ASCO肿瘤生物标记物检测进展培训课件.ppt

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1、主要内容1.肺癌驱动基因的突变谱 2.对EGFR TKI耐药情况的实时检测3.驱动基因检测技术的进展1ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023主要内容肺癌驱动基因的突变谱 1ASCO肿瘤生物标记物检测主要内容1.肺癌驱动基因的突变谱 2.对EGFR TKI耐药情况的实时检测3.驱动基因检测技术的进展2ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023主要内容肺癌驱动基因的突变谱 2ASCO肿瘤生物标记物检测NSCLC在高加索人群驱动基因突变谱Giaccone G,et al.2013 ASCO Abstract 7513.Aisner DL,et al.2014 ASCO Abstrac

2、t 11030.美国LCMC I肺腺癌结果高加索人群NSCLC发生EGFR基因突变约占20%3ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023NSCLC在高加索人群驱动基因突变谱Giaccone G,NSCLC在亚洲人群驱动基因突变谱中国检测结果日本检测结果EGFR依然是亚裔腺癌最常见的驱动基因，约占50%Koh Y,et al.2013 ASCO Abstract 7572.Wu YL,et al.2011.4ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023NSCLC在亚洲人群驱动基因突变谱中国检测结果日本检测结果E肺癌驱动基因的突变谱：腺癌&鳞癌腺癌鳞癌21%25%36%7.8%3.3%2

3、.6%2.2%0.8%0.7%0.7%0.1%肺腺癌与肺鳞癌发生模式不同，腺癌以突变为主，鳞癌以扩增为主。Aisner DL,et al.2014 ASCO Abstract 11030.Gadgeel SM,et al.2014 ASCO Abstract 7592.5ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023肺癌驱动基因的突变谱：腺癌&鳞癌腺癌鳞癌21%25%36评估6785例NSCLC患者肿瘤标志物以指导联合治疗策略Xiu J,et al.2014 ASCO Abstract e19012.6ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023评估6785例NSCLC患者肿瘤标志物以指

4、导联合治疗策略X研究设计与结果EGFR突变率：12.7%过表达率：57%扩增率：61%lEGFR突变患者中：66%MET高表达，7%MET扩增患者或可获益于EGFR和MET双重靶向治疗54%TP53突变患者或可对TKI耐药，对放疗交叉耐药入组患者：N=6785NSCLC研究方法：多平台检测6种肿瘤标志物测序法(Sanger，二代测序)蛋白表达(IHC)基因扩增(CISH/FISH)研究终点：各肿瘤标志物的突变、表达、扩增、重排率Xiu J,et al.2014 ASCO Abstract e19012.7ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究设计与结果EGFR入组患者：N=678

5、5研究方法：研究终研究结果ALKALK重排率：2.8%lALK重排阳性患者中：19%EGFR扩增，3%MET扩增，2%HER2扩增患者或可获益于克唑替尼、西妥昔单抗、曲妥珠单抗、onartuzumabBRAFBRAF突变率：3.3%lBRAF突变患者中：58%EGFR高表达，48%MET高表达患者或可获益于Dabrafenib、西妥昔单抗、onartuzumab研究结论：多靶点基因变异发生可能并不相斥Xiu J,et al.2014 ASCO Abstract e19012.8ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究结果ALK研究结论：多靶点基因变异发生可能并不相斥Xiu主要内容1

6、.肺癌驱动基因的突变谱 2.对EGFR-TKI耐药情况的实时检测3.驱动基因检测技术的进展9ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023主要内容肺癌驱动基因的突变谱 9ASCO肿瘤生物标记物检测无创、动态监控获得性EGFR-T790M突变以及探索TKI治疗的晚期NSCLC患者T790M突变异质性Zheng D,et al.2014 ASCO Abstract 11049.10ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023无创、动态监控获得性EGFR-T790M突变以及探索TKI治研究设计和结果T790M突变率：36/66(54.5%)Zheng D,et al.2014 ASCO Abs

7、tract 11049.检测标本66例NSCLC患者PD后血浆cfDNA研究终点：T790突变率数字PCR法检测T790M突变16.7%（6/36）例仅有T790M突变，83.3(30/36)例T790M突变和敏感突变共存9.1%（6/66）患者仅有EGFR敏感突变36.4%（24/66）患者未检测到EGFR突变T790M positive rate:54.5%(36/66)11ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究设计和结果T790M突变率：36/66(54.5%)Zh血液检测可早于影像学发现肿瘤进展在临床PD前中位2个月时即可在血浆cfDNA中检测到T790M(范围：1.5-

8、3.5个月)时间(月)EGFR突变率(%)仅T790M双突变仅外显子19缺失/L858R80.00%60.00%40.00%20.00%0.00%m-2(n=12)-2m0(n=16)0m 2(n=44)2m 4(n=20)490%EGFR敏感突变率：数字PCR法和ARMS法结果相似(80-90%)Thress K,et al.2014 ASCO Abstract 8092.AZD9291研究入组EGFR突变阳性患者检测标本：(n=38)AZD9291临床研究(NCT0182632)中入组患者血浆及部分相应肿瘤组织研究终点：EGFR突变率ARMS平台罗氏Cobas凯杰Therascreen E

