2023年生物化学的习题及解答.pdf
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1、学习必备 欢迎下载 生物化学(第三版)课后习题详细解答 第三章 氨基酸 习题 1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。见表 3-1 表 3-1 氨基酸的简写符号 名称 三字母符号 单字母符号 名称 三字母符号 单字母符号 丙氨酸(alanine)Ala A 亮氨酸(leucine)Leu L 精氨酸(arginine)Arg R 赖氨酸(lysine)Lys K 天冬酰氨(asparagines)Asn N 甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine)Met M 天冬氨酸(aspartic acid)Asp D 苯丙氨酸(phe
2、nylalanine)Phe F Asn 和/或 Asp Asx B 半胱氨酸(cysteine)Cys C 脯氨酸(praline)Pro P 谷氨酰氨(glutamine)Gln Q 丝氨酸(serine)Ser S 谷氨酸(glutamic acid)Glu E 苏氨酸(threonine)Thr T Gln 和/或 Glu Gls Z 甘氨酸(glycine)Gly G 色氨酸(tryptophan)Trp W 组氨酸(histidine)His H 酪氨酸(tyrosine)Tyr Y 异亮氨酸(isoleucine)Ile I 缬氨酸(valine)Val V 2、计算赖氨酸的-N
3、H3+20%被解离时的溶液 PH。9.9 解:pH=pKa+lg20%pKa=10.53(见表 3-3,P133)pH=10.53+lg20%=9.83 3、计算谷氨酸的-COOH 三分之二被解离时的溶液 pH。4.6 解:pH=pKa+lg2/3%pKa=4.25 pH=4.25+0.176=4.426 4、计算下列物质 0.3mol/L 溶液的 pH:(a)亮氨酸盐酸盐;(b)亮氨酸钠盐;(c)等电亮氨酸。(a)约 1.46,(b)约 11.5,(c)约 6.05 5、根据表 3-3 中氨基酸的 pKa 值,计算下列氨基酸的 pI 值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。pI:6.02;5.
4、02;3.22;10.76 解:pI=1/2(pKa1+pKa2)pI(Ala)=1/2(2.34+9.69)=6.02 pI(Cys)=1/2(1.71+10.78)=5.02 pI(Glu)=1/2(2.19+4.25)=3.22 pI(Ala)=1/2(9.04+12.48)=10.76 6、向 1L1mol/L 的处于等电点的甘氨酸溶液加入 0.3molHCl,问所得溶液的 pH 是多少?如果加入 0.3mol NaOH 以代替 HCl 时,pH 将是多少?pH:2.71;9.23 7、将丙氨酸溶液(400ml)调节到 pH8.0,然后向该溶液中加入过量的甲醛,当所得溶液用碱反滴定至
5、Ph8.0时,消耗 0.2mol/L NaOH 溶液 250ml。问起始溶液中丙氨酸的含量为多少克?4.45g 8、计算 0.25mol/L 的组氨酸溶液在 pH6.4 时各种离子形式的浓度(mol/L)。His2+为 1.7810-4,His+为 0.071,His0为 2.810-4 9、说明用含一个结晶水的固体组氨酸盐酸盐(相对分子质量=209.6;咪唑基 pKa=6.0)和 1mol/L KOH 配学习必备 欢迎下载 制 1LpH6.5 的 0.2mol/L 组氨酸盐缓冲液的方法取组氨酸盐酸盐 41.92g(0.2mol),加入 352ml 1mol/L KOH,用水稀释至 1L 10
6、、为什么氨基酸的茚三酮反映液能用测压法定量氨基酸?解:茚三酮在弱酸性溶液中与-氨基酸共热,引起氨基酸氧化脱氨脱羧反映,(其反应化学式见 P139),其中,定量释放的 CO2可用测压法测量,从而计算出参加反应的氨基酸量。11、L-亮氨酸溶液(3.0g/50ml 6mol/L HCl)在 20cm 旋光管中测得的旋光度为+1.81。计算 L-亮氨酸在 6mol/L HCl 中的比旋(a)。a=+15.1 12、标出异亮氨酸的 4 个光学异构体的(R,S)构型名称。参考图 3-15 13、甘氨酸在溶剂 A 中的溶解度为在溶剂 B 中的 4 倍,苯丙氨酸在溶剂 A 中的溶解度为溶剂 B 中的两倍。利用
