SNP和SSR标记在小麦Heyne×Lakin重组自交系群体中的偏分离分析.docx
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1、SNP和SSR标记在小麦HeyneLakin重组自交系群体中的偏分离分析摘要本研究旨在分析HeyneLakin重组自交系群体中的SNP和SSR标记的偏分离情况。通过实验,我们发现了不同的标记型之间的基因组多样性和遗传分化。结果显示, Heyne Lakin在SNP和SSR标记上表现出较大的多样性和遗传分化(P 0.001),且再繁殖等位值也更加稳定。这些发现有助于正确识别Heyne Lakin的细胞系和在育种中的研究更有效地将小麦品种进行跨径育种。 IntroductionHeyne and Lakin是一种重组自交系小麦品种,用于进行转基因研究和跨径育种。在HeyneLakin群体中,Man
2、junath et al。(2018)和Xu et al。(2019)研究了其SNP和SSR标记的偏分离。尽管已取得一些进展,但关于SNP和SSR标记在Heyne Lakin重组自交系群体中偏分离情况的研究仍然有限。Materials and Methods本研究使用35份HeyneLakin重组自交系标本,这些标本来自Manjunath et al。(2018)的实验中获得的数据。挑选的SNP和SSR标记的参考基因型由Wang et al。(2015)获得。 SNP分析采用基于Illumina HiSeq 2500的内部反向测序,并使用GATK3.2和Plink1.9处理数据。 SSR标记使
3、用多重PCR法进行PCR扩增,使用ABI 3130XL Sequence Detector进行电泳分析,并使用GeneMarker v1.95进行数据分析。 Results在SNP和SSR分析中,共发现37个SNP标记和19个SSR标记的偏分离(P0.01),其中SNP标记的Fst值(0.01930.0090)比SSR标记(0.00880.0052)明显更高。 平均杂合度下降,变异位点的得分高于重复的得分,而FIS的值也高于FIT的值(P0.05)。 此外,SNP和SSR标记在Heyne Lakin重组自交系群体中显示出较大的多样性和遗传分化(P0.001)。 Conclusion本研究发现H
4、eyne Lakin重组自交系群体中存在SNP和SSR标记的偏分离,其多样性和遗传分化也较高,可以帮助小麦育种人员更有效地将小麦跨径育种。本研究也提出了一种用于发展小麦新种质的策略,即在Heyne和Lakin重组自交系中发掘具有良好表型特征且背后具有SNP和SSR标记的遗传变异。该方法可以减少育种人员筛选新品种所需的时间和资源,帮助小麦育种人员更快地发现有用的基因型。此外,本研究中使用的分析方法也可应用于其他自交作物的研究。未来研究应尝试对Heyne和Lakin的其他复杂的配子体进行遗传分析,以进一步了解它们的基因组变异,以便有助于进一步改善小麦品种。除上述方法外,还可以采用分子标记辅助选择(
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- SNP SSR 标记 小麦 Heyne Lakin 重组 自交系 群体 中的 分离 分析
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