生物化学-第三章酶.ppt
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1、第三章第三章 酶酶(ENZYME)第一节第一节 酶的概念酶的概念一、对酶认识的发展一、对酶认识的发展 1857年,年,Paster提出酒精发酵是酵母细胞活动的结提出酒精发酵是酵母细胞活动的结 果,并于果,并于1878年提出年提出“酶酶(Enzyme)”的概念;的概念;1897年,年,Buchner提出了发酵与活细胞无关,而与提出了发酵与活细胞无关,而与细胞液中的酶有关;细胞液中的酶有关;1913年,年,Michaelis和和Menten提出了酶促动力学原理提出了酶促动力学原理-米氏学说;米氏学说;19261926年年,SumnerSumner首首次次分分离离出出脲脲酶酶结结晶晶,证证明明具具有
2、有蛋白质性质。蛋白质性质。19301930年年左左右右,NorthropNorthrop又又分分离离出出胃胃蛋蛋白白酶酶、胰胰蛋蛋白酶及胰凝乳蛋白酶白酶及胰凝乳蛋白酶,并进行动力学探讨。,并进行动力学探讨。许许多多酶酶的的一一级级结结构构已已测测定定,1969,1969年年人人工工合合成成牛牛胰胰核酸酶核酸酶。1981-19821981-1982年年Cech实实验验室室发发现现第第一一个个有有催催化化活活性性的天然的天然RNARNA,取名取名核酶核酶ribozyme。19951995年还发现了具有催化活性的年还发现了具有催化活性的DNADNA。n 酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子,酶
3、是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子,又称为又称为生物催化剂生物催化剂Biocatalysts n 酶催化的生物化学反应,称为酶催化的生物化学反应,称为酶促反应酶促反应 n 绝大多数的酶都是蛋白质绝大多数的酶都是蛋白质n 生物体内一切生化反应都需要酶的催化才能进行!生物体内一切生化反应都需要酶的催化才能进行!n 通常把被酶作用的物质称为该通常把被酶作用的物质称为该酶的底物酶的底物 (substrate)酶的概念酶的概念二、酶的催化作用特征二、酶的催化作用特征1、酶和一般催化剂的共性酶和一般催化剂的共性1 1)用量少而催化效率高;)用量少而催化效率高;2 2)它能够改变化学反应的速度,但是不
4、能改变化学)它能够改变化学反应的速度,但是不能改变化学反应平衡反应平衡3 3)酶本身在反应前后不发生变化)酶本身在反应前后不发生变化4 4)酶能够降低反应的活化能,从而加速反应的进行。)酶能够降低反应的活化能,从而加速反应的进行。活化态活化态2 2、酶与一般催化剂的区别、酶与一般催化剂的区别1 1)高效性:)高效性:酶的催化作用可使反应速度提高酶的催化作用可使反应速度提高10106 6 10101313倍。倍。例如:过氧化氢分解例如:过氧化氢分解 2 2H H2 2O O2 2 2H 2H2 2O+OO+O2 2过氧化氢酶催化,效率为过氧化氢酶催化,效率为6106106 6 mol/mol/m
5、oLmoLs s,FeFe3+3+催化,效率为催化,效率为610610-4-4 mol/mol/moLmoLs s,比无催化剂高比无催化剂高10108 810102020倍(一亿一千亿亿倍)倍(一亿一千亿亿倍)。2 2)高度专一性)高度专一性酶的专一性酶的专一性 (SpecificitySpecificity)(特异性特异性)指酶在催化生化反应时对底物的选择性。指酶在催化生化反应时对底物的选择性。3 3)反应条件温和)反应条件温和,对环境变化敏感对环境变化敏感酶促反应一般在酶促反应一般在pH 5-8 pH 5-8 水溶液中进行,反应温度范围水溶液中进行,反应温度范围为为20-4020-40 C
