生物化学和分子生物学(1).ppt
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1、 重组重组DNA技术技术生物科学成为当今世界自然科学的热点和重点,主要由于两方面的原因:(1)二十世纪后叶,分子生物学领域一系列突破性成就,使生命科学在自然科学中的地位发生了革命性的变化;(2)建立在实验室研究基础上的生物技术的发展为人类带来了巨大的利益和财富。生物技术将是未来经济发展的新动力第一次技术革命 工业革命解放人的双手第二次技术革命 信息技术扩展人的大脑第三次技术革命 生物技术改造生命本身基因工程、细胞工程、发酵工程、蛋白质(酶)工程此外还有基因诊断与基因治疗技术、克隆动物技术、生物芯片技术、生物材料技术、生物能源技术、利用生物降解环境中有毒有害化合物的技术直接相关联的学科:分子生物
2、学、微生物学、生物化学、遗传学、细胞生物学、生物信息学、化学工程学、医药学等。对人类和社会生活各方面影响最大的生物技术领域:农业生物技术、医药生物技术、环境生物技术、海洋生物技术l生物技术的主要内容 基因工程亦称遗传工程,即利用基因工程亦称遗传工程,即利用DNA重组技术的方重组技术的方法,把法,把DNA作为组件,在细胞外将一种外源作为组件,在细胞外将一种外源DNA(目的(目的基因)和载体基因)和载体DNA重新组合连接(重组),最后将重组重新组合连接(重组),最后将重组体转入宿主细胞,使外源基因体转入宿主细胞,使外源基因DNA在宿主细胞中,随细在宿主细胞中,随细胞的繁殖而增殖(胞的繁殖而增殖(c
3、loning,克隆),或最后得到表达,克隆),或最后得到表达,最终获得基因表达产物或改变生物原有的遗传性状。最终获得基因表达产物或改变生物原有的遗传性状。基因重组技术作为分子生物学最重要、最基本的技基因重组技术作为分子生物学最重要、最基本的技基因重组技术作为分子生物学最重要、最基本的技基因重组技术作为分子生物学最重要、最基本的技术之一,是许多分子生物术之一,是许多分子生物术之一,是许多分子生物术之一,是许多分子生物,生物化学和细胞生物学实验实生物化学和细胞生物学实验实生物化学和细胞生物学实验实生物化学和细胞生物学实验实施的基础。施的基础。施的基础。施的基础。现代基因工程的创始人现代基因工程的创
4、始人PP伯格伯格伯格伯格(美国(美国,1926,1926)在)在19601960年以敏锐的科学预见年以敏锐的科学预见力提出一个大胆的设想:是否可以创造出一种人工方法,把外界的遗传基因引力提出一个大胆的设想:是否可以创造出一种人工方法,把外界的遗传基因引入动物体内,以达到改变遗传性状和治疗某些疾病的需要呢?入动物体内,以达到改变遗传性状和治疗某些疾病的需要呢?19721972年,伯格把年,伯格把两种病毒的两种病毒的DNADNA用同一种限制性内切酶切割后,再用用同一种限制性内切酶切割后,再用DNADNA连接酶把这两种连接酶把这两种DNADNA分子连接起来,于是产生了一种新的重组分子连接起来,于是产
5、生了一种新的重组DNADNA分子,首次实现两种不同生物的分子,首次实现两种不同生物的DNADNA体外连接,获得了第一批重组体外连接,获得了第一批重组DNADNA分子,这标志着基因工程分子,这标志着基因工程技术的诞生。伯格因此获得了19801980年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖。19731973年,美国斯坦福大学教授年,美国斯坦福大学教授SS科恩科恩科恩科恩和加州大学旧金山分校教授和加州大学旧金山分校教授HWHW博耶博耶博耶博耶将两个不同的质粒(一个是抗四环素质粒,另一个是抗将两个不同的质粒(一个是抗四环素质粒,另一个是抗链霉素质粒)拼接在一起,组成嵌合质粒,并将其导入大肠杆菌,链霉素质粒)拼接在
