蛋白质生物合成翻译.ppt
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1、第十二章第十二章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成 蛋蛋白白质质的的生生物物合合成成又又称称翻翻译译,是是以以mRNA为模板指导合成蛋白质的过程。为模板指导合成蛋白质的过程。第一节第一节 蛋白质生物合成体系蛋白质生物合成体系 蛋白质生物合成体系复杂,有多种物质蛋白质生物合成体系复杂,有多种物质参与合成过程。参与合成过程。参与蛋白质生物合成的物质参与蛋白质生物合成的物质l2020种氨基酸种氨基酸l模板模板mRNAl核糖体(核糖体(rRNA+蛋白质)蛋白质)ltRNA(氨基酸载体)氨基酸载体)l延长因子延长因子l释放因子释放因子l能量物质及离子能量物质及离子l氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶l起
2、始因子起始因子 一、模板、模板mRNAl顺顺反反子子:遗遗传传学学将将编编码码一一个个多多肽肽链链的的遗遗传单位称为顺反子传单位称为顺反子(cistron)。l原原核核生生物物多多顺顺反反子子mRNA:mRNA可可为为功功能能相相关关的的几几种种蛋蛋白白质质肽肽链链编编码码,称称多多顺顺反子反子(polycistron)。l真真核核生生物物单单顺顺反反子子mRNA:一一个个mRNA分分子子只只编编码码一一种种蛋蛋白白质质肽肽链链,称称单单顺顺反反子子(monocistron)。l开开放放读读码码框框架架:从从mRNA 5端端起起始始密密码码子子AUG到到3端端终终止止密密码码子子UAA(UAG
3、,UGA)之之间间的的核核苷苷酸酸序序列列,称称为为开开放放读读码码框框架架(open reading frame,ORF)。)。l密密码码子子:在在ORF中中每每3 3个个相相邻邻碱碱基基组组成成的的三三联联体体,构构成成1 1个个密密码码子子(codon),编编码码1 1个氨基酸。个氨基酸。53GG U CCAUCUG A C U A Al遗遗传传密密码码:由由A、G、C、U四四种种碱碱基基可可组成组成6464种三联体密码子。种三联体密码子。起始密码子起始密码子(AUG,甲硫氨酸密码子甲硫氨酸密码子)终止密码子终止密码子(UAA、UAG、UGA)其余其余6060种密码子种密码子(编码编码1
4、919种氨基酸种氨基酸)图表图表 遗传密码的特点:遗传密码的特点:(一)方向性(一)方向性(direction)密密码码子子及及组组成成密密码码子子的的各各碱碱基基在在mRNA中中的的排列具有方向性排列具有方向性,阅读方向是阅读方向是53方向方向。(二)连续性(二)连续性(commaless)mRNA中中密密码码子子及及密密码码子子的的各各碱碱基基是是连连续续排排列列 的的,无无 间间 隔隔,又又 称称 无无 标标 点点 性性(non-punctuation)(三)简并性(三)简并性(degenerate)l简简并并性性:指指一一种种氨氨基基酸酸具具有有2 2个个或或2 2个个以以上上密密码码
5、子子。除除色色氨氨酸酸和和甲甲硫硫氨氨酸酸有有1 1个个密密码码子子,其余氨基酸有其余氨基酸有2 2,3 3,4 4个或个或6 6个密码子。个密码子。l简简并并密密码码子子:为为同同一一氨氨基基酸酸编编码码的的各各密密码码子子,又又称称同同义义密密码码子子。一一般般简简并并密密码码子子前前2 2位位碱碱基基相相同同,第第3 3位位碱碱基基不不同同。如如苏苏氨氨酸酸Thr密密码码子子 。图图(四)通用性(四)通用性(universal)从从最最简简单单的的病病毒毒,一一直直到到人人类类,都都使使用同一套遗传密码。用同一套遗传密码。仅仅发发现现少少数数例例外外,如如线线粒粒体体中中的的密密码码子子
