重组DNA技术与基因组学.pptx
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1、第十七章第十七章 重组重组DNA技术与基因组学技术与基因组学 第一节第一节 DNA序列测定序列测定第二节第二节 重组重组DNA技术的基本操作原理技术的基本操作原理第三节第三节 重组重组DNA技术的应用技术的应用第四节第四节 基因组学和蛋白组学及研究技术简介基因组学和蛋白组学及研究技术简介DNADNA测序的基本策略测序的基本策略 设设法法产产生生带带标标记记的的不不同同长长度度的的成成套套DNADNA片片段段,各各带带有有标标记记的的片片段段起起点点相相同同、终终点点不不同同,使使待待测测的的DNADNA链链中中的的相相应应每每个个核核苷苷酸酸处处都都有有断断裂裂或或终终止止。通通过过PAGEP
2、AGE电电泳泳,能能够够将将相相差差一一个个核核苷苷酸酸的的DNADNA片片段段分分开开,放放射射自自显显影影后后,根根据据长长短短排排列列,根根据据特特定定末末端端碱碱基基的的DNADNA片片段段就就可可读读出出待待测测DNADNA的碱基序列。的碱基序列。双脱氧末端终止法双脱氧末端终止法 化学法化学法 测序技术进展测序技术进展+-Mark DNADNA测序的基本策略测序的基本策略 设设法法产产生生带带标标记记的的不不同同长长度度的的成成套套DNADNA片片段段,各各带带有有标标记记的的片片段段起起点点相相同同、终终点点不不同同,使使待待测测的的DNADNA链链中中的的相相应应每每个个核核苷苷
3、酸酸处处都都有有断断裂裂或或终终止止。通通过过高高分分辨辨率率的的电电泳泳,能能够够将将相相差差一一个个核核苷苷酸酸的的DNADNA片片段段分分开开,根根据据DNADNA片片段段长长短短排排列列顺顺序序及及其其末末端端碱碱基基就可读出待测就可读出待测DNADNA的碱基序列。的碱基序列。双脱氧末端终止法双脱氧末端终止法 化学法化学法 测序技术进展测序技术进展+-Mark 有相同的起点有相同的起点,不同终点的不同终点的一套一套DNADNA片段示意图片段示意图电泳图谱电泳图谱 双双脱脱氧氧末末端端终终止止法法测测序序原原理理酶酶反反应应电电泳泳方方向向模板模板CCGGTAGCAACT35GG53引物
4、引物dATPdCTPdGTPdTTP+ddATPdATPdCTPdGTPdTTP+ddTTPdATPdCTPdGTPdTTP+ddGTPdATPdCTPdGTPdTTP+ddCTPGGCCAGGCCATCGTTGAGGCGGCCGGCCATCGGCCATCGTTGGGCCATCGGGCCATGGCCATCGTGGCCATCGTTA C G TAGTTGCTACC35TCAACGATGG53读出模板读出模板互补序列互补序列读出模板读出模板序列序列GGCCATCGTTGAGGCCATCGTGGCCATCGTTGGGCCATCGTTGGCCATCGGGCCATCGGCCAGGCCATGGCCGGC双
5、脱氧末双脱氧末端终止法端终止法(SangerSanger测序法)测序法)读出模板读出模板互补序列互补序列dNTP 凝胶电泳凝胶电泳 较大片段较大片段 较小片段较小片段ddGTPddATPddCTP ddTTP 反应混合物反应混合物Klenow酶酶 未知序列的单链未知序列的单链DNADNA 读出待读出待测序列测序列CTGACTTCGACAAAGAA53 放射性标记的引物放射性标记的引物TGTTA C T GddGddGddGddGGACTGAAGCTGTT35CTGACTTCGACAA53DNADNA的测序仪示意图的测序仪示意图computer analysis凝胶中凝胶中DNADNA移动方向移
6、动方向样品槽样品槽激光器激光器输入光学系统输入光学系统成象透镜成象透镜聚焦透镜聚焦透镜高灵敏度相机高灵敏度相机旋光镜旋光镜/棱镜组件棱镜组件DNADNA的化学测序示意图的化学测序示意图 反应试剂反应试剂G反应:硫酸二甲酯反应:硫酸二甲酯G+A反应:甲酸反应:甲酸T+C反应:肼反应:肼C反应:反应:NaCl+肼肼测序技术进展测序技术进展同位素标记到荧光标记同位素标记到荧光标记,平板电泳到毛细管电泳平板电泳到毛细管电泳多色荧光标记多色荧光标记毛细管电泳毛细管电泳 单色荧光标记单色荧光标记平板电泳平板电泳同位素标记同位素标记平板电泳平板电泳A C G TA C GT测序图谱测序图谱T A TTG C
