生物检测技术(第二版)第五章电子课件 .ppt
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1、生物检测技术(第二版)第五章电子课件【知识目标】掌握琼脂糖凝胶电泳的基本原理及操作要点。掌握聚丙烯酰胺凝胶电泳的基本原理及操作要点。理解双向电泳的基本原理及操作方法。掌握纸电泳的基本原理及操作步骤。理解毛细管电泳的基本原理及应用。【能力目标】能较好地利用电泳检测技术检测蛋白质、。能根据实际需求选择相应的电泳检测技术对待测物进行检测。第一节 电泳检测技术总论 一、电泳检测技术介绍电泳检测技术是指利用带电颗粒在电场中能向异性电极泳动这一现象来分离、纯化或分析检测供试品的一种生物化学技术。一般用于生物大分子物质核酸、蛋白质等的检测。二、电泳检测技术的原理许多生物分子都带有电荷,在电场作用下可发生移动
2、,由于混合物中各组分所带电荷性质、数量以及相对分子质量各不相同,使在同一电场作用下,各组分的泳动方向和速率也各有差异,所以在一定时间内它们移动距离不同,从而可达到分离鉴定的目的。三、电泳的分类按支持物的物理性状不同,区带电泳可分为:滤纸及其他纤维(如醋酸纤维、玻璃纤维、聚氯乙烯纤维)薄膜电泳;粉末电泳,如纤维素粉、淀粉、玻璃粉电泳;凝胶电泳,如琼脂、琼脂糖、硅胶、淀粉胶、聚丙烯酰胺凝胶电泳等;丝线电泳,如尼龙丝、人造丝电泳。按支持物的装置形式不同,区带电泳可分为:平板式电泳,支持物水平放置,是最常用的电泳方式;垂直板式电泳,聚丙烯酰胺凝胶常做成垂直板式电泳;垂直柱式电泳,聚丙烯酰胺凝胶盘状电泳
3、即属于此类;连续液动电泳,首先应用于纸电泳,将滤纸垂直竖立,两边各放一电极,溶液自顶端向下流,与电泳方向垂直。第二节 琼脂糖凝胶电泳 一、琼脂糖凝胶琼脂糖是线性的多聚物,基本结构是,连结的 半乳糖和,连结的,内醚 半乳糖交替连接起来的长链多糖聚合物。琼脂糖在水中一般加热到 以上溶解,温度下降到 时形成良好的半固体状物质即为琼脂糖凝胶。琼脂糖的凝胶性是由存在的氢键所致,凡是能破坏氢键的因素都能导致凝胶性的破坏。琼脂糖具有亲水性,并几乎完全不存在带电基团,对敏感的生物大分子极少引起变性和吸附,是理想的惰性载体。琼脂糖冷却后成为孔径范围从 到大于 的大网孔径凝胶。由于孔径较大,对一般蛋白质不起分子筛
4、作用,该电泳技术是目前分离、分析 片段的标准方法。二、琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法,主要用于核酸(和)、少部分蛋白等生物大分子的检测。三、核酸琼脂糖凝胶电泳的检测原理琼脂糖凝胶电泳是基因工程实验室中分离鉴定核酸的常规方法。核酸是两性电解质,其等电点为 .,在常规的电泳缓冲液中(约.),核酸分子带负电荷,在电场中向正极移动。核酸分子在琼脂糖凝胶中泳动时,具有电荷效应和分子筛效应,但主要为分子筛效应。四、影响核酸琼脂糖凝胶电泳的主要因素(一)核酸的分子大小线状双链 分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与 分子质量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难以在凝胶孔
5、隙中移动,因而迁移得越慢。具体如图 所示。(二)核酸分子的构象当 分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子质量有关,还和它本身构象有关。相同分子质量的线状、开环和超螺旋质粒 在琼脂糖凝胶中移动的速度是不一样的,超螺旋 移动得最快,而开环状 移动得最慢。如在电泳鉴定质粒纯度时发现凝胶上有数条 带难以确定是质粒 不同构象引起还是因为含有其他 引起时,可从琼脂糖凝胶上将 带逐个回收,用同一种限制性内切酶分别水解,然后电泳,如在凝胶上出现相同的 图谱,则为同一种。具体如图 所示。图 不同类型 分子电泳图(三)电源电压在低电压时,线状 片段的迁移速率与所加电压成正比。但是随着电场强度的增加,不同
