2023年生物技术制药重点及名词解释.pdf
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1、学习必备 欢迎下载 生物技术制药 第一章 绪论 生物技术与生物技术药物的概念 生物技术药物的分类 按用途分类:治疗药物、预防药物、作为诊断药物(免疫诊断试剂、酶诊断试剂、器官功能诊断药物、放射性核素诊断药物、诊断用单克隆抗体(McAb)、诊断用 DNA 芯片)按作用类型分类:细胞因子类药物、激素类药物、酶与辅酶类药物、疫苗、单克隆抗体药物、反义核酸药物、RNA 干扰(RNAi)药物、基因治疗药物 按生化特性分类:多肽类药物、蛋白质类药物、核酸类药物、聚乙二醇(PEG)化多肽或蛋白质药物 生物技术药物的特性 理化性质特性:相对分子量大、结构复杂、稳定性差 药理学作用特性:活性与作用机制明确、作用
2、针对性强、毒性低、体内半衰期短、有种属特异性、可产生免疫原性 生产制备特性:药物分子在原料中的含量低、原料液中长存在降解目标产物的杂质、制备工艺条件温和、分离纯化困难、产品易受有害物质污染 质量控制特性:质量标准内容的特殊性、制造项下的特殊规定、检定项下的特殊规定(原液、半成品及成品检定等等)第二章 基因工程制药 蛋白类药物的特点:结构确证不完全性、具有种属特异性、多功能性、免疫原性 临床前安全性评价的特殊性:蛋白类药物安全性担忧的性质和来源;受试物的纯度;相关动物的选择;给药剂量的选择;免疫原性;遗传毒性和致癌性(一般不进行常规的遗传毒性实验);药代动力学 真核细胞表达制品的安全性问题:生产
3、细胞 DNA 残留的影响、生产用血清的影响 基因工程药物稳定性研究的相关问题:药物浓度、温度、湿度和水分、氧、光照、pH 基因工程药物的缺陷:生物利用度低,半衰期短;异体蛋白具有免疫原性 基因工程菌的修饰改造方法:构建突变体、构建融合蛋白、PEG 修饰(降低免疫原性、增加水溶性、延长 t1/2)基因工程制药基本环节 上游阶段:制备目的基因构建重组质粒构建工程细胞 下游阶段:培养工程细胞分离纯化产物除菌半成品、成品检定包装 基本工具:目的基因、各种酶(切割酶、连接酶、修饰酶等)、载体、宿主细胞 酶切结果:5粘性末端、3粘性末端、平头末端 1U 核酸内切酶的酶活性:指在最佳反应条件下反应 1 小时
4、,完全水解 1mg 标准 DNA 所需的酶量 影响限制性内切酶反应的因素:DNA 样品的纯度:DNA 的甲基化程度:核酸限制性内切酶不能够切割甲基化的核苷酸序列。在基因克隆中要使用甲基化酶缺陷型细菌菌株制备质粒 DNA。酶切反应的温度 DNA 的分子结构 反应缓冲液组成 反应时间、反应体积等 工具酶 核酸限制性内切酶:识别、水解外源的双链 DNA 分子上特定的核苷酸序列。主要存在于原核微生物中。学习必备 欢迎下载 同裂酶:指来源不同,识别序列相同的酶;进行同样的切割,产生相同的末端 同尾酶:来源不同,识别序列不同,但产生相同的粘性末端 DNA 甲基化酶:具有宿主专一性,对宿主自身 DNA 上特
5、定核苷酸进行甲基化修饰,避免被自身限制性内切酶水解 DNA 连接酶 T4噬菌体连接酶:连接双链 DNA 切口,或带粘性末端或平头末端的 DNA 片段 大肠杆菌 DNA 连接酶:连接双链 DNA 切口,或带粘性末端的 DNA 片,不能连接带平头末端的 DNA片段 聚合酶:以 DNA 或 RNA 为模板,将核苷酸连续加至 3-OH 末端,合成方向为 53。DNA 聚合酶、RNA 聚合酶 大肠杆菌 DNA 聚合酶:5 3 DNA 聚合酶活性;5 3 DNA 外切酶活性;35DNA 外切酶活性;RNA H 酶活性 Klenow酶:不具备 53DNA 外切酶活性 T4 噬菌体 DNA 聚合酶:不具备 5
