2022年酶学概论重点知识点.pdf
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1、。酶学概论、酶的生物学意义大肠杆菌生命周期20分钟,生物体内化学反响变得简单和迅速进行的根本原因是体内一般存在生物催化剂酶。没有酶,生长、发育、运动等等生命活动就无法继续。限制性核酸内切酶(限制修饰)二、酶的概念及其作用特点1、酶是一种生物催化剂酶是一类具有高效率、高度专一性、活性可调节的高分子生物催化剂。生物催化剂:酶(enzyme),核(糖)酶(ri bozyme),脱氧核(糖酶(deoxyri bozyme)2、酶催化反响的特点(1)、催化效率高酶催化反响速度是相应的无催化反响的108-1020倍,并且至少高出非酶催化反响速度几个数量级。(2)、专一性高酶对反响的底物和产物都有极高的专一
2、性,几乎没有副反响发生。(3)、反响条件和气温度低于100C,正常大气压,中性pH环境。(4)、活性可调节。依据据生物体的需要,许多酶的活性可受多种调节机制的灵敏调节,包含:别构调节、酶的共价修饰、酶的合成、活化与降解等。(5)、酶的催化活性离不开辅酶、辅基、金属离子3、酶与非生物催化剂相比的几点共性:催化效率高,用量少(细胞中含量低)。不改变化学反响平衡点。降低反响活化能。P234图4-1非催化过程及催化过程自由能的变化反响前后自身结构不变。催化剂改变了化学反响的途径,使反响通过一条活化能比原途径低的途径进行,催化剂的效应只反映在动力学上(反响速度),不影响反响的热力学(化学平衡)。三、酶的
3、化学本质(一)酶的蛋白质本质经典概念:全部的酶都是蛋白质,酶是具有催化功能的蛋白质,因此酶具有蛋白质的一切共性。1、酶的蛋白质组成有些酶仅由蛋白质组成,例如,脤酶、溶菌酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等有些酶不仅含有蛋白质(酶蛋白),还含有非蛋白质成分(辅助。因子),只有酶蛋白与辅助因子结合形成复合物(全酶)才范表现出酶活性,如超氧化物歧化酶Cu2+、Zn2+)、乳酸脱氢酶(NAD+)酶的专一性由酶蛋白的结构决定,辅助因子传递电子或某些化学基团。2、酶的辅助因子酶的辅助因子主要有金属离子(Fe2+、Fe3+、Cu+、Cu2+、Mn2+、Mn3+、Zn2+、Mg2+、K+、Na+、Mo6+、Co2
4、等)和有机化合物。辅酶:与酶蛋白结合较松,可透析除去。辅基:与酶蛋白结合较紧。酶辅助因子CuZn-SOD Cu2+Zn2+Mn-SOD Mn2+过氧化物酶Fe2或Fe3+11型限制性核酸内切酶Mg2+狻肤酶Zn2+P235范表4-1一些酶的辅助因子(金属离子P237范表4-2基团反响中的辅酶和辅基。酶蛋白决定酶专一性,辅助因子决定酶促反响的类型和反响的性质。比方,NAO可与多种酶蛋白结合,构成专一性强的乳酸脱。氢酶、醇脱氢酶、苹果酸脱氢酶、异拧檬酸脱氢酶。生物体内酶种类很多,而辅助因子种类却很少,原因是一种辅助因子可与多种酶蛋白结合。(二ribozyme核酶(具有催化功能的RNAJ1980以前
5、,已知全部的生物催化剂,其化学本质都是蛋白质。80年代初,美国科罗拉多大学博尔德分校的ThomasCech和美国耶鲁大学SidneyAltman各自独立发觉RNA具有生物催化功能,此发觉被认为是近十年生化领域蛊令人鼓舞的发觉,此二人分亨1989诺贝尔化学奖。ribozyme种类:自我剪接ribozyme自我剪切ribozyme 催化分子间反响ribozyme后边细讲四、按酶蛋白的亚基组成及结构特点分类1、单体酶由一条或多条共价相连的肤链组成的酶分子牛胰RNase124a.a 单链鸡卵清溶菌酶129a.a 单链胰凝乳蛋白酶三条肤链单体酶种类较少,一般多催化水解反响。2、寡聚酶由两个或两个以上亚基
