第八章现代生物技术在抗生素工业中的应用.ppt
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1、第八章现代生物技术在抗生素工业中的应用传统育种方法与现代生物技术传统育种方法与现代生物技术在制药工业中的比较在制药工业中的比较传统的育种方法:要用经典的方法育种盲目性高不能组合不同菌株的优良性状现代生物技术:基因重组改造菌种提高产品产量改造传统的发酵生产工艺,节约能源和原料,降低污染诱变育种采用诱变因子促使微生物遗传物质发生改变,从而导致其性能改善到菌种优化方法物理诱变因子物理诱变因子 紫外线、射线 化学诱变剂化学诱变剂 化学因子如碱基类似物、5氟尿嘧啶、烷化剂等突变是随机过程,筛选过程大,不能增加拷贝数突变是随机过程,筛选过程大,不能增加拷贝数现代生物技术:理性化育种现代生物技术:理性化育种
2、建立在微生物生理代谢理建立在微生物生理代谢理论和抗生素合成机理基础论和抗生素合成机理基础上,有目的调节产生菌生上,有目的调节产生菌生理代谢、调节生物合成途理代谢、调节生物合成途径或改造其生物合成基因径或改造其生物合成基因结构到育种。结构到育种。链霉菌为主到次级代谢产链霉菌为主到次级代谢产物产生菌到基因克隆表达物产生菌到基因克隆表达宿主系统日益完善宿主系统日益完善新观点:系统代谢工程改造菌种Park JH,et al.Current Opinion in Biotechnology,2008,19:454-460System Metabolic Engineering大量引进国外高产菌株大量引进
3、国外高产菌株 我国至今用于大规摸工业生产的生产菌株,如青霉素、红霉素、头C、各种氨基酸、阿维霉素、泰乐霉素、黄霉素以及高表达水平的基因工程产品等几乎都是从国外高价引进。因此,从根本意义上来说,我国的传统生物制药工业和现代生物技术产业缺乏竞争力。现代生物技术改造传统制药工业现代生物技术改造传统制药工业抗生素提高产量和改善组分产生新的杂合抗生素Olano C et al.Metabolic Engineering 2008,10:281-292.红霉素全基因组序列红霉素全基因组序列现代生物技术改造传统制药工业现代生物技术改造传统制药工业氨基酸获得高产菌种缬氨酸组氨酸苏氨酸异亮氨酸缬氨酸高产菌种代谢
4、工程改造现代生物技术改造传统制药工业现代生物技术改造传统制药工业维生素:获得高产菌种简化生产工艺维生素Cl我国发明了维生素C两步发酵法,使中国维生素C生产技术居世界先进水平 l维生素C产量5万吨以上,占全球产量的40%背 景20世纪70年代,重组DNA技术兴起应用于医药蛋白多肽方面,取得了突出的效果.80年代,重组DNA技术应用于结构比较复杂的次级代谢产物的生物合成.(链霉菌)目前,抗生素生物合成酶基因的分离,质粒的选择,基因重组于转移和宿主表达.(已克隆的抗生素合成基因有23种之多)基因工程在抗生素生产中的应用基因工程在抗生素生产中的应用第一节 重组DNA技术在抗生素生产中的应用重组重组DN
5、ADNA技术技术是指将一种生物体(是指将一种生物体(供体供体)的基因与)的基因与载体载体在在体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(受体受体)内,)内,使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的DNADNA体外操作程序,也称为体外操作程序,也称为分子克隆技术分子克隆技术。因此,因此,供体供体、受体受体、载体载体是重组是重组DNADNA技术的三大基本元件。技术的三大基本元件。抗生素生物合成并非单一基因的直接产物,而是由初级抗生素生物合成并非单一基因的直接产物,而是由初级代谢产物经过一系列酶催化产生的
6、次级代谢产物,其形成代谢产物经过一系列酶催化产生的次级代谢产物,其形成过程是一个复杂的、多因素调节的过程过程是一个复杂的、多因素调节的过程 传统的提高微生物产生抗生素能力的方法主要是用诱传统的提高微生物产生抗生素能力的方法主要是用诱变剂(如紫外线、化学诱变剂等)处理微生物,获得生产变剂(如紫外线、化学诱变剂等)处理微生物,获得生产能力较高的突变株。能力较高的突变株。8080年代,人们开始将年代,人们开始将DNADNA重组技术应用重组技术应用于次级代谢产物的生物合成上;通过生物合成酶基因的分于次级代谢产物的生物合成上;通过生物合成酶基因的分离、质粒的选择、基因重组与转移、宿主表达等方面。离、质粒