6、分子质量的 片段的迁移率将以不同的幅度增长,片段越大,因电场强度升高引起的迁移率升高幅度也越大,因此电压增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围将缩小。要使大于 的 片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过 。在一般进行 结果检测时,为了更快地得到检测结果,电压一般设定到 左右进行电泳。但是在加入检测结果条带较多,如进行分子标记结果检测时,一般要求电压 ,这样跑出的电泳条带很清晰且漂亮。(四)离子强度影响电泳缓冲液的组成及其离子强度影响 的电泳迁移率。在没有离子存在时(如误用蒸馏水配制凝胶),电导率最小,几乎不移动;在高离子强度的缓冲液中(如误加 电泳缓冲液),则电导率很高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化
7、或 变性。(五)核酸染料在核酸电泳中,最常用的染料是溴化乙锭(,),其能插入 分子中形成复合物,在波长为 紫外光照射下 能发射荧光,而且荧光的强度正比于核酸的含量,如将已知浓度的标准样品作电泳对照,就可估算出待测样品的浓度。由于溴化乙锭有致癌的嫌疑,所以现在也开发出了安全的染料,如 (双链嵌合荧光染料)、(一种新型核酸染料)、(一种新型核酸染料)等。但是其染色效果总的来说都不如溴化乙锭好。(六)不同类别和浓度的凝胶常规的水平式琼脂糖凝胶电泳适合于 和 的分离鉴定;但经甲醛进行变性处理的琼脂糖电泳更适用于 的分离鉴定和 印迹杂交,因为变性后的 是单链,其泳动速度与相同大小的 分子质量一样,因而可
8、以进行 分子大小的测定,而且染色后条带更为锐利,也更牢固结合于硝酸纤维素膜上,与放射性或非放射性标记的探针发生高效杂交。根据分离核酸片段的大小,在分离时选用不同浓度的琼脂糖凝胶,具体选择参考表 。五、琼脂糖凝胶电泳常用仪器设备琼脂糖凝胶电泳常用的仪器设备主要包括电源、电泳仪、缓冲液(主要是)、琼脂糖凝胶、微量移液器、染料等。具体见图 。六、琼脂糖凝胶电泳的操作步骤()用胶带将洗净、干燥的制胶板的两端封好,水平放置在工作台上。()调整好梳子的高度。()开始配制琼脂糖凝胶,称取.琼脂糖于 的.中,在微波炉中使琼脂糖颗粒完全溶解。()冷却到 左右,加入溴化乙锭()(取自配制的 的 储 备 液,存 放
9、),最 后 浓 度.,摇 匀 后,冷 却 至 时倒入制胶板中,使其厚度约为。()室温放置 后,溶液凝固形成凝胶,小心拔去梳子,撕下胶带,即制成琼脂糖凝胶板。()使琼脂糖凝胶板平移至电泳槽中,加样孔在负极,缓慢加入.缓冲液,使液面浸没胶面 左右。()将电泳样品与上样缓冲液混合,依次点入加样孔中。()接通电源,使其维持在 左右,一般电压为 ,当溴酚蓝移至阳极端时,关闭电源。()取出胶板,在 紫外灯下观察,凝胶内加入的 会渗入 分子内,在紫外灯下呈现红色荧光区带,以此确定核酸存在的位置。观察结果,并照相记录。应用举例植物基因组 的琼脂糖凝胶电泳检测第三节 聚丙烯酰胺凝胶电泳一、聚丙烯酰胺凝胶电泳介绍
10、聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺(简称)单体和少量交联剂甲叉双丙烯酰胺(简称)通过化学催化剂(过硫酸铵),四甲基乙二胺()作为加速剂或光催化聚合作用形成的三维空间的高聚物。聚合后的聚丙烯酰胺凝胶形成网状结构。具有浓缩效应、电荷效应、分子筛效应。它是一种垂直式电泳,聚丙烯酰胺凝胶分为两部分,上部分是浓缩胶,一般浓度较稀(左右),主要起浓缩样品的作用;下部分是分离胶,一般来说浓度较大(左右),主要起分离样品的作用。由于在聚丙烯酰胺凝胶电泳过程中经常加入离子去污剂和强还原剂(即十二烷基硫酸钠),蛋白质亚基的电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小(可以忽略电荷因素),避免了构象对电泳迁移速度的影响,因此聚丙