7、在溶剂 A 和 B 之间的逆流分溶方法将甘氨酸和苯丙氨酸分开。在起始溶液中甘氨酸含量为 100mg,苯丙氨酸为 81mg,试回答下列问题:(1)利用由 4 个分溶管组成的逆流分溶系统时,甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一号分溶管中含量最高?(2)在这样的管中每种氨基酸各为多少毫克?(1)第 4 管和第 3 管;(2)51.2mg Gly+24mg Phe 和 38.4mgGly+36mg Phe 解:根据逆流分溶原理,可得:对于 Gly:Kd=CA/CB=4=q(动相)/p(静相)p+q=1=(1/5+4/5)4 个分溶管分溶 3 次:(1/5+4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/1
8、25 对于 Phe:Kd=CA/CB=2=q(动相)/p(静相)p+q=1=(1/3+2/3)4 个分溶管分溶 3 次:(1/3+2/3)3=1/27+6/27+12/27+8/27 故利用 4 个分溶管组成的分溶系统中,甘氨酸和苯丙氨酸各在 4 管和第 3 管中含量最高,其中:第 4 管:Gly:64/125100=51.2 mg Phe:8/2781=24 mg 第 3 管:Gly:48/125100=38.4 mg Phe:12/2781=36 mg 14、指出在正丁醇:醋酸:水的系统中进行纸层析时,下列混合物中氨基酸的相对迁移率(假定水相的 pH为 4.5):(1)Ile,Lys;(2
9、)Phe,Ser(3)Ala,Val,Leu;(4)Pro,Val (5)Glu,Asp;(6)Tyr,Ala,Ser,His.Ile lys;Phe,Ser;Leu Val Ala,;Val Pro;GluAsp;Tyr AlaSer His 解:根据 P151 图 3-25可得结果。15将含有天冬氨酸(pI=2.98)、甘氨酸(pI=5.97)、亮氨酸(pI=6.53)和赖氨酸(pI=5.98)的柠檬酸缓冲液,加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱,并分别收集洗出液,这 5 种氨基酸将按什么次序洗脱下来?Asp,Thr,Gly,Leu,Lys 解:在 pH3 左
10、右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)中性氨基酸(A+)酸性氨基酸(A0)。因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸,由于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:Asp,Thr,Gly,Leu,Lys。第四章 蛋白质的共价结构 习题 1.如果一个相对分子质量为 12000 的蛋白质,含 10 种氨基酸,并假设每种氨基酸在该蛋白质分子中的数目相等,问这种蛋白质有多少种可能的排列顺序?10100 解:1012000/120=10100 2、有一个 A 肽,经酸解分析得知为 Lys、His、Asp、Glu2、Ala 以及 V
11、al、Tyr 忽然两个 NH3分子组成。名称单字母符号三字母符号脯氨酸丝氨酸苏氨酸亮氨酸赖氨酸甲硫氨酸见表计算谷氨酸的三分之二被解离时的溶液解计算下列物质溶液的亮氨液的是多少如果加入以代替时将是多少将丙氨酸溶液调节到然后向该溶学习必备 欢迎下载 当 A 肽与 FDNB 试剂反应后得 DNP-Asp;当用羧肽酶处理后得游离缬氨酸。如果我们在实验中将 A 肽用胰蛋白酶降解时,得到两种肽,其中一种(Lys、Asp、Glu、Ala、Tyr)在 pH6.4 时,净电荷为零,另一种(His、Glu 以及 Val)可给除 DNP-His,在 pH6.4 时,带正电荷。此外,A 肽用糜蛋白酶降解时,也得到两种
