(36)--基于心脏电生理模型的心律失常机制研究进展.pdf
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1、基于心脏电生理模型的心律失常机制研究进展*摘要揭示发病机制是心律失常诊断、治疗、药物研发和设备设计的关键整合当前在心脏分子生物学、生物化学、生理学及解剖学方面的最新成果,构建从离子通道、心肌细胞、心肌纤维、心肌组织、心脏器官到躯体各个层次的多尺度多模态心脏电生理模型,用于系统研究微观局部变化发生、发展、转化为宏观心律失常表现的过程,将彻底改变传统从基因突变、蛋白质表达、细胞电生理、临床表现单独研究心律失常的方式,实现微观与宏观研究的统一,使心脏电生理模型成为系统研究心律失常发病机制的有力手段本文综述了心脏电生理模型的构建方法和研究进展,讨论了多尺度心脏电生理模型在揭示心律失常机制研究中的作用和
2、地位,给出了基于心脏电生理模型心律失常研究的挑战和重要发展方向关键词系统生物学,生理组学,计算心脏学,虚拟心脏,心律失常,心脏电生理模型,建模与仿真学科分类号R318.04,TP391.9DOI:10.16476/j.pibb.2015.0302生物化学与生物物理进展Progress in Biochemistry and Biophysics2016,43(2):综述与专论R e v i e w s a n d Mo n o g r a p h s*国家自然科学基金(61173086,61571165)资助项目.*通讯联系人.Tel:0451-86412671,E-mail:收稿日期:201
3、5-09-29,接受日期:2015-12-31心律失常是指心脏电冲动的频率、节律、起源部位、传导速度和激动次序的异常,其直接后果是心源性猝死和心力衰竭据估计,我国有 2.9 亿心血管患者,其中心律失常的患者高达 26.8%,而其患病率和死亡率仍处于上升阶段1目前,针对心律失常的诊断方法有各种成像技术、心电图和心电图成像等,治疗手段包括抗心律失常药物、人工起搏器、心脏移植、心脏支架、心脏搭桥、射频消融等虽然先进的诊疗技术和药物降低了心律失常的致死率,但是某些治疗方式(如抗心律失常药物和射频消融)不但没有治愈心律失常,反而成为导致心律失常的关键因子,使得心律失常的致死率居高不下1,而解决该问题的关
4、键在于揭示心律失常的内在机理目前,关于心律失常产生机制的研究,心脏生理病理学家大都从细胞、基因、蛋白质、分子等微观层次上研究心律失常的离子机制,通过实验得到的结果往往仅能反映亚细胞或单细胞的局部特性,无法进一步阐明微观变化演变为宏观整体心脏病的过程;临床心脏学家则重点从解剖结构等宏观层次上研究心律失常的传导机制,通过临床心电图诊断得到的结果仅能反映心律失常病症的表现,而忽略心律失常的微观起源因此,当前对于心律失常机制的研究呈现两极分化的特点,亟需解决的问题是实现微观与宏观研究的统一心脏电生理模型提供了从复杂系统角度认识心脏结构、行为和控制机理,综合解析心血管系统运转规律,破解、改造和设计生命的
5、方法近年来,随着先进生物学信息获取技术(如膜片钳技术、基因蛋白质分离分析技术和各种组织成像技术)和信息统计分析处理技术(如数据挖掘、三维重建、数值计算和建模仿真技术)的发展,大大加快了心律失常量化研究的步伐心脏电生理模型就是运用计算机技术,综合当前在分子生物学、生物化学、生理学及解剖学方面的最新成果,量化以及模式化地处理心血管系统到器官、组织、细胞、生物大分子等各个层次的解剖、生化及生理学信息,从大量电生理实验数据中发现新知识,建立各个层次的生理模型,并实现层次模型间的整合,其致力建立一组白杰云,等:基于心脏电生理模型的心律失常机制研究进展2016;43(2)1多尺度心脏电生理模型多尺度心脏电
6、生理模型实现了心脏生理病理大数据的整合和数据挖掘,实现了宏观与微观研究的统一该模型利用基因组学、蛋白质组学、代谢组学、医学影像学以及生物芯片技术等获取疾病相关的生物分子信息,从离子通道蛋白、心肌细胞、心肌纤维、切片组织,三维心脏和心脏躯干的多尺度建立心脏电生理模型,并从多尺度多模态的角度分析离子通道电产生、心肌细胞动作电位形成和心肌组织电传导的过程其中,多尺度心脏的构建是进行病理研究的基础11多尺度心脏电生理模型的研究进展多尺度心脏电生理建模是进行心脏生理、病理和药理学研究的重要手段,将为心律失常诊断、治疗和设备开发提供理论和技术支撑,因此,多尺度心脏电生理建模成为当前国内外的一个研究热点,但
