溶剂重组能-推导和应用66660.pptx
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1、李象远李象远四川大学化工学院2005.5.22山东烟台phone:+86-28-85405233Fax:+86-28-85407797Solvent effect and continuum modelSolvent effectSupermoleculeModelContinuumModelSupermolecule-ContinuumModel总的溶剂化能的表达式:包含四个部分的贡献:a.静电能b.溶剂中形成溶质空穴的空穴化能c.溶质溶剂耦合色散能d.溶质溶剂耦合排斥能连续介质模型基本思想:溶剂:视为连续介质无结构,各向同性或各向异性只用一个宏观参量表示其性质:介电常数存在外场时,介质发生
2、极化,产生诱导偶极或极化电荷(导体近似时,称屏蔽电荷)极化电荷是束缚电荷.溶质:电荷分布视为自由电荷.溶质-溶剂相互作用长程静电相互作用平衡静电自由能计算模型1Bornmodel(1920)离子体系(单极子),球空穴溶剂化能:Q:溶质电荷;a0:空穴半径s2点偶极模型Onsagermodel(点偶极,球空穴)考虑静电势的多极展开:四极矩八极矩溶剂化能表达式:3.多级展开方法(球空穴)PCM(Tomasi,1981)I-PCM(Tomasi,1999)COSMO(Klamt,1983)GB(Cramer,1991)4任意形状空穴的数值解GB-推广Born方法(SM程序)gkk为原子之间距离,k为
3、k原子有效波恩半径d为原子对之间距离参数.计算步骤:1.指定原子半径构建空穴.2.计算有效原子波恩半径和原子间距离3.计算原子电荷集居.4.利用公式计算溶剂化能.PCM从电磁场理论的角度建立其它电荷(自由Q和极化q)在P点的电场强度E与P点极化电荷的关系.严格解(场强和极化电荷密度之间的关系)spnE离散化处理离散化处理矩阵形式相互作用极化电荷真空电势C-PCM或称COSMO在积分方程公式化PCM即IEF-PCM的基础上,对介质引入类导体假设,即:孔穴表面电势处处相等为常数,在二元方程组中消去电势变量,极化电荷密度和溶质电荷密度之间的关系:离散化处理一个值得注意的问题:Onsager模型中溶质
4、孔穴半径问题分子体积计算方法:1等电子密度面:分子等电子密度面(0.001elec/bohr3)包含体积;2COSMO方法:溶剂可接近表面(由原子范德华半径加rsolv0.5构建)3.PCM方法:溶剂可接近表面(由1.2倍原子范德华半径构建)一般采用分子体积来确定等效半径Gaussian程序推荐:?矛盾:对于简单的金属离子,溶剂可接近表面为球形.空穴半径为:PCM方法:1.2avdwCOSMO方法:avdw+(0.5)A晶体密度方法:因此,前三种方法得到的孔穴半径基本相当.Gaussian推荐半径:严重加大了孔穴半径.问题:SCRF计算采用何种半径?非平衡溶剂化理论简介电子转移双球模型光谱Li
5、ppert-Mataga公式Gaussian03DFT/PCM,CAS/PCMAguilar,Tomasi多级展开光诱导ETR-W公式溶剂化动力学Levich,OvchinikovTachiya,MarcusNewton溶剂重组能极化模型Klamt光谱COSMO理论 非平衡态平衡态溶质电荷:快溶剂极化:取向:不响应电子:快响应Hynes的溶剂化理论非平衡:平衡:平衡态正确的可逆功途径 不可逆途径电子转移双球模型光谱Lippert-Mataga公式Gaussian03DFT/PCM,CAS/PCMAguilar,Tomasi多级展开光诱导ETR-W公式溶剂化动力学Levich,Ovchiniko
6、vTachiya,MarcusNewton溶剂重组能极化模型Klamt光谱COSMO理论 非平衡态平衡态溶质电荷:快溶剂极化:取向:不响应电子:快响应Hynes的溶剂化理论Publicationsonthistopic1.K.-X.Fu,X.-Y.Li,Q.Zhu,J.Mole.Struc.(Theochem).715(2005)157.2.X.-Y.Li,K.-X.Fu,J.Comput.Chem.25(2004)500.3.X.-Y.Li,K.-X.Fu,Q.Zhu,J.Comput.Chem.25(2004)835.4.Q.Zhu,K.-X.Fu,X.-Y.Li,J.-Y.Ma,J.Co
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- 关 键 词:
- 溶剂 重组 推导 应用 66660
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