蛋白质的生物合成(翻译)Protein Biosynthesis,Translation.ppt
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1、蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成(翻译(翻译)Protein BiosynthesisProtein Biosynthesis,TranslationTranslation第第 十十 二二 章章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成,即,即翻译翻译,就是将,就是将核酸中由核酸中由 4 4 种种核苷酸序列核苷酸序列编码的遗传信息,编码的遗传信息,通过通过遗传密码遗传密码破译的方式解读为蛋白质一破译的方式解读为蛋白质一级结构中级结构中2020种种氨基酸的排列顺序氨基酸的排列顺序 。蛋白质合成体系蛋白质合成体系Protein Biosynthesis SystemProtein Biosynthesis
2、 System 第第 一一 节节 l2020种氨基酸种氨基酸(AA)AA)作为原料作为原料l酶及众多蛋白因子,如酶及众多蛋白因子,如IFIF、eIFeIF lATPATP、GTPGTP、无机离子无机离子参与蛋白质生物合成的物质包括参与蛋白质生物合成的物质包括l 三种三种RNARNAmRNAmRNA(messenger RNA,messenger RNA,信使信使RNARNA)rRNArRNA(ribosomal RNA,ribosomal RNA,核蛋白体核蛋白体RNARNA)tRNAtRNA(transfer RNA,transfer RNA,转移转移RNARNA)一、翻译模板一、翻译模板m
3、RNAmRNA及遗传密码及遗传密码l mRNAmRNA是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者遗遗传传学学将将编编码码一一个个多多肽肽的的遗遗传传单单位位 称称 为为 顺顺 反反 子子(cistroncistron)。原核细胞中数个结构基因常串联为一个原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的转录单位,转录生成的mRNAmRNA可编码几种功能可编码几种功能相关的蛋白质,为相关的蛋白质,为多顺反子多顺反子(polycistron)polycistron)。PPPPPP5 5 3 3 蛋白质蛋白质非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编
4、码序列编码序列非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPPPPPm mG G-5 5 3 3 蛋白质蛋白质 真真核核mRNAmRNA只只编编码码一一种种蛋蛋白白质质,为为单单顺顺反反子子(single cistron)single cistron)。l mRNAmRNA上存在遗传密码上存在遗传密码mRNAmRNA分分子子上上从从5 5 至至3 3 方方向向,由由AUGAUG开开始始,每每3 3个个核核苷苷酸酸为为一一组组,决决定定肽肽链链上上某某一一个个氨氨基基酸酸或或蛋蛋白白质质合合成成的的起起始始、终终止止信信号号,称称
5、为为三三联体密码联体密码(triplet triplet codencoden)。起始密码起始密码(initiation initiation codencoden):AUG):AUG 终止密码终止密码(termination termination codencoden):):UAAUAA,UAGUAG,UGA UGA 遗遗传传密密码码表表从从mRNA mRNA 5 5 端端起起始始密密码码子子AUGAUG到到3 3 端端终终止止密密码码子子之之间间的的核核苷苷酸酸序序列列,各各个个三三联联体体密密码码连连续续排排列列编编码码一一个个蛋蛋白白质质多多肽肽链链,称称为为开开放放阅阅读读框架框架