7、是目前主要集中在通用模型的构建研究,而面向疾病的个体化心脏建模与病理研究还处于初级阶段.在国外对于多尺度心脏电生理建模与病理研究已经有几十年的积累,研究对象更加多样化,研究方法更加丰富(表 1)在欧洲,牛津大学建立了第一个心肌细胞模型4,提出了基于多尺度心脏生理病理研究的理论5,联合奥克兰大学开发了统一建模语言 CellML6,在心脏模型中引入了力学特征,构建了电力耦合模型7,并开发了用于建模与仿真研究的软件6,近年来又发起了“个性化心脏诊疗建模”的计划8;乌得勒支大学主要对心脏非线性动力学进行了理论研究,分析折返波的产生、维持和转化的过程9-13,这为基于多尺度心脏研究心律失常奠定了理论基础
8、;曼彻斯特大学从构成心脏系统的各个部分出发,不仅构建了窦房结14、房室结15、心房16、浦肯野纤维网络、心室17、躯干18和肺静脉19等模型,而且还基于多尺度心脏电生理模型深入研究基因突变20、电重构21、药物作用22-25、特殊结构19和力学形变20对于心律失常发生的作用在美国,弗吉尼亚大学主要利用最新的生化数据,建立分子动力学模型,研究细胞信号调控对于心肌细胞电生理的作用26-27;加利福尼亚大学基于心肌细胞电生理数据,在细胞模型中引入了钙循环模块,建立了细胞级别的电力耦合模型28,研究细胞信号对于心律失常产生的作用29-30;约翰霍普金斯大学在微观研究方面,基于细胞内钙稳态31、细胞信号
9、32、能量代谢33的生化数据,建立了细胞级别的电-力-代谢细胞模型34,研究心律失常产生的离子机制35-36,在宏观研究方面,基于患者的医完善的心脏生理模型系统,构筑了从微观分子到宏观器官变化的桥梁,成为认识心脏电活动强有力的手段2-3(图 1),提供了研究微观变化对于整个复杂心脏系统功能作用的系统方法,为心律失常相关研究带来新的曙光Fig.1The schematic of multi-physics and multi-scale heart图 1多物理尺度心脏示意图亚细胞级跨膜螺旋P 环离子通道细胞膜电位激活离子通道开放心肌细胞肌浆网离子通道离子泵细胞级器官级浦肯野纤维电兴奋产生于细胞扩
10、散到整个心脏心脏心室129生物化学与生物物理进展Prog.Biochem.Biophys.2016;43(2)在国内,对于心血管系统建模研究才刚刚开始,国家中长期科学和技术发 展 规 划 纲 要(2012-2030 年)提出探索研究如何从复杂系统角度认识生物体的结构、行为和控制机理,综合解析生物系统运转规律,破解、改造和设计生命这一科学前沿问题其中多尺度心脏就是一个重要的课题,国内在这个领域已经有了一些成果,主要的研究单位有浙江大学和哈尔滨工业大学等浙江大学主要专注于心脏电生理建模与病理仿真56-57,构建了多尺度的电力耦合模型,并应用于心脏非线性动力学58、生理病理机制59、设备开发研究60
11、-62;哈尔滨工业大学则是一方面发挥计算机建模与可视化方面的优势,开发更加详尽的多尺度电-力耦合心脏63,另一方面利用计算机仿真技术发掘病理机制64-65和药物筛选66,目前专注于面向病人的个体化心脏模型构建与病理研究当前,系统心脏学家正在构建详尽的面向病人的心脏模型一方面,随着对于各种通道蛋白质从研究单位(教授)网址描述Department of Physiology(Denis Noble)http:/noble.physiol.ox.ac.uk/多尺度心脏研究的最早发起单位Auckland Bioengineering Institute(Peter Hunter)https:/unid
12、irectory.auckland.ac.nz/profile/phun025心脏电-力模型的标准化Biological Physics Group(Henggui Zhang)http:/www.manchester.ac.uk/research/h.zhang-3/personaldetails多尺度心脏的病理学研究Department of Physics and Astronomy GentUniversity(Alexander V.Panfilov)http:/www-binf.bio.uu.nl/panfilov/心脏非线性动力学理论研究Department of Biomedi
13、cal Engineering Universityof Virginia(Jeff Saucerman)http:/bme.virginia.edu/saucerman/分子动力学建模与病理学研究Department of Pharmacology(Donald M.Bers)https:/somapp.ucdmc.ucdavis.edu/Pharmacology/bers/细胞模型构建与病理学研究Institute for Computational Medicine(Raimond L.Winslow and Natalia A.Trayanova)http:/pages.jh.edu/