11、烯酰胺凝胶电泳又称为 。二、的基本原理 是在蛋白质样品中加入 和 巯基乙醇的样品处理液,是一种很强的阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级和三级结构。强还原剂 巯基乙醇可以断开二硫键,破坏蛋白质的四级结构。使蛋白质完全变性,解聚成单链分子。与解聚后的单链充分结合,形成带有大量负电荷的蛋白质 复合物。蛋白质分子结合 阴离子后,所带负电荷的量远远超过了它原有的净电荷,从而消除和遮盖了不同种类蛋白质间原有分析构象和电荷的差异。蛋白质的电泳迁移率主要决定于亚基的相对分子质量,而与其原有电荷和形状无关,如图 所示。三、的分离效应.浓缩效应浓缩胶的孔径大,分离胶的孔径小。在
12、电场的作用下,蛋白质颗粒在大孔径的浓缩胶中泳动时遇到的阻力小,移动快。而在小孔径的分离胶中泳动时遇到的阻力大,移动慢。因此,在两层凝胶的交界处,由于凝胶孔径的不连续性使样品迁移受阻而压缩成很窄的区带,如图 所示。.电荷效应当样品进入分离胶后,由于每种蛋白质所带的电荷多少不同,因而迁移率也不同。表面电荷多,则迁移快,反之则慢,因此各种蛋白质因迁移速率不一而以一定顺序排列成一个个区带,在凝胶中得以分离,如图 所示。.分子筛效应电场中,颗粒小,呈球形的样品分子泳动速率快;颗粒大,形状不规则的分子通过凝胶孔洞时受到的阻力大,泳动慢。所以受阻滞的程度不同而表现出不同的迁移率,如图 所示。四、聚丙烯酰胺凝
13、胶电泳常用的仪器设备聚丙烯酰胺凝胶电泳使用的仪器设备主要有电泳槽、电泳仪、凝胶架、玻璃板、插孔梳、固定玻璃板装置、点样辅助梳等,具体如图 所示。五、聚丙烯酰胺凝胶电泳常用的试剂.凝胶储备液丙烯酰胺.、甲叉双丙烯酰胺.、加双蒸水至、冰箱可保存一个月。.分离胶缓冲液.(.):.,加入约 双蒸水,用 的 调 到.,用双蒸水定容至最终体积,冰箱保存备用。.浓缩胶缓冲液.(.):,加入约 双蒸水,用 的 调 到.,用双蒸水定容至最终体积,冰箱保存备用。.甘氨酸电泳缓冲液.,、甘氨酸.、.,加双蒸水至,冰箱保存备用。.样品处理液 (.)、巯基乙醇、.溴酚蓝、甘油。.低相对分子质量标准蛋白质。.过硫酸铵浓度
14、为 过硫酸铵,此溶液需现配现用。.染色液.考马斯亮蓝,加入 甲醇,冰醋酸。.脱色液 甲醇,冰醋酸与 双蒸水混合。.的琼脂.琼脂粉加 双蒸水,加热至沸腾,未凝固前使用。六、主要操作流程聚丙烯酰胺凝胶电泳主要操作过程包括组装电泳操作装置制备分离胶和浓缩胶制备样品加样电泳固定染色脱色观察计算。()配制 所需的各种试剂。()将平板玻璃洗净烘干,组装在一起,在缝隙加入.琼脂封边。()迅速在两玻璃板的间隙中灌注丙烯酰胺溶液,留出灌注浓缩胶所需空间(梳子的齿长再加.)。再在胶液面上小心注入一层水(高),以阻止氧气进入凝胶溶液。()分离胶聚合完全后(约),倾出覆盖水层,再用滤纸吸净残留水。()制备浓缩胶:按所
15、需浓度需加入的量进行配制,一旦加入,马上开始聚合,故应立即快速旋动混合物并进入下步操作。()立即在浓缩胶溶液中插入干净的梳子。小心避免混入气泡,再加入浓缩胶溶液以充满梳子之间的空隙,将凝胶垂直放置于室温下。()在等待浓缩胶聚合时,可对样品进行处理,在样品中按 体积比加入样品处理液,在 加热 以使蛋白质变性。()浓缩胶聚合完全后,小心移出梳子。把凝胶固定于电泳装置上,上下槽各加入 甘氨酸电极缓冲液。必须设法排出凝胶底部两玻璃板之间的气泡。()按预定顺序加样,加样量通常为 (.厚的胶)。()将电泳装置与电源相接,浓缩胶所加电压为 。当染料前沿进入分离胶后,把电压提高到 ,继续电泳直至溴酚蓝到达分离