6、一起,组成嵌合质粒,并将其导入大肠杆菌,当该重组质粒进入大肠杆菌体内后,这些大肠杆菌能抵抗两种药物,当该重组质粒进入大肠杆菌体内后,这些大肠杆菌能抵抗两种药物,而且这种大肠杆菌的后代都具有双重抗药性。这表明而且这种大肠杆菌的后代都具有双重抗药性。这表明“杂合质粒杂合质粒”在大肠杆菌的细胞分裂时也能自我复制。在大肠杆菌的细胞分裂时也能自我复制。科恩随后以科恩随后以DNADNA重组技术发明人的身份向美国专利重组技术发明人的身份向美国专利局申报了世界上第一个基因工程的技术专利。这标志局申报了世界上第一个基因工程的技术专利。这标志着自然界不同物种间在亿万年中形成的天然屏障被打着自然界不同物种间在亿万年
7、中形成的天然屏障被打破了,人类可以根据自己的意愿定向地改造生物的遗破了,人类可以根据自己的意愿定向地改造生物的遗传特性,甚至创造新的生命类型。传特性,甚至创造新的生命类型。19771977年,吉尔伯特(年,吉尔伯特(W WGilbertGilbert)分别将编码)分别将编码胰岛胰岛胰岛胰岛素和干扰素素和干扰素素和干扰素素和干扰素的的DNADNA经过体外重新拼接后,导入大肠杆菌经过体外重新拼接后,导入大肠杆菌中,分别使大肠杆菌合成了胰岛素和干扰素中,分别使大肠杆菌合成了胰岛素和干扰素。基因工程的应用重组DNA操作一般步骤:(1)获得目的基因;(2)克隆:目的基因与载体连接,形成重组的DNA分子;
8、(3)转化:用重组DNA分子转化受体细胞,并能在受体细胞中复制和遗传;(4)筛选:对转化子筛选和鉴定;(5)大量培养:对获得外源基因的细胞或生物体通过培养,获得所需的遗传性状或表达出所需要的产物。DNA重组的基本模式 分(离目的基因)分(离目的基因)切(割目的基因和载体)切(割目的基因和载体)接(连目的基因和载体)接(连目的基因和载体)转(化宿主细胞)转(化宿主细胞)筛(选阳性克隆)筛(选阳性克隆)表(达目的基因)表(达目的基因)“纵向”体系 目的基因目的基因基因载体基因载体重组体重组体分切接转筛表总体技术路线总体技术路线(分分)-目的基因及载体的分离目的基因及载体的分离获得需要的目的基因常用
9、的方法:(1 1)化学合成)化学合成(2 2)基因组文库)基因组文库(genomic DNA library)(genomic DNA library)(3 3)cDNAcDNA文库文库(4 4)聚合酶链式反应()聚合酶链式反应(PCRPCR)化学合成根据已知多肽链的氨基酸顺序,利用遗传密码表推定其核苷酸顺根据已知多肽链的氨基酸顺序,利用遗传密码表推定其核苷酸顺序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。较短的核酸较短的核酸片段(片段(60-80bp60-80bp)多肽链的氨基酸顺序mRNA的碱基排列顺序相应的基因结构化学合成目的基因化学合成的不
10、足之处在于:()要已知基因的核苷酸顺序;()基因不能太大,这一方面是测定核苷酸(或氨基酸)顺序比较困难,另一方面是因为每次仅能合成几百的短片段,短片段越多,要连接成正确的基因顺序就越困难,得率越低;()价格昂贵。化学合成的最大优点是可以合成一些分离较困难的基因。用途:用途:PCRPCR引物引物,测序引物测序引物,定点突变定点突变,核酸杂交探针核酸杂交探针基因组文库基因组文库细胞内总DNA的提取分离与基因组文库的构建 基基因因组组DNA:在在真真核核生生物物体体,基基因因组组是是指指一一套套完完整整单单倍倍体体DNA(染染色色体体DNA)和和线线粒粒体体DNA的全部序列。的全部序列。基因组文库