6、 3DNA 外切酶活性。外切酶活性比 Klenow酶强 200 倍,对单链 DNA 作用强于双链 DNA T7噬菌体 DNA 聚合酶:不具备 5 3 DNA 外切酶活性 Taq DNA 聚合酶 反转录酶:催化以 RNA 或 DNA 为模板,合成 DNA;具有 RNA H 酶的活性 末端脱氧核苷酸转移酶:催化 dNTP 沿 5 3 聚合,逐个加于线性 DNA 分子的 3末端;不需要模板 载体:(vector)来源于质粒、噬菌体或病毒的 DNA 分子,可供插入或克隆目的基因或 DNA,并具有运载外源 DNA 导入宿主细胞的能力。质粒载体:共价闭合环状 DNA(cccDNA);开环 DNA(ocDN
7、A);线状 DNA(lDNA)质粒的三个重要性质:遗传传递的能力;遗传交换的能力;不相容性 用于克隆的质粒的三个要素:复制子、选择标记、多克隆位点 常用质粒载体:克隆载体、表达载体、突变载体、报告载体 噬菌体载体:插入型载体、置换载体 来源于噬菌体 DNA,因可以插入较大 DNA 片段,常用于构建基因组文库和 cDNA 文库。目的基因的常用制备方法 化学合成法:前提:基因的 DNA 的序列已知。小于 100bp的片段:直接合成,最常用固相亚磷酸三酯法。大片段目的基因:小片段粘接法、大片段酶促法 PCR 法:前提:已知待扩增目的基因或 DNA 片段两侧的序列,根据该序列化学合成聚合反应必需的双引
8、物。基因文库法:鸟枪法:适用于原核细菌目的基因的克隆分离 cDNA 文库法(与 mRNA 互补的 DNA)并非所有的 mRNA 分子都具有 polyA 结构;仅限于克隆蛋白质编码基因;mRNA 含量少且 t1/2 短,对酶和碱极为敏感,分离纯化困难 第一链:mRNA 模板,引物(polyT),逆转录酶,dNTPs 第二链:自身引导法:取得的双链 cDNA5 端会有几对碱基缺失(NaOH,煮沸;Klenow酶,dNTPs;S1 内切酶)引导合成法:获得的 cDNA 能保持完整的 5端序列(TdT,Dctp;NaOH;退火;Klenow酶,dNTPs)基因文库的完备性:指在构建的基因文库中任一基因
9、存在的概率,它与基因文库最低所含克隆数 N 之间的关系可用下式表示:N=ln(1 P)/ln(1 f),P=完备性,f=克隆片段的平均大小/生物基因组的大小 双酶切产生的粘性末端,最常用,可以确保连接方向的正确性 影响连接效率的因素:连接方式;目的基因与载体的浓度比例摩尔数比大于1;连接温度、时间、酶的活性、反应缓冲体系 重组 DNA 导入宿主细胞 导入大肠杆菌:CaCl2法;转染法 用芯片按作用类型分类细胞因子类药物激素类药物酶与辅酶类药物疫苗化性质特性相对分子量大结构复杂稳定性差药理学作用特性活性与作用条件温和分离纯化困难产品易受有害物质污染质量控制特性质量标准内学习必备 欢迎下载 导入酵
10、母:电转化法;化学转化法;原生质转化法 导入链霉菌:原生质转化法;电穿孔法 重组 DNA 导入哺乳动物细胞:显微注射法;DEAE 葡聚糖转染法;DNA-磷酸钙转染法;阳性脂质体介导法;电穿孔法;细胞融合法;病毒感染法 重组子的筛选与鉴定 遗传标记筛选法:抗生素抗性筛选法;互补筛选法(蓝白斑筛选载体含有 LacZ 基因,X-gal 培养基,成功导入的菌落显示为蓝斑);营养缺陷型筛选法;噬菌斑筛选法 核酸分子杂交法:菌落原位杂交法;DNA 印迹法;RNA 印迹法 限制性内切酶图谱法:琼脂糖凝胶电泳鉴定各片段分子量,含有目的基因的为阳性克隆 DNA 序列测定法 目的基因表达产物测定法 原核细胞表达的