6、AUA是起始密码子兼甲硫氨酸密码子。是起始密码子兼甲硫氨酸密码子。(五)摆动性(五)摆动性(wobble)mRNA密密码码子子与与tRNA反反密密码码子子配配对对,有有时时出出现现不不遵遵从从碱碱基基配配对对规规律律的的情情况况,称称为为密密码码子的摆动性,又称摆动配对。子的摆动性,又称摆动配对。常常见见于于密密码码子子第第三三位位和和反反密密码码子子第第一一位位。其能使其能使1 1种种tRNA识别识别mRNA多种密码子。多种密码子。图图核核糖糖体体又又称称核核蛋蛋白白体体,由由大大、小小亚亚基基构构成成,每个亚基又含不同的蛋白质和每个亚基又含不同的蛋白质和rRNA。原核生物原核生物:核糖体核
7、糖体70s=70s=小亚基小亚基30s+30s+大亚基大亚基50s50s真核生物:真核生物:核糖体核糖体80s=80s=小亚基小亚基40s+40s+大亚基大亚基60s 60s 图图1 1,图图2 2,图图3 3二、核糖体二、核糖体三、三、tRNAltRNA以以3-CCA-OH结合运载氨基酸。结合运载氨基酸。ltRNA以以反反密密码码环环上上的的反反密密码码子子结结合合mRNA的密码子。的密码子。图图四、四、蛋白质合成需要的其他物质蛋白质合成需要的其他物质 (一)重要的酶类(一)重要的酶类l氨基酰氨基酰-tRNA合成酶:合成酶:位于胞液中。位于胞液中。l转转肽肽酶酶:位位于于核核糖糖体体大大亚亚
8、基基上上,A位位与与P位之间。位之间。l转转位位酶酶:原原核核生生物物位位于于延延长长因因子子EF-G中,真核生物位于延长因子中,真核生物位于延长因子eEF-2中。中。(二)蛋白质因子(二)蛋白质因子l起始因子起始因子原核起始因子原核起始因子IF (initiation factor)真核起始因子真核起始因子eIF (eukaryote)l延长因子延长因子l释放因子释放因子原核延长因子原核延长因子EF (elongation factor)真核延长因子真核延长因子eEF (eukaryote)原核释放因子原核释放因子RF(release factor)真核释放因子真核释放因子eRF (euka
9、ryote)l所需能量物质:所需能量物质:ATP、GTP。l无机离子无机离子:Mg2+、K+。(三)能量物质及离子(三)能量物质及离子第二节第二节 氨基酸的活化氨基酸的活化l氨基酸活化氨基酸活化 氨基酸氨基酸 +tRNA+ATP氨基酰氨基酰-tRNA +AMP +PPi氨基酰氨基酰-tRNA合成合成酶酶tRNA以以3-CCA-OH结结合合氨氨基基酸酸(形形成成酯酯键键。图图氨基酸与特异氨基酸与特异tRNA在氨基酰在氨基酰-tRNA合成酶合成酶催化下生成氨基酰催化下生成氨基酰-tRNA的过程。的过程。l氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)1
10、1.具具有有高高度度特特异异性性:酶酶对对氨氨基基酸酸和和tRNA能高度特异地识别能高度特异地识别 2 2.具具有有校校正正活活性性:对对氨氨基基酸酸与与tRNA出出现现的错配加以更正(水解酯键)的错配加以更正(水解酯键)。l氨基酰氨基酰-tRNA的表示方法的表示方法 Ala-tRNAAla Met-tRNAeMet fMet-tRNAfMet Met-tRNAiMet Met-tRNAeMet辨辨认认结结合合延延长长中中的的AUG;Met-tRNAiMet辨辨认认结结合合真真核核起起始始AUG;fMet-tRNAfMet辨辨认认结结合合原原核核起起始始AUG,称称为为N-甲酰甲硫氨酰甲酰甲硫