6、(open reading frame,ORF)open reading frame,ORF)。1.1.连续性连续性(c co ommalessmmaless)l遗传密码的特点遗传密码的特点编码蛋白编码蛋白质氨基酸序列质氨基酸序列的各个三联体的各个三联体密码连续阅读,密码连续阅读,密码间既无间密码间既无间断也无交叉。断也无交叉。基因损伤引起基因损伤引起mRNAmRNA阅读框架内的碱基发生插阅读框架内的碱基发生插入或缺失,可能导致入或缺失,可能导致框移突变框移突变(frameshiftframeshift mutation)mutation)。2.2.简并性简并性(degeneracy)dege
7、neracy)遗传密码遗传密码中,除中,除色氨酸色氨酸和和甲硫氨酸甲硫氨酸仅仅有一个密码子有一个密码子外,其余氨基外,其余氨基酸有酸有2 2、3 3、4 4个个或多至或多至6 6个三联个三联体为其编码。体为其编码。3.3.通用性通用性(universal)universal)蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。人类都通用。已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。物细胞的叶绿体。密码的通用性进一步证明各种生物进化自同密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。一祖先。4.4.摆动性摆动性(w
8、obble)wobble)转转运运氨氨基基酸酸的的tRNAtRNA的的反反密密码码需需要要通通过过碱碱基基互互补补与与mRNAmRNA上上的的遗遗传传密密码码反反向向配配对对结结合合,但但反反密密码码与与密密码码间间不不严严格格遵遵守守常常见见的的碱碱基基配配对规律,称为摆动配对。对规律,称为摆动配对。U摆动配对摆动配对密码子、反密码子配对的摆动现象密码子、反密码子配对的摆动现象tRNA反密码子反密码子第第1位碱基位碱基IUGACmRNA密码子密码子第第3位碱基位碱基U,C,AA,GU,CUG二、核蛋白体是多肽链合成的装置二、核蛋白体是多肽链合成的装置核核蛋蛋白白体体的的组组成成原核生物翻译过
9、程中核蛋白体结构模式原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:A A位:氨基酰位位:氨基酰位(aminoacyl site)aminoacyl site)P P位:肽酰位位:肽酰位(peptidyl site)peptidyl site)E E位:排出位位:排出位(exit site)exit site)三、三、tRNAtRNA与氨基酸的活化与氨基酸的活化反反密码环密码环氨基酸臂氨基酸臂tRNAtRNA的三级结构示意图的三级结构示意图氨基酸氨基酸 +tRNAtRNA氨基酰氨基酰-tRNAtRNAATPATP AMPAMPPPiPPi氨基酰氨基酰-tRNAtRNA合成酶合成酶(一)(一)氨基酰氨基酰-
10、tRNAtRNA合成酶合成酶(aminoacyl-tRNA aminoacyl-tRNA synthetasesynthetase)l 氨基酸的活化氨基酸的活化两步反应两步反应氨基酸氨基酸 ATP-E ATP-E 氨基酰氨基酰-AMP-EAMP-E AMP AMP PPi PPi 氨基酰氨基酰-AMP-AMP-E E tRNA tRNA 氨基酰氨基酰-tRNAtRNAAMPAMPE El在在此此反反应应中中,特特异异的的tRNA3tRNA3端端CCACCA上上的的22或或33位位自自由由羟羟基基与与相相应应的的活活化化氨氨基基酸酸以以酯酯键键相相连连接接,形形成成氨氨基基酸酸tRNAtRNA,
11、从从而而使使活活化化氨氨基基酸酸能能够被搬运至核蛋白体上参与多肽链的合成。够被搬运至核蛋白体上参与多肽链的合成。l氨基酸氨基酸tRNAtRNA的合成,可使氨基酸的合成,可使氨基酸 活化活化;搬运搬运;定位定位。l氨基氨基酰酰-tRNAtRNA合成酶对底物氨基酸和合成酶对底物氨基酸和tRNAtRNA都有高都有高度特异性,这是保证度特异性,这是保证tRNAtRNA能够携带正确的氨基酸能够携带正确的氨基酸对号入座的必要条件对号入座的必要条件。l氨基酰氨基酰-tRNAtRNA合成酶具有校正活性。合成酶具有校正活性。目前认为,该酶对目前认为,该酶对tRNAtRNA的识别,是因为在的识别,是因为在tRNA
