生物化学课件蛋白质结构与功能.ppt
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1、五、蛋白质的结构五、蛋白质的结构蛋白质蛋白质是由一条或多条多肽链以特殊方是由一条或多条多肽链以特殊方式组合成的生物大分子。式组合成的生物大分子。蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将分子量在将分子量在60006000道尔顿道尔顿(dalton,ddalton,d)以上以上的多肽称为蛋白质。的多肽称为蛋白质。蛋白质分子量变化范围很大蛋白质分子量变化范围很大,从大约从大约60006000到到100100万道尔顿甚至更大。万道尔顿甚至更大。1.1.构型和构象构型和构象构型构型(configuration)(configuration):立体异构体分子中立体异构体分子中
2、取代原子或者基团的取向。这种排列的改变取代原子或者基团的取向。这种排列的改变会牵涉到会牵涉到共价键共价键的的形成和破坏形成和破坏,但与氢键无,但与氢键无关。例如氨基酸的关。例如氨基酸的D-D-和和L-L-型。型。构象构象(conformation):取代基团单键旋转时取代基团单键旋转时形成的不同的立体结构,这种空间位置的改形成的不同的立体结构,这种空间位置的改变变会牵涉到氢键的形成和破坏,但共价键不会牵涉到氢键的形成和破坏,但共价键不被破坏。被破坏。一级结构一级结构 二级结构二级结构 三级结构三级结构 四级结构四级结构aaaa顺序顺序 -螺旋螺旋 多肽链多肽链 寡聚蛋白寡聚蛋白 (单体蛋白或亚
3、基)(单体蛋白或亚基)2.2.蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构(primary structure)指蛋白指蛋白 质分子中氨基酸残基的排列顺序。质分子中氨基酸残基的排列顺序。蛋白质的化学结构包括组成蛋白质的多肽链蛋白质的化学结构包括组成蛋白质的多肽链 数目,多肽链的氨基酸序列,以及多肽链内数目,多肽链的氨基酸序列,以及多肽链内 或链间二硫键的数目和位置。或链间二硫键的数目和位置。二硫键二硫键(disulfide bond):由肽链中相应部由肽链中相应部 位上两个半胱氨酸残基的侧链脱氢形成。位上两个半胱氨酸残基的侧链脱氢形成。链间链间二硫键二硫键 链内链内二硫键
4、二硫键我国我国19651965年在世界上第一个用化年在世界上第一个用化学方法人工合成这种学方法人工合成这种牛胰岛素牛胰岛素。牛牛胰胰核核糖糖核核酸酸酶酶的的一一级级结结构构(1 1)蛋白质样品的预处理)蛋白质样品的预处理;(2 2)测定每条多肽链的氨基酸组成测定每条多肽链的氨基酸组成;(3 3)测定)测定多肽链的多肽链的N-N-末端和末端和C-C-末端末端;(4 4)应用两种或两种以上不同的水解方法将所要)应用两种或两种以上不同的水解方法将所要测定的蛋白质断裂,各自得到一系列大小不同测定的蛋白质断裂,各自得到一系列大小不同的肽段;的肽段;(5 5)分离提纯所产生的肽,并测定它们的序列;)分离提
5、纯所产生的肽,并测定它们的序列;(6 6)从有重叠结构的各个肽的序列中推断出蛋白)从有重叠结构的各个肽的序列中推断出蛋白质中全部氨基酸顺序。质中全部氨基酸顺序。蛋白质一级结构测定的步骤蛋白质一级结构测定的步骤(3 3)分析多肽链的分析多肽链的N-N-末端和末端和C-C-末端末端;N-N-端氨基酸分析法:端氨基酸分析法:DNFBDNFB法、法、EdmanEdman法、氨肽酶法(法、氨肽酶法(肽链外切肽链外切酶,它能从多肽链的酶,它能从多肽链的N-N-端逐个的向里水解端逐个的向里水解)C-C-端氨基酸分析法:端氨基酸分析法:羧肽酶法(羧肽酶法(肽链外切酶,它能从多肽链的肽链外切酶,它能从多肽链的C
6、-C-端端逐个的逐个的向里向里水解水解)、肼解法)、肼解法肼解法肼解法多肽与肼在无多肽与肼在无水条件下加热,水条件下加热,C-C-端氨基酸即端氨基酸即从肽链上解离从肽链上解离出来,其余的出来,其余的氨基酸则变成氨基酸则变成肼化物;肼化肼化物;肼化物能够与苯甲物能够与苯甲醛缩合成不溶醛缩合成不溶于水的物质而于水的物质而与与C-C-端氨基酸端氨基酸分离。分离。3、多肽链折叠的空间限制多肽链折叠的空间限制 肽肽键键带带有有双双键键的的性性质质,主主链链上上1/31/3的的键键不不能能自自由由旋旋转转。肽肽键键中中的的四四个个原原子子和和它它相相临临的的两两个个CC原子都处于一个平面上(原子都处于一个