7、AT TG TC TGCATTG T C T引物标记法测序(Dye Primer)一个样本,一个样本,4 4个反应。个反应。4 4个反应中引物序列相同,个反应中引物序列相同,但分别标记有不同颜色的荧光。但分别标记有不同颜色的荧光。+AmpliTaq FS enzymedCTP,dATP,dGTP,dTTPddATP(terminator)反应结束后,反应结束后,将将4 4管反应液混合,管反应液混合,经乙醇沉淀后上经乙醇沉淀后上样样+AmpliTaq FS enzymedCTP,dATP,dGTP,dTTPddGTP(terminator)+AmpliTaq FS enzymedCTP,dATP
8、,dGTP,dTTPddCTP(terminator)+AmpliTaq FS enzymedCTP,dATP,dGTP,dTTPddTTP(terminator)终止法测序(Dye Terminator)一个样本,一个样本,1 1个反应。反应中包含分别带个反应。反应中包含分别带4 4色荧光标记的色荧光标记的ddNTP(ddNTP(终止子终止子)unlabeled primertemplate DNA+AmpliTaq FSdATP,dCTP,dGTP,dTTPddCTPddATPddGTPddTTP 测序反应结束后,采用乙醇沉淀法进行测序反应结束后,采用乙醇沉淀法进行测序反应结束后,采用乙醇
9、沉淀法进行测序反应结束后,采用乙醇沉淀法进行纯化,除去过量的纯化,除去过量的纯化,除去过量的纯化,除去过量的ddNTPddNTP后上样。后上样。后上样。后上样。第二节第二节 重组重组DNA技术的基本操作原理技术的基本操作原理 重组重组DNADNA是基因工程的核心技术,即把是基因工程的核心技术,即把DNADNA作为组件,在细胞作为组件,在细胞外将一种外源外将一种外源DNADNA(目的基因)和载体(目的基因)和载体DNADNA重新组合连接(重组),重新组合连接(重组),最后将重组体转入宿主细胞,使外源基因最后将重组体转入宿主细胞,使外源基因DNADNA在宿主细胞中随细在宿主细胞中随细胞的繁殖而增殖
10、(胞的繁殖而增殖(cloningcloning,克隆),或最后得到表达,最终获,克隆),或最后得到表达,最终获得基因表达产物或改变生物原有的遗传性状。得基因表达产物或改变生物原有的遗传性状。一、一、DNADNA重组技术重组技术重要的工具酶重要的工具酶二、二、重组重组DNADNA技术的基本操作原理技术的基本操作原理返返返返回回回回一、一、重组重组DNA的重要的工具酶的重要的工具酶1、限制性内切酶限制性内切酶2、DNA连接酶连接酶3、逆转录酶逆转录酶常用的常用的DNADNA限制性内切酶的专一性限制性内切酶的专一性酶酶辨认的序列和切口辨认的序列和切口特点特点 A G C T T C G A G G
11、A T C C C C T A G G A G A T C T T C T A G A G A A T T C C T T A A G A A G C T T T T C G A A G T C G A C C A G C T G C C C G G G G G G C C C Bam H IAlu IBgl IEco R IHind Sal ISma I四核苷酸,平端切口四核苷酸,平端切口六核苷酸,平端切口六核苷酸,平端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸,粘端切口六核苷酸
12、,粘端切口连连接接酶酶连连接接切切口口Mg2+连接酶连接酶ATP或或NADAMP+PPi或或NMN+AMPTCPTTPPPGAPACPPPPOHGATCGPTTPPPAACCTGAPACPPPTGGP缺口3AGAACCTTG3555533模板链模板链模板链模板链反转录酶的三种催化功能反转录酶的三种催化功能依赖依赖RNA的的DNA聚合酶聚合酶核糖核酸核糖核酸酶酶H活力活力依赖依赖DNA的的DNA聚合酶聚合酶重组重组DNA技术技术基本操作原理基本操作原理Foreign DNA to be insertedPlansmid vectorJoiningRecombinant DNA molecule