11、特点及选择 大肠杆菌(首选,遗传背景研究清楚;适合大规模生产(成本低,周期短,效率高,操作简单)、芽孢杆菌、链霉菌等 缺点:缺乏翻译后修饰系统;容易以包涵体形式存在;外源蛋白容易被宿主酶系统水解 外源基因表达的调控原件:复制子、启动子(表达效率的关键因素)和终止子、核糖体结合位点(即 SD 序列及 SD 序列到起始密码子 AUG 的距离)、识别翻译后修饰信号 用于原核表达的载体必须具备的条件:具有复制子、灵活的克隆位点和方便的选择标记、很强的启动子、阻遏子(一般有)、强的终止子,所产生的 mRNA 应具有翻译起始信号(起始密码子 AUG 以及SD 序列)外源基因在大肠杆菌中的表达方式 胞内表达
12、:非融合蛋白表达:蛋白质接近天然状态,易被降解,易形成包涵体。有原核多肽基因 融合蛋白表达:表达效率高;产物稳定;可以切除原核多肽,获得天然外源蛋白 分泌表达:有信号肽基因,形成周质表达或细胞外表达 外源蛋白表达效率的影响因素 外源基因密码子:大肠杆菌具有偏好密码子和稀有密码子,外源基因应尽量设计成为大肠杆菌的偏好密码子 mRNA 的结构:改变一级结构;降低 5端二级结构稳定性;调控 3端非翻译区二级结构 表达载体的选择:表达方式;强的复制子(拷贝数高);强的启动子(转录效率高);高效率的核糖体结合位点;强的终止子(提高 mRNA 稳定性);适应范围广;稳定性高;产物易纯化。外源蛋白的稳定性:
13、采用融合蛋白形式表达;采用蛋白酶缺陷的突变菌株 真核细胞表达的特点及选择 常用的真核表达系统:酵母表达系统、昆虫细胞表达系统、哺乳动物细胞表达系统 大肠杆菌和酵母表达系统的比较 大肠杆菌 巴斯德毕赤酵母 载体 原核载体 穿梭载体 调控序列 原核 原核和真核 表达形式 包涵体、融合蛋白、分泌 分泌 翻译后修饰 基本无 有 生产方式 发酵,操作简单、经济 发酵,操作较简单、较经济 酵母表达体系的影响因素 外源基因的结构 用芯片按作用类型分类细胞因子类药物激素类药物酶与辅酶类药物疫苗化性质特性相对分子量大结构复杂稳定性差药理学作用特性活性与作用条件温和分离纯化困难产品易受有害物质污染质量控制特性质量
14、标准内学习必备 欢迎下载 外源基因 5端非翻译区的序列和长度影响 mRNA 的翻译效率 起始密码子两侧若容易形成 RNA 二级结构,将阻止翻译进行 富含 A-T序列导致转录提前终止 密码子的偏好性 高度复杂的胱氨酸结构基序影响表达效率 表达形式及信号肽的选择:无信号肽常胞内表达;有信号肽,胞外分泌型表达 启动子:多数毕赤酵母采用乙醇氧化酶 AOX1、AOX2 启动子 转化子的拷贝数:拷贝数越高,表达水平也越高 诱导条件:甲醇诱导的浓度、时间以及温度的选择 外源蛋白的降解:采用酶缺陷型宿主、加入底物蛋白或调节 pH 值抑制蛋白酶活性,提高外源蛋白的稳定性。哺乳动物细胞表达系统 表达载体:病毒载体
15、(腺病毒、腺相关病毒、反转录病毒等);质粒载体 表达方式:瞬时表达、稳定表达、诱导表达 基因重组蛋白的主要分离技术:离心、沉淀(等电点沉淀法、盐析法)、膜分离、双水相萃取 基因重组蛋白的主要纯化技术:离子交换层析、亲和层析、凝胶过滤层析、反相色谱和疏水色谱 选择分离纯化方法的依据 根据表达形式选择 分泌型:沉淀和超滤 周质表达:溶菌酶处理渗透压休克 胞内可溶表达:亲和层析或离子交换层析 胞内不溶表达(包涵体):易与杂蛋白分开,但需要复性形成有活性的蛋白质。根据分离单元之间的衔接选择 先采用低分辨、分离规模大的方法,后采用高分辨的方法,最后采用分离规模小、速度慢的方法。合理选择色谱分离次序 根据