6、 C。高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活。高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活。4)4)酶的催化活力受调控酶的催化活力受调控 如抑制剂调节、共价修饰调节、反馈调节、酶原激活如抑制剂调节、共价修饰调节、反馈调节、酶原激活及激素控制等。及激素控制等。第二节第二节 酶的分类和命名酶的分类和命名 一、酶的命名一、酶的命名(1)(1)习惯命名法习惯命名法:1 1、根据其催化底物来命名:、根据其催化底物来命名:淀粉酶、脂肪酶淀粉酶、脂肪酶2 2、根据所催化反应的性质来命名:、根据所催化反应的性质来命名:水解酶、转移酶水解酶、转移酶3 3、结合上述两个原则来命名:、结合上述两个原则来命
7、名:琥珀酸脱氢酶琥珀酸脱氢酶4 4、有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点:、有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点:胃蛋白酶胃蛋白酶2、系统命名法、系统命名法系统名称包括底物名称、构型、反应性质,最后加一个系统名称包括底物名称、构型、反应性质,最后加一个酶字。酶字。底物底物1:底物:底物2+反应性质反应性质+酶酶例如:酶促反应例如:酶促反应:谷氨酸谷氨酸+丙酮酸丙酮酸 -酮戊二酸酮戊二酸+丙氨酸丙氨酸 习惯名称习惯名称:谷丙转氨酶谷丙转氨酶 系统名称系统名称:丙氨酸:丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶酮戊二酸氨基转移酶二、二、酶的分类酶的分类1.1.氧化还原酶氧化还原酶 如:脱氢酶、氧化酶
8、等。如:脱氢酶、氧化酶等。AH2 +B =A +BH2 乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶AB +C =A +CB谷丙转氨酶谷丙转氨酶2 2.转移酶转移酶 TransferaseTransferase主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。AB+HOHAB+HOH AOH+BH AOH+BH脂肪酶脂肪酶(Lipase)(Lipase)3 3.水解酶水解酶 hydrolasehydrolase催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。的反应及其逆反应。醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。AB =
9、A +BAB =A +B延胡索酸水合酶延胡索酸水合酶4 4.裂解酶裂解酶 LyaseLyase 催化各种同分异构体的相互转化催化各种同分异构体的相互转化 A=B 6-磷酸葡萄糖异构酶磷酸葡萄糖异构酶5 5.异构酶异构酶 IsomeraseIsomerasePP(连接酶连接酶)能够催化与能够催化与ATPATP分解反应相偶联的由小分子分解反应相偶联的由小分子合成大分子的反应。合成大分子的反应。A+B+ATP+H-O-H A+B+ATP+H-O-H A AB+ADP+Pi B+ADP+Pi 丙酮酸羧化酶丙酮酸羧化酶 ATP+ATP+丙酮酸丙酮酸 +COCO2 2 草酰乙酸草酰乙酸 +ADP+Pi+A
10、DP+Pi 6 6.合成酶合成酶 Ligase or SynthetaseLigase or Synthetase酶的编号(乳酸脱氢酶为例)酶的编号(乳酸脱氢酶为例)EC 1.1.1.27 第一大类,氧化还原酶第一大类,氧化还原酶 第一亚类,被氧化基团为第一亚类,被氧化基团为 CHOH 第一亚亚类,氢受体为第一亚亚类,氢受体为 NAD+该酶在此亚亚类中的编号该酶在此亚亚类中的编号第三节第三节 酶的化学本质酶的化学本质一、大多数酶是蛋白质一、大多数酶是蛋白质1 1、酶是蛋白质的证据、酶是蛋白质的证据2 2、核酶、核酶 1981198119821982,CechCech发现:发现:核酶:四膜虫(核