7、平面上(酰胺平面)酰胺平面)。多肽链通过可多肽链通过可 旋转的旋转的-碳碳 原原 子连接子连接的酰胺平面链的酰胺平面链 二个肽平面旋转时受到二个肽平面旋转时受到CC原子上侧链原子上侧链R R基空间位阻的影响。基空间位阻的影响。蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构v蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构(Secondary Structure)Secondary Structure)是指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式。是指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式。v它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。成的氢键。v主要有主要有-螺旋、螺旋、-折叠、折叠、-转角、无规卷
8、转角、无规卷曲曲等。等。(1 1)-螺旋螺旋(-helix)helix)最常见最常见多肽链中的各个肽平面围绕多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转,形成螺旋结构,同一轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一周,沿轴上升的距离螺旋一周,沿轴上升的距离即螺距为即螺距为0.540.54nm,nm,含含3.63.6个个AaAa残基;两个残基;两个AaAa之间的距离为之间的距离为0.150.15nmnm;AaAa残基残基侧链伸向外侧,相邻侧链伸向外侧,相邻的螺圈之间的螺圈之间形成链内氢键;形成链内氢键;天然蛋白质的天然蛋白质的-螺旋通常都螺旋通常都是右手是右手-螺旋。螺旋。氢键的取向几乎与轴平行,氢键的取向几乎与轴平行
9、,第一个氨基酸残基的酰胺基第一个氨基酸残基的酰胺基团的团的-COCO基与第五个氨基酸基与第五个氨基酸残基酰胺基团的残基酰胺基团的-NHNH基形成基形成氢键。氢键。-螺旋有左旋和右螺旋有左旋和右旋两种,右旋比左旋两种,右旋比左旋更加稳定,因此旋更加稳定,因此也更常见。也更常见。影响影响-helixhelix不稳定的因素:不稳定的因素:a.多肽链中连续存在带相同电荷的氨基酸;多肽链中连续存在带相同电荷的氨基酸;b.多肽链中有多肽链中有ProPro时,则时,则helixhelix中断,产中断,产生一个生一个“结节结节”;c.R R基团太大,造成空间阻碍作用。基团太大,造成空间阻碍作用。(2 2)折叠
10、折叠(pleatedpleated sheet)sheet)两条或多条几乎完全伸展的肽链通过两条或多条几乎完全伸展的肽链通过链间的氢链间的氢键键交联而形成的;交联而形成的;肽链的主链呈锯齿状折叠构象,肽链的主链呈锯齿状折叠构象,R R基团处于基团处于折折叠平面的两侧。叠平面的两侧。平行式平行式反平行式反平行式折叠中的折叠中的氢键与氢键与-螺螺旋中的氢键有旋中的氢键有何不同?何不同?(3 3)转角转角(turnturn)或或迴迴 转结构转结构(reversereverse turn turn)多肽链经常出现多肽链经常出现180180的回折,这个回折角就是的回折,这个回折角就是 转角结构;转角结构
11、;它由四个它由四个AaAa残基组成残基组成;回折处的第一个回折处的第一个AaAa残残 基的基的 -C=OC=O 和第四个和第四个 AaAa残基的残基的 N-HN-H 之间之间 形成氢键,形成一个不很稳定的环状结。形成氢键,形成一个不很稳定的环状结。(4 4)无规卷曲)无规卷曲(nonregularnonregular coil coil)或自由回转或自由回转(random coil)random coil)没有一定规律的松散的肽链结构,通常没有一定规律的松散的肽链结构,通常酶的活性中心酶的活性中心常处在这一构象区域里。常处在这一构象区域里。转角转角折叠折叠 螺旋螺旋无规卷曲无规卷曲4.4.超二