6、组成的酶,亚基可以相同或不同,一般是。偶数,亚基间以非共价键结合。含相同亚基的寡聚酶苹果脱胱氢酶(鼠肝),2个相同的亚基含不同亚基的寡聚酶唬珀酸脱氢酶(牛心),a2个亚基寡聚酶中亚基的聚合,有的与酶的专一性有关,有的与酶活性中心形成有关,有的与酶的调节性能有关。大多数寡聚酶是胞内酶,而胞外酶一般是单体酶。3、多酶复合体由两个或两个以上的酶,靠非共价键结合而成,其中每一个酶催化一个反响,全部反响依次进行,构成一个代谢途径或代谢途径的一局部。如脂肪酸合成酶复合体。例如:大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成)丙酮酸脱氢酶(E1)以二聚体存在2X9600二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2)70000 二氢硫
7、辛酸脱氢酶(E3)以二聚体存在2X56000复合体:12个E1二聚体24X9600024个E2单体24X 70000 6个E3二聚体12 X56000 总分子量560万4、多酶融合体一条多肤链上含有两种或两种以上催化活性的酶,这往往是基因。融合的产物。例如:天冬氨酸激酶I-高丝氨酸脱氢酶I融合体(双头酶)该酶是四聚体a4,每条肤链含两个活性地域:N端地域是Asp激酶,C端地域是高Ser脱氢酶。五、酶在细胞中的分布一个细胞内含有上千种酶,相互有关的酶往往组成一个酶体系,分布于特定的细胞组分中,因此某些调节因子可以比拟特异地影响某细胞组分中的酶活性,而不使其它组分中的酶受影响。1.分布千细胞核的酶
8、核被膜酸性磷酸酶染色质三磷酸核旮酶核仁核糖核酸酶核内可溶性局部酵解酶系、乳酸脱氢酶2.分布于细胞质的酶参与糖代谢的酶酵解酶系磷酸戊糖途径酶系参与脂代谢的酶脂肪酸合成酶复合体参与a.a蛋白质的酶Asp氨基转移酶参与核酸合成的酶核旮激酶核旮酸激酶3.分布千内质网的酶光滑内质网胆固醇合成酶系粗糙内质网蛋白质合成酶系。(细胞质一侧)4分布于线粒体的酶外膜:酰基辅酶A合成酶内膜:NADH脱氢酶基质:三狻酸循环酶系脂肪酸B氧化酶系5.分布于溶酶体的酶水解蛋白质的酶水解糖苦类的酶水解核酸的酶水解脂类的酶6.标志酶有些酶只分布于细胞内某种特定的组分中,核:尼克酰胺单核旮酸腺旮酰转移酶,功能:DNA、RNA生物
9、合成线粒体:唬珀酸脱氢酶(电子转移、三狻酸循环)溶酶体:酸性磷酸酶(细胞成分的水解)微粒体:(核蛋白体、多核蛋白体、内质网)Glc-6磷酸酶上清液:乳酸脱氢酶第二节酶的国际分类及命名一、习惯命名1961年6以前使用的酶沿用习惯命名。1.(绝大多数酶)依据底物来命名如:催化蛋白质水解的酶称蛋白酶。催化淀粉水解的酶称淀粉酶。2.依据催化反响的性质命名如:水解酶、转氨酶3结合上述两个原则命名,唬珀酸脱氢酶。4.有时加上酶的X如:胃蛋白酶、牛胰凝乳蛋白酶习惯命名较简单,但缺少系统性。二、国际系统命名系统名称应明确标明酶的底物及催化反响的性质。如:草酸氧化酶(习惯名),系统名称:草酸:氧氧化酶又如:谷丙
10、转氨酶(习惯名),系统名:丙氨酸:a酮戊二酸氨基转移酶反响:丙氨酸a酮戊二酸Glu丙酮酸三、国际系统分类法及编号(EC编号)原则:将全部酶促反响按性质分为六类,分别用1、2、3、4、5、6范表示。再依据底物中被作用的基团或键的特点,将每一大类分为假设干个亚类,编号用1、2、3,每个亚类又可分为假设干个亚一亚类,用编号1、2、3范表示。每一个酶的编号由4个数字组成,中间以“隔开。第个数字。范表示大类,第二个数字范表示亚类,第三个范表示亚亚类,第四个数字范表示在亚亚中的编号。1、氧化复原酶类催化氧化复原反响:A2H+B=A+B2H 乳酸:NAD氧化复原酶(EC1.1.1.27),习惯名:乳酸脱氢酶
11、图2、转移酶类AB+C=A+BC Ala:酮戊二酸氨基移换酶(EC2.6.1.2),习惯名:谷丙转氨酶图3、水解酶类催化水解反响,包含淀粉酶、核酸酶、蛋白酶、脂酶。亮氨酸氨基肤水解酶(EC3.4.1.1),习惯名:I le氨肤酶。4、裂合酶类(裂解酶)催化从底物上移去一个基团而形成双键的反响或其逆反响二磷酸酮糖裂合酶(EC4.1.2.7),习惯名:酪缩酶5、异构酶(EC5.3.1.9)催化同分异构体相互转化,6-磷酸Glc异构酶。6、合成酶连接酶催化一切必须与ATP分解相偶联、并由两种物质合成一种物质的反响。P241范表4-8酶的国际分类一大类和亚类第个数字范表示大类:氧化复原第二个数字范表示
