酸的变性是指核酸双螺旋区的多聚核苷酸链间的氢键断裂,变成单链结构的过程。变性核酸将失去其部键断裂,变成单链结构的过程。变性核酸将失去其部分或全部的生物活性。核酸的变性并不涉及磷酸二酯分或全部的生物活性。核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,所以它的一级结构键的断裂,所以它的一级结构(碱基顺序碱基顺序)保持不变。保持不变。v能够引起核酸变性的因素很多。温度升高、酸碱度改能够引起核酸变性的因素很
24、多。温度升高、酸碱度改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变性。RNARNA本身只有局部的双螺旋区,所以变性行为所引起的性本身只有局部的双螺旋区,所以变性行为所引起的性质变化没有质变化没有DNADNA那样明显。那样明显。v利用紫外吸收的变化,可以检测核酸变利用紫外吸收的变化,可以检测核酸变性的情况。性的情况。v而而RNARNA变性后,约增加变性后,约增加1.1%1.1%。这种现象称。这种现象称为增色效应。为增色效应。v变性变性DNADNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以在适当的条件下,两条彼此分开的单链可以重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性
25、。重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复性。DNADNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复。般只能得到部分的恢复。vDNADNA复性的程度、速率与复性过程的条件有关。复性的程度、速率与复性过程的条件有关。v将热变性的将热变性的DNADNA骤然冷却至低温时,骤然冷却至低温时,DNADNA不可能复性。不可能复性。但是将变性的但是将变性的DNADNA缓慢冷却时,可以复性。缓慢冷却时,可以复性。分子量越分子量越大复性越难。浓度越大,复性越容易。此外,大复性越难。浓度越大,复性越容易。此外,DNADNA的的复性也与它本身的组成和结
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