14、trayanova/website/about.html电-力-代谢细胞模型与个性化心脏构建Cardiac Bioelectricity and Arrhythmia Center(Yoram Rudy)http:/rudylab.wustl.edu/心律失常的基础与应用研究The Virtual Heart Project Group(Elizabeth M.Cherry and Flavio H.Fenton)http:/thevirtualheart.org/心脏非线性动力学理论研究Cardioid Cardiac Modeling Project Group(JohnJeremy Ri
15、ce)http:/ Managemen(Kazuo Nakazawa)http:/www.ncvc.go.jp/english/res/ldebis/ldebis_001.html基于多尺度心脏的心律失常预测研究School of Computer Science and Technology(Henggui Zhang and Kuanquan Wang)http:/ of Biomedical Engineering&InstrumentScience(Ling Xia)http:/ IBM 研究院利用超级计算机构建了有限元心脏电力耦合模型54,用于研究心脏的生理病理功能日本心血管系统研究
16、中心也在开发和研究面向病人的多尺度心脏模型,并用于心律失常诊断、治疗和防治的研究55Table 1Major research institutions and scientific achievements表 1主要的研究机构和科研成果130白杰云,等:基于心脏电生理模型的心律失常机制研究进展2016;43(2)Fig.2Integrating multi-scale data to create a virtual physiological heart:cardiac electrophysiology from cell to bedside图 2基于多尺度数据的虚拟生理心脏的构建过程
17、:从细胞学到临床电生理学基因到表达、从结构到功能、从正常到异常的深入研究,他们正在建立更加详尽的电-力-代谢-细胞信号心肌细胞模型;另一方面,随着超级计算机和医学影像技术的发展,系统心脏学家正在构建面向病人的心脏模型,使得心脏电生理模型能够应用于病理研究、疾病诊断、药物开发和设备研发12多尺度心脏电生理模型的构建过程模型构建和验证的一般流程是(图 2):采用心脏分子细胞生物学家的实验数据构建离子通道和心肌细胞模型,利用心脏解剖结构数据构建组织器官几何结构和纤维走向,结合细胞电生理模型和组织结构,构建心肌纤维、心肌组织、心脏和躯干心脏虚拟生理模型,将躯干表面仿真的心电图与临床心临床医生体表心电图
18、数据库验证对比体表电位躯干器官心脏电传导组织电传导组织跨膜电传导纤维细胞动作电位蛋白质失活曲线对比验证电生理数据数据库分子生物心脏学家验证一阶微分方程表示每一个门控离子的状态关闭开放1-mmmmdm/dt=(1-m)m-mm细胞膜的等效电路图离子泵模型离子通道模型细胞内细胞外dVm/dt=(Iion+Istim)/CmIionir验证通过间隙连接构成一维纤维、二维组织、三维心脏,通过反应扩散方程表示电传导细胞间电阻细胞膜电阻细胞内环境从躯干表明计算获得伪心电图荦Gi(荦Vm+荦e)=(CmdVm/dt+Iion)荦(Gi+Gi)荦e=-荦(Gi荦Vm)ECG=蘩(DVmR)/r3dVr=|A-
19、A0|多尺度多模态建模与仿真00.51.000.51.00-40-800-40-80131生物化学与生物物理进展Prog.Biochem.Biophys.2016;43(2)脏学家的心电图对比验证,通过多尺度心脏电生理模型构筑了心脏分子细胞生物学家与临床心脏学家之间的桥梁,使该模型成为研究心律失常的有利工具2,67其中,离子通道模型是基于离子通道蛋白的动力学特性开发的,这不仅要考虑蛋白质的功能和结构,而且考虑蛋白质状态转变受内环境的影响对于离子通道门控模型的构建,其通过蛋白质的分布和动力学数据来设定通道的开放和关闭状态;基于通道对于电压、温度、药物浓度等的敏感性来设定状态转变的速率;依据状态转