12、反响基团:醇基第三个数字范表示电子受体:NAD或NADP+第四个数字范表示此酶底物:乙醇,乳酸,苹果酸。前面三个编号范说明这个酶的特性:反响性质、底物性质(键的类型及电子或基团的受体,第四个编号用千区分不同的底物。酶的物种和组织的差异来自不同物种或同一物种不同组织或不同细胞器的同一种酶,虽然它们催化同一个生化反响,但它们的一级结构可能不相同,有时反响机制也可能不同,可是无论是酶的系统命名法还是习惯命名法,对这些均不加以区别,而定为相同的名称,这是因为命名酶的依据是酶所催化的反响。例如,SOD不管X如何,均催化如下反响202-+2H+H202+02 H202再由过氧化氢酶催化、分解实际此酶可分三
13、类:CuZn-SOD 真核生物细胞质中Mn-SOD 真核生物线粒体中。Fe-SOD 即使同是CuZn-SOD,来自牛红细胞与猪红细胞的,其一级结构也有很大不同。因此,在商量一个具体的酶时,应对它的X与名称一并加以说明。第三节酶促反响动力学酶促反响动力学是研究酶促反响的速度以及影响酶促反响速度的各种因素,包含低物浓度、酶浓度、pH、温度、激活剂与抑制剂、等。一、酶的量度酶的含量不能直接用重量和摩尔数范表示(不纯、失活、分子量不知,而采纳酶的活力单位范表示1、酶活力与酶促反响速度酶活力:用在肯定条件下,酶催化某一反响的反响速度范表示。反响速度快,活力就越高。酶量酶活力一反响速度酶促反响速度的范表示
14、方法:单位时间、单位体积中底物的减少量或产物的增加量。单位:浓度单位时间P243图4-4酶反响速度曲线。研究酶促反响速度,以酶促反响的初速度为准。因为底物浓度降低、酶局部失活产物抑制和逆反响等因素,会使反响速度随反响时间的延长而下降。2、酶的活力单位(U)国际酶学会标准单位:在特定条件下,1分钟内能转化1umol底物的酶量,称一个国际单位(IU)。特定条件:25CpH及底物浓度采纳最适条件(有时底物分子量不确定时,可用转化底物中1umol的有关基团的酶量范表示)。实际工作中,每一种酶的测活方法不同,对酶单位分别有一个明确的定义。如:限制性核酸内切酶用粘度法测活性:定义为30C,1分钟,使底物D
15、NA溶液的比粘度下降25的酶量为1个酶单位。转化率法:标准条件,5分钟使1ug供体DNA残留37的转化活性所需的酶量为1个酶单位。凝胶电泳法测活:37C,1小时,使1ug入DNA完全水解的酶量为1个酶单位。可见,同一种酶采纳不同的测活方法,得到的酶活单位是不同的,即使是同一种测活法,实验条件稍有相同,测得的酶单位亦有差异。如淀粉酶,两种定义A:1 g可溶性starch,在1h内液化所需的enzyme量。8:I ml 2可溶性starch,在1h内液化所需的enzyme量。1g酶制剂溶千1000mlH20,取0.5ml与2的starch20ml反响,pH6.0,10分钟完全液化,求酶活力。A:6
16、0/10X20X2%X 1/0.5X1000=4800u克enzyme制剂8:60/10 X 20/0.5 X 1000=240000u克enzyme制剂3、酶的比活力Specificactivity 每毫克酶蛋白所具有的酶活力。酶的比活力是分析酶的纯度是重要指标。单位:U/mg蛋白质。有时用每克酶制剂或每毫升酶制剂含有多少个活力单位范表示。举例:一个酶的别离纯化分为4步。步骤1 2 3 4 总活力(U6 4 3 2 总蛋白质(mg)20 10 5 2 比活力(U/mg)6/20 4/10 3/5 2/2 酶的提纯过程中,总蛋白减少,总活力减少,比活力增高。酶的纯化倍数:酶的回收率:X 100
