核酸的合成(RNA).ppt
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1、RNARNA的生物合成的生物合成 (转录转录)1在在RNA聚聚合合酶酶的的催催化化下下,以以一一段段DNA链链为为模模板板合合成成RNA,从从而而将将DNA所所携携带带的的遗遗传传信信息息传传递递给给RNA的过程称为的过程称为转录转录。经经转转录录生生成成的的RNA有有多多种种,主主要要的的是是rRNA,tRNA,mRNA,snRNA和和HnRNA等。等。转录转录RNADNA 2复制和转录的区别复制和转录的区别 3第第 1 1节节 RNA RNA转录合成的特点转录合成的特点Section 1 Characters of RNA Biosynthesis4 转录转录(transcription)
2、的不对称性就是指以双的不对称性就是指以双链链DNA中的一条链作为模板进行转录,从而将中的一条链作为模板进行转录,从而将遗传信息由遗传信息由DNA传递给传递给RNA。对对于于不不同同的的基基因因来来说说,其其转转录录信信息息可可以以存存在在于于两条不同的两条不同的DNA链上。链上。一、转录的不对称性一、转录的不对称性5能够转录能够转录RNA的那条的那条DNA链称为链称为模板链模板链(template strand),也称作,也称作有意义链有意义链或或Watson链链。而与之互补的另一条而与之互补的另一条DNA链称为链称为编码链编码链(coding strand),也称为,也称为反义链反义链或或C
3、rick链链。模板链模板链编码链编码链55335565 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链转录方向转录方向转录方向转录方向模板链和编码链的相对性模板链和编码链的相对性75GCAGTACATGTC 33 c g t g a t g t a c a g 5编码链编码链模板链模板链mRNA5GCAGUACAUGUC 3转录转录NAla Val His Val C蛋白质蛋白质翻译翻译模板链、编码链与转录及翻译的关系模板链、编码链与转录及翻译的关系8RNA转录合成时,以转录合成时,以DNA作为模板,在作为模板,在RNA聚合酶的催化下,连续合成一段聚合酶的催化下,
4、连续合成一段RNA链,各条链,各条RNA链之间无需再进行连接。链之间无需再进行连接。二、转录的连续性二、转录的连续性9RNA转录合成时,只能向一个方向进行聚合,转录合成时,只能向一个方向进行聚合,所依赖的模板所依赖的模板DNA链的方向为链的方向为35,而,而RNA链的合成方向为链的合成方向为53。三、转录的单向性三、转录的单向性10RNA转录合成时,只能以转录合成时,只能以DNA分子中的某一段分子中的某一段作为模板,故存在特定的起始位点和特定的终作为模板,故存在特定的起始位点和特定的终止位点。止位点。特定起始点和特定终止点之间的特定起始点和特定终止点之间的DNA链构成一链构成一个个转录单位转录
5、单位,通常由转录区和有关的调节顺序,通常由转录区和有关的调节顺序构成。构成。四、有特定的起始和终止位点四、有特定的起始和终止位点11第第2 2节节 参与转录合成的酶和蛋白参与转录合成的酶和蛋白因子因子Section 2 Enzymes and Protein Factors for RNA Biosynthesis12原料原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板模板:单链单链DNA酶酶:RNA聚合酶聚合酶(RNA polymerase,RNA-pol)其他蛋白质因子其他蛋白质因子参与转录的物质:参与转录的物质:13这是一种不同于引物酶的依赖这是一种不同于引物酶的依赖DNA的的RNA聚
6、合聚合酶(酶(DDRP)。)。该酶在单链该酶在单链DNA模板以及四种核糖核苷酸存在模板以及四种核糖核苷酸存在的条件下,不需要引物,即可从的条件下,不需要引物,即可从53聚合聚合RNA。一、一、RNA聚合酶(聚合酶(DDRP)14n原核生物中的原核生物中的RNA聚合酶全酶由五个亚基构成,聚合酶全酶由五个亚基构成,即即 2。n 亚基与转录起始点的识别亚基与转录起始点的识别有关,在转录合成开有关,在转录合成开始后被释放;余下的部分(始后被释放;余下的部分(2)被称为)被称为核核心酶心酶,与与RNA链的聚合链的聚合有关。有关。(一)原核生物的(一)原核生物的RNA聚合酶聚合酶15核心酶核心酶(core