11、基基因因组组文文库库是是含含有有某某种种生生物物全全部部基基因因片片断断的的DNADNA克克隆隆群群体体。直直接接从从生生物物体体中中提提取取总总DNADNA,用用超超声声或或酶酶处处理理,将将染染色色体体DNADNA切切割割成成片片断断,插插入入载载体体,转转入入受受体体菌菌扩扩增增,得得到到基基因因组组DNADNA文文库库,从从中中调调用用目目的的基因;基因;缺缺点点:结结构构基基因因只只含含基基因因组组很很小小一一部部分分,有有重重复复序序列列,假假基基因因。真真核核生生物物基基因因组组有有内内含含子子。这这些些给从基因组克隆目的基因带来困难。给从基因组克隆目的基因带来困难。细胞内总DN
12、A的提取分离程序苯酚沉淀蛋白质乙醇浓缩DNA组织或细胞染色体组织或细胞染色体DNADNA基因片断基因片断克隆载体克隆载体重组重组DNADNA分子分子含重组分子的转化菌含重组分子的转化菌限制性内切酶限制性内切酶受体菌受体菌将将总总DNADNA经经过过酶酶解解,经经蔗蔗糖糖梯梯度度离离心心或或琼琼脂脂糖糖凝凝胶胶电电泳泳分分离离不不同同长长短短的的DNADNA片片段段。包包含含的的基基因因组组片片段段分分别别克克隆隆在在质质粒粒或或噬噬菌菌体体载载体体上上,转转染染细细菌菌或或体体外外包包装装到到噬噬菌菌体体颗颗粒粒上上便便构构成成了了该该生物的基因组文库。生物的基因组文库。基因组基因组DNA文库
13、文库cDNAcDNA文库文库cDNA文库的构建文库的构建mRNA反转录酶cDNA(互补DNA)DNA聚合酶第二条DNA链用细胞总用细胞总mRNA,制备全套双链,制备全套双链cDNA后,建立后,建立的基因文库。简称的基因文库。简称cDNA文库。文库。以以mRNA为模板,为模板,用反转录酶,合成用反转录酶,合成与与mRNA互补的互补的cDNA(complementary DNA,cDNA)片段,插片段,插入载体,转入受体入载体,转入受体菌扩增,得到菌扩增,得到cDNA文库;文库;n 比较基因组文库与cDNA文库 构建基因组文库获取目的基因存在的问题费时费事内含子序列反转录人工合成互补DNA方法的优
14、势 不含内含子序列获取的DNA片段往往是具有特定功能的目的基因将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术PCR(Polymerasechainreaction)-聚合酶链式反应分子生物学,医学,考古,法医美国Mullis教授1988年发明了PCR技术1993年获得诺贝尔奖聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)Polymerase Chain Reaction载体载体DNA的选择的选择可转移性可转移性,为目的基因提供进入受体细胞的为目的基因提供进入受体细胞的转移转移能力。能力。合适的复
15、制位点合适的复制位点,为目的基因提供在受体细胞中的为目的基因提供在受体细胞中的复制能复制能力或整合能力。力或整合能力。多克隆位点:广泛、特异多克隆位点:广泛、特异选择标志,便于筛选和鉴定选择标志,便于筛选和鉴定分子较小,可容纳较大的外源分子较小,可容纳较大的外源DNA理想载体的基本条件:理想载体的基本条件:质粒质粒噬菌体噬菌体腺病毒载体腺病毒载体逆转录病毒载体逆转录病毒载体种类:种类:质粒载体的一般结构质粒载体的一般结构存在于细菌染色存在于细菌染色存在于细菌染色存在于细菌染色体外的小型环状体外的小型环状体外的小型环状体外的小型环状DNADNADNADNA分子。分子。分子。分子。具有具有具有具有