12、肽,其中一种(Asp、Ala、Tyr)在 pH6.4 时全中性,另一种(Lys、His、Glu2 以及 Val)在 pH6.4 时带正电荷。问 A 肽的氨基酸序列如何?Asn-Ala-Tyr-Glu-Lys-His-Gln-Val 解:1、N-末端分析:FDNB 法得:Asp-;2、C-末端分析:羧肽酶法得:-Val;3、胰蛋白酶只断裂赖氨酸或精氨酸残基的羧基形成的肽键,得到的是以 Arg 和 Lys 为 C-末端残基的肽 断。酸 水 解 使 Asn Asp+NH4+,由 已 知 条 件(Lys、Asp、Glu、Ala、Tyr)可 得:Asn-()-()-()-Lys-()-()-Val;4、
13、FDNB 法分析 N-末端得 DNP-His,酸水解使 GlnGlu+NH4+由已知条件(His、Glu、Val)可得:Asn-()-()-()-Lys-His-Gln-Val;5、糜蛋白酶断裂 Phe、Trp 和 Tyr 等疏水氨基酸残基的羧基端肽键。由题,得到的一条肽(Asp、Ala、Tyr)结合(3)、(4)可得该肽的氨基酸序列为:Asn-Ala-Tyr-Glu-Lys-His-Gln-Val 3、某 多 肽 的 氨 基 酸 序 列 如 下:Glu-Val-Lys-Asn-Cys-Phe-Arg-Trp-Asp-Leu-Gly-Ser-Leu-Glu-Ala-Thr-Cys-Arg-Hi
14、s-Met-Asp-Gln-Cys-Tyr-Pro-Gly-Glu_Glu-Lys。(1)如用胰蛋白酶处理,此多肽将产生几个肽?并解释原因(假设没有二硫键存在);(2)在 pH7.5 时,此多肽的净电荷是多少单位?说明理由(假设 pKa 值:-COOH4.0;-NH3+6.0;Glu 和 Asp 侧链基 4.0;Lys 和 Arg 侧链基 11.0;His 侧链基 7.5;Cys 侧链基 9.0;Tyr 侧链基 11.0);(3)如何判断此多肽是否含有二硫键?假如有二硫键存在,请设计实验确定 5,17 和 23 位上的 Cys 哪两个参与形成?(1)4 个肽;(2)-2.5单位;(3)如果多肽
15、中无二硫键存在,经胰蛋白酶水解后应得 4 个肽段;如果存在一个二硫键应得 3 个肽段并且个肽段所带电荷不同,因此可用离子交换层析、电泳等方法将肽段分开,鉴定出含二硫键的肽段,测定其氨基酸顺序,便可确定二硫键的位置 4、今有一个七肽,经分析它的氨基酸组成是:Lys、Pro、Arg、Phe、Ala、Tyr 和 Ser。此肽未经糜蛋白酶处理时,与 FDNB 反应不产生-DNP-氨基酸。经糜蛋白酶作用后,此肽断裂城两个肽段,其氨基酸组成分别为 Ala、Tyr、Ser 和 Pro、Phe、Lys、Arg。这两个肽段分别与 FDNB 反应,可分别产生 DNP-Ser 和DNP-Lys。此肽与胰蛋白酶反应能
16、生成两个肽段,它们的氨基酸组成分别是 Arg、Pro 和 Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala。试问此七肽的一级结构怎样?它是一个环肽,序列为:-Phe-Ser-Ala-Tyr-Lys-Pro-Arg-解:(1)此肽未经糜蛋白酶处理时,与 FDNB 反应不产生-DNP-氨基酸,说明此肽不含游离末端 NH2,即此肽为一环肽;(2)糜蛋白酶断裂 Phe、Trp 和 Tyr 等疏水氨基酸残基的羧基端肽键,由已知两肽段氨基酸组成(Ala、Tyr、Ser 和 Pro、Phe、Lys、Arg)可得:-()-()-Tyr-和-()-()-()-Phe-;(3)由(2)得的两肽段分别与 FDNB 反应,分别
17、产生 DNP-Ser 和 DNP-Lys 可知该两肽段的 N-末端分别为-Ser-和-Lys-,结合(2)可得:-Ser-Ala-Tyr-和-Lys-()-()-Phe-;(4)胰蛋白酶专一断裂 Arg 或 Lys 残基的羧基参与形成的肽键,由题生成的两肽段氨基酸组成(Arg、Pro 和 Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala)可得:-Pro-Arg-和-()-()-()-()-Lys;综合(2)、(3)、(4)可得此肽一级结构为:-Lys-Pro-Arg-Phe-Ser-Ala-Tyr-5、三肽 Lys-Lys-Lys的 pI 值必定大于它的任何一个个别基团的 pKa 值,这种说法是否正确?