16、分离纯化工艺的要求选择 具有良好的稳定性、重复性和较高的安全性;尽量较少组成工艺步骤;所用时间尽可能短;工艺和技术必须高效 基因工程药物的质量控制与小分子药物质量控制相比,不同的方面 Mr 远大于小分子化学物质,致使适用于小分子药物的鉴别方法无法用于基因工程药物。如质谱 基因工程药物结构复杂,常需多种检测方法 两者杂质性质差别较大。小分子药物杂质主要来源于合成中原料残留、合成副产物和纯化中溶剂残留;基因工程药物多为宿主蛋白残留和宿主基因残留,其检测一般都用专用的试剂盒。药物定量方面,基因工程药物一般采用生化反应的方式 基因工程药物的质量控制 1、蛋白质含量的测定 紫外吸收光谱:在 280nm
17、有最大吸收值。快速,无破坏性。不是严格定量,核酸可引起强干扰作用。BCA 法:碱性条件与 Cu2络合同时将 Cu 2还原成 Cu(双缩脲反应),再与二辛可宁酸形成紫色复合物,在 562nm 有最大吸收值。需短时间 10min 内完成 Lowry 法:碱性条件蛋白质与铜形成复合物可还原磷钼酸磷钨酸试剂,产生深蓝色。特点:灵敏,准确度高;操作步骤多,繁琐;影响因素多(盐酸胍、尿素、EDTA 等)考马斯亮蓝法:灵敏,操作简单,重复性好;抗干扰能力弱 SDS-凝胶染色与扫描分析法 2、蛋白质纯度的测定:电泳(SDS-PAGE)、质谱法、色谱法、末端氨基酸分析法 3、蛋白质分子量的测定:SDS-PAGE
18、、凝胶色谱、质谱法 4、蛋白质等电点的测定 用芯片按作用类型分类细胞因子类药物激素类药物酶与辅酶类药物疫苗化性质特性相对分子量大结构复杂稳定性差药理学作用特性活性与作用条件温和分离纯化困难产品易受有害物质污染质量控制特性质量标准内学习必备 欢迎下载 5、蛋白质序列分析 N 末端氨基酸序列分析:鉴定蛋白质的种类;C 末端分析:判断表达、纯化过程中有无加工 6、蛋白质二硫键分析 7、蛋白质活性的测定 8、免疫测定法 9、内毒素分析、宿主蛋白和核酸残留分析 基因工程药物的实例:干扰素(IFN)、人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(CMCSF)、人白细胞介素-2(IL-2)、胰岛素、人生长激素(hGH)第三
19、章 动物细胞工程制药 动物细胞的体外培养 体外培养动物细胞的形态:贴壁依赖性细胞,非贴壁依赖性细胞,兼性贴壁细胞 贴壁依赖性细胞:成纤维样细胞型(主要来源于中胚层组织);上皮样细胞型(主要来源于外胚层和内胚层组织)非贴壁依赖性细胞:又叫悬浮细胞,一般呈圆球形。主要来源于血液、淋巴组织、杂交瘤细胞 兼性贴壁细胞:如 CHO 细胞、小鼠 L929 细胞 动物细胞的生理特点 1)细胞的分裂周期长,一般为 1248h(G1 S G2 M)2)细胞生长需贴附于基质,并有接触抑制现象 3)正常二倍体细胞的生长寿命是有限的 4)动物细胞对周围环境十分敏感(如渗透压、pH、离子浓度、剪切力、微量元素等的变化耐
20、受力很弱)5)动物细胞对培养基的要求高(需要 12 种必需氨基酸、8 种以上的维生素、多种无机盐和微量元素、作为主要碳源的葡萄糖,以及多种细胞生长因子和贴附因子,而且不同种类要求又有变化。)6)动物细胞对蛋白质的合成途径和修饰功能与细菌不同 培养条件要求高、成本贵,产量低;多半是分泌在胞外的,收集纯化方便,得到了较完善的翻译后修饰 动物细胞培养的条件(一)环境条件:直接接触的器材、防止污染(显著地污染标志:pH 值迅速改变,细胞外形模糊,甚至出现细胞集落)、水质、pH(大多是 7.2-7.4)、渗透压、温度、通氧量、基本营养物质(二)营养要求:水、碳源、氮源、维生素、激素、无机盐等 碳源不能为