13、Introduction into host cells by transformation of viral infection Host chromatemeSlection for cells coteining a recombinant DNA moleculeCloning+1 1、目的基因目的基因的获取的获取2 2、载体载体的构建的构建3 3、目的基因与载体、目的基因与载体的重组的重组4 4、重组、重组 体体导入导入宿主宿主细胞进行扩增细胞进行扩增5 5、筛选克隆细胞筛选克隆细胞目的基因的获取目的基因的获取1 1、建立、建立DNADNA和和cDNAcDNA文库文库2 2、体外扩增
14、、体外扩增PCRPCR技术技术3 3、人工合成、人工合成重组重组DNADNA技术路线技术路线11基因文库基因文库(DNA library)基因文库是指整套由基因组基因文库是指整套由基因组DNADNA片段插入克隆载体获得的片段插入克隆载体获得的分子克隆之总和。应用分子克隆之总和。应用DNADNA重组技术,可以将各种生物体全部重组技术,可以将各种生物体全部基因组的遗传信息,贮存在可以长期保存的稳定重组体中,基因组的遗传信息,贮存在可以长期保存的稳定重组体中,以备需要时应用。好象将文献资料贮存于图书馆一样,所以以备需要时应用。好象将文献资料贮存于图书馆一样,所以称其为称其为genomic libra
15、rygenomic library。cDNA文库(文库(complemental DNA library)将细胞全部将细胞全部mRNAmRNA反转录成反转录成cDNAcDNA并被克隆的总和称为并被克隆的总和称为cDNAcDNA文文库库。基因文库和基因文库和cDNAcDNA文库的建立文库的建立可克隆之可克隆之DNA载体载体DNAcDNAmRNA部分或完全部分或完全酶解酶解DNADNA长度分级长度分级甲基化,双链甲基化,双链接头接头DNADNA与载体连接与载体连接引入大肠杆菌引入大肠杆菌鉴定文库的滴度和特性鉴定文库的滴度和特性扩增后供扩增后供长期储存长期储存筛选出所需筛选出所需要的克隆要的克隆组织
16、组织DNA克隆的载体克隆的载体1 1、质粒质粒2 2、噬菌体噬菌体3 3、动物病毒动物病毒4 4、植物寄生菌植物寄生菌重组重组DNADNA技术路线技术路线22重组重组DNADNA转移技术转移技术1 1、转化、转化(transformation)(transformation):以质粒为载体构建的重:以质粒为载体构建的重组组DNADNA分子导入受体细胞的过程。分子导入受体细胞的过程。2 2、转染、转染(Transfection):):以噬菌体或真核病毒为载以噬菌体或真核病毒为载体构建的重组体依靠对细胞的感染功能导入受体细体构建的重组体依靠对细胞的感染功能导入受体细胞的过程。胞的过程。3 3、电穿
17、孔法电穿孔法(electroporation):(electroporation):高压脉冲电流使细高压脉冲电流使细胞产生临时的通透性以吸收胞产生临时的通透性以吸收DNADNA。4 4、微注射法、微注射法(microinjection):(microinjection):借助极细针管的帮借助极细针管的帮助把助把DNADNA注射入细胞核的方法。注射入细胞核的方法。重组重组DNADNA技术路线技术路线44电穿孔法示意图电穿孔法示意图细胞壁细胞壁原生质膜原生质膜纤维素酶纤维素酶电穿孔电穿孔细胞壁再生细胞壁再生瞬间的开口瞬间的开口外来的外来的DNA插入外源插入外源DNA的植物细胞的植物细胞pBR322
18、质粒的结构质粒的结构 噬菌体感染大肠杆菌的途径噬菌体感染大肠杆菌的途径 噬菌体突变型作为克隆载体噬菌体突变型作为克隆载体 DNA用限制性内切酶用限制性内切酶除去中间一段除去中间一段与外源与外源DNA连接连接重组载体的重组载体的体外包装体外包装带有外源带有外源DNA的的 噬菌体噬菌体太小不能被包装太小不能被包装反转录病毒的生活周期反转录病毒的生活周期RNA衣壳衣壳被膜被膜逆转逆转录酶录酶整合入宿主细胞染色体整合入宿主细胞染色体DNADNA进入细胞进入细胞丢失被膜丢失被膜丢失衣壳丢失衣壳逆转录逆转录RNAcDNA转录转录转译转译RNA衣壳蛋白衣壳蛋白被膜蛋白被膜蛋白逆转录酶逆转录酶植物冠瘿瘤植物冠
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- 关 键 词:
- 重组 DNA 技术 基因组
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