9、GFR突变检测试剂盒数字PCR平台BioRad 微滴数字PCR PCR(MolecularMD)BEAMing(Inostics)21ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究设计所有四种方法检测血液EGFR突变率均和组织标本一致性EGFR敏感突变四种检测方法检测EGFR敏感突变具有高灵敏度和高特异性T790MDigital PCR和AS-PCR检测NSCLC患者血浆T790M突变与组织相比具有高灵敏度，其中Digital PCR更有优势Roche cobas AS-PCRQiagen therascreen ARMSMolMD droplet dPCRInostics BEAMin

10、g dPCR19 DEL assaysSensitivity86%(24/28)82%(23/28)-90%(19/21)Specificity100%(10/10)100%(10/10)-100(10/10)concordance89%87%-93%L858R assaySensitivity90%(9/10)78%(7/9)90%(9/10)100%(9/9)Specificity100%(28/28)100%(28/28)100%(28/28)91%(19/21)concordance97%95%97%93%T790M assaySensitivity41%(7/17)29%(5/17)

11、71%(12/17)69%(9/13)Specificity100%(6/6)100%(6/6)83%(5/6)67%(4/6)Concordance57%48%74%68%研究结果Thress K,et al.2014 ASCO Abstract 8092.22ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023EGFR敏感突变Roche cobas AS-PCRQiagNSCLC患者M1b期T790M突变明显高于M1a/M0期组织和血浆检测T790M突变状态对AZD9291临床有效率Plasma ctDNADisease classificationT790M+T790M-M1a/M025%(

12、3/12)75%(9/12)M1b77%(20/26)23%(6/26)研究结果Thress K,et al.2014 ASCO Abstract 8092.TissuePlasmaT790M(+)T790M(-)T790M(+)T790M(-)Response Rate(CR&PR)62%(26/42)26%(6/23)63%(24/38)29%(10/34)Disease control Rate(CR,PR&SD)95%(40/42)70%(16/23)89%(34/38)76%(26/34)23ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023NSCLC患者M1b期T790M突变明显高于

13、M1a/M0期组研究结果EGFR-T790M突变率：数字PCR法高于ARMS法(67-71%vs 29-41%)转移性患者高于局部疾病患者(77%vs 25%)T790M突变与AZD9291疗效相关性基线T790M突变可以定量的患者缓解率为71%，而基线水平检测不到T790M突变的患者缓解率为31%Thress K,et al.2014 ASCO Abstract 8092.结论：Digital PCR检测T790M突变敏感度达70-80%，且一致性高，优于其他检测方法。24ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究结果EGFR-T790M突变率：Thress K,et二代测序(NG

14、S)检测晚期EGFR突变肺腺癌患者循环肿瘤DNA(ctDNA)中EGFR敏感突变和耐药突变Goldber SB,et al.2014 ASCO Abstract 8093.25ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023二代测序(NGS)检测晚期EGFR突变肺腺癌患者循环肿瘤DN研究设计Goldber SB,et al.2014 ASCO Abstract 8093.检测标本：(n=52)52例EGFR敏感突变肺腺癌患者血浆标本其中32例患者在治疗中多次取血样其中31例患者在获得性耐药时活检取样研究终点ctDNA中EGFR敏感突变、T790M突变NGS检测患者特征患者数（n=22）肿瘤特征

15、患者数（n=22）年龄（岁）64（46-79）肺腺癌22（100%）性别 男 女16（73%）6（27%）EGFR基因敏感突变 19DEL 21L858R13（59%）9（41%）吸烟状态 从不吸烟 既往吸烟12（55%）10（45%）获得性耐药T790M突变阳性阴性11（50%）11（50%）26ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究设计Goldber SB,et al.2014 AS研究结论Goldber SB,et al.2014 ASCO Abstract 8093.突变突变肿瘤和血肿瘤和血浆都检测浆都检测到到肿瘤和血肿瘤和血浆都未检浆都未检测到测到仅在血浆仅在血浆中检测

16、到中检测到仅在肿瘤仅在肿瘤中检测到中检测到共计共计EGFR T790M765422获得性耐药患者肿瘤组织和血浆中EGFR T790M 耐药突变检测结果 在获得性耐药的患者中，有11/22（50%）患者的肿瘤组织发生T790M突变 -7/11例患者同时伴有肿瘤和血浆T790M突变 在未存在肿瘤T790M突变的患者中，5例仅在血浆中检测到T790M突变，说 明可能存在肿瘤异质性NGS检测ctDNA EGFR敏感和耐药突变可行但仍需优化27ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023研究结论Goldber SB,et al.2014 AS总 结EGFR基因突变仍是亚裔肺腺癌最重 要的驱动因素，除主要驱动突变外，可能存在并发的其他变异。T790M突变的实时监测可提早发现耐药的产生，从而为后续治疗提供参考。数字PCR 及二代测序（NGS）技术为实现肿瘤的实时检测和多靶点并行检测提供了可能。28ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023总 结EGFR基因突变仍是亚裔肺腺癌最重 要的驱动因素，除谢谢29ASCO肿瘤生物标记物检测进展5/11/2023谢谢29ASCO肿瘤生物标记物检测进展10/1/2022