7、的选择、基因重组与转移、宿主表达等方面。传统发酵法的弊端:传统发酵法的弊端:采用经典方法育种,采用经典方法育种,盲目性高,无法集合不同菌株的优良性状。盲目性高,无法集合不同菌株的优良性状。基因重组技术的优点:基因重组技术的优点:可以定向改造菌种,可以定向改造菌种,且能集多个菌株的多种优良性状于同一菌且能集多个菌株的多种优良性状于同一菌株,达到简化工艺、提高产品质量和产量株,达到简化工艺、提高产品质量和产量的目的。的目的。一、克隆抗生素生物合成基因的方法1.1.抗生素(链霉素)生物合成基因的结构特点抗生素(链霉素)生物合成基因的结构特点链霉菌抗生素生物合成基因组的一个典型特性是链霉菌抗生素生物合
8、成基因组的一个典型特性是G-CG-C碱碱基组成,基组成,(G+CG+C)%高达高达70%70%以上;且三联体密码子中第以上;且三联体密码子中第3 3个碱基个碱基G G、C C比例极高比例极高抗生素生物合成基因大多处于一个基因族中抗生素生物合成基因大多处于一个基因族中抗生素生物合成基因除定位在染色体上外,有的定位于抗生素生物合成基因除定位在染色体上外,有的定位于质粒上质粒上2.克隆抗生素生物合成基因的方法1)阻断变株法2)突变克隆法3)直接克隆法4)克隆抗生素抗性基因法5)寡核苷酸探针法6)同源基因杂交法7)在标准宿主系统中克隆检测单基因产物1.阻断变株法阻断变株法 通过一系列阻断变株的互补结果
9、来确定被克隆的DNA片断的性质方法与步骤 野生型 突变型 筛选表型恢复型 分析基因 总DNA 基因库Tetracenomycin C(tam C)Tetracenomycin C(丁省霉素)是一个有淡青链霉菌产生的抗生素分离tamC的突变株 并 分析阻断性质野生型总DNA BamH1消化 连接到pIJ702分离tamC+克隆其基因2.突变克隆法ligation重组整合载体重组整合载体转化药物产生菌转化药物产生菌整合质粒或噬菌体整合质粒或噬菌体DNA片段片段发生整合,可能干发生整合,可能干扰某生物合成基因扰某生物合成基因说明这个生物合成基因说明这个生物合成基因发生了插入突变,这个发生了插入突变,
10、这个基因就是这个生物合成基因就是这个生物合成相关相关3.直接克隆法直接克隆法直接克隆整套的生物合成基因(适合于基因簇相对较小(30kb)的抗生素生物合成基因。局限:大片段基因簇的稳定性、原始株的重要的调控因素头霉素C基因的克隆筛选对C.terrigena抗性的菌株克隆其基因分别将转化子涂平板部分酶切链霉菌总DNA选择20-40kb的片段连接到pIJ943的Bgl位点 转化变青链霉菌1326筛选转化子(不产黑色素、硫链丝菌素抗性)检测产物:TLC,HPLC等 。根据抗生素生物合成基因和抗性基因是连锁的,表达上也是协同的,而且抗性基因比较小(1-2kb),容易检测和克隆。ligation重组载体重
11、组载体转化抗性敏感得抗转化抗性敏感得抗生素产生菌生素产生菌Vector药物产生药物产生菌菌DNA酶酶切片段切片段分析连锁得生物合成基分析连锁得生物合成基因因probe产生菌产生菌genomeabankhybrid分离与之同源并带分离与之同源并带有生物合成基因的有生物合成基因的DNA片段片段局限:有些抗生素不与合成基因连锁,并且可能抗性不止一个,所以分析比较复杂。4.克隆抗生素抗性基因法红霉素生物合成基因的克隆 得到阳性克隆分析表明:片段为35kb,含有所有红霉素生物合成基因和抗性基因Mbo1酶切产生菌总DNA与穿梭粘粒pKC462a连接分析片段转导大肠杆菌SF8形成转化子以含有红霉素抗性基因质
12、粒pIJ43为探针进行菌落原位杂交5.寡核苷酸探针法事实基础 链霉菌基因对密码子的利用有明显的不随机性,即DNA中G+C的比例为70%以上,密码子第三位有90%以上为G或C原理 分离抗生素生物合成酶后,获得这些酶的氨基酸序列,根据氨基酸序列推倒出较低程度简并性的基因序列,人工合成寡核苷酸探针,从基因文库中就可克隆生物合成基因6.同源基因杂交法原理 利用一种已克隆的抗生素生物合成基因片段为探针,探测相关抗生素同源基因,最后分离及克隆抗生素生物合成基因 由于基因保守序列的同源性,利用同源基因杂交法克隆化学结构类似的抗生素生物合成基因是比较快速准确的方法7.在标准宿主系统中克隆检测单基因产物鸟枪克隆