11、氨酰-tRNA。(生成图生成图)一、原核生物蛋白质合成过程一、原核生物蛋白质合成过程 原原核核生生物物蛋蛋白白质质合合成成过过程程需需多多种种蛋蛋白白质质因子参加,包括:因子参加,包括:起始因子起始因子IF (intiation factor)延长因子延长因子EF (elongation factor)释放因子释放因子RF(release factor)第三节第三节 蛋白质生物合成过程蛋白质生物合成过程蛋白质生物合成(翻译)包括起始、延长蛋白质生物合成(翻译)包括起始、延长和终止三个阶段和终止三个阶段种类种类生物学功能生物学功能起始因子起始因子IF-1结合小亚基,促进大小亚基分离并占据结合小亚
12、基,促进大小亚基分离并占据A位位IF-2与与GTPGTP结合结合fMet-tRNAfMet-tRNAfMetfMet,促进结合促进结合AUGAUGIF-3结合小亚基,促进大小亚基分离结合小亚基,促进大小亚基分离延长因子延长因子EF-Tu促进氨基酰促进氨基酰-tRNA进入进入A位,结合并分解位,结合并分解GTPEF-Ts调节亚基调节亚基EF-G有转位酶活性,促进有转位酶活性,促进mRNA-肽酰肽酰-tRNA由由A位移至位移至P位,促进位,促进tRNA卸载与释放卸载与释放释放因子释放因子RF-1特异识别特异识别UAA、UAG,诱导转肽酶转变为酯酶,诱导转肽酶转变为酯酶RF-2特异识别特异识别UAA
13、、UGA,诱导转肽酶转变为酯酶,诱导转肽酶转变为酯酶RF-3有有GTP酶活性,能介导酶活性,能介导RF-1及及RF-2与核糖体的相与核糖体的相互作用互作用参与原核生物翻译的各种蛋白质因子参与原核生物翻译的各种蛋白质因子1.1.核糖体大小亚基分离核糖体大小亚基分离IF-1、IF-3与与小小亚亚基基结结合合,促促使使核核糖糖体体大大小小亚亚基基分分离离。(IF-1结结合合占占据据小小亚亚基基A位位)图图(一)起始阶段(一)起始阶段2.2.mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合mRNA结合于小亚基上,此时结合于小亚基上,此时AUG位于位于P位,位,第二个密码子位于第二个密码子位于A位。位。图图lS
14、-D序序列列:在在mRNA起起始始AUG上上游游,因因shine-Dalgarno发现命名,以发现命名,以AGGA为核心。为核心。lUCCU序序列列:在在核核糖糖体体小小亚亚基基的的16S-rRNA近近3 3端端,以以UCCU为为核核心心,与与S-D序序列列互互补补结合。结合。图图lrpS辨辨认认序序列列:在在mRNA上上紧紧邻邻SD序序列列,可可被被核核糖糖体体小小亚亚基基蛋蛋白白rpS-1(ribosomal proteins in small subunit)辨认结合。辨认结合。图图3.3.起始氨基酰起始氨基酰tRNA的结合的结合fMet-tRNAfMet与与IF-2GTP结结合合,再再
15、辨辨认认结结合合于于mRNA的起始的起始AUG上上 图图 。4.4.核糖体大亚基结合核糖体大亚基结合IF-2结结合合的的GTP分分解解,促促使使3 3种种IF脱脱离离,核核糖糖体体大大亚亚基基结结合合在在小小亚亚基基上上,形形成成翻翻译译起起始始复复合合物物。此此时时fMet-tRNAfMet 位位于于核核糖糖体体的的P位位上,上,A位空着。位空着。图图原核起始动画原核起始动画(二二)延长阶段延长阶段 (核糖体循环(核糖体循环 ribosomal cycle)核糖体循环分三步:核糖体循环分三步:进位进位(positioning)成肽成肽(peptide bond formation)转位转位(