16、胶底部上方约,然后关闭电源。()从电泳装置上卸下玻璃板,用刮勺撬开玻璃板。紧靠最左边一孔(第一槽)凝胶下部切去一角以标注凝胶的方位。()在两侧溴酚蓝染料区带中心,插入细铜丝作为前沿标记。()加入固定液中固定 以上,以固定其中的蛋白质成分。()之后,加入考马斯亮蓝染液,在固定的同时进行染色,染色时间超过 小时为宜。()换脱色液脱色,在水平摇床上脱色 ,更换多次脱色液,直到背景清楚。()对凝胶进行拍照,或将凝胶干燥成胶片。()用直尺分别量出标准蛋白质,待测蛋白质区带中心以及钢丝距分离胶顶端的距离,按下式计算相对迁移率:以蛋白质相对分子质量标准物的对数相对迁移率作图,得到标准曲线。根据待测蛋白质样品
17、的相对迁移率,从标准曲线上查出其相对分子质量。相对迁移率 蛋白质样品迁移距离()/溴酚蓝区带距加样端距离()七、聚丙烯酰胺凝胶电泳中常见的问题及解决方法.纹理和拖尾现象由于样品溶解不好引起的,克服的方法可以在加样前离心,增加一些增溶辅助试剂如尿素。.蛋白带过宽与邻近泳道的蛋白带相连是由于加样量太多,可以减少上样量。.指示剂成微笑符号说明凝胶不均匀冷却,中间部分冷却不好,导致分子有不同的迁移率所致。.凝胶时间不对通常胶在 至 内凝固。如果凝得太慢,可能是、剂量不够或者失效。应该现配现用,不稳定,易被氧化成黄色。如果凝得太快,可能是 和 用量过多,此时胶太硬易裂。应用举例聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定牛乳
18、蛋白质的研究第四节 蛋白质双向电泳双向电泳是一种分析从细胞、组织或其他生物样本中提取的蛋白质混合物的有力手段,已得到广泛应用。这项技术利用蛋白质的两种特性,分两步将不同的蛋白质分离。第一步骤为等电聚焦(),即根据蛋白质的等电点()差异将蛋白质分离。第二步骤为十二烷基硫酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳(),即利用蛋白质的分子质量差异将蛋白质分离。双向凝胶电泳结果中的每个蛋白质点都对应着样本中的一种蛋白。因此,可将上千种不同的蛋白质分离开来,并得到每种蛋白质的等电点、表观分子质量和含量等信息。目前,这项技术已经成为蛋白质组学研究的一个主要方法,和质谱技术一起成为了鉴定蛋白质差异表达的十分重要的手段。一、双
19、向电泳实验步骤(一)样本制备正确的样本制备对于良好的双向电泳结果是十分重要的。(二)干胶条水化进行等电聚焦电泳()之前,必须加入恰当的添加物,使 干胶条溶胀。(三)等电聚焦电泳()第一向 电泳在平板电泳系统中进行,电泳时采用超高电压和主动温度控制。(四)干胶条平衡将样本胶条在含有 的平衡液中进行平衡处理,以便第二向分离。(五)十二烷基硫酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳()样本胶条进行第二向 凝胶电泳。(六)显影对第二向凝胶基质上的蛋白质斑点进行染色,使之显影。如果蛋白质经预先标记过,就可以通过放射自显影,或紫外线照射,或荧光显像的方法使蛋白质斑点显影。(七)分析对样本双向电泳斑点结果进行分析。蛋白质双
20、向电泳流程如图 所示。二、双向凝胶电泳各个步骤的原理及注意事项(一)样品的制备要得到良好的双向电泳结果,适当的样本制备是很重要的。尽量使样本中的蛋白质完全溶解、分离、变性、还原。在设计某种样本制备方案时,必须对双向电泳最终要达到怎样的结果有清晰的把握。样本制备过程中,增加步骤能提高电泳最终结果的质量,但同时也能导致一些蛋白选择性的丢失。所以必须充分考虑提高样本质量和样本的完全分离之间的相互关系,权衡利弊。要想在复杂的蛋白质混合物中辨别出特定的蛋白质,必须使那些感兴趣的蛋白质在电泳条件下完全裂解。裂解不同种类的蛋白质样本应采用不同的处理和条件:一些蛋白质在天然条件下与膜、核酸及其他蛋白质形成复合