7、 enzyme)全酶全酶(holoenzyme)原核生物原核生物RNARNA聚合酶的全酶和核心酶聚合酶的全酶和核心酶16原核生物原核生物RNARNA聚合酶亚基的功能聚合酶亚基的功能17真核生物中的真核生物中的RNA聚合酶可按其对聚合酶可按其对-鹅膏蕈碱鹅膏蕈碱的的敏感性而分为三种,它们均由敏感性而分为三种,它们均由1012个大小不同个大小不同的亚基所组成,结构非常复杂,其功能也不同。的亚基所组成,结构非常复杂,其功能也不同。(二)真核生物的(二)真核生物的RNA聚合酶聚合酶18RNARNA聚合酶聚合酶的分子结构的分子结构19酵母酵母RNARNA聚合酶聚合酶和和的电子晶体图的电子晶体图20在真核
8、生物中,转录的起始过程较为复杂。现在真核生物中,转录的起始过程较为复杂。现已发现数百种蛋白因子与已发现数百种蛋白因子与RNA转录合成有关,转录合成有关,这些蛋白因子被统称为这些蛋白因子被统称为反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor)。在反式作用因子中,直接或间接参与转录起始在反式作用因子中,直接或间接参与转录起始复合体的形成的蛋白因子被称为复合体的形成的蛋白因子被称为转录因子转录因子(transcriptional factor,TF)。不同的不同的RNA聚合酶存在相应的转录因子,如与聚合酶存在相应的转录因子,如与RNA聚合酶聚合酶相关的转录因子包括相关的转录因子包括
9、 TFA,TFB,TFD,TFE,TFF,TFH等。等。二、转录因子二、转录因子21真核生物真核生物RNARNA聚合酶聚合酶转录因子及其功能转录因子及其功能22原核生物中的终止因子原核生物中的终止因子蛋白蛋白是一种六聚体的蛋白质,亚是一种六聚体的蛋白质,亚基的分子量为基的分子量为50kd。该蛋白因子能识别转录终止该蛋白因子能识别转录终止信号,并与信号,并与RNA紧密结合,紧密结合,导致导致RNA的释放。的释放。三、终止因子三、终止因子23第第3 3节节 RNA RNA转录合成的过程转录合成的过程Section 3 The Process of RNA Biosynthesis24(一)转录起始
10、(一)转录起始转录起始需解决两个问题:转录起始需解决两个问题:1.RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。始区域。2.DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。模板。一、原核生物的转录过程一、原核生物的转录过程25原原核核生生物物一一个个转转录录区区段段可可视视为为一一个个转转录录单单位位,称称为为操操纵纵子子(operon),包包括括若若干干个个结结构构基基因因及及其上游其上游(upstream)的的调控序列调控序列。DNA分分子子上上参参与与转转录录调调控控的的序序列列统统称称为为顺顺式式作作用元件(用元件(c
11、is-acting element)。)。1.模板与酶的辨认识别:模板与酶的辨认识别:5 3 3 5 结构基因结构基因调控序列调控序列RNA-pol26原核生物转录起始时,首先由原核生物转录起始时,首先由RNA聚合酶中的聚合酶中的 因子因子识识别转录起始点,并促使核心酶结合形成全酶复合物。别转录起始点,并促使核心酶结合形成全酶复合物。RNA的合成不需要引物的合成不需要引物。体外实验证明,不含。体外实验证明,不含亚基亚基的核心酶会随机地在一个基因的两条链上启动,当有的核心酶会随机地在一个基因的两条链上启动,当有亚基时就会选择正确的起点。亚基时就会选择正确的起点。位于基因上游,与位于基因上游,与R
12、NA聚合酶识别、结合并起始转录聚合酶识别、结合并起始转录有关的一些有关的一些DNA调控序列被称为调控序列被称为启动子(启动子(promoter)。启动子序列通常由一些带共性的保守序列构成。启动子序列通常由一些带共性的保守序列构成。27 亚基起着识别亚基起着识别DNADNA分子上的起始信号(分子上的起始信号(启动子启动子指指RNARNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNADNA序列)的序列)的作用。作用。启动子的结构至少由三部分组成:启动子的结构至少由三部分组成:-35-35序列提供了序列提供了RNARNA聚合酶全酶识别的信号;聚合酶全酶识别的信号;-10-10