13、法 把抗生素产生菌的DNA克隆到最常用的宿主变青链霉菌中,通过检测宿主中的个别基因产物,筛选克隆,从而分离基因。利用鸟枪克隆法,把抗生素产生菌利用鸟枪克隆法,把抗生素产生菌DNADNA克隆到最常用的宿克隆到最常用的宿主主变青链霉菌中,通过检测宿主菌中个别基因产物,筛变青链霉菌中,通过检测宿主菌中个别基因产物,筛选克隆,从而分离到相应的基因。选克隆,从而分离到相应的基因。digestion质粒质粒genomeligationtransformHost-TestphenotypeShotgun抗生素基因簇的组成PABA合成酶基因pab的克隆受体菌BamH1连接供体菌:过量生产PABA的磺胺抗性的灰
14、色链霉菌 总DNA 筛选磺胺抗性转化子质粒转化分离基因克隆抗生素所用的方法二、几种典型的抗生素生物合成基因的结构红霉素红霉素:参与红霉素生物合成的基因长度为参与红霉素生物合成的基因长度为60kb60kb,整个基因由整个基因由2323个个ORF(open reading frame)组成。组成。中心部分约为中心部分约为35kb35kb,称为,称为eryAeryA,由,由3 3个个ORFORF(eryA eryA,eryA eryA,eryA eryA)组成,主要参与内酯组成,主要参与内酯环的合成。环的合成。eryFeryF编码细胞色素编码细胞色素P450P450单氧化酶,使单氧化酶,使6 6位原
15、子羟基化;位原子羟基化;”eryB”eryB”与与”eryC”eryC”是两组基是两组基因,分别与红霉素的形成和红霉内酯的因,分别与红霉素的形成和红霉内酯的3-O-3-O-红霉红霉糖苷化有关,及与红霉糖胺的形成或糖苷化有关,及与红霉糖胺的形成或3-O-3-O-红霉糖红霉糖苷化有关;苷化有关;eryK eryK编码编码C-12C-12羟基化酶。羟基化酶。AT-acyltransferase ACP-acyl carrier protein KS-ketosynthase KR-ketoreductase DH-dehydrtase ER-enoylreductase TE-thioesteras
16、脱氧红霉内酯脱氧红霉内酯B B脱氧红霉内酯脱氧红霉内酯B的生物合成的生物合成ORF1ORF2ORF3 青霉素青霉素:pcbCpcbC基因编码异青霉素基因编码异青霉素N N合成酶,合成酶,通过通过“反向遗传学反向遗传学”方法克隆方法克隆IPNSIPNS的的N N末端末端氨基酸序列,根据已知的氨基酸序列,以氨基酸序列,根据已知的氨基酸序列,以合成的寡核苷酸为探针,通过杂交来识别合成的寡核苷酸为探针,通过杂交来识别含有相关含有相关DNADNA序列的克隆体,经序列的克隆体,经DNADNA序列分序列分析发现了一个可读框,并能在大肠杆菌中析发现了一个可读框,并能在大肠杆菌中表达,这种重组大肠杆菌可产生表达
17、,这种重组大肠杆菌可产生IPNSIPNS,故,故证实已克隆到了证实已克隆到了pcbCpcbC基因。基因。按硫代模板机制进行。按硫代模板机制进行。ACVACV合酶合成合酶合成-氨基己二酸氨基己二酸-半胱氨酸半胱氨酸-D-D-缬氨酸三肽。由缬氨酸三肽。由IPNIPN合酶催化形成合酶催化形成异青霉素异青霉素N N。+ACV合酶合酶异青霉素异青霉素NIPN合酶合酶-氨基己二酸氨基己二酸-半胱氨酸半胱氨酸-D-缬氨酸三肽缬氨酸三肽异青霉素的生物合成异青霉素的生物合成青霉素和头孢菌素的生物合成青霉素和头孢菌素的生物合成三、提高抗生素产量的方法经典方法 通过物理或化学手段进行诱变育种得到高产菌株基因工程方法
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- 第八章 现代生物技术在抗生素工业中的应用 第八 现代 生物技术 抗生素 工业 中的 应用
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