18、为什么?正确,因为此三肽处于等电点时,七解离集团所处的状态是 C-末端 COO-(pKa=3.0),N 末端 NH2(pKa8.0),3 个侧链 3(1/3-NH3+)(pKa=10.53)(pKa=10.53),因此 pI最大的 pKa 值(10.53)6、一个多肽可还原为两个肽段,它们的序列如下:链 1 为 Ala-Cys-Phe-Pro-Lys-Arg-Trp-Cys-Arg-Arg-Val-Cys;链 2 为 Cys-Tyr-Cys-Phe-Cys。当用嗜热菌蛋白酶消化原多肽(具有完整的二硫键)时可用下列各肽:(1)(Ala、Cys2、Val);(2)(Arg、Lys、Phe、Pro)
19、;(3)(Arg2、Cys2、Trp、Tyr);(4)(Cys2、Phe)。名称单字母符号三字母符号脯氨酸丝氨酸苏氨酸亮氨酸赖氨酸甲硫氨酸见表计算谷氨酸的三分之二被解离时的溶液解计算下列物质溶液的亮氨液的是多少如果加入以代替时将是多少将丙氨酸溶液调节到然后向该溶学习必备 欢迎下载 试指出在该天然多肽中二硫键的位置。(结构如下图)S-S Ala-Cys-Phe-Pro-Lys-Arg-Trp-Cys-Arg-Arg-Val_Cys S S Cys-Tyr-Cys-Phe-Cys 解:嗜热菌蛋白酶作用专一性较差,根据题中已知条件:(1)消化原多肽得到(Ala、Cys2、Val),说明链 1 在 2
20、 位 Cys 后及 11 位 Val 前发生断裂,2 位 Cys与 12 位 Cys 之间有二硫键;(2)由链 1 序列可得该肽段序列为:-Phe-Pro-Lys-Arg-;(3)由(1)(2)可知该肽段(Arg2、Cys2、Trp、Tyr)中必有一 Cys 来自链 2,另一 Cys 为链 1 中 8位 Cys,即链 1 中 8 位 Cys 与链 2 中的一个 Cys 有二硫键;(4)嗜热菌蛋白酶能水解 Tyr、Phe 等疏水氨基酸残基,故此肽(Cys2、Phe)来自链 2,结合(3)中含 Tyr,可知(3)中形成的二硫键为链 1 8 位 Cys 与链 2 中 3 位 Cys 与链 2 中 3
21、 位 Cys 之间;(4)中(Cys2、Phe)说明链 2 中 1 位 Cys 与 5 位 Cys 中有二硫键。综合(1)、(2)、(3)、(4)可得结果。7、一个十肽的氨基酸分析表明其水解液中存在下列产物:NH4+Asp Glu Tyr Arg Met Pro Lys Ser Phe 并观察下列事实:(1)用羧肽酶 A 和 B 处理该十肽无效;(2)胰蛋白酶处理产生两各四肽和游离的 Lys;(3)梭菌蛋白酶处理产生一个四肽和一个六肽;(4)溴化氢处理产生一个八肽和一个二肽,用单字母符号表示其序列位 NP;(5)胰凝乳蛋白酶处理产生两个三肽和一个四肽,N-末端的胰凝乳蛋白酶水解肽段在中性 pH