13、序列是酶的紧密结合位点(富含序列是酶的紧密结合位点(富含ATAT碱基,利于双链打碱基,利于双链打开);开);第三部分是第三部分是RNARNA合成的起始点。合成的起始点。AACTGTATATTATTGACATATAAT+1转录起始点转录起始点5335 35序列序列 Sextama 框框 10序列序列Pribnow框框28开始转录开始转录(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A Py-10 区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 原核生物启动子的保守序列原核生物启动子的保守序列T T G A C AA A C T G T-35 区区RNA-po
14、l辨认位点辨认位点(recognition site)5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 29原核生物转录起始区的一致性序列原核生物转录起始区的一致性序列30被被RNA聚聚合合酶酶辨辨认认的的区区段段就就是是位位于于转转录录起起始始点点-35区区的的TTGACA序列序列。酶酶与与该该区区结结合合后后,即即滑滑动动至至-10区区的的TATAAT序序列列(Pribnow盒)盒),并启动转录。,并启动转录。31RNARNA聚合酶全酶在转录起始区的结合聚合酶全酶在转录起始区的结合 32 DNA局部双链解开。局部双链解开。RNA聚合酶全酶聚合酶全酶(2)与模板结合。与模板结合。
15、在在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物。形成转录起始复合物。RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH 3 转录起始复合物转录起始复合物:5-pppG-OH +NTP 5-pppGpN-OH 3 +ppi2.转录起始过程:转录起始过程:33 因子从全酶上脱离,余下的核心酶继续沿因子从全酶上脱离,余下的核心酶继续沿DNA链移动,按照碱基互补原则,不断聚合链移动,按照碱基互补原则,不断聚合RNA。1.亚基脱落,亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,与模聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着板结合松弛,沿着DNA模板前移;模板前移;2.在在
16、核心酶核心酶作用下,作用下,NTP不断聚合,不断聚合,RNA链不断延链不断延长。长。(二)转录延长(二)转录延长(NMP)n +NTP (NMP)n+1 +PPi34RNARNA转录的延长转录的延长35转录空泡转录空泡(transcription bubble)(transcription bubble)的形成的形成36原核生物转录过程中的羽毛状现象原核生物转录过程中的羽毛状现象37RNA转录合成的终止机制有两种:转录合成的终止机制有两种:1依依赖赖Rho因因子子的的转转录录终终止止:由由终终止止因因子子(因因子子)识识别别特特异异的的终终止止信信号号,并并促促使使RNA的的释释放。放。(三)
17、转录终止(三)转录终止38ATP依赖依赖 Rho Rho因子的转录终止因子的转录终止392非非依依赖赖Rho的的转转录录终终止止:模模板板DNA链链在在接接近近转转录录终终止止点点处处存存在在相相连连的的富富含含GC和和AT的的区区域域,使使RNA转转录录产产物物形形成成寡寡聚聚U及及发发夹夹形形的的二二级级结结构构,引引起起RNA聚聚合合酶酶变变构构及及移移动动停停止止,导致导致RNA转录的终止。转录的终止。405UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3 5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUG
18、GUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3 RNA 5 TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT.3 DNA UUUUU.UUUU.5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3茎环茎环(stem-loop)/(stem-loop)/发夹发夹(hairpin)(hairpin)结构结构41茎环结构使转录终止的机理茎环结构使转录终止的机理 使使RNA聚合酶变构,转录停顿;聚合酶变构,转录停顿;使转录复合物趋于解离,使转录复合物趋于解离,RN
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- 核酸 合成 RNA
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