16、自我复制自我复制自我复制自我复制功功功功能。能。能。能。带有抗性基因及带有抗性基因及带有抗性基因及带有抗性基因及表型识别等表型识别等表型识别等表型识别等遗传遗传遗传遗传性标记物性标记物性标记物性标记物。经改造后具有经改造后具有经改造后具有经改造后具有多多多多克隆位点。克隆位点。克隆位点。克隆位点。DNA重组的基本模式 分(离目的基因)分(离目的基因)切(割目的基因和载体)接(连目的基因和载体)接(连目的基因和载体)转(化宿主细胞)转(化宿主细胞)筛(选阳性克隆)筛(选阳性克隆)表(达目的基因)表(达目的基因)“纵向”体系切切-限制性内切酶酶切限制性内切酶酶切限制性内切限制性内切酶酶切酶酶切酶切
17、载体和目的基因的切断载体和目的基因的切断通常采用限制性核酸内切酶通常采用限制性核酸内切酶(restriction endonuclease),简称限制酶,分别对载体,简称限制酶,分别对载体DNA和目的基因进行切断,以便于重组。和目的基因进行切断,以便于重组。限制酶目前已经发现限制酶目前已经发现400多种,所识别的顺多种,所识别的顺序往往为序往往为4-8个碱基对,且有回文结构。个碱基对,且有回文结构。由限制酶切断后的末端可形成平端、由限制酶切断后的末端可形成平端、3-突突出粘性末端和出粘性末端和5-突出粘性末端三种情况。突出粘性末端三种情况。形成粘性末端形成粘性末端(cohesive end)者
18、较有利于载者较有利于载体体DNA和目的基因的重组。和目的基因的重组。DNA重组的基本模式 分(离目的基因)分(离目的基因)切(割目的基因和载体)接(连目的基因和载体)接(连目的基因和载体)转(化宿主细胞)转(化宿主细胞)筛(选阳性克隆)筛(选阳性克隆)表(达目的基因)表(达目的基因)“纵向”体系接接-载体和目的基因的载体和目的基因的连接连接即将带有切口的载体与所获得的目的基因连接即将带有切口的载体与所获得的目的基因连接起来,得到重新组合后的起来,得到重新组合后的DNA分子。分子。(一)粘性末端连接法:(一)粘性末端连接法:当载体当载体DNA和目的基因均用同一种限制酶进行和目的基因均用同一种限制
19、酶进行切断时,二者即可带有相同的粘性末端。如将切断时,二者即可带有相同的粘性末端。如将载体与目的基因混合在一起,二者即可通过粘载体与目的基因混合在一起,二者即可通过粘性末端进行互补粘合,再加入性末端进行互补粘合,再加入DNA连接酶,即连接酶,即可封闭其缺口,得到重组体。可封闭其缺口,得到重组体。较少的情况下,对产生的平端也可直接进行连较少的情况下,对产生的平端也可直接进行连接。接。载体DNA与目的基因的连接(二)人工接尾法:(二)人工接尾法:即同聚物加尾连接法。当载体和目的基因无法采用同即同聚物加尾连接法。当载体和目的基因无法采用同一种限制酶进行切断,无法得到相同得粘性末端时,一种限制酶进行切
20、断,无法得到相同得粘性末端时,可采用此方法。可采用此方法。此法首先使用单链核酸酶将粘性末端切平,再在末端此法首先使用单链核酸酶将粘性末端切平,再在末端核苷酸转移酶的催化下,将脱氧核糖核苷酸添加于载核苷酸转移酶的催化下,将脱氧核糖核苷酸添加于载体或目的基因的体或目的基因的3-端,如载体上添加一段端,如载体上添加一段polyG,则,则可在目的基因上添加一段可在目的基因上添加一段polyC,故二者即可通过碱,故二者即可通过碱基互补进行粘合,再由基互补进行粘合,再由DNA连接酶连接。连接酶连接。(三)人工接头连接法:(三)人工接头连接法:将人工连接器(将人工连接器(linker,即一段人工合成的含有多
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