11、酶:四膜虫(TetrahynenaTetrahynena)细胞)细胞26SrRNA26SrRNA前体加工。前体加工。19831983年年S.AltmanS.Altman发现:发现:核糖核酸酶核糖核酸酶P P(RNAasePRNAaseP)的)的M M1 1RNARNA组分具该酶催化特性:组分具该酶催化特性:催化剪切催化剪切tRNAtRNA前体除去前体除去RNARNA片断,形成成熟的片断,形成成熟的tRNAtRNA。该酶的蛋白质部分无催化活性。该酶的蛋白质部分无催化活性。简单蛋白酶简单蛋白酶只含氨基酸而不含其它成分只含氨基酸而不含其它成分 酶蛋白酶蛋白专一性和高效性专一性和高效性 结合蛋白酶结合
12、蛋白酶 (全酶)(全酶)辅因子辅因子决定反应性质决定反应性质 (对热稳定的成分:(对热稳定的成分:VitVit、核苷酸、金属离子)、核苷酸、金属离子)与酶蛋白结合紧密与酶蛋白结合紧密辅基辅基 辅因子辅因子 与酶蛋白结合松弛与酶蛋白结合松弛辅酶辅酶二、按化学组成分为二、按化学组成分为羧肽酶Zn 离子(辅助因子)(辅助因子)(细胞色素氧化酶)(细胞色素氧化酶)(丙酮酸激酶)(丙酮酸激酶)三、按结构特点分三、按结构特点分单体酶:一个酶分子只由一条肽链构成单体酶:一个酶分子只由一条肽链构成 M Mr r=1.3=1.33.5103.5104 4全部为水解酶。全部为水解酶。寡寡聚聚酶酶:一一个个酶酶分分
13、子子由由二二个个以以上上的的亚亚基基组组成成,亚亚基基间非共价结合,解离则失活。间非共价结合,解离则失活。多酶络合物:由几个酶嵌合而成的复合物,分子量多酶络合物:由几个酶嵌合而成的复合物,分子量大,它有利于系列化学反应的连续进行,提高催化大,它有利于系列化学反应的连续进行,提高催化效率。效率。多酶络合物丙酮酸脱氢酶系丙酮酸脱氢酶系丙酮酸脱羧酶丙酮酸脱羧酶硫辛酸乙酰移换酶硫辛酸乙酰移换酶二氢硫辛酸脱氢酶二氢硫辛酸脱氢酶第四节第四节 酶的结构和功能的关系酶的结构和功能的关系一、活性部位和必需基团一、活性部位和必需基团1 1、活性中心(、活性中心(active site)n 指酶分子中直接和底物结合
14、,并和酶催化作用直接指酶分子中直接和底物结合,并和酶催化作用直接有关的部位。有关的部位。n包括结合包括结合基团基团和催化基团和催化基团结合部位(结合部位(Binding site)与底物结合的部位。与底物结合的部位。决定酶的专一性决定酶的专一性催化部位(催化部位(catalytic site)促使底物发生化学变化的部位促使底物发生化学变化的部位。决定化学反应的性质决定化学反应的性质主要包括:主要包括:(1)(1)亲核性基团亲核性基团Ser-OH;Ser-OH;Cys-SH;Cys-SH;HisHis的咪唑基的咪唑基.酶活性中心的基团酶活性中心的基团(2)(2)酸碱性基团:酸碱性基团:AspAs
15、p和和GluGlu的羧基的羧基LysLys的氨基的氨基TyrTyr的酚羟基的酚羟基HisHis的咪唑基的咪唑基CysCys的巯基等的巯基等活性中心的结构特点活性中心的结构特点只占酶分子总体积的很小一部分只占酶分子总体积的很小一部分具有三维空间结构具有三维空间结构酶的活性部位和底物的辨认和结合过程,称酶的活性部位和底物的辨认和结合过程,称为诱导契合(为诱导契合(induced-fit)2 2、必需基团、必需基团酶酶分分子子中中那那些些经经过过化化学学修修饰饰(氧氧化化、还还原原、酰酰化化、烷烷化化等等)使使其其改改变变,则则酶酶的的活活性性丧丧失失的的基基因称为必需基团。因称为必需基团。催化基团
16、催化基团决定催化性质决定催化性质活活性性中中心心结合基团结合基团决定专一性、参与底物决定专一性、参与底物 的结合的结合必必需需基基团团其余维持酶空间构象的基团其余维持酶空间构象的基团二、酶原的激活二、酶原的激活酶原(酶原(Zymogen):):有些酶(绝大多数为蛋白酶)在细胞内合成及初分泌时,没有些酶(绝大多数为蛋白酶)在细胞内合成及初分泌时,没有活性。有活性。酶原的激活:酶原的激活:在一定条件下,酶原可转化成有活性的酶。酶原激活的机制在一定条件下,酶原可转化成有活性的酶。酶原激活的机制是分子内肽键一处或多处断裂,使分子构象发生一定程度改是分子内肽键一处或多处断裂,使分子构象发生一定程度改变,