20、换的过程,用一阶微分方程来描述离子通道开放状态的变化概率68(图 2).心肌细胞模型是以各种离子通道和离子泵模型为基础,通过细胞膜将细胞内和外环境分割开来,将其等效为一个电路图,用一阶微分方程来描述该模型用于描述细胞膜动作电位随时间变化的过程,它反映的是所有离子通道和离子泵随时间和膜电压开放、关闭产生离子流的总体变化过程目前,依据心脏传导系统中的心肌细胞电生理的特点,已建立了包括窦房结、心房、浦肯野纤维和心室细胞在内的多物种细胞模型68(图 2)心肌组织模型是单细胞模型的扩展,其通过间隙连接将周围的细胞连接起来,并考虑不同维度方向上间隙连接的电异质性,用一个电阻网络来近似心肌组织,其中对于组织
21、中的每一个细胞来讲,其包括细胞内电阻、间隙连接的外电阻和细胞内环境心肌组织模型用于量化描述电兴奋在组织中的传导过程,该过程包括了单个离子通道离子流的产生、单细胞动作电位的形成和多细胞通过间隙连接的电传导,使用反应-扩散模型来描述心肌组织模型69(图 2)对于三维心脏和躯干模型来讲,一方面它是一维纤维、二维心肌组织的扩展,另一方面它考虑了心脏各部分的解剖结构和纤维走向,也是通过反应-扩散模型来描述电传导过程70(图 2)其中,三维心脏模型用于研究特殊几何结构和组织异质性对于电传导的影响,从整体上分析电传导过程,而结合躯干结构构建的心脏躯干模型,用于研究心脏电传导与体表心电图的对应关系,它通过积分
22、方式计算体表心电图,与临床心电图对比验证(图 2),从而可以将模型应用于临床诊疗当中心脏电生理模型建立了基因在离子通道、细胞、纤维、组织、器官和更高层次上的生理功能联系,可用于研究正常生理功能和病理发病机制从模型构建过程来讲,对于心律失常机制的研究,可以从以下三个方面进行研究:离子通道模型仿真离子通道蛋白质的动力学,研究心律失常的电产生机制;细胞电生理模型仿真动作电位的产生过程,用于研究心律失常的触发机制;而组织器官的电生理模型仿真电兴奋的传导过程,用于研究心律失常的电传导机制2离子通道模型与心律失常的电产生机制心肌细胞中各种离子通道和离子泵开放与关闭引起的离子流是心律产生的基础,各种门控蛋白
23、的有序协调活动在细胞膜上形成动作电位,细胞通过间隙连接的电耦合在组织中产生电兴奋波而对于特定的离子通道来说,心律失常的电产生异常表现为离子电流幅值、总电流和电流随时间形态的变化,这些变化源自离子通道蛋白质结构、功能、数量和分布的改变按照心律失常电产生的原因,将心律失常分为遗传性心律失常和获得性心律失常对于遗传性心律失常,主要是由于基因突变引起离子通道功能和蛋白质表达的改变,从而导致离子通道或相关蛋白的功能性异常:失活异常和激活异 常 这 类 疾 病 包 括 长 QT 综 合 征(long QTsyndrome,LQT)、短 QT 综合征(short QT syndrome,SQT)、Bruga
24、da 综合症(brugada syndrome,BrS)和儿茶酚胺多形性室性心动过速(catecholaminergicpolymorphic ventricular tachycardia,CPVT)然而基因突变与临床表现之间的关系非常复杂:a不同离子通道特定位点的突变可以导致相同的临床表现如 LQT,虽然动作电位表现为复极延迟,心电图表现为 QT 间期延长,但是有多种离子通道的功能异常都可以表现为 QT 间期延长b对于特定的离子通道,不同的基因位点突变可以导致相同的功能改变如 L 型钙通道在 BrS9、BrS4、BrS3、SQT4、SQT5、SQT6 都表现为功能减弱71c同一基因不同位点
25、突变也能引起不同的临床表现如L 型钙通道基因突变导致的 BrS 表现为:右束支阻滞、右胸导联 ST 呈下斜形或马鞍形抬高、T 波倒置72而其导致 SQT 表现为:QT 间期明显缩短,胸导联上 T 波高尖、对称或不对称73d基因突变引起的心律失常不只只是离子通道功能的异常,很多时候包括细胞内环境稳态的改变(如细胞内钙处理的改变)74,从而引起临床表现的差异因此,对于心律失常的基因突变机制需要理解特殊基因突变在整个复杂心脏系统中的作用离子通道模型可132白杰云,等:基于心脏电生理模型的心律失常机制研究进展2016;43(2)以量化离子通道功能的变化,依据分子和细胞生物学实验数据,建立在各种病态情况
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- 36 基于 心脏 生理 模型 心律失常 机制 研究进展
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