17、%4、酶的转换数和催化周期分子活性定义:每mol的enzyme在1秒内转化substrate的。mol数。亚基或催化中心活性定义:每mol的activesubunit或activecenter在一秒内转化的substrate的mol数,称为转换数KeatP244图范表44转换数的倒数即为催化周期:一个酶分子每催化一个底物分子所需的时间。如:乳糖脱氢酶转换数为1000秒,则它的催化周期为10-3秒。二、底物浓度对酶促反响速度的影响单底物酶促反响,包含异构酶、水解酶及大局部裂合催化的反响。1913 Michael is和Menten提出米曼方程。(一底物浓度对酶促反响速度的影响米式学说的提出190
18、3 Henri 研究荒糖水解反响。sucrose+H20 acid glucose+fructose sucrase 酸水解V V。sucrose 酶水解v v enzyme(substrate不变)sucrose 底物浓度与酶促反响速度的关系:当底物浓度不断增大时,反响速度不再上升,趋向一个极限,酶被底物饱和(底物饱和现象)。中间产物假说:酶与底物先络合成一个中间产物,然后中间产物进一步分解成产物和游离的酶。证据:(1)竞争性抑制实验(2)底物爱护酶不变性(3)结晶ES复合物的获得。米式学说:1913年,Michae Ii s和Menten继承和开展了中间产物学说,在前人工作根底上提出酶促动
19、力学的根本原理,并以数学公式范说明了底物浓度与酶促反响速度的定量关系,称米式学说:(二米式方程的导出:1、基千快速平衡假说早年的米式方程最初,Michae Ii s和Menten是依据“快速平衡假说“推出米式方。程。快速平衡假说:在反响的初始阶段,底物浓度远远大千酶浓度,因此,底物浓度S可以认为不变。游离的酶与底物形成ES的速度极快,E+S ES,而ES形成产物的速度极慢,ES分解成产物P对千ES浓度的动态平衡没有影响,不予考虑。K1、K2K3因为研究的是初速度,P的量很小,由PES可以忽略不记。ES的生成速度:K1(E-ES)SJ ES的分解速度:K2ESK1(E-ES)SJ=K2ES 反响
20、速度:KS现在称为底物常数2、Briggs和Haldane的稳态平衡假说”及其对米式方程的开展:稳态平衡假说:。ES的的生成与分解处千动态平衡(稳态),有时必须考虑ES分解成产物P对千ES动态平衡的影响(ES分解速度)。或者说,ES的动态平衡(分解速度)不仅与ESE+S有关,还与ES P+E有关。稳态平衡假说的奉献在于第点。用稳态假说推导米式方程:ES生成速度:k 1(E-ES)SJ ES分解速度:k2ES+k3ES 以上两个速度相等。k 1(E-ES)S=k2ES+k3ES 反响速度:Vmax=k3 E Km称米氏常数,当Km及Vmax已知时,即可确定酶反响速度与底物浓度的关系。(三)米式方
21、程商量1、快速平衡假说与稳态平衡假说的实质区别当K1、K2K3时,即ESP是整个反响平衡中极慢的一步,那么。这就是早年提出的米式方程因此说,稳态平衡快速平衡慢速平衡,当ESP(即K3/K1)极慢时,稳态平衡根本等千快速平衡2、Km的物理意义当反响速度v=1/2Vmax时,Km=SJ,Km的物理意义是:当反响速度到达最大反响速度的一半时底物的浓度。单位:与底物浓度的单位一致,moI L-1或mmoI L-1 Km是酶的特征常数之一。一般只与酶的性质有关,与酶的浓度无关。不同的酶Km值不同。P248范表4-5一些酶的Km值。3、Km与天然底物如果一个酶有几种底物,则每一种底物各有一个特定的Km,其
22、中Km最小的底物称该酶的最适底物或天然底物。因为Km愈小(到达Vmax一半所需的底物浓度愈小)范表示V变化越灵敏底物。4、Km、Ks与底物亲和力Km称米式常数,Km=(K2+K3)/K1,从某种意义上讲,Km是ES分解速度(K2+K3)与形成速度(K1)的比值,它包含ES解离趋。势(K2/K1)和产物形成趋势(K3/K1)。Ks称为底物常数,Ks=K2/K1,它是ES的解离常数,只反映ES解离趋势,因此,1/Ks可以范表示酶与底物的亲和力大小(ES形成趋势,不难看出,底物亲和力大不肯定反响速度大(产物形成趋势,K3/K1)只有当K2、K1K3时,Km:陷,因此,1/Km只能近似地范表示底物亲和
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