12、级结构和结构域超二级结构和结构域v 超二级结构超二级结构(supersecondarysupersecondary structure)structure):是指若干相邻的二级结构中的构象单元彼是指若干相邻的二级结构中的构象单元彼 此相互作用,形成有规则的,在空间上能此相互作用,形成有规则的,在空间上能 辨认的二级结构组合体。通常有辨认的二级结构组合体。通常有,。v 结构域结构域(domaindomain):是在超二级结构:是在超二级结构 基础上进一步卷曲折叠成紧密的近似基础上进一步卷曲折叠成紧密的近似 球状的结构,在空间上彼此分隔,各球状的结构,在空间上彼此分隔,各 自具有自具有部分生物功能
13、部分生物功能的结构。的结构。由由4 4个个组成的组成的/桶结构域桶结构域/桶结构域:丙酮酸激酶桶结构域:丙酮酸激酶 小的蛋白质分子只有一个小的蛋白质分子只有一个 结构域结构域 结构域三级结构结构域三级结构 大的蛋白质分子有数个结大的蛋白质分子有数个结 构域构域丙酮酸激酶己糖激酶前清蛋白肌红蛋白免疫球蛋白5.5.三级结构三级结构(Tertiary StructureTertiary Structure)在二级结构基础上,肽链不同区段的侧在二级结构基础上,肽链不同区段的侧链基团相互作用,进一步盘绕、折叠形链基团相互作用,进一步盘绕、折叠形成的的空间结构。成的的空间结构。维系这种特定结构的力主要有氢
14、键、疏维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键、范德华力和二硫键、配水键、离子键、范德华力和二硫键、配位键等。位键等。肌肌红红蛋蛋白白辅辅基基血血红红素素结结构构图图多肽链多肽链疏水键疏水键氢键氢键二硫键二硫键离子键离子键CHCH2 2OHOH CHCH2 2OHOH范德华力范德华力维维持持三三级级结结构构的的作作用用力力6.6.四级结构四级结构(Quaternary Quaternary StructureStructure)由由两两条条或或两两条条以以上上具具有有三三级级结结构构的的肽肽链链聚聚合合而而成成的的特特定定构构象象的的蛋蛋白白质质分分子子叫蛋白质的四级结构;叫蛋白质的四级
15、结构;其其中中具具有有独独立立三三级级结结构构的的一一条条肽肽链链叫叫亚基亚基(subunit)subunit),无生物功能;无生物功能;由由几几个个亚亚基基聚聚集集而而成成的的蛋蛋白白质质常常常常称称为寡聚蛋白。为寡聚蛋白。4 4个亚基缔合而成个亚基缔合而成 2 2种亚基种亚基(、)亚基呈亚基呈球形球形 亚基间靠亚基间靠次级键次级键连接连接 亚基两两相同,亚基两两相同,分别分别 为为1 1、2 2、1 1、2 每个亚基都含有一个每个亚基都含有一个 血红素辅基血红素辅基血红蛋白血红蛋白 氨基酸序列大氨基酸序列大 不相同,但结不相同,但结 构构(三级)(三级)相相 似,功能也相似,功能也相 似(
16、载氧)似(载氧)结构决定功能结构决定功能维持蛋白质结构的作用力维持蛋白质结构的作用力v 一级结构:一级结构:肽键、二硫键肽键、二硫键(都属于共价键)(都属于共价键)v 二级结构:二级结构:氢键氢键(主链上(主链上C=OC=O和和NHNH之之 间形成)间形成)v 三、四级结构:三、四级结构:次级键次级键(氢键、疏水键、(氢键、疏水键、离子键、范德华力、配位键)离子键、范德华力、配位键)7.7.蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系a.a.同源蛋白质中氨基酸顺序的种属差异同源蛋白质中氨基酸顺序的种属差异 同源蛋白质同源蛋白质(homologous proteinhomologous prot
17、ein):):指指不同的有机体中实现同一功能的蛋白质。不同的有机体中实现同一功能的蛋白质。例如:胰岛素和细胞色素例如:胰岛素和细胞色素C C(1 1)蛋白质的一级结构与功能的关系)蛋白质的一级结构与功能的关系b.b.同种蛋白质中氨基酸顺序的个体差异(分子病)同种蛋白质中氨基酸顺序的个体差异(分子病)血红蛋白的一级结构变化引起镰刀型贫血病血红蛋白的一级结构变化引起镰刀型贫血病正常细胞正常细胞 镰刀形细胞镰刀形细胞 血液中大量出现镰刀血液中大量出现镰刀 型红细胞,患者因此型红细胞,患者因此 缺氧窒息;缺氧窒息;它是最早认识的一种它是最早认识的一种 分子病。流行于非洲,分子病。流行于非洲,死亡率极高
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- 生物化学 课件 蛋白质 结构 功能
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