21、无机物,大多只能利用葡萄糖 氮源不能为无机物,主要利用各种氨基酸 在多数情况下,需要添加 520的小牛血清,或适量动物胚胎浸出液。培养基:天然培养基,合成培养基,无血清培养基 天然培养基:主要见于早期阶段,来源:血浆凝块、淋巴液、血清(最常用有效)、羊水、腹水等。分维持液(低或不含牛血清)和生长液(5%-20%牛血清)合成培养基:主要成分:糖、氨基酸、核苷酸前体、维生素、激素、缓冲体系、无机盐等 无血清培养基 提高了细胞培养的可重复性,避免了由于血清批之间差异的影响;减少了由血清带来的病毒、真菌和支原体等微生物污染的危险;供应充足、稳定;细胞产品容易纯化;避免了血清中某些因素对有些细胞的毒性;
22、减少了血清中蛋白对某些生物测定的干扰,便于实验结果的分析 用芯片按作用类型分类细胞因子类药物激素类药物酶与辅酶类药物疫苗化性质特性相对分子量大结构复杂稳定性差药理学作用特性活性与作用条件温和分离纯化困难产品易受有害物质污染质量控制特性质量标准内学习必备 欢迎下载 血清的作用:提供各种生长因子和激素,贴附因子和伸展因子,可识别金属、激素、维生素和脂类的结合蛋白,必须的脂肪酸和微量元素 其他常用溶液:平衡盐溶液;培养基 pH 调整液;细胞消化液(胰蛋白酶,EDTA);抗生素溶液 动物细胞培养的基本技术和方法 动物细胞培养的方法:原代培养、传代培养、克隆培养 细胞的原代培养:组织块培养法、单层细胞培
23、养法。取动物组织块剪碎分散处理(加胰蛋白酶或胶原蛋白和 EDTA)洗涤纯化计数稀释培养 细胞的传代培养:离心或酶消化法收获细胞,计数后,以适当浓度接种到新的培养环境中 单克隆培养 动物细胞培养的基本技术:细胞分离(离心法;蛋白酶消化法);细胞计数;细胞传代;细胞的冻存(慢冻,液氮,196 度)和复苏(快融,投入 37水浴融化)冻存主要步骤:活性好的细胞,加保护剂(DMSO 等)混合;做好标记(细胞种类、日期等);逐渐降低温度,最后放至液氮中;降温梯度要合适,总的原则是慢冻 生产用动物细胞 原代细胞:费钱费力,少用 传代细胞系:安全,特点:2n 核型,贴壁依赖,接触抑制,有限传代(50 代)转化
24、细胞系:自发转化或人为转化,失去了正常细胞的特点,可=无限增殖传代,适宜大规模工业培养 工程细胞系:融合细胞系(仙台病毒融合法、聚乙二醇融合法、电融合法);基因工程细胞系 病毒载体:牛痘病毒。腺病毒和逆转录病毒载体,杆状病毒载体-昆虫细胞系统 基因工程细胞主要的筛选系统,HAT(次黄嘌呤、氨基喋呤、胸腺嘧啶)选择系统,筛选tk+、hgprt+的转化细胞 GPT(HAT、黄嘌呤、甘氨酸、霉酚酸)选择系统,筛选gpt+的转化细胞 G418(Geneticin)选择系统,筛选Neor的转化细胞 MTX 选择系统,筛选dhfr+的转化细胞 细胞库的建立:原始细胞库(MCR)生产用细胞库(MWCR,又称
25、工作细胞库,主细胞库生产细胞库)常用生产用动物细胞:BHK-21,C127 细胞,CHO-K1,COS 细胞,MDCK 细胞,WI-38,MRC-5,Namalwa,Sf-9,Vero,SP2/0-Ag14 动物细胞大规模培养 动物细胞的大规模培养方法 悬浮培养:适用于非贴壁依赖细胞或兼性贴壁细胞 优点:操作简便,培养条件均一,传质传氧较好,容易扩大培养,可以借鉴细菌培养的经验。缺点:细胞培养密度较低。微载体培养:用于培养贴壁细胞。充分发挥悬浮培养的一切优点。理想的微载体应具备:生物相容性、无毒性、表面惰性、比重适当(1.030 1.045g/ml)、粒径均一,在 60250 m 之间(溶胀后
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