16、translocation)每每循循环环1 1次次,肽肽链链延延长长1 1个个氨氨基基酸酸,如如此此不不断断重重复复,直直至至肽肽链链合合成成终终止止。延延长长过过程程需需延延长长因子因子EF(elongation factor)参加。参加。1.进位进位l起起始始结结束束时时核核糖糖体体P P位位有有fMet-tRNAfMet,A位空着。位空着。l氨氨基基酰酰-tRNA根根据据A位位上上mRNA密密码码子子的的指指引,进入引,进入A位。位。图图l需延长因子需延长因子EF-T的协助的协助 。反应图反应图2.2.成肽成肽 转转肽肽酶酶(transpeptidase):核核糖糖体体大大亚亚基基上的蛋
17、白质,位于上的蛋白质,位于P位和位和A位之间。位之间。在在转转肽肽酶酶的的催催化化下下,将将P位位上上的的fMet-tRNAfMet的的N-甲甲酰酰甲甲硫硫氨氨酰酰基基转转移移到到A位位上上的的氨氨基基酰酰-tRNA的的氨氨基基酰酰基基上上,形形成成肽肽键键,反反应应在在A位位上上进进行行(图图)。tRNAfMet 暂暂留留P位位上。上。图图 (延长中延长中P位上是肽酰位上是肽酰-tRNA)3.3.转位转位l延长因子延长因子EF-G有有转位酶转位酶(translocase)活性。活性。l转转位位酶酶分分解解1分分子子GTP,促促进进核核糖糖体体沿沿mRNA 53移动一个密码子的位置。移动一个密
18、码子的位置。l此此时时,tRNAfMet(延延长长过过程程中中为为其其他他tRNA)移移入入E位位并并脱脱离离,位位于于A位位上上的的肽肽酰酰-tRNA转转入入P位,位,A位空出。位空出。图图 肽肽链链延延长长阶阶段段如如此此三三步步一一循循环环,53方方向向阅阅读读mRNA 密密码码子子,肽肽链链从从N端端C端延长。端延长。延长动画延长动画 l当当 核核 糖糖 体体A位位 出出 现现 终终 止止 密密 码码 子子(UAA,UAG,UGA)时时,RF-1或或RF-2辨辨认认结合终止密码子,进入结合终止密码子,进入A位。位。l在在RF-3介介导导下下触触发发核核糖糖体体构构象象改改变变,诱诱导导
19、转转肽肽酶酶转转变变为为酯酯酶酶活活性性,水水解解肽肽-tRNA,释出肽链。,释出肽链。l在在IF-1、IF-3作作用用下下各各组组分分分分离离,翻翻译译结结束。束。图图 动画动画 (三)终止阶段(三)终止阶段 真真核核生生物物蛋蛋白白质质合合成成过过程程与与原原核核生生物物基基本本相相同同,但但反反应应更更复复杂杂,涉涉及及的的蛋蛋白白质因子更多,包括:质因子更多,包括:真核起始因子真核起始因子eIF 真核真核延长因子延长因子eEF 真核释放因子真核释放因子eRF。二、真核生物蛋白质合成过程二、真核生物蛋白质合成过程种种类类生物学功能生物学功能起始因子起始因子eIF-1多功能因子,参与翻多功
20、能因子,参与翻译译多个步多个步骤骤eIF-2促促进进Met-tRNAiMet与小与小亚亚基基结结合合eIF-2B eIF-3结结合小合小亚亚基,促基,促进进大小大小亚亚基分离基分离结结合小合小亚亚基,促基,促进进大小大小亚亚基分离基分离eIF-4AeIF-4F复合物成分,有复合物成分,有RNA解螺旋解螺旋酶酶活性,解除活性,解除mRNA5-端的端的发夹结发夹结构,使其与小构,使其与小亚亚基基结结合合eIF-4EeIF-4F复合物成分,复合物成分,结结合合mRNA 5帽子帽子结结构构eIF-4GeIF-4F复合物成分,复合物成分,结结合合eIF-4E、eIF-3和和PABPeIF-4B结结合合m