12、tRNA的氨基酸臂上存在特定的识别密码,即第二套遗传密码的氨基酸臂上存在特定的识别密码,即第二套遗传密码。l氨基酰氨基酰-tRNAtRNA的表示方法:的表示方法:AlaAla-tRNAtRNAAla Ala SerSer-tRNAtRNASer Ser MetMet-tRNAtRNAMetMet 真核生物真核生物:Met-Met-tRNAtRNAi iMetMet原核生物原核生物:fMet-tRNAfMet-tRNAi if fMetMet 原核生物起始密码子需要在原核生物起始密码子需要在Met-tRNAMet-tRNAmetmetf f上上进行甲酰化,而真核生物不需要。进行甲酰化,而真核生物
13、不需要。(二)(二)起始肽链合成的氨基酰起始肽链合成的氨基酰-tRNAtRNA蛋白质生物合成过程蛋白质生物合成过程 The Process of Protein BiosynthesisThe Process of Protein Biosynthesis 第第 二二 节节 l翻译的起始翻译的起始(initiation)initiation)l翻译的延长翻译的延长(elongation)elongation)l翻译的终止翻译的终止(termination)termination)整个翻译过程可分为整个翻译过程可分为 :翻翻译译过过程程从从阅阅读读框框架架的的5 5-AUGAUG开开始始,按按m
14、RNAmRNA模模板板三三联联体体密密码码的的顺顺序序延延长长肽肽链链,直直至至终止密码出现。终止密码出现。一、肽链合成起始一、肽链合成起始指指mRNAmRNA和起始氨基酰和起始氨基酰-tRNAtRNA分别与核蛋白分别与核蛋白体结合而形成体结合而形成翻译起始复合物翻译起始复合物 (translational initiation complex)translational initiation complex)。多种蛋白质因子参与这个过程,称为起多种蛋白质因子参与这个过程,称为起始因子(始因子(initiation factor,IFinitiation factor,IF)原核、真核生物各种
15、起始因子的生物功能原核、真核生物各种起始因子的生物功能 (一)原核生物翻译起始复合物形成(一)原核生物翻译起始复合物形成l核蛋白体大小亚基分离;核蛋白体大小亚基分离;lmRNAmRNA在小亚基定位结合;在小亚基定位结合;l起始氨基酰起始氨基酰-tRNAtRNA的结合;的结合;l核蛋白体大亚基结合。核蛋白体大亚基结合。IF-3IF-11.核蛋白体大小亚基分离核蛋白体大小亚基分离IF-1:占据占据A位防止结合其他位防止结合其他tRNAIF-3:促使大小亚基分离,并提高促使大小亚基分离,并提高P位对起始位对起始tRNA的敏感性的敏感性A U G53IF-3IF-12.mRNA在小亚基定位结合在小亚基
16、定位结合 在原核生物在原核生物mRNAmRNA的起始密码前的起始密码前8 81313核苷酸的核苷酸的位置,有一非常保守的序列:位置,有一非常保守的序列:AGGAGG-AGGAGG-1 1、S-DS-D序列序列(核糖体结合序列)核糖体结合序列)mRNA在核蛋白体上定位的机制:在核蛋白体上定位的机制:S-DS-D序列序列:在原核生物:在原核生物mRNAmRNA的起始密码前的起始密码前8 81313核苷酸的位置,有一非常保守的序列,核苷酸的位置,有一非常保守的序列,与核糖与核糖体小亚基上的体小亚基上的1616S-rRNAS-rRNA结合结合,引导,引导mRNAmRNA进入核进入核糖体,这样的序列称为
17、糖体,这样的序列称为S-DS-D序列序列。2 2、S-DS-D序列后的小核苷酸序列,可以被核蛋白体序列后的小核苷酸序列,可以被核蛋白体小亚基蛋白小亚基蛋白rpSrpS1 1识别结合识别结合 RNA-RNA RNA-RNA与与RNA-RNA-蛋白质相互作用使得蛋白质相互作用使得mRNAmRNA在核蛋白体小亚基上精确定位在核蛋白体小亚基上精确定位IF-3IF-1IF-2GTP3.起始氨基酰起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)结合到小结合到小亚基亚基A U G53IF-2:常与常与GTP结合,促进起始结合,促进起始tRNA与小亚基与小亚基结合结合IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4