21、物;一些蛋白质形成各种非特异性的集合体;一些蛋白质一旦离开其正常环境就会发生沉淀。裂解的效果取决于细胞破碎的方法、蛋白质浓缩和裂解的方法、去污剂的选择以及样本溶液的组成。.细胞破碎、避免蛋白质水解、样本分级为了对细胞内蛋白做全面分析,必须有效地破碎细胞。细胞破碎方法的选择依赖于样本是来源于细胞悬液、实体组织还是其他生物材料,以及是否要分析细胞内所有蛋白质或仅仅是细胞内的一部分蛋白质。当细胞被破碎后,蛋白酶就被释放出来或被激活。由于蛋白酶的作用,会使蛋白质分解,使双向电泳的最后结果复杂化,所以,必须避免这个问题。如果可能的话,应直接将样本在强变性液中裂解,用 尿素、或 来抑制蛋白酶。低温下蛋白酶
22、的活性低,因此建议在样本制备时尽可能地在低温下进行。此外,样本在制备过程中,通常在 碱、碳酸钠或碱性载体两性电解质存在的条件下,蛋白酶能得以有效抑制。如果只对组织或细胞中的一部分蛋白质感兴趣,在样品制备过程中可以采取样本分级的方法。如果想要分析的蛋白质来源于某一亚细胞单位(如细胞核、线粒体、质膜等),可以在蛋白质裂解之前采取差速离心或其他方法将感兴趣的细胞器纯化。还可以在双向电泳前,将样本在不同的提取条件下利用溶解性的不同进行样本分级。.蛋白质的沉淀和去除干扰物质在全细胞裂解液中,各种蛋白质的浓度范围差异很大,并呈动态变化,这种情况下,高丰度蛋白质就有可能掩盖低丰度蛋白质。有效的蛋白质组学分析
23、应当既包括将高丰度蛋白质分离,也包括富集低丰度蛋白质以达到可以检测到的水平。通过这种处理,提高了样本分析的分辨率,使双向电泳图像不至于过分拥挤,简化结果分析与解释,增加发现具有诊断或治疗价值蛋白质的机会。沉淀样本中的蛋白质及去除干扰物质并非必需的步骤,是否采用这两个步骤依赖于样本的特性和实验目的。(二)第一向:等电聚焦电泳()蛋白质是双性分子,会根据 环境不同而带正电荷、负电荷或不带电荷。只有在某一 时,蛋白质的净电荷为零,此 即为该蛋白质的等电点。在电场中,蛋白质分子在大于其等电点的 环境中以阴离子形式向正极移动,在小于其等电点的 环境中以阳离子形式向负极移动。如果在 梯度环境中将含有各种不
24、同等电点的蛋白质混合样品进行电泳,不管混合蛋白质分子的原始分布如何,都将按照它们各自的等电点大小在 梯度某一位置进行聚集,聚焦部位蛋白质的净电荷为零,测定聚焦部位的 即可知道该蛋白质的等电点。由于 梯度的变化程度和电场的强度决定了分离效果,为了得到最好的效果,一般在变性条件下进行。(三)第二向:十二烷基硫酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳()是一种根据蛋白质分子质量分离蛋白质的方法。它是在含有变性剂 的聚丙酰胺凝胶上实现的。是一种阴离子表面活性剂,当在蛋白质溶液中加入足够量的 时,形成了蛋白质 复合物,使得蛋白质从电荷和构象上都发生了改变。使蛋白质分子的二硫键还原,使各种蛋白质 复合物都带上相同密度的负
25、电荷,而且它的量大大超过了蛋白质分子原来的电荷量,因而掩盖了不同种蛋白质间原有的天然电荷差别。在凝胶中的迁移不再受蛋白质原来电荷和形状的影响,而仅取决于分子质量大小,从而可通过 来测定蛋白质的分子质量。第二向电泳包括 步:()凝胶制备。()胶条在 缓冲液中的平衡。()将平衡好的 胶条放在 凝胶上。()凝胶电泳。(四)染色目前,有很多方法来检测双向凝胶上所分离的蛋白质,主要方法是银染、考马斯亮蓝染色。以下将主要介绍这两种方法。.银染银染是一种非常灵敏的非放射性核素的方法(低于)。银染方法比较复杂,步骤较多,使用的试剂也较多,而且试剂纯度非常重要。最好采用专用的试剂盒,试剂盒中的试剂能够保证银染的
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