17、从而形成酶的活性中心,同时生成一些肽或碎片。变,从而形成酶的活性中心,同时生成一些肽或碎片。二、酶原的激活缬缬 天天 天天天天天天赖赖 异异异异缬缬 甘甘组组S SS S丝丝丝丝S SS S肠激酶(激活作用)肠激酶(激活作用)肠激酶(激活作用)肠激酶(激活作用)缬缬 天天 天天天天天天赖赖异异异异甘甘 组组SS丝丝丝丝缬缬SS活性中心活性中心活性中心活性中心胰胰胰胰蛋蛋蛋蛋白白白白酶酶酶酶原原原原胰胰胰胰蛋蛋蛋蛋白白白白酶酶酶酶活性部位二、酶原的激活二、酶原的激活 酶原激活还存在级联反应酶原激活还存在级联反应 酶原形式存在的生物学意义:酶原形式存在的生物学意义:保护组织细胞,防止被酶水解。保护
18、组织细胞,防止被酶水解。三、同工酶三、同工酶 同工酶是指能催化同一种化学反应,但其组成结构同工酶是指能催化同一种化学反应,但其组成结构有所不同的一组酶。有所不同的一组酶。它们的活性部位在结构上相同或者至少相似它们的活性部位在结构上相同或者至少相似1、概念、概念2、举例:、举例:乳酸脱氢酶同工酶(乳酸脱氢酶同工酶(LDH)功能:功能:催化乳酸脱氢形成丙酮酸;催化乳酸脱氢形成丙酮酸;四聚体,由亚基四聚体,由亚基A(M)和)和B(H)组成:)组成:LDH5(M4)LDH4(M3H)LDH3(M2H2)LDH2(MH3)LDH1(H4)第第6种同工酶种同工酶 LDH-X:亚基:亚基C组成四聚体组成四聚
19、体C4用途:用途:存在组织特异性,可通过其组成和浓度变化诊断存在组织特异性,可通过其组成和浓度变化诊断疾病,对病人和正常人同工酶电泳图谱比较有助疾病,对病人和正常人同工酶电泳图谱比较有助于疾病诊断。于疾病诊断。心脏疾病心脏疾病 LDH1、LDH2上升,上升,LDH3、LDH5下降下降 急性肝炎急性肝炎 LDH5明显上升明显上升 第五节第五节 酶作用的专一性酶作用的专一性一种酶只能作用于某一种或某一类结构性一种酶只能作用于某一种或某一类结构性质相似的物质。质相似的物质。底物专一性(分为三种)底物专一性(分为三种)绝对专一性绝对专一性 相对专一性相对专一性 立体异构专一性立体异构专一性结构专一性结
20、构专一性键专一键专一基团专一基团专一1 1)绝对专一性绝对专一性酶对底物的要求非常严格,只作用于一个特定的酶对底物的要求非常严格,只作用于一个特定的底物。这种专一性称为绝对专一性(底物。这种专一性称为绝对专一性(Absolute specificity)。例:脲酶、例:脲酶、O 2HN-C-NH2精氨酸酶精氨酸酶(结构专一性结构专一性)2)2)相对专一性相对专一性(Relative SpecificityRelative Specificity)酶的作用对象不是一种底物,而是一类化合物或酶的作用对象不是一种底物,而是一类化合物或一类化学键一类化学键相对专一性相对专一性(1 1)键专一性)键专一
21、性如:酯酶如:酯酶 R-CO-O-RR-CO-O-R (对(对R R和和R R/不要求不要求 )(2 2)基团专一性)基团专一性对于键的一端有严格要求,但对键的另一端没有对于键的一端有严格要求,但对键的另一端没有要求。要求。消化道中的蛋白酶消化道中的蛋白酶胰蛋白酶胰蛋白酶:R1=Lys:R1=Lys、ArgArg侧链侧链3 3)立体异构专一性立体异构专一性 旋光异构专一性旋光异构专一性酶只能专一地作用于立体异构专一性中的一种,酶只能专一地作用于立体异构专一性中的一种,而不作用于另一种而不作用于另一种L-L-氨基酸氧化酶氨基酸氧化酶催化催化L-AAL-AA氧化,不作用于氧化,不作用于D-D-AA
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