18、.核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成A U G53同时同时IF-2结合的结合的GTP水解放能,促使三种水解放能,促使三种IF因子释放因子释放IF-3IF-1IF-2A U G53IF-3IF-1IF-2同时同时IF-2结合的结合的GTP水解放能,促使三种水解放能,促使三种IF因子释放因子释放(二)真核生物翻译起始复合物形成(二)真核生物翻译起始复合物形成l核蛋白体大小亚基分离;核蛋白体大小亚基分离;l起始氨基酰起始氨基酰-tRNAtRNA结合;结合;lmRNAmRNA在核蛋白体小亚基就位;在核蛋白体小亚基就位;l核蛋白体大亚基结合。核蛋白体大亚基结合。metm
19、et40S40S60S60SMeMet tMetMet40S40S60S60SmRNAeIF-2BeIF-2B、eIF-3eIF-3、eIF-6 elF-3elF-3GDP+Pi各种各种各种各种elFelF释放释放释放释放elF-5ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PABMetMet-tRNAiMet-elF-2-GTP真核生物翻译起始真核生物翻译起始复合物形成过程复合物形成过程二、肽链合成延长二、肽链合成延长指指根根据据mRNAmRNA密密码码序序列列的的指指导导,依依次次添添加加氨氨基基酸从酸从N N端向端向C C端延伸肽链,直到合成终止的过程。端延伸肽链,
20、直到合成终止的过程。l肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行,又肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为称为核蛋白体循环核蛋白体循环(ribosomal cycle)ribosomal cycle),每次循每次循环增加一个氨基酸,包括以下三步:环增加一个氨基酸,包括以下三步:进位进位(entrance)entrance)成肽成肽(peptide bond formation)peptide bond formation)转位转位(translocation)translocation)l延伸过程所需蛋白因子称为延长因子延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongation elongatio
21、n factor,EF)factor,EF)原核生物:原核生物:EF-T(EF-EF-T(EF-TuTu,EF-Ts),EF-Ts)EF-GEF-G真核生物:真核生物:EF-1 EF-1、EF-2 EF-2 原核延长因原核延长因子子生物功能生物功能对应真核延长对应真核延长因子因子EF-Tu促进氨基酰促进氨基酰-tRNA进入进入A位,结合分位,结合分解解GTPEF-1-EF-Ts调节亚基调节亚基EF-1-EFG有转位酶活性,促进有转位酶活性,促进mRNA-肽酰肽酰-tRNA由由A位前移到位前移到P位,促进卸载位,促进卸载tRNA释放释放EF-2肽链合成的延长因子肽链合成的延长因子 (一)进位(一
22、)进位指根据指根据mRNAmRNA下一下一组遗传密码指导,使组遗传密码指导,使相应氨基酰相应氨基酰-tRNAtRNA进进入核蛋白体入核蛋白体A A位。位。又称注册又称注册(registration)registration)延长因子延长因子EF-TEF-T催化催化进位(原核生物)进位(原核生物)EF-TuEF-Tu促进氨基酰促进氨基酰tRNAtRNA进入进入A A位位(失活失活)(活性活性)TuTu有有两种形式两种形式:Tu-GTP Tu-GTP 和和 Tu-GDPTu-GDPTsTs为为调节亚基调节亚基(二)成肽(二)成肽是由是由转肽酶转肽酶(transpeptidasetranspepti
23、dase)催化的肽催化的肽键形成过程。键形成过程。(三)转位(三)转位延长因子延长因子EF-GEF-G有有转位酶活性转位酶活性,可结合并水解,可结合并水解1 1分分子子GTPGTP,促进核蛋白体向促进核蛋白体向mRNAmRNA的的33侧移动侧移动 。N N端端进进位位转转位位成肽成肽肽链的延长在核蛋白体上连续循环进行,每肽链的延长在核蛋白体上连续循环进行,每加上一个氨基酸需要三步反应:加上一个氨基酸需要三步反应:进位进位成肽成肽转位转位核蛋白体循环核蛋白体循环真真核核生生物物肽肽链链合合成成的的延延长长过过程程与与原原核核基基本本相相似,但有不同的反应体系和延长因子。似,但有不同的反应体系和延
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