21、RNA,促,促进进mRNA扫扫描定位起始描定位起始AUGeIF-5促促进进各种起始因子从小各种起始因子从小亚亚基解离,基解离,进进而而结结合大合大亚亚基基eIF-6促促进进核糖体分离成大小核糖体分离成大小亚亚基基延延长长因子因子eEF1-相当于相当于EF-TueEF1-调节亚调节亚基,相当于基,相当于EF-TseEF-2有有转转位位酶酶活性,相当于活性,相当于EF-G 释释放因子放因子eRF识别识别所有所有终终止密止密码码子,具有原核生物各子,具有原核生物各类类RF的功能的功能参与真核生物翻译的各种蛋白质因子参与真核生物翻译的各种蛋白质因子(一)起始阶段(一)起始阶段eIF-2B、eIF-3与
22、小亚基结合,在与小亚基结合,在eIF-6参参与下,促进大小亚基解离。与下,促进大小亚基解离。1.1.核糖体大小亚基分离核糖体大小亚基分离2.2.Met-tRNAiMet与核糖体小亚基与核糖体小亚基结合结合eIF-2与与GTP结合,再结合结合,再结合Met-tRNAiMet,在其他在其他eIF参与下,与小亚基结合。参与下,与小亚基结合。3.3.mRNA在在核糖体小亚基就位核糖体小亚基就位leIF-4E结结合合mRNA的的5端端帽帽子子结结构构,并并与与eIF-4A、eIF-4G共共同同形形成成帽帽子子结结合合蛋蛋白白复复合合物物(eIF-4F复合物复合物)。lpolyA结结合合蛋蛋白白(poly
23、A binding protein,PABP)结合)结合polyA。leIF-4G通通过过分分别别与与PABP和和eIF-3结结合合而而将将mRNA结合于小亚基上。结合于小亚基上。l在在eIF-4B和和eIF-4A作作用用下下,Met-tRNAiMet在在mRNA上上扫扫描描结结合合起起始始AUG(其其位位于于Kozak序序列列ACCAUGG中中),使使mRNA在在小小亚基上准确定位。亚基上准确定位。通通过过eIF-5作作用用和和水水解解GTP供供能能,促促使使各各种种eIF从从小小亚亚基基释释放放,大大亚亚基基与与小小亚亚基结合,形成基结合,形成翻译起始复合物。翻译起始复合物。4.4.核糖体
24、大亚基结合核糖体大亚基结合(二)延长阶段(二)延长阶段 真真核核生生物物肽肽链链延延长长过过程程与与原原核核生生物物基基本本相相同同,延延长长因因子子不不同同,其其核核糖糖体体无无E位位,转位时卸载的转位时卸载的tRNA直接从直接从P P位脱落。位脱落。真核翻译终止过程与原核相似,真核翻译终止过程与原核相似,eRF只只有一种,可完成原核各有一种,可完成原核各RF的功能。的功能。(三)终止阶段(三)终止阶段l多聚核糖体多聚核糖体(polysome)原原核核与与真真核核生生物物的的一一条条mRNA上上可可附附着着10100个个核核糖糖体体,同同时时进进行行肽肽链链合合成成,此此mRNA与与多多个个
25、核核糖糖体体的的聚聚合合物物称称多多聚聚核核糖糖体体,电电镜镜下下显显示示为为羽羽毛毛状状。图图1 1 图图2 2 每每个个氨氨基基酸酸活活化化为为氨氨基基酰酰tRNA消消耗耗2 2个高能磷酸键。个高能磷酸键。进位、转位各消耗进位、转位各消耗1 1个高能磷酸键。个高能磷酸键。为为保保持持蛋蛋白白质质合合成成的的高高度度保保真真性性而而进进行校正消耗能量。行校正消耗能量。每每生生成成一一个个肽肽键键,平平均均要要消消耗耗5 5个个高高能能磷酸键磷酸键(ATP+GTP)。)。l蛋白质翻译能量消耗蛋白质翻译能量消耗 第三节第三节 蛋白质翻译后修饰和靶向输送蛋白质翻译后修饰和靶向输送l新新生生多多肽肽
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