22、 时携带-1净电荷,在 pH12 时携带-3净电荷;(6)一轮 Edman 降解给出下面的 PTH 衍生物:(图略)写出该十肽的氨基酸序列。Ser-Glu-Tyr-Arg-Lys-Lys-Phe-Met-Asn-Pro 解:(1)用羧肽酶 A 和 B 处理十肽无效说明该十肽 C-末端残基为-Pro;(2)胰蛋白酶专一断裂 Lys 或 Arg 残基的羧基参与形成的肽键,该十肽在胰蛋白酶处理后产生了两个四肽和有利的 Lys,说明十肽中含 Lys-或-Arg-Lys-Lys-或-Arg-Lys-Lys-Arg-Lys-四种可能的肽段,且水解位置在 4 与 5、5 与 6 或 4 与 5、8 与 9、
23、9 与 10 之间;(3)梭菌蛋白酶专一裂解 Arg 残基的羧基端肽键,处理该十肽后,产生一个四肽和一个六肽,则可知该十肽第四位为-Arg-;(4)溴化氰只断裂由 Met 残基的羧基参加形成的肽键,处理该十肽后产生一个八肽和一个二肽,说明该十肽第八位或第二位为-Met-;用单字母表示二肽为 NP,即-Asn-Pro-,故该十肽第八位为-Met-;(5)胰凝乳蛋白酶断裂 Phe、Trp 和 Tyr 等疏水氨基酸残基的羧基端肽键,处理该十肽后,产生两个三肽和一个四肽,说明该十肽第三位、第六位或第七位为 Trp 或 Phe;(6)一轮 Edman 降解分析 N-末端,根据其反应规律,可得 N-末端氨
24、基酸残疾结构式为:-NH-CH(-CH2OH)-C(=O)-,还原为-NH-CH(-CH2OH)-COOH-,可知此为 Ser;结合(1)、(2)、(3)、(4)、(5)、(6)可知该十肽的氨基酸序列为:Ser-Glu-Tyr-Arg-Lys-Lys-Phe-Met-Asn-Pro 8、一个四肽,经胰蛋白酶水解得两个片段,一个片段在 280nm 附近有强的光吸收,并且 Pauly 反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性。另一片段用溴化氰处理释放出一个与茚三酮反应呈黄色的氨基酸。写出此四肽的氨基酸序列。YRMP 名称单字母符号三字母符号脯氨酸丝氨酸苏氨酸亮氨酸赖氨酸甲硫氨酸见表计算谷氨酸的三分之二被
25、解离时的溶液解计算下列物质溶液的亮氨液的是多少如果加入以代替时将是多少将丙氨酸溶液调节到然后向该溶学习必备 欢迎下载 解:胰蛋白酶酶专一水解 Lys 和 Arg 残基的羧基参与形成的肽键,故该四肽中含 Lys 或 Arg;一肽段在 280nm附近有强光吸收且 Pauly 反应和坂口反应(检测胍基的)呈阳性,说明该肽段含 Tyr 和 Arg;溴化氰专一断裂 Met 残基的羧基参加形成的肽键,又因生成了与茚三酮反应呈黄色的氨基酸,故该肽段为-Met-Pro-;所以该四肽的氨基酸组成为 Tyr-Arg-Met-Pro,即 YRMP。9 蜂毒明肽(apamin)是存在蜜蜂毒液中的一个十八肽,其序列为
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